SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoIG_DN30792_c0_g4_i1
Scaffold_idBomo_Chr15
NCBI non-redundant
(nr)		GRIP_and_coiled-coil_domain-containing_protein_2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000042 P protein localization to Golgi apparatus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005802 C trans-Golgi network
GO:0005829 C cytosol
GO:0006622 P protein targeting to lysosome
GO:0006810 P transport
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0031023 P microtubule organizing center organization
GO:0034067 P protein localization to Golgi apparatus
GO:0034453 P microtubule anchoring
GO:0034499 P late endosome to Golgi transport
GO:0070861 P regulation of protein exit from endoplasmic reticulum
GO:0071955 P recycling endosome to Golgi transport
GO:0090161 P Golgi ribbon formation
Transcript
Level		FPKM:8.90 TPM:4.95
ORF EntryO_BomoIG100784_complete:A_BomoIG_DN30792_c0_g4_i1
Sequence
(Nucleotide)
TGCAGTAAGCTGAATGCGTTACATACATTCGCATTAATTTCAATCAATCAACTGTAACAT
GTCATGGTATATAAATTATTTTATTAGTGATAATCATAAATTTAAACTAATTTTACGATT
TAATCTCGCGTTTAGTTTTTGTGGTCATCGGACAAGTAATCGTCAGACATTAAACCGTAA
AGTAGTTTTGAATGAAAATACAATAATAAAGAAATATAATTCGTGTTATAATATTTTTAT
CATACGTTTGGGTGTATCTTAATTCCATCATAATCTCTATTGAAAATGCAATAAATAAAT
TTACATTTAGAAAATAATAATAGTACATATCTGACTTCTTTGTTATGTTTCTTTCAAATT
CCAACCCGGTGATGGCACAGTTACCCTTGTGATTAGGCGAATAATTGTGGAATGTATGGT
AATTGAAAATGAAATTAACATATTTTTTTAAACTTAAAAAAAAGAAAATGTAAGCTTCTA
TTTAAAACACTTCCCTTATATTCCGAATTGAAGTTTATACAACATAACATATTTTTTCAA
AGCAGCCACACTGATTGACCGCTGTTATTTTAAAACTAGAATAATACAAAATTATATTAG
TAGATATATTTTATTAAATATTTACTCCTATGTTATTATTAAAACGCTGAATTAAGCCGC
TTGACAAGGCGAAACATACGTTTCGATCACAGATGTCACTAGTGCACGAAGTTACCGGTG
TATTTACCGATTCATTTCCCTCCAGGCCACGGCAAGTAGCTTCCCCATCCTTTACTCGAG
TTTGGATCTAAACCTTTTGCAATCGCTTGAATTTTTTGAGTTTCGTCTGGCGTCAAGGTC
AAAATCTTCTGAAGAACTGGGACAAGTCGAATACGCTCGTCACCGGATGGAAGGGTTAGG
AACTTGAGAGTGACGTTCTTCATGTACTCGGTGTTATGTGCATTTTGCGTGGTCCCTCTC
ACCCGACGCAACTCTGCCTTAAGGAGTTCGCTGAGCTGAGCCATACGCGCGCATTCTCGC
TCAGACTCCGATAGCAGCACCGTGACGTGCTTCACTCTTTGTTGTTGAGCTTGTAAACGC
CTTTTTAGATCGGCCACCTCCTGTTCTGGGGTGAAGCCTAATGAAGACGTGTCGAGCGCT
