SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoIG_DN29620_c0_g1_i1
Scaffold_idBomo_Chr21
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_ribose-phosphate_pyrophosphokinase_2_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0000287 F magnesium ion binding
GO:0002189 C ribose phosphate diphosphokinase complex
GO:0004749 F ribose phosphate diphosphokinase activity
GO:0005515 F protein binding
GO:0005524 F ATP binding
GO:0006015 P 5-phosphoribose 1-diphosphate biosynthetic process
GO:0006144 P purine nucleobase metabolic process
GO:0006164 P purine nucleotide biosynthetic process
GO:0006167 P AMP biosynthetic process
GO:0007399 P nervous system development
GO:0009156 P ribonucleoside monophosphate biosynthetic process
GO:0009165 P nucleotide biosynthetic process
GO:0016208 F AMP binding
GO:0016301 F kinase activity
GO:0016310 P phosphorylation
GO:0016740 F transferase activity
GO:0019003 F GDP binding
GO:0019693 P ribose phosphate metabolic process
GO:0030246 F carbohydrate binding
GO:0031100 P animal organ regeneration
GO:0034418 P urate biosynthetic process
GO:0042803 F protein homodimerization activity
GO:0043234 C protein-containing complex
GO:0043531 F ADP binding
GO:0044249 P cellular biosynthetic process
GO:0046101 P hypoxanthine biosynthetic process
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:8.24 TPM:4.59
ORF EntryO_BomoIG13637_complete:A_BomoIG_DN29620_c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
GCAAACACAAAATGTCTGTGCACAAGTCGAACCAAAGTGATTCCGTAGCCTGTAAGTGAA
GTCTGAGTCTGGTTGAGTTGCCATACGCGAAGGACATAGGTGCAGGATACACGGCGCGAC
AAGACCTCACGCGTTGCCCTTCGAACTCTTATTGATAAATGGACTCGGCAATTTAAATAA
TTCATCTCTGTTTTATCGCTTCGCATAGCGCCACTTGCTACGACGTCTGGTTTAGTGTCG
ATGAAATCAACAATAACCCTAGAAGACGTAGTGAATAAATTAGATCACGTTCTTCCCTTA
ACAACAAGAATGCCGAACATCAAAGTTTTTAGCGGCAGCTCGCATCCTGATCTGGCTCAA
AAGATTGTCGACCGTTTGGGCATCGATCTCGGTAAAGTTGTAACCAAAAAATTCAGTAAT
ATGGAAACGTGCGTTGAAATAGGAGAATCGGTACGCGGCGAAGATGTGTACATCGTACAA
AGCGGCAGCGGAGAGATCAACGACAACCTAATGGAGCTCCTGATTATGATTAACGCTTGT
AAAATAGCGTCTGCATCGCGAGTGACCGCCGTCATACCTTGCTTCCCGTACGCGCGGCAA
GACAAAAAAGACAAGAGCAGAGCCCCGATCACGGCCAAACTCGTTGCCAACATCCTTTCA
GTGTCTGGAGCCGATCACATCATCACTATGGATCTTCATGCGTCGCAAATTCAAGGATTC
TTTGATATTCCGGTAGATAACCTCTTTGCCGAACCCGCAGTGTTAAAATGGATCAAAGAA
AACATACCGGACTGGAAAACAAGCATTGTTGTGTCCCCTGATGCTGGTGGTGCTAAAAGG
GTGACATCTATTGCAGATCGTTTGAATGTTGAATTTGCTTTGATCCACAAAGAGAGAAAG
AAGGCCAATGAAGTAGCCTCTATGGTGCTTGTTGGTGATGTTAAAGACAGAACTGCCATT
TTAGTAGACGACATGGCCGACACTTGTGGCACGATTTGCCATGCTGCCGAAAAATTGATA
GAAGCTGGTGCTACTAAAGTGTATGCTATTTTGACTCATGGTATTTTTTCGGGACCTGCA
ATATCCAGAATTAACAATGCTTGTTTAGAAGCTGTTGTTGTCACAAACACAATACCCCAG
GAGAGGCACATGCAAGAATGTCCAAAAATACAATGCATTGACGTGTCAATGATGCTGGCA
GAGGCTGTCAGACGTACACACAATGGGGAATCTGTTTCATACCTCTTCTCTAATGTTCCA
