SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoIG_DN32671_c4_g1_i13
Scaffold_idBomo_Chr1
NCBI non-redundant
(nr)		ecotropic_viral_integration_site_5_ortholog_isoform_X3_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005096 F GTPase activator activity
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005768 C endosome
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0006886 P intracellular protein transport
GO:0007298 P border follicle cell migration
GO:0017137 F small GTPase binding
GO:0030334 P regulation of cell migration
GO:0031338 P regulation of vesicle fusion
GO:0031982 C vesicle
GO:0032880 P regulation of protein localization
GO:0043087 P regulation of GTPase activity
GO:0055037 C recycling endosome
GO:0090630 P activation of GTPase activity
Transcript
Level		FPKM:0.17 TPM:0.10
ORF EntryO_BomoIG15610_complete:A_BomoIG_DN32671_c4_g1_i13
Sequence
(Nucleotide)
GTTTGCTGTCGTGTGTATCGATACAAACGCGCATGAGTATCGCGTCTGTATCGATTCAAA
CGCGTATTTGAATTTATACAGGTGTGAAAAGGTCTACAGGTTGCGTCTGACTTGCGTGCG
TATCGCGTCGGTATCGCTACGATCGCGCATCGACGGCGCGTTTACAAAACGTGGTGTGCA
CAGGCTCTAATACGTCGAAGCAAGTGCAAGCCCGGTTGTAATTCGTACGTATTTACATAT
ATATGTACGAGGGCTATCGCGTACAGTCGTAGTCATAGTTATTTGTCGCATAGATTAAAC
ACAATACACGAGATTCAGTCATTTTTAGTAGCTGATTTGGATGTAGTAGGATTTTAAAAC
CGATCTCGTTTGTTCCTGCATCTCATCACTAGTAGCGACCTCGCGGACATGGTGCCGCGG
AGTGAGGAGAAGCTCCGCCATCAGGACCTTTGCCTCTCATAAAAAAAACCACGAACACTC
GCTCGAACGACTATGAACCTGCGCAAACTCCGTTTATATTTGCTATGTAAACCAACAATT
GAATATATAGGTACTATTAAAATATCAACGTTTTTACTTTCAAGACCACTCAGTTCAAAT
CTGAGGCTTAATATTTTAACGCGTTCGAACATGAGAAATAGTAAGATCGCAGTGTCCCAA
TTGTTCATTATTTCGTTAATGATAATAAAGATATTTGAACGTTTTAACACACCTAAATCT
CATTATGTTTGGACCATAGTAGTTGCCTAATTGACTATATCACGTAACGTAAATTTTAAG
AGTTAATAATTAATTTTTTTGGTGTTAGGATACTTCTCTATAGATCAAATGGCCGTGCGT
AGATTAATGCAATTCGCAAATAGACAATTTCTTTATTGTTTCAAAACGATTAAATTTTAA
AAGAGATTTAAAGACATCGATCTTCACGCTGATGCAAGTGTTGACGCAGAAATAGTAACA
GCGCCGTCGAGAGAATATTTAAATAAATTACTTCGCCTTGGCCTGTTTCCTGTGAAATAC
