SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoIG_DN31337_c0_g1_i7
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		schwannomin-interacting_protein_1_homolog_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0008150 P biological_process
GO:0042802 F identical protein binding
Transcript
Level		FPKM:0.42 TPM:0.23
ORF EntryO_BomoIG12398_complete:A_BomoIG_DN31337_c0_g1_i7
Sequence
(Nucleotide)
CGGGACAATAGAAACACACACCTCGAAATGTTAAAGTCGCTCATGACGGCGGTATTTCAA
TTTTTTTAAACCAGCAACACTAAATGGTACGATTTAAAATAATAAAATAAATATAACTAA
TTTAATTTTATATGTTATGGATGGTTATTTTGTTCAAATGGTACATTTGAAAGAGTCAAA
GGGTAAATTTGTTTATTCAAGAATATATTTAGTGTATCTAAGAAACACGGTCCAAGGTAA
TAATAATTATACTCTAAAACAACAATATCGGTCATGGAATATCATTCGATTACATTATTT
TAAATATCGATTAAAATTCTACACACAAATAGTATTTGAATAGTATAGAGAGGTAACATT
TTATAACGTTTATATGCTGAGCGGAAGGAAACATGACTTCAACTAATCTAGAAGTAGCAC
TGTTAAAGATACTGTTTAAATGTACATCGAATGTTTTATTTTTAATTGTTTCCAAATGTA
ATCGAATCCAAAATCGATTTTAAAACGATTTTCCGTCAGTGATTGCGTGAAAATTATGAA
CTACAGTTTTCACGCAATAACGATCCGGCTGTAAAAAAAATGTTCTTTAAAATTATTAGA
TTATTGATGTAGATCTCACTCCGATGACAGAATTGGGCAAAAGGAGAAATAATAATGATA
TCAATACAAACATTATGCCAAATTAGATTTTAAATTAACTTACAATTACTGTTGTTCTAT
CGTCAATGTCTGTTCACTTCCGTTTCCTTCCGCAATAGAATTAAAGTCAAAAATTGTAAG
AGTAATATAGTTTAGACATATTAATTTACAAGACAAATGGTTAAATTTCAGGAGAGCAAT
TTAATTAATGGCCTTTACTTTAAGTTGGATACCATAATTACCTTGTGTTGTAAGCACCGT
TTAAGTCATCACTCAGAAAAAGTCGCACATAATAATTTGATCTTTCAAAGATAATTATTA
TAAGAAACGAGATTTCTCAGAATAATAAACTTAGACGGCAGCGATAATTTAAAATTTTCA
TTAAATACAATATTATCATAACACATAATCTAATCACATATAAGCTTCACTAATTTATTT
TACTTCACTAACGATGTAAGCCTCTTCATACCAGATTTGGAGCCTTTTGTCTTCTTGGTT
TGCTCTTTTACACCCAAATAACGAGTGAGATCCTCGATGTCAACGAGCATGGAATCTTGA
CCCATGTGCAGCTCGTCACGAGCCATCAAAAGTTTCACCAGACTGTCGTTTAGCGATTCA
ATCTGCGAATGCAACTCGTTCACGATCACCTGCAACTGTGCAATATTCATATCGGTGAGC
AGCTGTCGGGATACCCGACGTCGATCAGCAGCTAACGGCGCGCTTGCCTTCTCCATGCTA
CGTCTTAACATTTCGGTCACGGGCGACACCGGACGGCTGCGACGTTCATGCTCCATTTGA
ATACGTGCCATTTCTTTTGCTTGGGCCAGCGCAATCCGCGCCTCGGTCTGAAGTGTCGCC
TGTAGTGCATAAAAATCTGACTCTTTCAGCTCAATATGACCCAACGAGTGTGAAGAACGG
GACTTATTATTCTTTTGTAAAGCTGATGGACGCAATTTCGCACCGCTCTGAAGAGTGCTA
ATTTTGTCATGTTTTGTTATATTGACCGACAATGGCCTTGTCTGATAAGGATGGTTATAG
TTTAATTTACTGAAAAGACTGGATTGTGAAAGACTTTTTGTTTCATAATTTACATTCTTG
TCCAAATCTTGAAATTCATTTTCCGATGCTGTTTCATTCATAAAACAAATTTGCAGATTC
ATCCCACTTTGAAGTCGAGACTGTAAGCTAGGTTTTTTCCCTGGGCGCTCTGTGTGTCCC
ATACTGAAGTATTCATCTGCATCTGCTCCCATAGCCAAACGCCTTCTAATTTCCTCTCTA
TCATTACGTTTCTGTAATAAATAAAATTATGACATAGTCCAAATTATTTTAGATAAGAAT
GTAAAACCAATATTCATTGTTTTGTATCATTTTAAAACACAATGGAGATTTAATTAAATT
ACTTTTTTATCATGATATGGTGCATAGTCAGTAATAGTTACAATCCTAGTAAATTTATCT
AATAAGTTAGGATTATTGTCTGTTATTTTTGGCCATTCAATTTCAGTTTGAGCACACCCT
GCAACACCATTAGCACGTGGACTTAACGCTATATCATCACATTGGTCTATAGGGGGATTC
TTGACATCTGGTTTTGTTAATTTTAACTTGAACAGGTGCAGTCGTTTTTTAAGTCCTGTT
TTTTCTACTGTTTCACAATTATCAGCAGTCTCCGGCGACGGTTTGGTAAGCTTCCGCCTT
ATATTAGTAATTAAGCTCTCAAACATAATAAATACAAATCAGTCTTCTTAAATTTGGCAA
AAATATGGCACGTTTTGTTTATAGCACACAATGGTAAACAAAAAAAAAACGACGTTATCC
TTTCTTGTCAATCCCGTCAATGTGACATTTTAGGACAAGGTCACACATTTACAGAATGTT
CCATTTAATTTGTCTATGGAACTCAACCCAAACTATATTAATTTGGTCAGTTTATCTGTA
TGTCAAAAAAAGGTTTTACGATGCTTATAGAACTTACGAGGCAACAAATATTA
(2633 bp)

- SilkBase 1999-2023 -