SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoIG_DN31372_c2_g2_i3
Scaffold_idBomo_Chr10
NCBI non-redundant
(nr)		BTB/POZ_domain-containing_adapter_for_CUL3-mediated_RhoA_degradation_protein_3_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0031463 C Cul3-RING ubiquitin ligase complex
GO:0043161 P proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0051260 P protein homooligomerization
Transcript
Level		FPKM:0.05 TPM:0.03
ORF EntryO_BomoIG12315_complete:A_BomoIG_DN31372_c2_g2_i3
Sequence
(Nucleotide)
GACCGAGCTTAGTTAATTCAGAGACATAAAACTGTTGACATTAGTTATAAAAATATCAAA
ATATATTCAGTAGTGCACATAGAAAGAAATTAGGGTACTAACACTTGTATATTCTATTAT
AATTTACCTATTTTCAGGTTTTTTCACCTGTTGAGTTACTGAACTTAAAAATAAAATATA
TAAAAATGTTTAAAGCAATTAACATACAATAGATCCGTTATTTAGATAATTAACAATCTA
AGAGCACCGATTACTAGTGTTTGGTAATGTGGTAACATACATACAAAATGGTACGAAGAC
AACGAGAACAAAGCACTACAGAGGATGAAATCGTCATTGATACACCACCTTCTAAAAAAC
TTAAGAAGCACAGGCACAAAAAGCACAAGAGAAGAAAGCTACAAGATGAGTTTGATAGTG
ACACTTCCATCGATGTATCATATGAAGATAATTTGGATAAACCCTATAAAATAAAATTAA
AAGGTGGGAGAGAGTTGCCTGGAACATCAGCTGCCGATCTCCTCAAAGCACAAACAATGA
AATCTGTACCAGATTCAAGGCGATCTTTGCCTGGATCTTCCTCAAGTACTCCTCCTAAAG
TAACTTCTAAAAAAAAGAAAAAGGGACGGGAAAGTGGAACTTCTAGCGAAGAAGAAAGAT
GGCTGGATGCCATAAAGTCTGGAAAACTTGAGGAGGTTGTTTAACTCAGTAATGTGTGAA
TTAAATGTCATCCTGTTAATAACTCCGTTCTTAGGCCTACTTTGGCTTGTCTAGTGTATA
TATTTTTTCATGCAAGCTATTATCTTAACTGGCCTCTTTAAAATGAACTGGCTTTCAGTT
CTCGAAACTGTAAGTCAGTTAGCATCTTTGTTTTTGGAAATTAGGATGGAAAATTTAATA
TATGTACTTGAAATTTTATATATACATAAGGGCTATAATCAAGTTATTTGTCAAAGTATA
TATGAATTATTATATTTAAAATTGCTCCTATCTGTGTATGGCTTTCTCAGTGTGAAAGCC
TTCTCCACTCACCTTGTGTTGTCCAATGAGCAGTGTGTACTAAATCTTAAAGATTCCGAT
TAACTTTTCACTATGTCTGCAAATGTTAAATGACATAAATGAGTGTCAATTTATTCTTCT
TTGACCAACTTACTTCCGAATTTGTATTGCAAAACACAGCTTTAAAAAGTTATTACTATT
ATTACTTATTTGACATCTCAGACAATTTTCATCTTGTTGCTGCTCTTTTCAAGTATTATT
TTCTAACTTTATTGTAAATATGTTTGAGCGTGTTATATATTTAAATATTAGCAGACTGAG
TAATTTGAGTACTTAATTTGGCATAATCAATTATACTATTATTAGAGTAGTATTATGACT
GATGAAATCAAAAGCTTTATTACAAGATTCAGGTTGTCTTCAGTTGCATAGTTGCAATAA
ACTTAAATAGGGTAATATAAAATAAAATACACAATATTAATGAAAAATGTTATTGGAATT
ATTCTAATGTGTTATCATTGTTAGGTTGATGAGGAACTAAAGAAGATAAAACCTAAAGAT
CCTAAAATGATGACAGCAAGGCAAAGGGCCATGTATGAGAGGGGAACAGATAAAGAAACC
AGCCCTGGAGGTGAAGTACTACTCGCCCTTCCCTCAGGTTACAAAGAGAAAGTAATGACA
GCAGAAGCAATTCAGAAAGCTGCACTAAAATCACAAAAGCGCAAACAACTTGCTGATGAA
AAACGTGAGAAAGACAAAAAGAAAACAATGGACAGACTTCTTAAAAAACAAGATTCTAAA
AACATAAAAAATATGCATAAGGGTAAACCCATCAAAAAACAGGAGCCCATGATTGTTTAT
AAAAATAATATCAATGAAATTTCCTTGGCTCTGCCCATTGGTATTGAATTCCCATTGGCT
GTGAAACCTCCAATAGCAGCACCAAAACCAATTATCTGTGGAGCTGATGGATGTGTTAAT
TTAAAAAAATATAATTGTTCTAAAACTAGCATACCTCTGTGTAGTTTAGAATGTTATAAA
