SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoIG_DN30257_c0_g3_i5
Scaffold_idBomo_Chr13
NCBI non-redundant
(nr)
semaphorin-2A_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0001755 P neural crest cell migration
GO:0005515 F protein binding
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005615 C extracellular space
GO:0005829 C cytosol
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0007399 P nervous system development
GO:0007411 P axon guidance
GO:0007431 P salivary gland development
GO:0007629 P flight behavior
GO:0007632 P visual behavior
GO:0012505 C endomembrane system
GO:0016201 P synaptic target inhibition
GO:0030154 P cell differentiation
GO:0030215 F semaphorin receptor binding
GO:0030335 P positive regulation of cell migration
GO:0030534 P adult behavior
GO:0042756 P drinking behavior
GO:0045499 F chemorepellent activity
GO:0048843 P negative regulation of axon extension involved in axon guidance
GO:0070983 P dendrite guidance
GO:0071526 P semaphorin-plexin signaling pathway
GO:0071678 P olfactory bulb axon guidance
GO:0097374 P sensory neuron axon guidance
Transcript
Level
FPKM:5.60 TPM:3.12
ORF EntryO_BomoIG16_complete:A_BomoIG_DN30257_c0_g3_i5
Sequence
(Nucleotide)
GAACCGAACTGAGTTGAACTGACTGAGTCAGTCGGTTTCAGTTCTCGACGTTGCGATGTC
GGTGGCGCACGTCACGCCCGTCGCACACTCGCCACTTTATGTTACGACGATCGCGGCGTA
TTTCTTTTCAAACTAATAAATCAGCGCAAGTAAGCCCCCACGAACAGATTATAACTCGAT
ATGCGATAACAAACTCGCGGGACGACTTCCCTCATTAATCACCAAATTCCGTTCGAATCA
TCCGAACGGAAGCATAATCTCTTCAATTTCGGTTTGGTTTGCGTAATGTAAACAAGTTGG
GCATTGTTCGAAATTATCAGAAATAGTTTGTTGGATTTGGGAGTCCATTGTATTGTGGAC
TTATGTTGACGACTACTTTTGATTTACGAAAGCAAACTGTAGTCTCGCCATAGATGTGCC
GGTAAGGACAGTGTGCAGAATGGGTGGCGGTGGACAATGGACAACGGGGATACTGTGGAT
AGTGGTGGCGGCTGCGTTAGCGGATTCTTGGACAGCGTACCAGGAGCAACCGTGTTGCCG
GCCGGTGTCACACCACCGCGTCCGACATCACCGAGATCACATAAGAGAGTTTTCATGTGG
TACACTCTTTTATCGTACTCTTTACATGAACGAAGAGAGAAATACGCTTTATGTTGGTGC
TATGGATCGTGTATTCAAATTAAATATGTCTGATATTAGTCAATCACATTGTGAGAGAGA
TGCATTGTTATTAGAAGCTAGTAATGTAGCGAGATGTGTTAGTAAAGGAAAATCAGAGCC
TTTTGAGTGTAGAAACCATATTCGTGTGCTGCAGCCGCTGGGCGACGGAGAGAGGCTGTA
CGTTTGCGGTACTAATGCACATAGCCCCAAAGATTGGGTCGTGTATTTAAATTTAACGCA