TGGTAATAAAATTTCAGCATTCCAAGCGTTTTAATTGATTTATCTGAAATGTATTCAAGA
ATTTGGAATCACTACGCGGCTGTCCCAAAAACATACATACCTGCACTTGCATTAGTACAC
GTAGGCCCATTAATAATTATTGGAATCCCAATGTGCTATTAAATTCTGGTTCGTTAAAAT
TGTTTTACAGTAAAGCGAAATACATCAAACCTTATAAAATAAAATTTTTAAACTAATATA
ATAATCTTACTATATTATAAATATTCTTCATAAAATTCACTCTGAATAAATTATTATGTA
TTATCTCGCAAACATCTTTAAGCATCTGGCGTAGAATTAATAACATAAAACAAATTAATA
AAATAAAAAATATCTTTTTAAATTAAATTAAGTTAACTAATCATTATTTATGAGTATTCA
ACAAGAATGTTGTAAGTGAAATTAATGAATAACACAGTCATATTCGAAAATTAAGTAAGT
ACACAAGGATGTAAGTATAGCTGTCATTAATATAATCACATTAGTCAGTACATAAAATAT
ATCATTATCATTTGGGCATATTGATTCTTAACTTATGACCAACACAACACGTTCGAATCA
CTGATATTATTCAATAATTATAAAAAAATTATTACCAAAATTTTACTGTGATAGCTCGAT
AAATTGACTGTTTTTTAGTTTACTACATTAACTATAGCGTTAATTGAAAACGCGATTAGA
CTATTTTGCTTATAGCAAGAGGTTTTGGTACGATTAGTACACGTATCGAATGAATTCGAC
ATTTAAGATACTAAGCCATGTGGAATACGATATAAATGTCAGAGGCTTATAGCTAGTTCT
TGTGTTTTGAACCGAAGGAATTATATCGAATTCCCGTCATTCCTTTTTAACATTTACGTA
CAGTACTTTACTGCTTGAAACCGGTTTATTCACTCATGGTGCGTTTTCAATATGATTCTG
TCTGCCATGTACTATCATTTTCGGAAATGAACTTTTATTACACGGTATTCCGCCGTACGC
TTATATGTCCCTTGTGGGTAGTGACCCAGTTCCGTGACCCTGGAAATGCTGACGTCCACG
AGAGACCTATTCGATTGCTTTCCACGACAATAAAAACATTCTAATTACGTAATGAATTTA
TTATCAAATTACTGATTCCTGTTATAACAAATATATTATCAGATATTTTGAATTTTTTTA
TTTCCGTTTTATTAAATGTTATTATTCCTTTATTAAGCAGTAATACTATTGTTATCAATT
TAAATGACCTAGGTATTAAAATATTATTTATCTCTCTCAAATATTTTACTATAATGCCAT
GAACAGTAAAACAAGTCAGGTTAGTCTTAGCCACATGTAAGATATTTAAGATATGATAAG
ATAAGATTTGTAATGATCCAACGATATTTTTAGTTCACCCAAAGCTTTTACTTATTCTTA
AGTAAAATAAACGAAATGCAGTAAATAATTATATTTTGCATTTAGACGAAACTTTCTTTT
CGCTTTTTTGCGAATCTCAAATAAGTTATTATTTAATAATCTTCCTGTTTTGAACGTATT
ATGTTATTTAAAATACTATGTTCTTGTAAAAATTATGATTAATGAAAATAGTTTAATCAA
GTGAACTTCACACTAGATCAAATCGATTATTATTATTATTATCTACAAATAAATTATTAA
TAAGGAATTCACATTGGAATGTTCAACTAGGCAAGTTGTAAAAGTTGTGAAAGTCTTGAA
GTTGTAAAGCGTGCTTTTGCGGTTTTGGTTTTGCAGTTTTAATAGCAATTACGTTCTGCA
CAATTAATGTTCAACAAAAATGACAATGTTTAATAAGCACTATTACTAAACTAACAAACG
TTGTGGTTAATTTCAATTTATTTGATTGGAGAGAAAAAAAAATCGCTTTCCAAGTAGTCG
