SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoFB_comp10550_c2_seq46
Scaffold_idBomo_Scaf048
NCBI non-redundant
(nr)
putative_conserved_plasma_membrane_protein_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0005319 F lipid transporter activity
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005635 C nuclear envelope
GO:0005764 C lysosome
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0005768 C endosome
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0006629 P lipid metabolic process
GO:0007041 P lysosomal transport
GO:0007165 P signal transduction
GO:0008158 F hedgehog receptor activity
GO:0008202 P steroid metabolic process
GO:0008203 P cholesterol metabolic process
GO:0008206 P bile acid metabolic process
GO:0015485 F cholesterol binding
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030301 P cholesterol transport
GO:0031902 C late endosome membrane
GO:0042632 P cholesterol homeostasis
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
Transcript
Level
FPKM:1.75 TPM:1.92
ORF EntryO_BomoFB15794_complete:A_BomoFB_comp10550_c2_seq46
Sequence
(Nucleotide)
TTTGTGGATATAAAAATCTGATTTTGTCTGTAGCACTAGTAAGCCTTCAGAGTAAATAAG
AAAAAAAAAGGGTCTAACTTATACAGTTTTAAAAGAAAAATGCTTCTAATAACCACTTTC
ATGTAACTCTCCACAATAATAAAGAAGCAAACAATTTGCATCTAAAAATATACATTCCTT
TTAAATATAAAGTGAATATGTTACGTAGTGCAATATATAAATCTTAAACAATTACTCTTG
AAAACTAATTTATATTCAAACACATTCCGTAAAACGGGGTGAATAAGGGCAAATCCCACA
ATTTTTAAGGTAGTTATTGATGAATATAATGCTATATCAGAATCAAAATGATTGAGTCTT
AGGCGTATCTTTGTTATCCAATTTAAAATTGTGCAATTAGCATTCCAGTTTAAGCAAAAA
TACCTAGGCGATATCCCTATTCACAGATATTGGGGTTAATGGGGACGAAATTAGTGTTAA
TAGAGAAATTTTCTAGGGCTGGCACTACTTGGTTTTAGTTAATTAATTAATTTATTTATT
TAGTTGCACCAACAAAGTGATCATCAATACAAAACATTGACAAATTGACAAAAGTTCATG
GCAGATGTCACCTCAATTATAGGTGCAATCGACAGTGCATTAACATCAAAAATAAAAAAA
ATATACAGTTCAAACCATTGTTGTCGATGGAGATTACATGTTGATGTTTCATGACAAGTA
TCATCCATGCACCAAGATACAACTTAATTCATTAAATACATTTCTAATTTAACGTCGTGG
AAGGTTTTCACTATACTATGCAAAACTTAGTTCTATTATAAGTACCTATATAGGTTTACA
GTAATTTAAAACATATTTTATTTATTAAGAATAATGTTAACATAACATTGAAACGTTGCT
TAAACTAAACACAAATATTAGAAGATAAAATATTTATACATCATTTCGTAGAGAATTAAT
TATCAACAATAATTTAACGAGATTTGAATTTTCAATAATTTATAAACAATACACCGTGCA
TTGTGATAACCATTCTGCGTCATGACCTTGCATGCCATCCAAAAGATTTGTTATCGACTT
CGACCTATTATTGGGAGTGCATTGATAGTAAGTATATAGGTTTACTAGATAATACGCAAG
TAAATACTAATCATACGAAAAATAAATATATTCTTTACATCAACATTCAAAAGACTACTA
TGTACTCTTATAATGTTACGCTATTGTCATTGCTGTCATTTAAAATATATTGTACTTTTT
GCCTACGCATTTGACTAAACAAATGTACAAAGAAAATACCTGTCACATTATGTAGGGATC
TTTGCGATTTATGAGAAACTGTTTATTGTTAGTAAATACTATTAATTAAAACGGTGTTTA
TATTGTATTTACATTATACAGTACATAATACACTTATAATGACTTAGTGTGCCGATTATC
GAATTATCTGCAGCGATAAATGTAGATATAAATACATCAACTTTATAAATACCTGTAAGA
CTACATATCGTCTTTACATTTTTATTCAGATTACAAACTCCTAGCTACGCTAAGTCTAAT
TTGGTATATACAAATAATTATAATTATTAAACTTCGATGAGTTTCAGGCTGATCTATTCG
CGCCTATTATGCATACCGACTTCGGTATAAATGATGTTAAATATCCGCTCCACCGAAACA
