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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoIG_DN29848_c1_g2_i3
Scaffold_idBomo_Chr25
NCBI non-redundant
(nr)		Single-strand_selective_monofunctional_uracil_DNA_glycosylase_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0002100 P tRNA wobble adenosine to inosine editing
GO:0003824 F catalytic activity
GO:0006400 P tRNA modification
GO:0008033 P tRNA processing
GO:0008251 F tRNA-specific adenosine deaminase activity
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0052717 F tRNA-specific adenosine-34 deaminase activity
GO:0052718 C tRNA-specific adenosine-34 deaminase complex
Transcript
Level		FPKM:0.23 TPM:0.13
ORF EntryO_BomoIG103895_complete:A_BomoIG_DN29848_c1_g2_i3
Sequence
(Nucleotide)
CGTAACGCTAATAAAATAAGTAATGTATAGATACTAACAAACAAATTCTCAAAACATAAA
AAGTAAACAACTGAACTTTTACTTTTATTCATTTAATAAATTATTTTAGTGTTCAACGCG
ATTCCCTTACCTCCTGTAGTAAATAGAAATCGAAATTTCAAGAAACAAAAATAAATGATG
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TTTTTAGAACATTTTGGCATATTTGAGGTAAGTCTTACTAAAGGCTAAAAGTCTCTTCTA
AGTTTGAAACTAAAAATGATAGAAATACCTTTAGTGGTGGATATCACATATGGCTAATAT
CTTGTTATCAGCTTGAAAACAGCTTATATTTTGTTAAAATTTACTGGATGAATAAAATAA
ACACACTTGTCATCAA
(2596 bp)

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