SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoIG_DN29672_c0_g1_i3
Scaffold_idBomo_Chr9
NCBI non-redundant
(nr)
guanine_nucleotide_exchange_factor_DBS_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0002102 C podosome
GO:0005515 F protein binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006801 P superoxide metabolic process
GO:0030054 C cell junction
GO:0035091 F phosphatidylinositol binding
GO:0042995 C cell projection
GO:0072593 P reactive oxygen species metabolic process
GO:0072675 P osteoclast fusion
Transcript
Level
FPKM:0.34 TPM:0.19
ORF EntryO_BomoIG13607_complete:A_BomoIG_DN29672_c0_g1_i3
Sequence
(Nucleotide)
CCTACCCGCGCGGACTCACAAGAGGTCCTACCACCAGTAAAAAATATGGTAATAAAATAA
AATGATATAAATAATATGAACCTAGAATGTGGTAATAAAATAAAATAGAAACAAAGTAAT
TGAACAAATTCTGTGTATTTTATGTTGTTTCAATCTACACATTTTAAAACTAATTTCTGA
TAAACAAACATGTCACTACGTGTATGAACATAGATATAGCTAAAGTCATGCACAATCGTG
GATTTAAATAATAATTAATAATGAGATATGAGAATTCAAGGTCAATTACATCAGACATCG
TACGTACAAATGCATCACAGATAAGATATTGTTATTCGAAAGTAAAAATCATGCTTATAG
CTTTTTAATTTTTAAACAATAAACGAACAATTTTAACGATTAATAAAGCAATATTGACAA
AAACGTATGATATGAAATGATTAAATGATTACTTGCTACCACAGGCTTTGCTACAATATT
AAAAGACAATTATCGAGGCACCATACAAACTCAATGTCTCGTACTACTTACTACTATGAA
TTAAAAAAAAAAAACTTCATGGACGTAAAAAACACAATTATAAAATGGATTGATGTATTG
AAAACGTTTTATATTCAATAACATTATAGATATTCTCACGAAAATATCACACGGGACGTT
AATAATTAATTATAAATGTTTGAAATCGATTCTCGTTCACATAATCTGTCATGGAGTATC
GAGACGTTACACGAAACAACACCGAAAGCCATCAAAATAAATAACTAAAATTAATTTTAA
TGTCGATTTGATATATACAAAAATGACGAGACCGATTCGGTCCCACGGTCCTACGCGACG
CCATTAAAACACAACTTTGGATAATCGTAACGACTATGGCTAAAAGGGCTAAAACACTAG
TTTACAATAAAGCTTTTTTAGAACAACATTTACACACATTAACAAATTGCTTGACGATAA
ACATTAACAAGTGGGATGGGACTACGTCGGGAAAACAAGTCTCATTGTGATTCGGGCGTA
ACCAGGAAATTCTAGGGAGTAACTAATCTCCCGCCACTACTGAGAAGTAGTCGCTCGAGA
TGAACAAGCTTGAGCAAAACTTGATCTCACCGAAAAATCCTGGCAACACCGTCTACTGTC
CTACAAAATTAACGCTAGACATTGGATATTGCTAAATAAGTTTCATACTAAATGGTGGTG
AATTACATTTTAGATCTCAAGTAATACTGAAAGCAGAGATGAATACCAATATCATATAGT
TAGCAGCTATAAACCAATTAAATACCTAGGTTAGTCTTTTTTGACAGTGACATTTTTGGT
ACTTATTATAGAGTAACAAGGACAGGTAGTGTAGTCGGTAACGCAAGGTGTGGTGGTTCA