TCATCATCGGGCACTCCTTCCTCGAGCAGTCGCTCCAGAGGGACCGGGGAGCGACCACTG
CCCCCGCCCGTGAACGGTTTAGATGGTGGAGGAGACGGCGCTGACTCTGAACCCTCTCCT
TCTTCTCTAGGTATCATGGACACATTAATCTCCAGGTCTGTTTCGCTGCCATCATCTTTA
TGAATAACTGGCAGCATATATTGACTGGATGATTCAATAGGAGCACTGGGCCTGTTAATT
TTCGTGTTCTCCTGGGCCAAAGCCAACTGTTTCTTGAGATTTTCCGTCTCGTTTCTAAGC
TTTGTCTCCAATTCAATTATTTGTGTCTTATAACATTGGGTTAGAGTTGAAACCTGTAGT
TTATGTTGCGTTCTTTCAGAATCTAGTTGGTGGCCTAGCCGCGTGAGGTCGCCCTGCAGT
CTCGCGGTGCGTTGCTGCGCTCGGCTCGCTTCGTTAGATGCTTCAGCGGCACGTCTCCGC
GCGCTCTCCGCCTCGCTTGTTTGTAATTCACACTCCTCCTGTGCAGTTTTTAGTTTAGCT
GTAAGAGTCTCGATCTGCGCTCTTAGCGCTGCTGTTTCTTCCTTCAGTTGTTCTTCTTGA
CTGTGGTCCACGGTCTGATTCTGTCGTAATACCGCCTGAGCCCGCACCTTATAGCTTGTA
TATTCAGTTTTCAAATCAGCCAATTCAATATTTAAAATTCTTAAATTTTCGTTTAGCTCG
GCACATTTGAATTCCAACTTTTTCACCTTATTACTTAGTTCCACTTTTTCATCTCCTAGA
GCAATTATAATCTTTTCTTTTTCACTTAGAATTAAAGTCGTTTCAAGATCACATTCTTCA
TTTTTATGCTTCTCATCTTCAAGATTTTGTTCTAGCTTTATTATGATGTTGTTCTTTATC
TGAATCACATCATCTTTCTGTTTGAGACCTTCAATGGCTTGCTGAAGTTCCTCTTTCAGG
AGCCTGTTTTGGGTTTCTTCTGTATTTATTTGATCCTCTAGTAGTTTGATTTGTGTTTTC
ATCGCGGTAATAGTTCCCTCGTGGGTATCTATTGTCGATTCCATCTGAATCATCTTTTTC
CTATTTTCCTCCATCTTCGACGTAAGTTCTTTCATTGACCTTTCGTAGTCTTCCATTTCA
AGACTTAGGACATTTTTCTTCTTAACATCTCGTTTAGCCTTTTCTAAATTCTCCTTGGTC
ACCTTATGAGCTTCAATTTCCGAAGCCAACTGTTGACTTATAGCGTGTAGTTCAGCTTTT
ATCTTCTCGATTTCAGCATTGTTCTTCTCAGCTACATTAATAGCAGAAGTTAATGACTCT
ACTTTTTCCTGTAACATAGGTACTTCTAATTTTCCATTTTTATGTACTTCCGCGGAATTT
TCGTTTATTAATTTTTCAAGTCTGACTTTATCTTCTTCTGTTTTTTGTAGTTGAGTTACA
GTTTCAGTCAGTTTTTTCTTAAGTTTTAATGCAAATAGCCTCAGTTTCGTATACTTTTCC
TCAAAAGTTTCATCTAAATCTCTCATTCTCGCAGTTTCATCTGCTTTTGACATGGTAGAA
GTGGACATGTTATCTTCGTTTGGAACCTCTGATGAATTTAGTGACTGATGTTTGAGTTTC
TCAATTTCATCTTTTAAAGATATTATTATAATATCTTTTTCTTCCAACATTTTAATAGCA
CTATCTCTTTCAGCAGTTAATGTATCGGTAAATTCATTTGTTTTCGTAGAAGATTTTTCA
GCTGTTTTTATTTGGTTTTCTAATTTTTCAATTTTTTTAGTTAGTTCAGTGTTGTTGTTA
GTTGAAATTTCTCTTTCTTTTTCCAAACTCTCGATCAACCTTTCCATTTCAATAATGGCT
TTTTGCAATTTTGATATAGATTCACCGCGTTCTTTTAAAACTTGATTTATTTCTTTCATT
TCATTCAATAATTCAGTATTTTCAGTTTTATAGCTTTGCAACTTTGATTTAGCTTCTTCA
TATTCAGCAAACAGAGAATCATATTCTTTGATTTTAATTCGAGATTCTTTTAGTTCCACT
