SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoFB_comp10550_c2_seq49
Scaffold_idBomo_Scaf048
NCBI non-redundant
(nr)		putative_conserved_plasma_membrane_protein_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0005319 F lipid transporter activity
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005635 C nuclear envelope
GO:0005764 C lysosome
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0005768 C endosome
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0006629 P lipid metabolic process
GO:0007041 P lysosomal transport
GO:0007165 P signal transduction
GO:0008158 F hedgehog receptor activity
GO:0008202 P steroid metabolic process
GO:0008203 P cholesterol metabolic process
GO:0008206 P bile acid metabolic process
GO:0015485 F cholesterol binding
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030301 P cholesterol transport
GO:0031902 C late endosome membrane
GO:0042632 P cholesterol homeostasis
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
Transcript
Level		FPKM:0.06 TPM:0.07
ORF EntryO_BomoFB15797_complete:A_BomoFB_comp10550_c2_seq49
Sequence
(Nucleotide)
CGGGCCCGGAGCCGGCTGCGGGGGACGCGCACGACCAGCTGGCGGCCGCCATCCAGGAGT
TCGTGGTCCACGTGAGGAACAACCCCGACTACCTCACGGAGGAGCTCGTGCTGGTGTCGT
GACCCGCGCCGCGCTCCCCAGGGCTCGTGTCCGCGAAGCTTTGGCCGGTGTTGTGCGCGT
GAACTTAACTTAAAGGCATATTACTGTTATAAAATCAAGTAAGTACAAATAAGTTTTTGG
TTTGATTTGTGTAAACTTAAAAAATAGGATCTCATGTATTTACAATTTAAACAAATATTT
ATAGAAAGAGCCGCGCGACACGTCACGTGCGCGCTGTACAGTGAGTGCCAAAGTTACAGT
CTGCATCCGGGTGGGAGGCAATAATATTCACTTGGCATTTCTATTTTGTTACGAAGTTTA
TACACTTTTAGATAAGTAATGGCCAAATGGGGTGATTCGGGACAAATTCCAACTTGATGA
ACAATTCTAAGATAGTTCTTGATGTTTAAAATGCTATATCAGGATCAAAATGATTGAGTC
TTGGGGCTATCTTTGTTATCCAATTTAAAGCTATGCAATTAGCATTCCAGTTTAAGCCAA
AAAAGCAAAAATAGGTGCTATCCCTATTTACCCAGAAATTGCTGTTATAGGGGACAAAAT
TACTGTTAATAGTGAAATTTGCTAAGGCTGGCACTCCTTGGTTTTAATTAATTTATTTAT
TTAGTTGCACCAACAAAGTGATCATCAATACAAAACATTGACAAATTGACAAAAGTTCAT
GGCAGATGTCACCTCAATTATAGGTGCAATCGACAGTGCATTAACATCAAAAATAAAAAA
AATATACAGTTCAAACCATTGTTGTCGATGGAGATTACATGTTGATGTTTCATGACAAGT
ATCATCCATGCACCAAGATACAACTTAATTCATTAAATACATTTCTAATTTAACGTCGTG
GAAGGTTTTCACTATACTATGCAAAACTTAGTTCTATTATAAGTACCTATATAGGTTTAC
AGTAATTTAAAACATATTTTATTTATTAAGAATAATGTTAACATAACATTGAAACGTTGC
