SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoIG_DN29881_c6_g1_i8
Scaffold_idBomo_Chr12
NCBI non-redundant
(nr)		chitooligosaccharidolytic_beta-N-acetylglucosaminidase_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000272 P polysaccharide catabolic process
GO:0004553 F hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds
GO:0004563 F beta-N-acetylhexosaminidase activity
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005975 P carbohydrate metabolic process
GO:0006032 P chitin catabolic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016798 F hydrolase activity, acting on glycosyl bonds
Transcript
Level		FPKM:2.42 TPM:1.35
ORF EntryO_BomoIG103376_complete:A_BomoIG_DN29881_c6_g1_i8
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTAACTCAAATATTCCACTTTTTTTTTAATCACCATCGTTTGCCTTACAACTAA
TGAGAAAATATACAAATTAATCACAGTTTATTTAATGGAAACTCCTTGCTGAGTCAGCGT
GTTATCCTCGTACGTCTCCAGTACGTGGGCCAAATGTTCATTGTCTCTTGGTTTCTTGAA
CTGTCTACGCTTCTGCTTGGCCTTCTTCCGTTTGGGAGCAAGCATCTTCTTTGGCCCGTG
ATCCTGCATGGATTTGATCCCTTGCTTCTCGAGGTACTCCTCGATCTTCGCGTCGTCCAT
CGCGTCCACCGCTGTTGCACGCCATAATTTCACGAATTCGTCATCTACGTCTAATGTAGC
AGTCTTATCATTGTAGAATAATATTTTCTTTTTATCAGTGTGCCTTGTTATATACAAAAT
CTCTTGTGCCAAATGTTTCAGTGCTCTCTCGCAGTGAGGCAGCGACTCTTGAACATCTTC
CAATAATATACCTCCCAAGCCTTTGAGGTCTTGTTGCTTAAGTAACCTCAGTAAAGATTT
TTTATCTTTTATTTTATAAACCGGTTTGAAGTTAAACTTTCCATCCGGAGAGCATTCGAT
TTTAGGATTGCTCTGTAGGGCTTCTGTTTGTAGCCACTGTTTTATTTTATTTCCGACATC
CAATTGATTTGTCTCATCTAAAATCTCATCTAAAGACAGTGGATGGTCATCTCCATCTTG
ATGCCTTGCTCTCATATGCCGTACAATACGCGCTAGCACACCAAAGCGATAGGACGAGCT
GCCAGTCATAGTCTTGTAATTACTAGCATCAAGCTTTGGTCCGGAGCTGACTGAGCTGGA
TGATTTCGATTTCTTTTTGCTGTCATCTTTGAATTCAGAGTCATCCCTTTTCTTTTTTTC
AATGCTAGGGCATGCCAGTCAATATAATCTTTAAAAAAATAGGGCCTGTGCCTTGATCAT
ATTTATCTAGAATATTGGCTGCTATTAAATTAGGAAAGATATTATATCTTATTAACATTT
AAATCTTCTACTTTTCTCTGCACAAGTGATTTGTTCACATTTCTACTCATTTAGTATTTC
GAAACACATATTTCCATTCATAACTTTATATAATGACTCAGTAATGAATATTGCCACAAG
GAAGTGAATTGATAGTAATTGTATGGGCTACGTGAGTGACAGAGAAAGTGTGCGATGGAT
GCCAGTATGTCTCCAATCATTGTTGTGGACTAGCGAATAGTTTAGTTAAAAATAATGTAA
CAGACCTCGGGGTCGCAAGTGCCTTCTTTTTAAACGCTTCCCGTTCCCGTAAGAGCGCCG
GGTCCATATTTTCGTCTTTTAAACACAATCACTAAAAGTAAAAGATGTGGCTTCAAGCAA
TTTGTATTTACACCGTCTTCATAATTATAGGATGCGGGATTCCGACGGCAGCCGAAGAGC
ACTCATTGTGGAGATGGACGTGCGAAAACAATAGATGCACGAAGATCAGGAACGAGCCGG
AGAATAAAGAGCCTGTCCTCAGTCTGGAAGCATGCAAGATGTTCTGTGACGATTACGGTC
TCCTCTGGCCGAAACCAACGATCGAGACAAATCTGGGTAACTTCCTCTCCAAGATTAATA
TGAACACCATCGACATTCAGATCACCAAGCAGGGAAAGAGCGACGACCTCCTCACAGCGG
CTGCCGACAGATTTAAGACACTGGTTTCCAGTTCCGTGCCAAAAGGCTTCTCGGCGAAGG
CTGCAGGAAAATCAGTCACAGTTTATTTAGTCAATGACAATCCTTATATCCGAGAATTCT
CCCTGGACATGGATGAGAGCTACGAGCTCTACATTTCATCAACGTCGAGCGACAAAGTGA
ACGCTACCATACGTGGAAACTCTTTCTTCGGCGTCCGTCACGGTCTGGAGACGCTCTCTC
