SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoMG_comp38396_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr21
NCBI non-redundant
(nr)		hypothetical_protein_KGM_20219_[Danaus_plexippus]
Ontology
GO:0005768 C endosome
GO:0005769 C early endosome
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0016020 C membrane
GO:0016023 C cytoplasmic vesicle
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0051443 P positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity
Transcript
Level		FPKM:5.01 TPM:3.96
ORF EntryO_BomoMG10764_complete:A_BomoMG_comp38396_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TGTAACATTTCTATAAGTAAATCTTCATAGAATATAGCACAATAAAGTTATATTTCTTAT
AGTAAAAATATCCATATCAAAAGTAAAAAAAAAAACTTCAAAATTGTTATTAGAAATATA
AATTTATAAACAACTGTATAAAAAACCGTGACATCAATATTTTTCACTTAGAAGCCTGGT
TAAATAGACAGGTCTTCACAAGTTCCAGTGTCTCGTTAAAAGCTACTTTTATCCGGGGTA
AGCGTCATCTTGAATAATCAAACGATTATAATAAAGTAAATTATTATAAACACTCGTCTT
GTCTCCACAATCAGTATAAGTACATAAATATTTCAAAAATAGATTTAAGTATTTTTTACC
CTTATGAACTAAATCAGCTGGATCGATTAGCACCCTTTTATGGCAGACACGGTTCATAAC
GTTTAAATTAATTATGAACAAAAACATTATATTTATATTTCGAATTACGTTGGTGTGTAT
AGTGATGTATTTCTAGTATCAAAGGCGGATTTGTGTGTATATATTGTAAGTAATATACCC
AATGAGTTGAGAAAGAAATCGCTACTTTTGGAACTTTGTAAGCTCTCTTCGTATTAAATT
GAAGGATCCCGCGCTACTAAACAGCTTGGCAGTGAAAAAAAATTGGCCTGTGACCTCTAG
ACGTCAGTGACAGCTGTCAGTTGATACTTGACAGTAGTGACAACAAAGTTTTAAAAGGGG
TCTAACTTATTCATTTGCGAACAATAAGTCCAAGCGTTTGTGATGATTATAATAATAATA
ATAATAATAGTAGTGATGAAACAAATTAAGCCAACATCCACATCTACATAGTGACGAACT
CACAAACTACAAGCTGCCAGTACAGATTTACACTACAGATTACATTCACATACAAAGTGT
TATTTTACAGTGCTCTGTGCGTATTCTGTTTTAATCTTTTTTAAGAAGATGGCGGCGGCG
CCGACGGCTGTATTGGAGATGAAGTCTGTGGCATCGTTACGTGTAATGGATATCCTGTTG
ACGCCGGAGTCGGTCCAGGATACGGAGTGTAATTTTGGGGCATATTATATGGTGCTGGAT
GAGATGTGCCCTGCGGTCCTTGAAATCCAATTTGATAGTCACAAAACGGCGCCCTACCTG
TCGAAGCTTGATCTGGAGGGTGGGACGGATAAGGCATATTTTGTGGTGGGTAAGGCACAT
TTTGAGGTAGGTATGGCACGTTATGTGCTGGATAAGGCACATTTTGAGTCGGATAAGAAG
ACTGGACGTGAGATACTTGACTAGTTGTGTAGGGACTATTACTCGGTTCGATGACGCCAG
AATTAATACCCACAGGAGCTTGTAATGGATCCGGTATGGGCCCGTCGGGCAAACTGTGAG
CCATTGGGTGCTTGTACTCGTCTTGGGTGAAACCAATAAGAGGAATCAAGCCGAGACAAA
TTTCGGATTCATCTTCTAGATCGTCATCGCAGCCTGACAGTTTTACTCTCACCTTAAAAA
AATACCCAATATCGATGATCGTACAGTTTTCTAAGTTCGGGACAATCAGATCCGGCACTT
TGAGGTTCACAGTGAAGTTCCTCGTGGTCTTGCCGAGCACCGCCCCCGACTTCACGGAGG
CCAGGACCCTCTCAGGAGGCATGTACTCCGCCATCGGTTGCTTGGTGCGATAGCATTCTT
TCACGACAAGCTGATAGACAATCTTCTTTATTTCATTGCCGCTTCGGTTTTGTGCCTGCA
CGGATATGGGTATTATCTGCCCTGGGCAGTACCCCGTCACTGGTAATGTTATCTTAACAC
TTATTTCTCCTGAACCAAAAAAACAGCTGCATCCTGCGTCAGTCTCCTCTAATTCAAAGT
TTACGGGTTGCTTAACTGTGTCATTTGCAAGGTTCAAATCAAACGGAGCAACTACTTCAA
AGATTGTCCCCAGTTCTTCTGCAGAATTATTAGCTTGAATAAGGCGAGCAGTAATCTTGT
AATTGATATTGCCTCGTTCACCTGCCACTGTTGATGGTGCTGTGTGTGGTATTTGAAATC
TGAATGGTAAAGATTGAGGACCGGCTGGAAGCTGAATTTGTCCATTGTTTGCGACTAGAT
GTTGAGTGTGCCTCAAATACGCCTCGTTGCCATAGTATCTAACTTGTTTGTATTGTTTAA
CACCATTATATGTTTCAGTTTCTTTTTCGATCCACTCTACAACAGCTTCACCAGTTGCCT
CAACAAACAAAGCTTGAACCGTAATTGGTCGATCTAACGTAAAATTTACACTTCCCGTTA
CAATTTGACCAGAATAAAACACATTTCTTATTGAGTCCAACTTTATGGTGCCTTTTTCGA
AACCACATTCCATTATTTTATTTTAATGGTTAAACAATGCTGGTTTTGAGAGGAATAGAT
CCTTAATTTGTTAAATTGAGTGTATTTCTACGTACAAAAACCCAGCGAAAACCTTA
(2456 bp)

- SilkBase 1999-2023 -