ATGCTCGTGAAGGCGGTCGTGCGACCTGCTGGAGGAGCGCGACGTCTTGCGCTGGTCGAG
GTAGGCAGCCGGAGCCCAGCCCTCGCCTTGTCCGCCTGCAAGCCGCACGTACCACCAGCC
GGCACAGCCGACTTTGAGTAGTTCAGCGTGTTGTCCCTCTCGCAGCGACACTTCGCTCGG
TCCCACGGCTGTGTAGTCGGACAGCGCCACCAGTCCACATCCCACCGCCTAAACAATCCA
ACACATTATACGACACTGTTTTAATGTTTTAAATACTCCCTTTACAATTGTACGCATCTC
TTAATATATATATTTCAATCACAACAAAACAATAATTTTCTGTTGTTGAAATTAACTATA
CATTCAGGTATTTGAAAGTGAAATTATCGTTACTAAATTCGGGTCTGTTAATGCCATTTT
AGAGCCTTAGTATTATCATGTCGCATTTTTTTACGGTACGTTATCTCAAAATTATTTCAA
CACAATAGAGGTTTTACTTACTCAAATACATGCATAACGTTTTAGTAAAATTTACGGAAA
TTGTACAACACTGCTCTTTTGAAATTAAGATTACATATTTAACTTATACTTTTCACGCAA
ATTCGTGAGAGGAAAAATTCAATATTAGTTATCTTTTATTGATCTTAAAGCCAATTTACC
TGCTATTTACAGTAGAATAAATTGGTTATAAGATCCAATTTTATCGCAGTATTATATATT
CCCATAAACAATAACAGATGGCAGCACTTTTGGTTTTTTATCACCACAGACAATTACCTA
AACAGTCTGTTCGCACATTTGTTAAAACAGATTAAAATAATCTGAATACTTTTCATAAAG
TGCTACCATCAATTTTAGCATTTTAGTTTCACACACAGTACATGCAGTTTCAGAAGTTGA
AGTACAATTATTAGTATTTTAACATGTCAATAATAATTGGTCAACATGCACGTTAGTTTT
GAGCCCTTAGTTGAAATTCGTTTAAAATACGTATTGTGTACAAGGTTCTTGGAGTGTTAA
AATCATATAATTTGTATCTTATAAATAAATTTATATAAAACATATTTAATACAGGTAATA
TAATAAACAAAAGTTATGTGTTTAAAAAATACTTTACATATATGTAGTTTTAGTAAAATT
GAGATTTTATTACAGAAATTCATAATGATAATATGTACAATACAAATAAGTAGGCTAGAT
AAAATTATTAAGATTTTTTTTTGTGATGTTTTATTGGGCAGTATATCGAAGAAACACAGA
GTAAAACAATTAGATGCGACAGCACATCGTAAGCGGTGCTCAGTGAATGATGCAAGCTGC
AGTGTTGCCTGACAATGTATCAGGTTTGTGTAACTAATACCGTAAGAAGATTTCTTCATA
GTTTATAGTACCACAGACGTCTTGATGCTTCACAAAAAATCTTTCAATGTATCATAAATA
TATATTATTTAATAATACGTATTATAATTAGACATACTCAGTACCTAGTTTTTGTACGTC
ACAGACAATGACAGTTGAAAAAATAATAATACCGACAGTGATTCTGTTTAAAATACACGA
AGCAAGCGCATTACACAACATAAAATAATCAAAGCACACTGACAATGAGACATAACAAAA
CATAAACTTACACGATAGTTAATGTTCAGCGAATAGAACCGAAATATCCACGTTCTCTTT
GGTTACCGCACTAAGCTTTGGACATAAACTCAGTCTGTTTCATTATATACAAGACCTCTA
CTTCGCGTAAAGGTATTTAACTTTCAGTATTGGGATACGTAAAACGTGGAGGTGGCTTGC
GCAGAGCCCGATACCGAAAAGAACTGTACCACTCTGTGGATGGTACCGTTGAGACCGACG
GCCTCCGTCACCTGTTGAACAACACAACATACAGCAAGACGCCATTTTGTAGAAATAGCT
ACGTCAAGATGGCGGCTGTCGATTCGAAATTACACCTCAACTTTGAGTTATTGCGGTGCA
