SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoIG_DN31389_c2_g1_i2
Scaffold_idBomo_Chr1
NCBI non-redundant
(nr)
endoplasmic_reticulum_mannosyl-oligosaccharide_1,2-alpha-mannosidase_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0004571 F mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity
GO:0005509 F calcium ion binding
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0006491 P N-glycan processing
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016798 F hydrolase activity, acting on glycosyl bonds
GO:0030433 P ubiquitin-dependent ERAD pathway
GO:0036508 P protein alpha-1,2-demannosylation
GO:0036509 P trimming of terminal mannose on B branch
GO:0044322 C endoplasmic reticulum quality control compartment
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0097466 P ubiquitin-dependent glycoprotein ERAD pathway
GO:1903561 C extracellular vesicle
GO:1904380 P endoplasmic reticulum mannose trimming
GO:1904382 P mannose trimming involved in glycoprotein ERAD pathway
Transcript
Level
FPKM:0.00 TPM:0.00
ORF EntryO_BomoIG12590_complete:A_BomoIG_DN31389_c2_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
GTCGAGGCTACTGTCAGTGTCACTGACTGCAAGACATACCTACCTAAATCTACTTCTAAT
TCACGCGTTTGGCACTTTGGTATTTCTTTCCTAAACATAATTGTATTAAATTTTATTTTT
ATATATGAATACATTTATAGGGATATATTAAAAATATTTAAATATATTAGATGTATACCT
ATATACATAAATACATTTATAGCTCTAATTAAAAATCCAAAAATACATTTCTGGATCAAA
ATGATGGTGAATATACTGAAACCTTAAATAACTGAACTTTCAATATGAGACAGCAAAACT
TAGAGACACATCTAAATTTTAATATAAATAATCATACAAATAATGTTAATGATAGAAAAT
GGGTCACCAATGGAGAGACAGCAATATTACTTAATGATCCAGCAATATCACATACTAAAA
TTATAAGGAAATGGAATCGTCTATCACGTCTTCAGAGATCCATAGTGTATGCTGTGCTAG
TTGTGACTGCAACAGCTCTTTTGTTGCTGTATTTTTCTAAAACTGGTATTGTCATCATTG
AGCGAGGCAATGAAGATTCAGTTCAGGAAAAATTAAGAAACACATCTCTAAATGCCAAAC
CTGCATTGGACAACACAGTTCAAATAAAATATGATCCTACAGTGTATGAGAGGCCTGTTT
TTACAGGACCAAAAAATGATCGGCAACGGGCATTGGTGGAAAGTTTTAGACATGCATGGA
GAGGGTATAAAGAGCATGCTTGGGGCCATGACAATCTAAAACCAGTCTCTGGTATGGCTT
CTGACTGGTTCTCTCTTGGACTTACAATTGTTGACAGTTTGGATACAGCTTACATAATGG
GACTAACTGATGTATTTGAGGAAGGCAAGCAATGGATCAAAGAAGAACTAATATTCACAA
AAAATAAAGATGTTAATTTCTTTGAAGTCACCATTAGAATACTAGGTGGCTTGTTAACAA
ATCATTATTTCACTCAAGACCAGCTATTTCTTGATAAAGCTATTGACCTCGGAGACCGTC
TCATGGCAGCATTTTCGTCACCATCTGGCATCCCATACTCTGATGTGAACTTGGGAGCTA
GAACTGCTCATGCTCCTGAATGGTCACACTACAGCACCACAGCTGAAGTTACTACTGTGC
AGTTGGAGTTTAGGCAACTGTCCAGAGCTAGTGGCAACCCTATATTCGAGGAGGCAGCAG
CAGCCGTTTCCGAGAAGATTCATCAGCTACCAAAAAAACATGGACTTGTTCCAATATTTA