TCTACCTCGGCACGAGTATATACCGGGCGTGGGCCTTGGTGTGGCCAAATGTCCATACGA
CCCTGCGGACAATAGTACTGCAGTATGGGTCACCGAGGGCAATCCTGGGGAGCTTCCAGC
TTTGTACGCTGGTACCAATGCAGAGTTCACGAAGGCTGACCCAGTTATATTTCGTAATGA
TCTCTTTGATTTTCGGACTGGTCAGAAGAAATTTAATTTTAAGAGAACATTAAAATATGA
TTCCAAGTGGTTGGATAAAACAAATTTCGTTGGTTCATTTGATGTGGGTGAATATGTTTA
CTTTTTCTTCCGCGAGACAGCGGTGGAGTTTATGAACTGTGGTAAAGCAGTATATTCAAG
AGTAGCCAGAGTTTGTAAACAGGATAACGGAGGGAAACATATCCTCAGTCAAAATTGGGT
CACTTATCTTAAAGCAAGACTTAATTGCAGCATACCTGGAGAATTTCCTTTTTATTTTGA
TGAAATACAAAGTGTACATCAAATACCGGGGGATACGAGCCGGTTTTACGCGGCGTTCAC
GACGGGCGCCAGTGATGGCCTCATAGGATCCGCGATATGCACTTACACTATGGACGATAT
ACAGGAGGCTTTCGCGGGAAGATTCAAAGAACAGGCTTCGTCAAGTTCAGCATGGCTTCC
AGTGCTGCGAGCTCGAGTGCCAGTGCCACGTCCCGGCACTTGCGTCAATAAAACCGAAGC
TTTACCAGACAATGTCCTCAACTTTATAAGGTCTCACCCGTTGATGGATTCAGCTGTGCG
ACACGACGGTGATGCACCTGCTTTCTACAAGCGTGATCTGGTGCTCACCACTCTTGTAGT
AGACAAACAGTTTGTTGACATGCTGGGAGATGACATCACGTACACAGTATTTTATGCCGG
AACTAATGCAGGCGAAGTATATAAGATAGTGCAGTGGGCGGGAGGGGGCGCTCGTGTGGC
TGATGTATGGCTGGCCGCCGCAGCAGAGCCTATTCGCGCCCTCGCACTCGCACGCACTCA
ACACGCGCTGTACCTAGCCACTGATCATAGATTAAGAGAACTACCACTAAGAGCTTGTGC
TCATCGTTACGATAGCTGCGTGCGTTGTGTACTAGATCCGTACTGTGGTTGGGACAAAGA
AGTAGGGGCGTGTCGTCCGTACACTCCCGGCCTACTTCACGACGCCACAAACTCAACTCC
TTCGATATGCGAGGCTAGTGCCCCTCTGAAAACTGTGAAGGCGAGCTACGGCCAAAGCGT
CCATTTAGCGGCCTTCGGGAAGACGCCGGATGCACTGAAAGACCAATACGTCGTATGGTT
TCATCATTCCAGAGAGAAGGGACGGTACAAAATTAATTTCAACTGGGATCGAGTGCTACA
AACATCGGAGCGAGGTCTCGTTCTACTCTCTGTGTCCGACTCGGACCGAGGCCGATACGA
ATGCTACTTTGGACCTTCTCTTGTGGCTTCATACAATCTAGATATTGATATACACAGGTG
TACACAACCGAGTAAAACTCAAGAATATAAACAAGTGTATTCCGATTGGTGTCATGAGTT
CGAGAAATACAAGAACGCTATGAAAGTATGGGAGTCACGGCAAATGCAATGCGCGAAGGG
CATGAATGCATCGAGTCAACAGAACAGTATGAACAACGAGCTCGTTGCGTCGCTGCGGTG
ATACAGCACAGTTAGTGATTAATGAACGATTACTCACGCCCGATCCACTGATCACACAAA
CTATCCGATACACAGATTCCCATAGTAATTTTGAGATCCCAATCTTTTCTGATATCTATC
GTTAAGTATAATATTTTTTACGGCTTTCACGAGTCGTAGTCGTAATTAAAACTGTTTCTA
CAGATTGATTAATCTCGCATTTTTTCTTGTCATTGTACTAATATATATCAAAAGTTCCGA
ATACTTTACAGTTAATGTCTGTTACGGTTAATTTTAGAACAGTTTTTAAAATTAGAACAA
CTAAATATGTGTCTCATGTGCTTTTTCTTTCGCACGTGTTTTGGTTTTTAACTACAAACG
AAACGCCTGAATCGTATCAGCCGGCCTGCATTTATTTTCAACGCTTATATTAACAACAGC
CGACCGGTTGTTTCGAACCGTTCATTCGACATCATAACGTTCCTTCTGTCTCACAATATC