ATATGGTATGTGCAAAACTAAATAAACATCTGTGTTTGTGTTGCTAATTCATTCTTTAGA
ATCAAAAAAAAAGCGATGATGGATGGCCGGGCTAAACCAAATTATTAAGCTGCATCAGCG
TGAATCTTAACTGTTTCGGGGTAATAGTGTAAAACTTCAAGAAAGTCGTGGTAGATATCT
TGTATTTTTCTAATGGATTAATGTACTTTTAGGATAAAATTAGCTTTAGCCGGGATAGTG
AAGCATAAACAGGGCCAGTTCTTTTATTTACTTAATTCTTTTAAAACAGAGAAGTCTGGC
CCTGGCCTTGTGGAAGAAGATCCGTGTTCCAGGGTTGTCAGCCTCATCATGCGCTATCCG
TGACAAGTCGTTTGGCATTCCTATAAAATACACTGTACACTTACATATATTTGAACTCAC
TTCACTCATCACTGCAATCCAAAATTACAGAGCGTTAAATGGGGTATTTAGCAAAGCTAC
CCCACTCCCTTTGGAAGCGGATTACTTACTCTACTATGTTAGTAATCTTAACACACATGA
AGACTTTTGGCACAACATTTAAATACACTATGAAAATCCCATTATATCCACAGTAATTAA
AGGTTTAAGACGTACACAAACAAACAAATGTGATTGACGATTACCAATAAATTTAGCTTG
TTAATAATGATTATTAGATTAGAACAATTTTTTTTTATCCCATCTCTATTGAAAAAAGTG
TACATCTACATATATACGTGTTGTATGTTTTAAAGTTAAAATTGAATAAAATATTCTTTT
AATTTGTATTAATTGAAACTATAGTTATTTTTTAATTTAAGATTTTTAAAATTCAAGTTT
TAATATTTAATAATAAAATGTACTTAAACATTGAACTATACAAATGTACACAATTTCTTC
GTCACTATTCCGATCCCCTGATGATCAACTTATTAGTAATCATTATTTTGATTTAAAACA
CAGTAAATAAATAAAAAAAAAAATCATTATTTGACTCAAACTGAATGTATTGTTAGGTAT
TATCTATTTACAGTGTTGCCCAATAAATATTTTAAAATGCAGTTTTATTCAAGGAATTTA
TTAACTCCCCGATGTCTTAGATCAAAGGATTTTAACAGATACTTCAATGTGTTTTTTTTT
TTGTATTCTATTTGTCACAATAAAATCCTGACGCAGCTAAGTTTTGCGAAGAGCATTCAT
CGTTCAAATTAATTCCAATTGTCACAATTAAAAAAAAAACCTGCGAAACCTAATTAAGTG
TGTAGAATAAAAATGATCCCTGTTTTAGAACTTGGTCTTTATATTATATTATAGGAAACA
TACGTAAATCACTTAAAAGACGACATTGTCTTTCAATTTTTAGGCACTAATGATCATAAC
CGCGTTAAATATTTCAGTTAAATCTATTGTGATATTATGACCGAATCTGAGCGAAACTAG
TCACTTTAGAAATTAAAAAAAAAACATGATTGAAAGATATATAGAGTTATAAAAAAGGTT
TTGTATTTGGCTGTTTATTATGTTACAGTCACTGTTAAAATCTATGACGGAAAAGATATT
TTGGTCACTAGATATCGGAAATTACTACTTTCTTAGCCCATATTTTGTCCTTATTTCTTT
ATCTAACTCATTCACTAAATAGAAAAGTTGACTTGTAGTTTGGGTATAAAAAAAAGTATG
TTCCAAAACTAAAATCGAAAAAAAAAACCGTTCAATATTTTATTAATTCACAATATTCGT
ATTCCACAAATATTTCGTGAGTCGCTTAAAGATTTGGGCGTGCGAGAGAAGTAGCGCGAT
TTTCCAATTATGCGCTTCCTTATATTTTACCACTAACAAAAAAAATGTTGTTAGACATAA
AACAATGTTACAAAATGAATTAAAAATTCCTATTACCGTATCGTATCGTCAGATCAATCA
ATCAATCAATCAATCATACAATGTCAGATAGCGGAAACACACAATACTCGATTATTGTGG
AATATTCTCAACGATTCTAG
(5360 bp)

- SilkBase 1999-2023 -