TATTAGTATTTTGTATTTTACTTTTTACTTATCTTAGGTTAAGTTTTTCAACAATGTTAT
TGCTGCTTGCAAAATAGATACGAATAAATATACAGGATGTCTTTGTTGACCGGCCATTGC
TAGGCTTAATATGGTTTTATTGAAACAGTGATATTTCAACATGACCTGTTTGATAATAAA
CTATTCATGTATGTACATGGAAAGTTAAAGATTCTAATTTTATAACTTTAGCATATTAAG
ATGAAGTTGATGGAGTATGAAATTATAGGAATAATCTCTAAACAAAATTTTACATTTCAA
TTGATGACTTTGTAATAGTTTTGCATTTAATTTTGTTTGTTTTGTTCTAATGAATTAATA
ACATTAATAAAAGACAATATTTAAGGAAGCAATGTTAAAATGTTGTTTATTTTACATTTT
CATTGTTATTCGAACCTAATGTAATTTGTAAAATGAATTGAATTTCATAGAGTTCGCAAA
AACAGGTTCATCAGAAAGAATGACCAGTGACAGTTTTGTTTTAAAAATCACATGGAGTAT
TAAATATGTAAAGAAAATCAGTTTGAAAAGCTTTCGTGCCCTTTTAAAGCTGCAGTGTTT
TAGTATCTAGAATCAAATGAAAGCATTTTGATTTGTAGATTTGTAGATTTGTATTGCTAT
GAAATTCAATTCATTATCACACTAGATTGATTTAGCAAAATCATTTACATGTTTAAGTTA
TAGATAGTTTAATAGCTCTTAGATACTAAATAGAGTTTGCCATTAAACATAATAATTGGT
TAATTAGTATGGAATTTATTAAGAAAAAATATAAGTACATTGGTACTATTAAAAAATAAT
AATGATAATATGTATTTTACATGAGATTTTTCTAAATTTATAGAATCTGTTATGTATATT
TGGTCAATATACCTACTATTATAATAAAAAAAACATTTTGTCTATATTTGTCACAGTAAT
ATGATTATGCTTTGTTTGCAGTTTACAACTAACATGACAACAGCTTATATTAACAAATGA
TAATATTTGTTTATTTCCAAACCACACTTCATATTTTGGGAGTAATTAAATCTGCATGAT
AAGTGAATGGTCAGTATAAACAACAAACTGCGTCACTAGATAGTAAACGTATCGTTCGCA
TTATGATTGTGCTCTTTAATCTTACATCATTATTCCGTATCTTCTTGAAATCTTGACCCT
TGAGGTCATGACTACGATGATGTAAAATGTGGGTGCGTCGCTTTCGTAAGCAGAAAATTG
TTATCATTGTTATGTATGTGCCTTAAATAGATGGATGATGGAGAGATCTTCGAAACTAAA
CACAAATTATTAGGGTATTCATTGCTTGTAAGGCATATTATCGGATTGCACGAATAGGAA
CTATCATCCTGCCTATTTCTATGGCGAAGCAGCCGTGTGTTCTGGTTTGTCTATGGTTAG
GGCTAAACTAAGGAATCGTTTCTTAAAAACGCTTCTATTTAGTATTTTAAGGTGGCTGGC
GACATTCATGTAGTATCTGGCTTCCGCCAATCATAAACCAGATTGGCTGTGAGCGCGGGT
GAATGCACCCTATGCAATATAAAAAAAATATTGCTTAAAATTATTGACCCTTTATAAAAT
AGTTTGAGTTTGTATCGAAAAGAAATCGAGGCATTTAAAATTAGTGTTTGTAAGACTGGA
AGTGTATCACAATAATTAGAGCCAAGGTAATTTTAGACAACTAAATTGATTGACGCGCAT
CGCGCGTGTTATGTTGGTACACAGACAAAACCGTAAATAAATTTAAAAAGCATAACATTA
TATTTGGAACCGTAATAATTTGGAATTGTGTCAACATTCCGTTGGTTTATATACGAGAGA
CTGACTGGCCTCGTTTAACATTTAGTTCATAGGATATTTCAAAGGTTCATGGTCGTGATT
ATTTAAATTCGTTTTCTAAGTTCTTGTTGCCCTTGGACGAACAATGGCCGATAAAAAGAA
AATCTATACTATTTGTAAAAGTCAAGTAAAGGTTGTATGTTCCCTATAGGCTTCGAATAA
CTGGTCTGATTTCGTCTATCGAAGTATCAGTAAATTATGACTACTAAAATGATTCTATTC
ATCTTTGATAATTATGGAGGTGTTAGATCTACTAAGTGATATTCACACTTTCGGTCTTGA
ATTATGGTAGGAAGACATTTGACATTTAAATTTAAATTGTTTTAGCGGAGGTAGTCTTAG
GCCTGGATGCTTTTATAATAAATTTAACTGCTACAAAATATACCTCAAAATAGGAACTTT
CGTTATTGCCGGATTTAGAAGTCAATTCCTTTATATTATAGCTTTTGAAGGTAGATAAGG
TACCAACGCACGGCTGATTGATGCTGAGCATCATCATCAACGTTATGGGTTTAGTTTTCA
CAATTTTCGTGTTATAAAATACAACATATTTCCCGAGAATCTCCCTTATTATGTACGCTG
TATGTATGTTACGTATGAAATTGTAATAATTATTTACAAATAATATGAATTAAATTGATA
ATTAAAATTAAATAGGACCGTATCCTTTCAGATTCCTTGATTTCGTCACTTGTTTGTTTT
TTTCAAATCATTTGTTATTCATTAATAAAAGATAACTATATCGGTATAGTGCTGGGTTGT
GTTATTCTTAGCAGGTCGTCAACGCTTTTGTTTGATAACCTTTGCCCGAACACTTGATGC
TGGA
(3964 bp)

- SilkBase 1999-2023 -