ATAGTGATTTTGGCGTCATTTTGATAATCGTAGTCTAACTACTAAGCAGATTTTTTTCAG
TTATAGCAAATGTGTCGTTTATTGCATAAAATATATATATATCTATAAAAAGTTCTACGT
TAAAATCTAGATGTATTATTTCAACTACAACCGTAAAGAGATACTAGCTAATTTGGATAT
TGGCATCACGAGTTAATGGAGATAAAACGTTGTTAATTATTCAAACTATCGATTTTAAAA
CTACAAAAATTTCAGTAATATCATTAAATCTAACAACCACTAATCATTGTTACTACGCCC
GGACTACAGTTCACTATATTAAATTCATATCGACACATACTAATAGTTAAAAATCGTTCA
CGAAGCACGAGAGAAATATGTTAACATTAAAATTTGAAGTCCGTCTGATTTTTTAAGCTA
AGAATATTTAAAAAAAAAGGTTTTTTTTTTGTTAAGCTATCAATACTTTGACGCTTCAAA
TAAATTTCATAGCAATCTCGTTTGCGGTTAGCTCGTTGTAATAAATATCTTAGCTACTAC
AATATAAAAAAAAAAAAAAACTACGCAGACTATAAAAAATACGCGACGAGACATAGCTAA
TTTCACCGCAATTTTCTCTCACCGAAAATTATTAATTAATATTAATATAATGTTATAATT
AATTAGCTTAAATAACATAATTATAATTGAAACGATCATAGAATCCTTTGCATTCGGACT
GTTTAGATGTAAAAAAACACATTTATTAACTGTCGTATTTAATTCTGTTAAAAGATTATG
AAATGAAATATGATTATAAAAAATATTGATAGTTTTAAGTGGATCTTACATAAAAATGTA
TATTTCTTAAACAACAGCAGCAGAAATGTTGATTAAATATACCAGAACTGAAACCACGGT
AATAATATATCACAGTATACACATAAATTTTTTTGTAGTATAAAAAGTGCATTCGGTTCT
TATCTTATTATTTAAATAATCAACGAATCGTGGGCGCTCATGTTATAAAAAGCTTCGGTT
CATATTATGTTGTCATATGCGTTTCTTATTTTTGTGTGTATATAACATAAACGAAAGACC
ACGATTGAGACCTTCATTTAAATAACAGATGCGACCGTTTCTAATATTAAGTCAATGGAA
AGAGCAAAAATATATACCGATCTGGTCGTTTTAGGGCTGTGCTGAGTATTCGCTACGAAG
GTTTGCGTGAGGTTGTTGTAAATTCTAATGATGTAGAAGATTCTCGGCGCAGTGTCAACT
TGAGTTTCTCGTCTTCTTCCAAATCGTCCTCCAGGGATATGGCGCGGCTGAGCTCCGTGT
GACCGAGAGCCCGAGATTTCCACGCCTCTAACCTCATGATCTCCGCTTTTAGCTCGGCGA
CTTGCTCTTGCAATTCACGTACTCTGTCGGAGTCGTCCATATTATTGTTCCTTAGTTCAC
CTTCGGTTGCCATGACTTCATTCTTTAATTTATATTCAGACACTTCTGTCTCCAGTTCGG
CTATTCTTTGCGCGTCTTCCATGTTTCGAATGTTAGCTTGCATCGATTCATACTTGGCCT
TGCTCTCTAAATCAGCGTATTTGTGCTGGAACTCTCTCTGTCTCGTTTGGAGAGCTCGTT
CACGTTGGAGGGCCGCATCTAGATTCTCGCGTAACAGCCGAGCTTCCTCGTCCTGTCTTC
GGAGCTGATTTGTCGACACTTGAACTTGAGTCTCTAGTTCCATTACCTTCAGTCTTAACT
CCTTTAATTCGGTCAAGGCCTCGACCTCCCTGATCCTGGTGGTCATGAGTTCCTCGTCCA
GTTTGAGCATATCAGCCGACCTCCCTTCCCAAGCTCGCAGCAGTTTCTTCGGGGTCGCCA
TGATGTCTGATACTACATTCGACTGAACTGGAGCAGCGGGTGCTTCCTGCTTGTGCTCCT
