SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoIG_DN32635_c0_g2_i4
Scaffold_idBomo_Chr15
NCBI non-redundant
(nr)		prenylated_Rab_acceptor_protein_1_isoform_X4_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0008021 C synaptic vesicle
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030054 C cell junction
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0045202 C synapse
Transcript
Level		FPKM:0.59 TPM:0.33
ORF EntryO_BomoIG14691_complete:A_BomoIG_DN32635_c0_g2_i4
Sequence
(Nucleotide)
GGATATAGTAATGATCACAAGATTATTATACAACTACAGAAATATATTTTTAATGACATA
AAAATGTAAAATCAAATTGGAATTATAGCTATTGCATTACTATACTATCACAAAAGATTA
AAGAATGAGAGATATTAAATTATAATTATTTTTTTTAATTAAGGGTTTATTTAAATTATT
GCCTATGACGAAATGATCAGGAAAGAAATCATAAAACTTAACTGAAATATATTTATATAG
ATACATAAATTTAAAACAAGTTAGTATATTTATGTGAGAGTTTAGACTGTCGATTTTAAA
TGCTGTACTATTTATCAAATACTTTAACTACTTTCTATCTGCCCCTGGGACTGATTGAAA
ATATACTAACCCTTTGGGACAAAAAAAATATTTTTATTTTTAACATAAATGGTTTTAACA
TATTAGTTATAAAATAAATTAGTGTCAAATGACACTTTCATTTATTGTGAAGTTGCTTAT
TTTGACTTTTTTTAGCCAGACTTCTATTAAATAAAAAAATTATATAGAAATGCTGTTTTC
TTTACTTTGAATAAATGAAGAGACAGTTCAGCGGACGTCTGCTCAATCGTGCTAATATCC
AAAACAACGGGTTTTAAATAAAAGGGGATGTTAGAACGTTTATTTATTTAAATCTTTAAG
ATAAAGTACAATAAATTCCTCTAATATATGAATAAAAATGTTATTTATATTTGGTTTTCA
TTTATTAATTCTACAAAATCATTTTCTATAGGCTGGTACGTTCTGTATGATTGCTAATAG
GCTGTCAGCATTGTCTAATAACTTCGCCAGACTAGGACAGTCGAAACCAACCAGTACTGC
ATAGCGCATAGATAATACACTTATGCTTAGCGTCATATAGCTGTAATAAGCAACACTGCT
GGGTTAAGCTGACAACCCTTATTTTTACACGTAAATAAATATCATTTATTATTTAATAAA
TATTATTTATTTATACTGTTAATCTTCAACTTTATAATGTTAACAATGTAAGCCTCTGTA
TATCATGTAGACTAATGTTTTATTTATCTTTGATGCAGAAACACTATTTAGTAATTTAGT
TTTATTTTTTACAATACACAGGCAATATGTAGTAAATGTGCTTATGTATAATATGGCAAT
TTTTCGATGATAATTAATATGTTGATTACTTGAATGAATTAAAAGTTTAAAATAAATTCG
AAAACACCTTTTTAATAATTAATTAACAAACAAAAAAGGTATTAATAAATATTTTATACA
ATATACACTCTTTATTTTATTTATTACATGGGTAAACGAGCTTACGGCCCTTCTGGTGTA
TAGAGAAGCCTATAGAAGTCACAAAGTGAACACCGTCACCCACCTTGCAACACGAGGTCG
ATATCCCACCCTTAAAACCGGAACTAAGGACTGATTCGGGGCAGAAATAGGCAGTATGGT
GGCACTTACTTGTGCGTGGCTTAGAAATGCGCCCTAGCACCGGTAATACACCCTACCATC
AGTACCTAAATACCGTTAAATTTAATCATGTTTAATTATTAAGCTCAGTTATACGGTGGT
GAGGAGAGAACCGGCCAGGCGGCGGAAGGAATAAAGGAAGATAGCTCTGTCACACTTGCT
CAATCATCGGAAACTGCTCCGGGTCTTCAAGATTAGGTAGTGCCTCTGCATCGAAGAAGC
TTGCATGAAGGGCGACTACGGTTACCGTTGCACCTAAAACCCAGAATAAAACGGCTCCAG
CTCCAGCAAGCCAACAGAGTGCCATGGATCCGGCAGCAGCTATAACATACTGCTGTGTTT
TCGTTAACTCCCAACCACCAATCTTCCAAGTATTCGGCCCTGAAGTTAATTTTCTATATC
CAAAGAAACTGGCCACCATAGTGATCAGCAACAGTGGTGATGTTATGAGGCAATAGGCAA
ATAGTCCCAGAAATACAATTAGGTAATTAGCTTGAAAATATTCTATGTTACGATAGAATC
TTCGAGACAATCTTGGTATAGATACTGGTACCTTAAAGTTGTCAGTGGCAACAAATTGTG
TCCATGGCCTGCGTGAAGATAAAACTCCCATCAACAATGCAGGAGCCGCACCACTACGTA
CATGCTGCAACAACTTTTGGAAACCTTTCTTTTCTGTTGTTGCGTTTATTTCACCTGACA
GATCAATCTTTACATTTTCAGACATTTTAGGGATTTTCTAATTTTGTGTACAGTATATAA
GTATTATTTAGTAGGTACACTATTTATTATTTTATTTTGGTTGTATGTGTTGTTTAATAT
TTTTTTTGCAAAATATAAACTTGGCATTCGATTTTTT
(2317 bp)

- SilkBase 1999-2023 -