SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp39653_c0_seq3
Scaffold_idBomo_Chr15
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_uncharacterized_protein_LOC101738399_isoform_X3_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005730 C nucleolus
GO:0008150 P biological_process
GO:0044822 F RNA binding
Transcript
Level		FPKM:6.89 TPM:5.44
ORF EntryO_BomoMG14141_complete:A_BomoMG_comp39653_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
CTGGAATAAAACTATGCTATTGAATTTTTACAATAATCACTCGCTACAATGATTTCCATT
TGGCTTTTACTCCAAATCTCGAAATAAAAGAACACGATTCAATGTTAGTAATTACATTTA
TTACTTGTCAAAAGACATTATAGCTTAAAATTATCTAATTTCATGTACTTAGTAAATACA
ATTAGCTAGATTTATTTCAGACAGACGGCCTCGCTCCCGTACTTCATATTACAACGTAGG
TATGTACATAAAATATATTTTACTGTGACAACTTAAATCACAAATAAAGACACTAAACAG
ACGTAAATCCCTTCACACAAGCGAATCTCTCGAATAGAAAAGTTAATATTTGAACCATAG
CGCTATATTTTATTAAAAAAAATTACGTAAAATCATACTGATGCGCCAATGCAGGCGAAA
GAAACCAACAGATTTATACATTAATTATCATTATATATATAATTGGGATCTCCTCTTTAT
TATTAATATATTCATTAAACAAGTTATAGGTTATTGCAAATGGCGAGATATTCCCACTAC
ATAGTGCTTTTACACATGTATACAGAAAATACTAATATTGTGTATAAAATAACATACTAA
AACATTGGCACTACAAATAATCTGTTTCTTTAAAATACAAGACTGGAAGTAAGTCCAATA
ATCTATGAATTACCCACAGGGACAGGATGTAAATTCAATCATACTAAGGCAACGCTCTGT
TCAGTGTTTACTATGGATTTAATAGTCGGGACTATCTAACAAGCCGCGTCTGCGATGCTC
AACAATAAAATATGTAGTAATGAATTTTATACATCTTTTTATATTACAATATTGTTGAAC
AACTCCAAAGGGGCTTATTTTTTACGTCTAAATCCATTGGTGGTTCATTTATATTACACA
TAAAAGGACAAATAATTTAAGCTTAATCTTAATATATCTCGGTTATTCTATTGTCCATGT
AAGCGAGATACTGATTTTATTTATCTATATAATTATGAGTTCAAACTTAAATATAAGAAT
AAAATTGTTTTAAAATGTACATTTTGTATCAAAGCATAGTAAGGTATATGTATGAACGGT
GTTGGCGAAAACGAAGGTATGTAGTAATGCTGGTGGTTACTGACATGATAATAACTAAAA
TCGCGGTCAAATAAATTATTTTCTTGGTTATATACACGCAATCAAACAAAAATCATGTGA
CGTAGCCATATACCTACTTTTTACATATTGGGGTCTCTAAAACTGGACTCTGAAGTTCTT
TATGGTTAAACTCGCCAAATAAACTTCATAATAAAAATCATATAATAATAATATTACCAA
TAGAGTTTACCGTTTTGACCACGTGAGAGATTTCCTTTAAGGCTAGGGCTCTAAATTTCA
CTTCTACAAGTGAAACATATAATGATTTCTACTTTTGTTCTAATAAACCTGATTTCTCGT
GTTTAGAAATTTTGTTAGTGAAATACCTTGACCAAATATTGCTTGCTATAAATTACTTGA
ACAAAAATAGTTTTGTATTTAATGTTAATTAATGTTATGTATTTAAGTGCAATATAAAAC
AATTTTACCTCATTCGATAGCGCCGACGCTCCATCGTTCAACATTCTCGCTTACATTAGC
GTACGTCTAAGCACACAATTTATACTCGATACATAAAATAATTCACCCGTGGTTTAAATT
CAAATCAAACAAACATTACAAACAATTCATTAGATTTCATTAAATTTCATAATTGTATTT
TGCCATTTGTATTTTTTCGACCTGTGAATCAATTAGATGTAGGTGCATTCAGAGCAGAGT
TAAAAAAACTCTTAACAATGTAAATGAAATACATTGTTTTCCGCCACAGATATAATTTTA
TGTTTACCACGAAAAATAAATACAATTAAAATTTTCTTGATACTCTGTGACTAATGCAAC
CTGCTTCAAAAGGTAAAGATATTTAATACGATGAATTCACGTTGCTTAAGCCTTGTAGTT
TAAGTACTAAAATTCTCAAACCCCCCGTAACTTTAAAAGGTTTAATTCGCAACTCCGATC