AAGAATTTGAAAAAATAAACAAAAATGTACTTTTAATAATGGAAGTGTGTTTACGTGTAA
TGATATTTTGTTTCAAAATAATCTGGCTGCCTTCACTATGGTGATTGGTGACTGTAAAAT
ATGTATGGCAGTTGTATTAATTATGCATCTCTTTAAAATTAAAATAAAACAAAAAGTTAT
AGTGAGCTAGACAGTGAGCATATATTTTGAAAAAAGTAAAATGTAAGTTTTTTTATAGTT
CATCATTCATCATCAATTGCATAGATTAGTCTTAATAAAATTATAACTATAAACCCAGTG
TCACTGTGACTAAACACGCTCTAAGTAACAAGTTCACATTTACACAGCACAATGGAATTT
TTTAATACTAAAGTAACATAGCCTCTCAACATTCCTGACACTAAGTCATAGGTACAAACT
CGACACAAATAATATGCCAGGCTGCATAGGTGCAAGACTTTCCATTCGTAACAAAACATT
TGCTGTATTCGTAATTTTTTATTGAATTTTGAGTAAAATTTTACCATGTACCTGACTTCA
TGTACCTATACCATCTTGATCTCCACCAGAATTATCAGACTACACAATAGAATTGAAGAC
ATAAGACTAGACATTAATTCAACTACTTTGTCATACTTGTCTTTGTTCACATTACTTACA
ACTTATTAAGTGTAATGACCATAAAATTACACAAAGTTCATGCATAAAGGGCTACTAACA
TATGAATTATGTACACAGTATACACAAAAATTCATTAAGCACAGTTACACATTAAAGTTT
GCTAATTTTATAATTTTTTTTTATACATTGATTATATATTGTATTTTAACAAAGAATAGT
TTGAGTGATATTTTTGAGAATATAAATTACATAATAGCTAAATACTCTTTTGATTAATAT
TTAACATTGAACAATTGAATCTTTACTTTTTTTTTCACTAACATCAATTTGGCAATACTT
GAGCTATCAGTATATTTTTGAGGACAAACACTAATAGAGACAGTACACGGAATAAGTATA
GTTAAGTTTCTAAGAGAGTTTTTAAATATAGAAGTTTAAAGTCAGTGCATACTACATCAT
CACACATCTTAAAACAACTGCAAGTATTTAATTACTAGAACTTTTTAAACATTTAGTCAC
CAACACTTGAAGACACAGTAATATAGTGAAAAATCCCTACTCAAGTGTCACTTTGTTTTC
ACAAATCTTGGGTGCCTTTTTGTTATACCCACTTTTCACTGTCACATTATTTAGAGAGCT
CAAAAAGGGAAACCCAGAGACAAGAATGAGGCTCAAAACAGTCTACAGACCGAAGCAGGG
CAGCCAACAGAGTGGCGGAAAACAGCCAGCTTCATATCAAACATTTGTTCGTTTTGAGCT
GCGAAGGCGTGCCAGGCCTGACTGTAACCGCTAAGATTGATTATTCTGCTTATTTGATCT
AAGTCGGGCAAGGCCAGATCGCTCTTCCTCCTCATCACTAGTGCAAGACAATCCCCCAAC
AGCACCTCGTGATGAAGTAGCTTGAATTAAATCTTGATCAGGGCCATTACGACTTTCATA
AAGTAAAATTCCCAGTGTTTCCTCATATATCCTGGCCTCCGGAAACTCAACCTTAGTATG
CTTTTTATCTGTAGCATACACAATTGAAGTGCAGCAGACTTCAGCACATTTTTTTCCATG
TCCAAAGAAAGACCAACAACAAATCTCATTAGAACCAATAACATCTTTAATAAACAGCAC
TCTCCCGCTGAATCGCAGCGAAAGTTTGTCAAAGAGTTCAATGTTCTTTAGTAAGTTATC
ATCAGAAGTGCTCGTGTAAGAATACTTGTTATTGTGTCTGTTAATCAACAGTTTCACCAC
AGGCTTGGAAGTGGACATAATTAAAAGTTGTTCTTCCTTTTGTGAAGTAATTAAAGGAAC
TCTGCAAATAGGCTCTGCCTCGCGTTCTTTTTTGGCTAAGGCCTGTAGGCAAGATTCAGT
TAACTCTTCAATCAGGAAATATTTAGCCTCCGCCAATAACTCCATGATCTCTTTATAACT
GTCGGGTAGCGCTACTGTGCCGTCACGAAGATAATTCAAAATAGTACCGAAATGCTTCCC
ACAACGATCAATCAAAATCCACCCTTCCGAATCTGTGAGAACCTCCATCCTCCCACTAAA
CATGGTTCGCAACATGTTATCGCTTTTCGTAAGCGTGCCGATAGTAGTGTAGAACAATGT
GCCGCCCACATTTAACTTCACATATTGTGACGGACTGCCTTTTAACAACGTTTTGTGATC
TCCCGACATTATTTCAAAACGAAGAAATAACATCAACGCGATAATACGAAACGACCAGTA
CACCCGGACTCTCAACTATTTTCTTGTTCCAAATGTACCTATACTACATTTTGTGCAGTT
TCAATACCATAAAGTAGGGTCATTTAAATTATGAACTGCAGAAATGAGCATTAGCGCTGG
ATTATTAGTTAATCCAACATTCGATTGCAATTAGACAAGCTACGGATATTCAAGAGATTT
TG
(4562 bp)

- SilkBase 1999-2023 -