TTAATCCGAATACAGGACATTTTCTGCCTCACGCCACCATCACTCTCGGAGCAAGAGGGG
ATAGTTATTATGAATACCTGCTAAAACAATGGCTCCAGACTGGGAAAACAATCAACTATT
TACTGGATGATTATTTAACCGGCATAGAAGGTGTACGTGAATTTTTGGCAAAACGTTCAT
CACCTAATAAACGATTGTTCATCGGAGAGTTGTCTGCTGGTTCAGAGGCTTTCAATCCGA
AAATGGATCATTTGACCTGTTTCTTGCCTGGAACATTGGCCTTAGGTCATTTGAATGGCC
TCCCCGACTGGCACATGACAATGGCCGAGGAACTTCTCTACACTTGCTATTTAACTTATG
CTGCACATCCAACGTTTTTAGCTCCAGAAATAACACATTTCAATCTCGCGAGCACAACAG
ATGATATGTATACGAAATCGGCCGATGCTCACAGCTTATTGCGACCGGAATTTATTGAGA
GTTTATGGTATATGTATCAAATAACTGGCAATACTACCTATCAAGAATGGGGCTGGCAGA
TATTCCAGGGCTTCGAAAAATATGCCAAAGTGCCAAACGGCTATTCGTCTCTAACAAACG
TGAAATCTGAAAATCCAATACCACGTGACATGATGGAATCTTTCTTTTTGTCAGAAACAC
TTAAGTACTTGTACTTATTATTGAGTGACGATCGCTTTCTCATCGATTTGAATAAGTATG
TCGTCAATTCGGAAGCGCACCCTTTACCTATACATAAAAATTAGTGAGATTTAAAGTAAT
AATAATACGTTAATGTTTATTTAACATAAGACGTATTCGCATGATTTAGTAGAATAAGTC
GCAATTAGCTAAATATGCCGCACTTTTTTTTCTCAACTAATATGTCAGTATATTTATTTT
AAAATGAGCACTATCATACTTAAAATTCATTCGTCATTCGAGTAATAACTGCAGGATTCA
GTAGTTTTCAGTAAAGTTGAATTTGTTGACGGACTCCTCACTAAACATTTAGAATTTAAA
GCTGTGATCATACGCGAATTACAATCAGTATTTATATTCTGACGTGCCTGTTACTTAAAT
GCCTTATACGTTAAGGGAGGGAGAGCGAGCTAAAGTTATCACTGGATGTTAGTTTGAGCG
GAATTAGTCAAATTATTATTAATGCGTGACGGGTGCGTTAATGTTTTATTTTAACAGTAG
GTACAATTTACAATTTTGACATATTAAAATTGTCTTTCCATAAAATTTGACAGTTAAACA
GTTTTACGCACAACGAACTAACTCCCTTCGATTTCTCCTTAAAAACATACTTCTGATTTT
TCAATAAACAGTTTTACCGTCAAATTATTATATATTTAATTGTATTGTTTAGGGTTTGTG
TGGCGGTAGTTTAAAAAAGCTTCGTGATTGCACATCCGTATCACGAATGTTTGTGTTCAT
TGAATTCTCTTCTAAAAGCAATTTATTATGTACTTATTAGATTTAATATTATATTAAAGA
ATATTATTTATTATGTAATAATGAAATTAAATGAAATACGTAAGTATAGTACTTATTTTG
ACTCGATTCGTGAATGTATTTGTTGCATATGCATATGTTGTTTGTAATTATATTATAAGA
AAACCGATACATGATAATTTCAAGCAATATCGTAAAGATTAAGTCGAAAAGTCCATGGTT
ACGCGCCAAAAAATTTCGTAAAAATATTAAGAAAGCTAGAAAAAACATGCTGTTTTTCGT
GATATAAAACCAGTGAGATTTTTCTAATTAAATTTAAGCTAGTTTGCTAGCGAATGCCAC
TAGATGAAAAATAGGACGTACCGTTTTATTCGTCAAATCGAATTTGTGCCACAGTTGCTG
TAACTGAATAACATATATCACATTACATAAATTGGAACAATTTTATTTACAGAGTACAGC
AATGCACAAAAGTATTACAGTATTTTATGGGGAGACTCGTTCTTTTTAAATATACGTTTT
GAATAATTTTTAATATTGTCCATGGGTTCCACATACATCATCAGAATGAGGTGCTTTAGT
CTGTGTCGTTGAAATTATATTCTTTCACAATTTATTCAAATTCCATCCATAAAACTTTTC
AAACACATAAGCGAATTATATTGTACTTTAATAAAATAATTTAAATGTTTAGTGTTATTC
GTGCTAGTAATTTATTTAGGTATTAAGAAATTTACCTATACTTAAAATAGACGTTCATTT
GTTGTGTATAAAAATTCAACTTTTAAATTATATAAAGATTTACTTAATAAGATACAAAAT
TATAGAGACATAGAGATGAATAAATATTTAAAAATTTAACTGAACACGGTTATTCTGAAT