TTAAACTAAACACAAATATTAGAAGATAAAATATTTATACATCATTTCGTAGAGAATTAA
TTATCAACAATAATTTAACGAGATTTGAATTTTCAATAATTTATAAACAATACACCGTGC
ATTGTGATAACCATTCTGCGTCATGACCTTGCATGCCATCCAAAAGATTTGTTATCGACT
TCGACCTATTATTGGGAGTGCATTGATAGTAAGTATATAGGTTTACTAGATAATACGCAA
GTAAATACTAATCATACGAAAAATAAATATATTCTTTACATCAACATTCAAAAGACTACT
ATGTACTCTTATAATGTTACGCTATTGTCATTGCTGTCATTTAAAATATATTGTACTTTT
TGCCTACGCATTTGACTAAACAAATGTACAAAGAAAATACCTGTCACATTATGTAGGGAT
CTTTGCGATTTATGAGAAACTGTTTATTGTTAGTAAATACTATTAATTAAAACGGTGTTT
ATATTGTATTTACATTATACAGTACATAATACACTTATAATGACTTAGTGTGCCGATTAT
CGAATTATCTGCAGCGATAAATGTAGATATAAATACATCAACTTTATAAATACCTGTAAG
ACTACATATCGTCTTTACATTTTTATTCAGATTACAAACTCCTAGCTACGCTAAGTCTAA
TTTGGTATATACAAATAATTATAATTATTAAACTTCGATGAGTTTCAGGCTGATCTATTC
GCGCCTATTATGCATACCGACTTCGGTATAAATGATGTTAAATATCCGCTCCACCGAAAC
AGATCGAATTTTGTTACGAAAAAATTATCAGTCTCCGCATCGTAGCGACTTAAAATATTT
TTATGACGTTTTCGACAATAGCTTTATCAAAATCAGTTTAGTTAGTAACTAATTTAAGCG
TGATACACGAAGGGAAAAGTAATAATACATCAGTGAGTTGGTACAACCAATAATAATTTG
TATTCATAATTTTTTAGTACATAATATTATGTTTAATGTTATGTATTTTTTATAATTTCA
CGAGTTATAGCGTAATTAAAAGAAAGATTTACGTTTCAAATTGCATATTTATAGTAAAAT
ATTCCCATAATCAGTCAACCGTGACCGCTGAAAATGTATAGTAGGACTAAAAATAAGGAA
GGAAATAAGGTAATAAATCGATATTAAATAGGTACCTTCTGTTAAAAAAATATCCTTTTC
TTTTGTTACTATTACTAAAAAAAATTAATTTGTATGCAAACCATCGTCGGTTTGTTTTTC
GTTTAATTCATATTGATGAGATTGACAGTCGACGGTGTGATCTTTTATTTTGTACGATCC
AGGGCCTATTAGAGACAAGACCACTGGTAAAAATATTAAGCCGTTAAAAAGTCCGAATAA
TATAACCAGAAGGAAGATTTTGAAAAATGATTGGAACGTGTAAGCCTTTGACATACTAAG
TAAAGACAGAGAGAGGAGAGTGGAACCACCACCTAAAAGCACTGCTGTGCCAATGGACGT
TACTGTTTTGTAAGCTCTTTCGTGTCGCGATCCGTCCTGGATGGTTAAAAATGTATGGCC
TACATGCGCTGCGTAATCTACGCACAGACCAATGGCTAATTCAAGACCAATACAACAAAC
TATATCTACTGTCATTCCCCATCTCTGCATCCATCCTAAAACGTTCAAAATTGTTAACGA
GACACAAATAAAAATCCAGAAACACATCTGAAGATTTGTTATTAATATAATCGTACAAAC
CATAACACAAATCAAAGCTAGTTCAATGTTTCTCTCAACTTCGTTTGCAATTACCTCGTC
AGTTACCCAATTTCCGAATACTCTTGACCACACACTGCGGTAAACGTCACCTGCTATGCT
GGCTGTTTTTACAATGTTCTTAACCTCATGCATAGCGGGAATATATTCTTCAGGACCATG
GAATTTTGTAAATTTGAATGGAATTGAAGTGGCTAAAATTCTTGGGGCGGCTACTCCGCA
TGATAATGGTTCAGAAAATTTAAAGTTGGCCTGAAACTTCCCTCCCACAGGGCTAAATAG
AAACCGTGATAAATACTGATAAAATTCAAAATCAGTTACTGAGGATGTATTTTTTAGATC
GGTATTGTAATTTATCAAAACATATTTATGCAGATATTCAATCGATGTCATAGCCTCGCT
CACATACGATTTATTACCAATGCTTTCCATCATTTTACACAGGTTTGGAAACTCTTTTCT
