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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoFB_comp10561_c4_seq72
Scaffold_idBomo_Scaf018
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_sorting_nexin-20_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0005546 F phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding
GO:0005768 C endosome
GO:0006810 P transport
GO:0008150 P biological_process
GO:0008289 F lipid binding
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0030659 C cytoplasmic vesicle membrane
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0031901 C early endosome membrane
GO:0032266 F phosphatidylinositol-3-phosphate binding
GO:0035091 F phosphatidylinositol binding
Transcript
Level		FPKM:0.30 TPM:0.33
ORF EntryO_BomoFB16188_complete:A_BomoFB_comp10561_c4_seq72
Sequence
(Nucleotide)
GTTGTATTTAAACGCATATATTTTCTATTATTAATGTAACAAAAGATTAAAAATGTTGCG
ATTCAAAATTATTTCGTCACGGACAGTGGATAGTTCTGAGACCGAGAAGAAATTTGTAGC
CTACATGGTACAGGTGAATCGAGAAACGGATTTGGCTGATCAAGATCCTGCGAACGTTGA
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AAAAATTACAAACACACAATGCGATATTAGTTTTAAGGGATTGCATATATCGAAGTTATA
GTAGGTAATTTTTTGACAACTATTAATTTTATTAAGTTTTTGATGAAAAATAATAAAGAT
TGACCGATTTTCATTCGAATTGAAAGTCTAAATGAAATCGAATAATTAATGCCACGTCTT
TGCGCCCAACCTAATGATGAATGAAATATGTAATGCACCGGTCCTTTGACGACTCGCTCC
TCATCTATTGTACGTGGATAGAAGCCAGGAACCTTACTCTTAAGTGCCAACTTTGACTGT
GCAAAGTTTTCAACTATTGCAGCTATCACACGAAGAAATTAAAGAACCTCTAAACATAAA
CATATTAGCTGTACCCGTCCGCTTCGCTGGGCATTTAAAATTAACATTATCATTTCTCAC
CTCCACAAAGATTCTCATCATTAACGCCCCCGCAACTGGTGTAGGGAGTCCAACACTCAT
ATAAATATTAGCCTATCCATTAAGTACATGTATTTTCTACATGGATACCAAGTTTCAAGT
CAATCGGATGCATGGTTCAGTAGTTATAACGGAACATCCGTAAAAACCACTGTAGATTTA
TATATTAGTATAGATTGCTAGTGCCCTTTTTCCCAGAGTACAGCCAATGTTTCTTAACTT
ATTATGCAATCTTTCTTCGGTTCTGACGGTTCCACTGACCATGACGCTAATCAGTGACTA
TCGCAACAATGAAGTATACATTTAAAATTGTTTAAAAATGGTGTTGATTGACAAAAAATA
TAAAAAATCCACGAATTCACACGTCACATAAAAAATCTGTTACCAATCAGGGACTAAACT
GATGCCAGACTTTACATATAACCTCCGTCTTACACGTTCTTTACCTACCTAATAAGTATT
GTCATTTATATCTAATATGTAAAATTCAACTTGTGAAATTAAGAG
(2145 bp)

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