AAAAGCGCTGAATTCTCTTGTTTATATAAAGACAATTTTGTTTCTAATTTTACAATGTCG
GCCTGTAATGATACATTCAAATCAGAAAAATTTTCAGTATCGTCGCTTGGTTGCTCTAAT
GACAGTTTTAAAGTATCTACTTCTTCTTTCAGTAGGCTGTTTAAATCTTGCAAGTCATCA
AACTCTTTTTTCAATCTACTATATTGTTCCTGCACTGTCATCAAATCGCACTTTAATAAA
TTTACTTGACTTTCTTTTTCAGCTGCAAAGTTTTTCTCGAGTTGCAGTTTTTGCTGTGAT
AAAGTATCTAACTTCGAATTGATAGTCTTATTTTCAAAAGACATTTTGGTTACTTGGTCA
CTTAAAACTTTATTTTTGTGTTCCAATTCTATAATACTATCTTTAGCATTTAGTTTTTCT
TTAACTAAAATATCCTTTTCGCTTTCTAAAGCCTTGAGTTGGAGTAATAAGTTTTCATGG
TCTTGATTGGTTTGCATTGTGCTTTGAATTGACTGAGACAAATCGTATTTTGCATTTTCA
AAACTTTCTTCAAGTTCGATATTTCTGCATTTTATTTCACTTAACTGTTGTTTAATTTCG
TCTAATTCTTTTGTTAATAATTTTTCGGCATTTATATGTGCCGGAAGTTCCGTATTAATA
AGGTGCTCATAATTACCCTGCACTTCTGATAAATCTTTCACTAATTTACGATTTTGATGT
GATATTTTCTCAAACTCTTGTTTTAGTGTCATATTTTCAATTTTTAAAGTCTCATTTAGT
GAGTTAGTTTTACTCAATTGTGATTCATCAATTTCACCTTTGCTTAATACATCAAGTTGC
GACTCCACTTGCTGTAATTTATCTCTTAAAATAGTATTTTCTGACTTAAGGTGATTAATT
TGAATGTCCAATTCTTTTGATGCTTTTATTATATCTTCTTGCCACTTAGGGATATTTTCA
GAATATTCTTTCACTGTTTTGGCCAAAATAAATCTTGTATTTTTAAGTTGATTTATACAA
ACTGCACATTTAAGAATCTTTTCTTTGTAACTCTTTAATTTAATATTCAATTTTTCTTTT
TTAGCTTTCTCATTTTCATATAGTTCAGTGAATTCTTGTACCTTATTTTCATAATCGACA
ATCTTTGTTTGTTTTTCTGATTCAAGTTTTTTTTCTAAACTTATAATTTTCAATTGAAGC
TCTTCTATTTGTTTGCAATTTTCTGAATCTTTCTGTACATTTTCTTCTAAAATCTTTAAT
TGTTCCTGCTGCTGAAGACCTATATTGTTCACCTCCACAGTTTTAGCTTCAATTTCAGAG
AGTTGATTAATCAGCTGTTCATTTTCTTCTAAAAGTCTAGTATTCTGTCTTCGCAATGAA
ATTATTTCACAATCCAGATCTGATAATTTTTGAGATATCATGCATATTTTATTGTCCTTC
ACAATCAAATCAGCTTTGTACTGCTTTATTTCTTCATTATATTGATTGACTTTTTTATTT
AGTTCTTTTACTTTTGTATGAGCTGAATCCACTTCAGTTATGAAGTTTAGTTTTTGTTCT
GTCAAAGAATCAACAAGCTCTTGAAGAGTTTTTAAATTTTCTTTGTTATTTTTTTCACTA
TTTTCCAATTTCTCAACTTTATTTTTGTTAGTTTCTAATTCAGCTTGTAATTCTGATTTA
GCTTGCTTAGCTTTCTGAGCTATTACAAGTAAACCCTTGCATTTATGGATCAAATCTTCT
CTGCTTAATTCATCAAAAGGACTCTTTTTTGGTGGTCCATCTTGACTCGGATGGTTCTGA
ATCGCTTCCATCATGAAATTGATTTTCTAGTTAGGAGCAAAACCTATTTGTTCATCTCAA
TCGGGAGTTTATATTTGAAAATATTAAATAGGTAGGTACTCCATTCAACAATATTATTTG
ACTACACGTATTATTATTTACTCCATAAGGCCCTCATAAGGGTATAATCTATGTTTACTC
CGAAGAATTAATTGACAACCAGCAGTCTTTTAGCATAAGTTATCTATGACATGACCACTA
GTGTTGCTTT
(5230 bp)

- SilkBase 1999-2023 -