GTAATTGAGTTTTCCGAGAAACACCATTGCGTCGTTCCCGTTTTCGGGGTAATAGTGATC
ATGAGTATCAAGATATTGTTTGTAATAGGTGTCGTCAGGAATAAACCATTTAGGGTCAAA
CCTTTGTTCCAACTTGAAAACAGCTTGTATACTAAATCCTGTTATTACTATAGTGAACAA
AATTACAATAATTTTTCCCGGAATCGTAAAAATAATATTCCTATATACGAATTCAAAAAT
ATTTCTCAGACAAGTCTTTTTCGTGGATATCTGTATTTGGTTCTTATGCTGATAGCAGAA
AATAAGACCATTGCAATTATTTTCAATTCTTATTACATCCAAAGTAAAGACTGCTACATA
AAACGTTACGGAAAAACAAAATATAAAAAAGACGCCCGTCGCTGCGTATAGGCAAAAAGA
TTTTAGTGATGGAAGAATTGTTATGGCTCCAATCAATAGAGCAACTATATCTGTAAATGA
AGTTATCACGATTGATACGCCTGCATGTTTTAGCATCAAACCAATTTTTACCGGGAGACT
TTTCTTTGCTTCACTTTCCGATAGATTTTTCCAGCAGGCTTTCATTACAAACATATCGTC
TATACCGAGACCCATTAGAAGGAATGGTAATGAAGAATGAACCGGACCAAATGGGATACC
AACAATAGAACACCAACTAACGGCAGATACGTATGCTAATCCTACACACAATAAACCTAC
GCTTCCGAGAGTCAATCTAATTTCCAACCAATTAAAACGGGATAGACCAAATTGTACGTA
AACGAACATTAGTAGAATCCCCAAAAAGAGTTTGTCTAAATCGTGAAACATGCTTTCGCC
ACTAACGTCAGCGAAACTTCTACCTGCTTCGTAAAATATTTTGACTGATTTAGTATTAAG
AGAGATGCTGGTTAAAGCTTCCAAAAATTGTTTTTCCCAAGACGCCAGTGGAACAGTTAC
CCAATCTTCTGTACCTACCAAGTTACCTACGTCATCTAAATTGACTTCTGACATATTTAC
TTTTGTATAAAATGTGAGTAATACAGACTTGGCAGAAATAATTTTACCTTTGTCATCGTA
TTCTAAACCTCCTAATATTTTGGTATAATCAAATGGATGGCCGCTTACAGGGTTGACCTT
AATCGAATTAACTTTTTCTATAATATCATGTTTATTCAAACTACTTATTATATTTAGATC
ATTCTTCCATATGTCTAACAAATTATATTGGAGACAGGTTAGTTCAAATTCTTCTAAGAA
ACTGCAATAGAATTCACTATCAACCCATAAAGTCGGGTCTTCAAAAACACTGTCACTGTA
ATCACTATTAGCTGAATTATTTGTTTTATCACTAGTTTTAATTGACCCTGTATTAAAGTT
TGAGCCAAAAAAATTCACAACAGGAACTTTGTAACACAAATCAGTAAGAGAAATGGATTG
ATTTTCATACTTAATATTTAGGGCACTTATTCTCTCAGTAATGTCGTTTATTTCTATGAG
TACATCTGGGTGTAATATATCATTTGCGGTGAAAATAATGTTTTGAAGTCTGAGGCCTGT
GCCGAATGTTTTGATATACCAGTTTGTATCGTGATAAAAATCTGAATCTGGCGGGACCCA
TAAGTTCATTGGATTCTTTTCTATGTGGAACCGTATTAAGCCGATACAGCTCACAGTAAC
AAATAATAATGTCCCAAAAATGACTTGCCATGGATGCTTTGCCACAAAGATGCCAAGCGA
AAAAAAAATGCTTTCAACAAAATGCACCGAAACAGATGACACCCCTTCCCATATCTGTTG
TGGAGTCTTGACATTTTTCTTTTTTGACATTTTGGAACAATTCACTGCACTTGTTGAGTA
TGATTTAATTTCGCGCCATATTTATTTTGTATGATTTCGTAAATAGTTTTTGTAATGTAA
GCATAAATATACTTCTAAAGAGTCGCAACACATTACATATCTAAATAATGTTATGTAAAA
AAATAAATAAATAATCACTTGTCACAATCACACACTCAGAATGCATTACTGTTTTATTTG
AGAGCTAATTGTTTACTGCGGCACGGACATGCGGAGAGCGCGCGCCGCTTCTTGCTACTG
ATGTTATCTCTGCCGAGTACTATATGAACGCAGCTAAGCACTGCCGGCCGTACTCCGAG
(5459 bp)

- SilkBase 1999-2023 -