TCAGAACTCCATAAAATTAATACAAGATAAAAGTGTTTAAAATATTTATTCAAACTACAG
AAAACGATCTCAAATACTGCCTCCCTCAAATACTGTTTATTTCAAGTTTTAAAATCTTTT
AATTTATTAAATCGTTGCATTTGGATTATATTAATTCATTATTTGTTTCAGGTTTAATGA
AATAGTGATTTTGTTTCTCAATGACTGGACTTTAAAATCATGTAAAACTAGTTTACAACT
TCCCAAAAGGATCTTGAATTTCACAAAACCATCGAAACTTATTTTCTTACTTATACAAAA
TTGCAATATTTTTATAAATAGCCGATTCGGCGATTTCTCCTATAATATTACATTAGTATG
AATTCTTATATTAGTGAACTTTGCATAGCTGGTTGTGTTGTCTACACAAACATCGGCGTG
CTCTGGTGTCAGAGCGACATACAATCATTTCACCAAAACGTGAAAAGAAATAAAAGTAAT
TATAAAAAAATTCAATATTTTATCTCGAAGCGAAGGCCGTTTGTCGCTGTTGTCTCATAT
ATAATCTTTCTCGATACAATTTACGTAAAACGAAATCATTTTTTACAGAATAGAAAAACC
TTGATCATTTAATAAAATGTGCATAACGTATCATAATTTGATGCTATTTAATACGAGTTC
ACTCTCACAGCACACTGGTAAACACAGAAGTCAACCCAGTAAAGGCAAAATAGGCAAAAT
CAAACTGTTTCTAGAATAATCGAAATCTTGTCATATTTGAATACTCACAGAAACTACTCA
ATATTTTAAAATTCATATCAACTACCGAAAAAATTAGTAATATTTAATTTTATAGGTTAA
TTTAGTTTATTGTAAAACTATGTTCATCAATATTCTAAATAAATATTTGTATGGCCTACG
TTGAAGAGTGAACTAACATTAAGAGCTGAATTATATTAGGTCAGACCCAGTTGGTTGGTG
ATCAACTTTTGCCGTTCACAGCACTGCGCCGCGGGAGCACGTGCAAACATCCACTACAAA
CGCAAGCCCGAGGAGGTTGCCAATAGTTTATTAGATTCCATTAATATAAATATTTCTGTA
TGCTAATAATTATTTACTCCACATTATATTGTCGGTCGGACCTAATATAAAACAAGTCTG
TGGACTCGAGATGAGTCATGATTATCCGGATCCTATAAGCATTACGTTGAACTTAAACTG
TACAGAGTGAGATTACACGCGCACACTCACACACACGGACACGGAACGATCACGACAACT
TCCTTAATAACTACGTTGCAATCTCCGGTTAGTACTTCCTCAGCCGCTTGTTCGGCCGTT
GTCCGTCGTTGATGAAGCCGCCGGGTCTGGCGAGGAAGCCCTGCGGCGGCATGTATGACG
TCACGGGGGCGACCCCGCCGCGAGGGAAGCCGCCGCCGCGCCCGAAGCCGCCGCCGCCGC
CGCGCCCGCGCGTGCCTCTAAAGTTCCCCTGCGCGTTGAAGGAGCTCCCGCGGGACCGGA
AGTTGTTGGCGCGGCCGGCGGGGCTGCTGGTGTTGTTGGCGGCGCTCGCAGCGTTGCGGT
TCTGCTGCTGCGGGTGCTGCCGCTTGTTCTTGTTAATACTTGCATTATGAGCTTTCTGTT
CGTCTTCGTCGCGATATTTGGAGACGGTGACGAGGAACCCGTTGATGCGGAGCTCGCGGT
CCAGCTTCAGCGCCTTCTCGACGGACTCCTTGTCGTGGAATGTCACCCGCAAGATTTTGT
ACTTGGTCTTGCTGAACTCGTGGATGTGCGCCACGTCGCCGCAGTGCGCGAACAGCAGGC
GCACGTAGTCCGTGCTGGCCTCGTAGGGCACCCCCACCAGCACGGCGGTCTCGGCGCGCG
ACTCCACCGCCACGGAGAGCGCGTGCCCCTCCACCACGGCGCCGTGCTCCGACAGCGCCT
TTTCCAGACTGTCTTTGTTTTTGAATTCGACTATAGCCGATAATGTCGGAGTTGTGGTCA
GTTCAGTTACAATGATTGGACCACGTTTGACTGTATTGATTTCCCCGTGTTTTGAGAACA
ACTCCTTGAGCTTTTCCTGGTAGTCGAAGAGGTAGCTCGAAGGGAGGTTCTCGACCAGCA
ATTTACCAGTTTCTACTTTTTCCTCCTGCTTCTCTTCAGTTTTTGTTTCGCCATCAGGAT
TTTCTTGATTCTGATCACCCTCCGTAGACTCATCAGCGTTCTCAGCGCCTTCAGCAGCGA
TTCCGTCGTCTCCATGCTCAACTTGATCCGATACGCCATTGTTCTCTTCGGCTTGTTCTG
GAACTTCTGCTTCTTCAACGACATCTTCAGCGGGCTTGGGTTTAGCTGCCTGAGTTTTAG
CTCCGCGACCTTTCTTTTGGGCTACCATGATGACGAAGTGTGGTATTCAGATAAAAAATG
CCAATAATAACTGTTTCACAAATTCACACAAAATGACGCCAAACTAAATGCAATAAAAAC
ACGATACCGGCATCACGCAAGCGCAT
(4526 bp)

- SilkBase 1999-2023 -