GCGAACATAACTGCAAATGTCGTTGCCACGATTCTGACAGCTCCGAGACCCGCTGCCTTA
AGTCCTTCAACGAGAGATTAGCTTCAGCTTCACGCAACTTTACGGCTATCAGCTCGTCCT
GTAAGTGTGCGACATTGTTGTCGACGCGCTGTCTCCTGAGGCTCTTGTTCTCGTTCTCGA
GTTCGTCGATGCGAGCCGTCAGTTCGCGTTCGGCGGCCTCGCGTTCCGCTGCGTGTAGAC
GCGCCCGCACTAGCTCCCTCTGCAGGCAGCGCGCTAGTTCCTCGTGTTTCTGACCGCTGG
CGCTTTCGGTGCCCTCCAGCGACGACTGCCTCGAGTTATTCTCGGCGATAGTCATCTCGA
GAGATCTTATCTCATCTAAAGCAACGGCCAGCCGCTGCTGCATGTCTACGTTAGCTCGAC
GCAACGCTTGGACCTCTCGATCCAATGCAAAGGTTTCTTCTTCTCCTTCAGCGCGGTCCA
CTTGACCTCGGACCAGACGCTCTGCTAGAGCGGAACTTTCCTTCTCCAGCAGTTCTACGC
GTTGCTTGAGGAGACGGTTCTCTTGACGAAGACACCTGAGCACGGCAATATCACCTTGCT
CCTTTGTTTTTATAACCGTGTACTCCTTTTCGAGTTTCTTCATCTTTTTCGGATTAACTT
TGACTGAATACGCCAAGTTCATGAAAGCGGCTTGATCCGCTTCAGCTTTCAAGGGCAGTT
CTTTCTGTATGTACTTCAAAATGCTCTCCATATCGAGCGATAAGAGATCGTTTTTTCCTA
AAGTAAGCAACGCTAGGGCGACTTTGAAAACAATTTCGATTCCTTCAGAGAGAAACACAT
CCATTATACGGCAAGCGAGCGGAAGTGATAGTGTTGTTGTAAACAAAGTCAGGAACCAAC
TACTAGCGTACAGAGACGTGCTGAAGCTCTGAGATTGGAAGTGAACATGCAAGTCAGGCA
ACAGTTCCTGTACCAAGTTCTCCAGCTGAAACATGCAGAGTCCCAGTTCCGCCATGCTCG
GTTTGAACATGTCCCGCATGCGATGTTGTTGCATTATTTTAACTAAAACAGCGAACGCTT
CCTCTTCCGGCATCTGCATTAGTAATAAGCCGACGATAAATCCTGAGCCTTGACAGTAGC
CGACTTCTCGATCGTGCAAAGAATACGCCTTCATCACATTGAATAAAGACTCCTGGCCGA
GGCCATCCTTCTCTTTGAAGAAATCGTGTTCGGGATATGTGCGAGCGATGTCACGACGTA
TGACCTTCTCGCAGGCTGATTTCGCCTTAATATATGAGGCGTATAACTTCTTTTCGGGCG
ACGTGTCTACGCCTGCCAGTAGCTGCCATACGATGCCTCTGAAATGATGTGGGACACCCT
GTCGAACAAGGTCGCGGACCCATTGGTTTCGACGTTTCCATTCCGATTCCCAGTTGCTGA
CGAGGCGACCCCAGAGGCTCCAAAGATCCTCTTCTCCATTAGTCCCAGGAGTTGGGCGCG
TTTCGACCTCATGACTTGAGCTTGTGGCGGAAGCGAGGGATATCAGTGATGTGTCGGAGC
TCTTCCGACTGTGGACGGTAGTGAGCGAGGCGTTCTTCGCATCAGCCTCGATACGACGGT
TTTCTTCCTCCAGCTTGGCGAGAAGCGCCCGGTCGGGCGTCGGGATAGTTTCACTTGTCG
GGATTCGGCAGTTAGCGGTCGGTGTTGCGGAGGCAGCGGTCTGCGCGGCGGGCGCGTCTG
TAGCGTCGGCATCCACCTTCATGATGACTCCGGATCTGCCATATAGACACTTCCTCTCGC
CCTCCGCCCCGCCTCCGCGTGCGCTCTTTTCTGCACCAGACACGCGCGAACACGCCAGCA
CCTCAGCACTCCT
(6733 bp)

- SilkBase 1999-2023 -