SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoIG_DN29881_c6_g1_i25
Scaffold_idBomo_Chr12
NCBI non-redundant
(nr)		chitooligosaccharidolytic_beta-N-acetylglucosaminidase_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000272 P polysaccharide catabolic process
GO:0004553 F hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds
GO:0004563 F beta-N-acetylhexosaminidase activity
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005975 P carbohydrate metabolic process
GO:0006032 P chitin catabolic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016798 F hydrolase activity, acting on glycosyl bonds
Transcript
Level		FPKM:2.53 TPM:1.41
ORF EntryO_BomoIG103401_complete:A_BomoIG_DN29881_c6_g1_i25
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTAACTCAAATATTCCACTTTTTTTTTAATCACCATCGTTTGCCTTACAACTAA
TGAGAAAATATACAAATTAATCACAGTTTATTTAATGGAAACTCCTTGCTGAGTCAGCGT
GTTATCCTCGTACGTCTCCAGTACGTGGGCCAAATGTTCATTGTCTCTTGGTTTCTTGAA
CTGTCTACGCTTCTGCTTGGCCTTCTTCCGTTTGGGAGCAAGCATCTTCTTTGGCCCGTG
ATCCTGCATGGATTTGATCCCTTGCTTCTCGAGGTACTCCTCGATCTTCGCGTCGTCCAT
CGCGTCCACCGCTGTTGCACGCCATAATTTCACGAATTCGTCATCTACGTCTAATGTAGC
AGTCTTATCATTGTAGAATAATATTTTCTTTTTATCAGTGTGCCTTGTTATATACAAAAT
CTCTTGTGCCAAATGTTTCAGTGCTCTCTCGCAGTGAGGCAGCGACTCTTGAACATCTTC
CAATAATATACCTCCCAAGCCTTTGAGGTCTTGTTGCTTAAGTAACCTCAGTAAAGATTT
TTTATCTTTTATTTTATAAACCGGTTTGAAGTTAAACTTTCCATCCGGAGAGCATTCGAT
TTTAGGATTGCTCTGTAGGGCTTCTGTTTGTAGCCACTGTTTTATTTTATTTCCGACATC
CAATTGATTTGTCTCATCTAAAATCTCATCTAAAGACAGTGGATGGTCATCTCCATCTTG
ATGCCTTGCTCTCATATGCCGTACAATACGCGCTAGCACACCAAAGCGATAGGACGAGCT
GCCAGTCATAGTCTTGTAATTACTAGCATCAAGCTTTGGTCCGGAGCTGACTGAGCTGGA
TGATTTCGATTTCTTTTTGCTGTCATCTTTGAATTCAGAGTCATCCCTTTTCTTTTTTTC
AATGATTTAAATCTTCTACTTTTCTCTGCACAAGTGATTTGTTCACATTTCTACTCATTT
AGTATTTCGAAACACATATTTCCATTCATAACTTTATATAATGACTCAGTAATGAATATT
GCCACAAGGAAGTGAATTGATAGTAATTGTATGGGCTACGTGAGTGACAGAGAAAGTGTG
CGATGGATGCCAGTATGTCTCCAATCATTGTTGTGGACTAGCGAATAGTTTAGTTAAAAA
TAATGTAACAGACCTCGGGGTCGCAAGTGCCTTCTTTTTAAACGCTTCCCGTTCCCGTAA
GAGCGCCGGGTCCATATTTTCGTCTTTTAAACACAATCACTAAAAGTAAAAGATGTGGCT
TCAAGCAATTTGTATTTACACCGTCTTCATAATTATAGGATGCGGGATTCCGACGGCAGC
CGAAGAGCACTCATTGTGGAGATGGACGTGCGAAAACAATAGATGCACGAAGATCAGGAA
CGAGCCGGAGAATAAAGAGCCTGTCCTCAGTCTGGAAGCATGCAAGATGTTCTGTGACGA
TTACGGTCTCCTCTGGCCGAAACCAACGATCGAGACAAATCTGGGTAACTTCCTCTCCAA
GATTAATATGAACACCATCGACATTCAGATCACCAAGCAGGGAAAGAGCGACGACCTCCT
CACAGCGGCTGCCGACAGATTTAAGACACTGGTTTCCAGTTCCGTGCCAAAAGGCTTCTC
GGCGAAGGCTGCAGGAAAATCAGTCACAGTTTATTTAGTCAATGACAATCCTTATATCCG
AGAATTCTCCCTGGACATGGATGAGAGCTACGAGCTCTACATTTCATCAACGTCGAGCGA
CAAAGTGAACGCTACCATACGTGGAAACTCTTTCTTCGGCGTCCGTCACGGTCTGGAGAC
GCTCTCTCAGCTAATCGTGTACGACGACATAAGGAATAATCTGTTGATTGTCCGTGACGT