GATCCGGCCTGTAAAATTTAAATTTAGTATCACTCAAATGAAGGCCAAGTCCATTAGAAG
ACTCATCGTGTAGTGGTAACATGTATAATTATTTACACATCAAATGAACGATCTCTCTGC
ACAAATAAGTGCTAGCATTGTTGATAGTGAGACTTTTCTATTAATATTTACATTTAGCTT
TACACATTATAGATGTTCGATTTTATTGACTTGTTGAATAAAAGTATTGTATCAATTCAA
TAATAATAATCATAATAATAAATTTATTTCTCTATTACATTGTTGACGAATTATAGAGGC
GATTGAAAAATATGTAATAGCTTGATAACACGATGGATCCCAATAAAAGCGGGACTTGGA
CTGGAATGTATTCGAGTATGATTATCTCATACATTGCATTTATGTAGTTATATGCTGAAA
ACGTTAAAGTAGTTTTTCTTAATGTAGAACGTGCGAGTTTTGCAATTGCAGTTGCAAGTT
TGGCGAATTCCTATTGCGGAATTTTGGATTTGTTCAGCAAAATAAGTCATTGTACAATCG
AGAACCATTCGAGTATTTAAAAAAATAATTAAATAAAACTTGTTCAAGTGATTTATATTT
AAACTTTTGCCTTTTCAGCAGCTCACTACTTTTATTGTTACAAGAGTAGCCCAAAATATT
AAAAATTAGAATAAACAGACTGATGTGTTTATAAACACAAATAATGCCTATTTCATGAAA
TGCTGAAATATTAGTTAGGAGTTAAAATGCAAAACTTAAGTTTCTTATGCAGATAAAAGA
AACAGTATATGTTTATTTGCATTAAGTGAGATATAATCAAGTTAAGTATTTCAAACTGGT
TGCCTTACAAGTACATAATATTATGAGTGTTTAAAATTAAATTCGCAGAATATAATCGAC
TGAATGAATTGTGCAAATTCTTTGAAAATAGTATCGCGTAGTGCACTTTTGATGATTATG
AAAATTGTTATATTTTTTCTATTGTAATTAAACAGAATAAGATTCGCTAGAAATTCAAGT
AATGTAGCATACAACGCACACAGTAGCAATTTGATAATACAATTTTATATCACTTGTTGC
AAATTTAAAGATACAAAGACACATGTTAGCATTTATACTGTAGGTAGATGTAACAGAAAA
AAGTATTTTTACATGACTAATATCTACTTTAATAATTTTTGATGGAATTATTTGCAATTA
TCATTACTGCGTATAAAAACATTAATCTGAAAAGGTTACTGCAAAACAACCCTTGATTAT
AAATGTAAATAAATATTTTAAAGTAATGATATTATATTTTCATCTCTTAGTCATTTTTCT
TGTAACGTAGTAACTACTAAGTCTCCTTTAGATATTAAGTATTTAATATTCACAGTGAAC
ATTTACACAATTTGTATGTAATATATTATAACGTATACCAAAAAATTTATCAAATTCATT
AATTGGTCGGTAGTGTCACAAAAATATATTTATTATGAGCACTAATTGGGAATATATTAT
TGTGTGCGAGTTAAGTAGTGTAGATTTTATTGTAATGGTTATTAGAAAATTTATTAGTTA
CCATGAACTAGTGTGCGCTTGTGTTAAATGCGGTGCATTTACGCAATTCGTTGATAGTTT
AACATAATATATATATTTTAATATAATTAATTTCGTATACATTTGTATTTAGTAAAGATT
CAATATATGTAGAGTATTATTTTAATTTTAGTTGTTATTTGTCTGTATTATAATTTTAAG
TCAATCCAAAATTGACCTTTACATTTTCTCAAGTTTGTTTCTTCAATTTATACCGCATAT
TATTGTATTTGCATTGTAAATGTTTATCAAATGACTTAGATGCCTGTTGTATTTTTATTA
GAATATATTGAGTGAATTTATTTATAGGACAATAATCTAAAACCATTAAACTTTATTTTG
CAATAAAAATTAAACATAGTGAAAATACGAAGAGCGTTTGTAGACTTTTTTAATTTTATT
AATGACTATTAACTTACATACGCAAATCGTATACTTTGTAATTAAATTTTAGTCGATCAT
TAAAATTCGCATTTATTTGTTGTTCGTAAGTTTAAATAATTTTTTGTTGGATTGTTTATA
TTTTTATTTATTATGTTAAAAGCATTCTACGCTCCTTCCAGTATTTCTTAGAAGATTTAA
TACTGTAACCATAATAGCAATAATATTATCACAAACTATTAGTTGTAACTATAACTTAGT
ATACTATTTCATTGTTTGGTTTTTTATATAATCGCTTTTATCTCTAATATAAACTACCAC
TTCATTTATTAAGTAGTTTAGTTATAAAATATTTCGACTATGGATTTAAATGGAAAATAA
AGAAAACAAGCATATGGTTATCTGAC
(5966 bp)

- SilkBase 1999-2023 -