AGCTAATCGTGTACGACGACATAAGGAATAATCTGTTGATTGTCCGTGACGTCACAATTA
AGGACAGGCCTGTCTATCCTTATCGAGGTATTTTGTTGGACACCGCGAGGAACTTCTACT
CCATAGAATCAATCAAAAGAACTATAGACGCAATGGCCGCAGTGAAACTGAACACATTCC
ACTGGCACATCACGGACAGCCAGAGTTTCCCGTTGGTGTTACAGAAAAGACCGAACTTGA
GTAAGCTCGGGGCATACAGTCCCACCAAGGTGTACACAAAGCAAGATATTCGTGAAGTTG
TCGCATATGGTCTAGAGAGGGGAGTTCGTGTTTTACCGGAATTTGATGCGCCTGCTCATG
TGGGAGAGGGATGGCAGGACACTGGACTCACCGTGTGCTTTAAGGCGGAGCCGTGGACGA
AATTCTGCGTGGAGCCGCCTTGTGGTCAGCTGAACCCGACTAAAGAGGAACTTTACGACT
ATTTGGAAGATATTTACGTTGAAATGGCTGAGGCGTTTGAGAGCACCGACATGTTCCACA
TGGGAGGAGACGAGGTCAGCGAACGCTGTTGGAACTCCTCAGAGGAGATCCAGAACTTTA
TGATTCAAAACCGATGGAATTTGGACAAGAGCAGTTTCTTGAAGCTTTGGAACTACTTCC
AGAAGAACGCTCAAGACAGAGCGTATAAGGCCTTCGGTAAACGACTGCCTCTGATTCTAT
GGACCAGCACATTGACCGACTACACTCACGTAGAGAAATTCTTGGACAAAGACGAATACA
TCATACAGGTCTGGACCACGGGAGCCGACCCACAAATTCAAGGTTTACTCCAGAAAGGAT
ATCGCCTGATTATGTCAAATTATGACGCTCTGTACTTTGACTGTGGATTCGGGGCATGGG
TTGGGTCCGGCAATAATTGGTGCTCACCGTACATCGGGTGGCAGAAAGTGTATGGTAACA
GTCCAGCGGTGATGGCGCTCTCGTACCGAGATCAGATCTTGGGTGGTGAAGTAGCGCTGT
GGTCCGAGCAGTCAGACCCTGCCACGCTGGACGGCCGACTGTGGCCCAGAGCGGCTGCCT
TCGCCGAGCGCATGTGGGCCGAACCTTCCACCGCGTGGCAGGACGCCGAGCACCGGATGC
TCCATGTCAGAGAACGTTTGGTAAGAATGGGAATTCAAGCTGAATCGCTTGAGCCGGAGT
GGTGCTATCAGAATCAAGGACTTTGCTATGGTTAGAGTTTATAGACAACGCGAAGAGGAT
GTGCTGCCAGCCTTATGAATAATAAATAACAAAGACAGACAATACTATCATAAAACTCAT
CGCAACTTTTTTCAAATAACCAAAATAAAGAGGAATTCCTTTGCTTTGTTTTGTTACATG
AAAAAATTATGTTTAACAAGGTTTTTTGGGCGAAATTACAATTTGAAATAAAAAGTAAGC
ACTTACTTTGCCAGCTTAAAAAAATATAAGCGAAATAATAATGTTAGAAAATAAAAACAA
AATGTATAATGTTAAAATAGGATTTTTTTTATTCAGTTAACAAATATTATCATAATTTAA
TTTTATGTTGTGTATAAAATAATTTAAAAAAATACGATTTCCCCGGGATGTTCTATTTCC
GTAGAGCATTAAAATACACCAGGTACTGCCATTATTTGCATAATAATAAGAGTATTTTGA
GATTACATGACATTATAATAATAATTAAGTTTATAAAATATATTAAATTAAAGATTTAAA
AGTTTGTAAATTAATCGTGATCAAAACGTGTATTCGCGTTTTCCAATTATGTACTTTATA
GCATATCTGTATTTTTTAAGCAGTCTTTTTAAATCTTTCACTGCACATGCATTTCTACTG
TAAAAAAAAAACATCTTCACTGTTGACATATTAATATGTCATGTAAGCGGGTATCCGCAA
AATTTAAAATTCCTGTCATTGTGGTTATTTATTTGACCAAGGGTTTGAGAACCTAGCGCT
TATTTTGTTCAATTTAATTACTGTTTATATCTACATTTGAAAACGATGTTGACATGACAA
TAAGATTGAAAACACAATTTTGTTCCATCAATTAATGAAACGAAAATAAAAAATAAAACG
AACGAGAGATTAAAACAGTAAAATGTTTTAAGTAAAAATGGTAAAATTTTTCAATAAAAA
ATACATATATCCAAAACGGAGCTACGATCAGATTTTTTGTCACAAATTATTTAAGTTGAT
AACAATTCAGTTTCGAGATATTATTCATTTCACAAATTTTACGTTCCTCCAGAGAAAATG
CTATATTTGTACAAGATCTCGACAATGTATATATTTCGACAAAAAATATTTCGATACGTG
ATTTACACTTTCGCGTTTTAAACAATTATTGTTAAGAAATCTGACATAAGCAATAAGTGC
GTTTATAAGTGTGGAAACATTTTTGGAATATCTTCACGAGAAGTTATAAATAAGATTAAT
ACTCATATCAAATATTTTTAAATTGTTTTACTATTTATATTTAACGTATATCTATCGTCA
CATATTATTACTAAATTGTAATACTTATACAGCATTTACTATTTACACATTAAATTAGAT
ATTATTATACTATATACTTCATGAGCACATGTGTGTTTTCATATTCTTGTGACTTATTAA
TGTACACTTATTGGTATTTTTAATAAAATTCTGCATAATA
(4600 bp)

- SilkBase 1999-2023 -