CATTAAACAAACATTTCCACCGCTGATTCTGATGTTAGTAGGTCAGAGATCGAATATTCA
TGGTTCGAGAAGTGAAATCGAAAGGGGAGATAATGCAGCGAGGGGATGATCTGTTAAAAT
AGATTTGTTGTTCGTTCGCGGTGTTCTCCTCGTGTTGATGGATCACTGAATGTACGACTT
TTACCCGCAACTTTTCTTTGTTGATAAAACATTGCACAGATAAATGGATCTTGTTGTTCA
AATTCCCTTAATACTCGTAGAACGGTTTGCATTAAGCAATTTGTGTAATGAATTTTTATC
TGAAAGTAATTTTCCATTTTTTAAATTGCCATCATTTTATAGAATAACGGTTGCAAAAGT
ATAAATGCTTTTGATCATAGTTAAACAGCTTGCATAAACTATTAAGCACATTTTCGCATA
TGACCAACAAACATAAATTCATCAGAAAAATATCGGATAGTTTGTAAAAACGTAGACGTT
AAATTCTTTAAGCCATTAAGTACTGCTTGATGAAAGCGACTGAGTGTAAAGTGTAATTTA
CAGTTAACTTGTTTCGCATATGTCTTTGTTGCATTAAGTTTAATTAAAGTTTCATTAAAA
CTTCGATGGAACTTTCGTTTAGTTTTTAGATTGACCTTTCGACTTTTCGCAGTTCAGTAA
TTTTGAGTTTATTTCTATAATACATCATGTTTAATTTTGTTTATGTGGTAATTATAGTTT
CAAGAAAACGTTAAAGGCAAATGTGATTATTGTAAATATTTGGATGATCTTAATAAAAAT
TATGAGGGTTTTGTACCATCAATACAAAATACTGTGATATCAGTTCTTGTTAAAATTTAA
AACATACAGAAATAAGATTTAATTGGACAATTCATTTATCATTTCAGATGGTCGAATTGG
ATAATTAACTCTGTAATACATTGTATCGAAAGTTGAAATGATTGAAGCAAATATTTTTCC
ATTTCATGTTTACAAAAAAAATATTGAATTATGTATAAATTATAACTACGGAAACTTGAA
ACGAAATACGCTAAGATAAACCATGCTAATGGGATTTAATGAAAGTTAAAGCAAAAAAGG
TTAAAAATTAAAGCAATATTAACGCCAATTTAGACGTAAGTTTAATGAATGTAAGGAAAA
GCTTATTTGTACGTAAAGTGTTGAAGCTTAGAATTATTATTGTGACCTCGGTTAATGGCT
CCACACTCACGCAGCGAGTGTTCGATAATGAATGTGTACAATTCGCGGTTCTTTATACAC
CTATGGTCGTCTCCTGCTCTAGTTATTCCTGAATCTTAAAAGATGTGACGAAGTGAGTGT
GGATTCAGTTTTAAATTTCATTATGTTTAATCGATGTTTATAATTTGATCACTGTTCTGT
TTTGAATACTAGCGGTTTCTGTTTCAAAATTTGATGTTACAGTTTCGTTGCCATAAAATG
TAATTTTAGGCCGGACTTCGGACTTTGAAACCGAATTTAATAGTTGTTTATGTTAATTTC
GGTTGTGTTTGTAAAAATCTCGCTAGAATAGTGCCTTGTGAAGCATGCTTACATTGTAAT
AAAAATCTTATTAAAATTTATTATTGATTAGATAGTATTTTTGTGTACCACTTAAATGAA
ATTTGATGGATGTAGGTGATAATTTCATTCGTGAACAAAAGCAATAATGATTCACTTATA
AGGCTCCAGTATTATATAAAATTAAATACTTATATGCAACGGTAAGATAGTTATGTACTT
AAGAGAAAATATTAGTGCTAGTGGTAAATAAATTATAATTATTTAATTATAACATGCTCT
TCTAAAAACCGTTTTGCACCCAAATTATTTAGTGCGGTAGTTTTAAGATATTACTTTTTA
TGTTTATTGTTATGAGTATTATTTTGCATCTACCTAATTTTAAAGCTGCCAATGTAATTC
ATGGAAATGTAAATAATGATACAATTATATATTTAATAGATAAATTCGCTAATAAATTTC
GTTTATGTAAAATATATATTGTAAAGCTTAAACATAAGCAATTGTTTTATAAAAAGAAAA
TGGAAATAAACTATTTTAGATCTAAAAAAAAAA
(5133 bp)

- SilkBase 1999-2023 -