CACAATTAAGGACAGGCCTGTCTATCCTTATCGAGGTATTTTGTTGGACACCGCGAGGAA
CTTCTACTCCATAGAATCAATCAAAAGAACTATAGACGCAATGGCCGCAGTGAAACTGAA
CACATTCCACTGGCACATCACGGACAGCCAGAGTTTCCCGTTGGTGTTACAGAAAAGACC
GAACTTGAGTAAGCTCGGGGCATACAGTCCCACCAAGGTGTACACAAAGCAAGATATTCG
TGAAGTTGTCGCATATGGTCTAGAGAGGGGAGTTCGTGTTTTACCGGAATTTGATGCGCC
TGCTCATGTGGGAGAGGGATGGCAGGACACTGGACTCACCGTGTGCTTTAAGGCGGAGCC
GTGGACGAAATTCTGCGTGGAGCCGCCTTGTGGTCAGCTGAACCCGACTAAAGAGGAACT
TTACGACTATTTGGAAGATATTTACGTTGAAATGGCTGAGGCGTTTGAGAGCACCGACAT
GTTCCACATGGGAGGAGACGAGGTCAGCGAACGCTGTTGGAACTCCTCAGAGGAGATCCA
GAACTTTATGATTCAAAACCGATGGAATTTGGACAAGAGCAGTTTCTTGAAGCTTTGGAA
CTACTTCCAGAAGAACGCTCAAGACAGAGCGTATAAGGCCTTCGGTAAACGACTGCCTCT
GATTCTATGGACCAGCACATTGACCGACTACACTCACGTAGAGAAATTCTTGGACAAAGA
CGAATACATCATACAGGTCTGGACCACGGGAGCCGACCCACAAATTCAAGGTTTACTCCA
GAAAGGATATCGCCTGATTATGTCAAATTATGACGCTCTGTACTTTGACTGTGGATTCGG
GGCATGGGTTGGGTCCGGCAATAATTGGTGCTCACCGTACATCGGGTGGCAGAAAGTGTA
TGGTAACAGTCCAGCGGTGATGGCGCTCTCGTACCGAGATCAGATCTTGGGTGGTGAAGT
AGCGCTGTGGTCCGAGCAGTCAGACCCTGCCACGCTGGACGGCCGACTGTGGCCCAGAGC
GGCTGCCTTCGCCGAGCGCATGTGGGCCGAACCTTCCACCGCGTGGCAGGACGCCGAGCA
CCGGATGCTCCATGTCAGAGAACGTTTGGTAAGAATGGGAATTCAAGCTGAATCGCTTGA
GCCGGAGTGGTGCTATCAGAATCAAGGACTTTGCTATGGTTAGAGTTTATAGACAACGCG
AAGAGGATGTGCTGCCAGCCTTATGAATAATAAATAACAAAGACAGACAATACTATCATA
AAACTCATCGCAACTTTTTTCAAATAACCAAAATAAAGAGGAATTCCTTTGCTTTGTTTT
GTTACATGAAAAAATTATGTTTAACAAGGTTTTTTGGGCGAAATTACAATTTGAAATAAA
AAGTAAGCACTTACTTTGCCAGCTTAAAAAAATATAAGCGAAATAATAATGTTAGAAAAT
AAAAACAAAATGTATAATGTTAAAATAGGATTTTTTTTATTCAGTTAACAAATATTATCA
TAATTTAATTTTATGTTGTGTATAAAATAATTTAAAAAAATACGATTTCCCCGGGATGTT
CTATTTCCGTAGAGCATTAAAATACACCAGGTACTGCCATTATTTGCATAATAATAAGAG
TATTTTGAGATTACATGACATTATAATAATAATTAAGTTTATAAAATATATTAAATTAAA
GATTTAAAAGTTTGTAAATTAATCGTGATCAAAACGTGTATTCGCGTTTTCCAATTATGT
ACTTTATAGCATATCTGTATTTTTTAAGCAGTCTTTTTAAATCTTTCACTGCACATGCAT
TTCTACTGTAAAAAAAAAACATCTTCACTGTTGACATATTAATATGTCATGTAAGCGGGT
ATCCGCAAAATTTAAAATTCCTGTCATTGTGGTTATTTATTTGACCAAGGGTTTGAGAAC
CTAGCGCTTATTTTGTTCAATTTAATTACTGTTTATATCTACATTTGAAAACGATGTTGA
CATGACAATAAGATTGAAAACACAATTTTGTTCCATCAATTAATGAAACGAAAATAAAAA
ATAAAACGAACGAGAGATTAAAACAGTAAAATGTTTTAAGTAAAAATGGTAAAATTTTTC
AATAAAAAATACATATATCCAAAACGGAGCTACGATCAGATTTTTTGTCACAAATTATTT
AAGTTGATAACAATTCAGTTTCGAGATATTATTCATTTCACAAATTTTACGTTCCTCCAG
AGAAAATGCTATATTTGTACAAGATCTCGACAATGTATATATTTCGACAAAAAATATTTC
GATACGTGATTTACACTTTCGCGTTTTAAACAATTATTGTTAAGAAATCTGACATAAGCA
ATAAGTGCGTTTATAAGTGTGGAAACATTTTTGGAATATCTTCACGAGAAGTTATAAATA
AGATTAATACTCATATCAAATATTTTTAAATTGTTTTACTATTTATATTTAACGTATATC
TATCGTCACATATTATTACTAAATTGTAATACTTATACAGCATTTACTATTTACACATTA
AATTAGATATTATTATACTATATACTTCATGAGCACATGTGTGTTTTCATATTCTTGTGA
CTTATTAATGTACACTTATTGGTATTTTTAATAAAATTCTGCATAATA
(4488 bp)

- SilkBase 1999-2023 -