GATCGAATTTTGTTACGAAAAAATTATCAGTCTCCGCATCGTAGCGACTTAAAATATTTT
TATGACGTTTTCGACAATAGCTTTATCAAAATCAGTTTAGTTAGTAACTAATTTAAGCGT
GATACACGAAGGGAAAAGTAATAATACATCAGTGAGTTGGTACAACCAATAATAATTTGT
ATTCATAATTTTTTAGTACATAATATTATGTTTAATGTTATGTATTTTTTATAATTTCAC
GAGTTATAGCGTAATTAAAAGAAAGATTTACGTTTCAAATTGCATATTTATAGTAAAATA
TTCCCATAATCAGTCAACCGTGACCGCTGAAAATGTATAGTAGGACTAAAAATAAGGAAG
GAAATAAGGTAATAAATCGATATTAAATAGGTACCTTCTGTTAAAAAAATATCCTTTTCT
TTTGTTACTATTACTAAAAAAAATTAATTTGTATGCAAACCATCGTCGGTTTGTTTTTCG
TTTAATTCATATTGATGAGATTGACAGTCGACGGTGTGATCTTTTATTTTGTACGATCCA
GGGCCTATTAGAGACAAGACCACTGGTAAAAATATTAAGCCGTTAAAAAGTCCGAATAAT
ATAACCAGAAGGAAGATTTTGAAAAATGATTGGAACGTGTAAGCCTTTGACATACTAAGT
AAAGACAGAGAGAGGAGAGTGGAACCACCACCTAAAAGCACTGCTGTGCCAATGGACGTT
ACTGTTTTGTAAGCTCTTTCGTGTCGCGATCCGTCCTGGATGGTTAAAAATGTATGGCCT
ACATGCGCTGCGTAATCTACGCACAGACCAATGGCTAATTCAAGACCAATACAACAAACT
ATATCTACTGTCATTCCCCATCTCTGCATCCATCCTAAAACGTTCAAAATTGTTAACGAG
ACACAAATAAAAATCCAGAAACACATCTGAAGATTTGTTATTAATATAATCGTACAAACC
ATAACACAAATCAAAGCTAGTTCAATGTTTCTCTCAACTTCGTTTGCAATTACCTCGTCA
GTTACCCAATTTCCGAATACTCTTGACCACACACTGCGGTAAACGTCACCTGCTATGCTG
GCTGTTTTTACAATGTTCTTAACCTCATGCATAGCGGGAATATATTCTTCAGGACCATGG
AATTTTGTAAATTTGAATGGAATTGAAGTGGCTAAAATTCTTGGGGCGGCTACTCCGCAT
GATAATGGTTCAGAAAATTTAAAGTTGGCCTGAAACTTCCCTCCCACAGGGCTAAATAGA
AACCGTGATAAATACTGATAAAATTCAAAATCAGTTACTGAGGATGTATTTTTTAGATCG
GTATTGTAATTTATCAAAACATATTTATGCAGATATTCAATCGATGTCATAGCCTCGCTC
ACATACGATTTATTACCAATGCTTTCCATCATTTTACACAGGTTTGGAAACTCTTTTCTG
TAATTGAGTTTTCCGAGAAACACCATTGCGTCGTTCCCGTTTTCGGGGTAATAGTGATCA
TGAGTATCAAGATATTGTTTGTAATAGGTGTCGTCAGGAATAAACCATTTAGGGTCAAAC
CTTTGTTCCAACTTGAAAACAGCTTGTATACTAAATCCTGTTATTACTATAGTGAACAAA
ATTACAATAATTTTTCCCGGAATCGTAAAAATAATATTCCTATATACGAATTCAAAAATA
TTTCTCAGACAAGTCTTTTTCGTGGATATCTGTATTTGGTTCTTATGCTGATAGCAGAAA
ATAAGACCATTGCAATTATTTTCAATTCTTATTACATCCAAAGTAAAGACTGCTACATAA
AACGTTACGGAAAAACAAAATATAAAAAAGACGCCCGTCGCTGCGTATAGGCAAAAAGAT
TTTAGTGATGGAAGAATTGTTATGGCTCCAATCAATAGAGCAACTATATCTGTAAATGAA
GTTATCACGATTGATACGCCTGCATGTTTTAGCATCAAACCAATTTTTACCGGGAGACTT
TTCTTTGCTTCACTTTCCGATAGATTTTTCCAGCAGGCTTTCATTACAAACATATCGTCT
ATACCGAGACCCATTAGAAGGAATGGTAATGAAGAATGAACCGGACCAAATGGGATACCA
ACAATAGAACACCAACTAACGGCAGATACGTATGCTAATCCTACACACAATAAACCTACG
CTTCCGAGAGTCAATCTAATTTCCAACCAATTAAAACGGGATAGACCAAATTGTACGTAA
ACGAACATTAGTAGAATCCCCAAAAAGAGTTTGTCTAAATCGTGAAACATGCTTTCGCCA
CTAACGTCAGCGAAACTTCTACCTGCTTCGTAAAATATTTTGACTGATTTAGTATTAAGA
GAGATGCTGGTTAAAGCTTCCAAAAATTGTTTTTCCCAAGACGCCAGTGGAACAGTTACC
CAATCTTCTGTACCTACCAAGTTACCTACGTCATCTAAATTGACTTCTGACATATTTACT
TTTGTATAAAATGTGAGTAATACAGACTTGGCAGAAATAATTTTACCTTTGTCATCGTAT
TCTAAACCTCCTAATATTTTGGTATAATCAAATGGATGGCCGCTTACAGGGTTGACCTTA
ATCGAATTAACTTTTTCTATAATATCATGTTTATTCAAACTACTTATTATATTTAGATCA
TTCTTCCATATGTCTAACAAATTATATTGGAGACAGGTTAGTTCAAATTCTTCTAAGAAA
CTGCAATAGAATTCACTATCAACCCATAAAGTCGGGTCTTCAAAAACACTGTCACTGTAA
TCACTATTAGCTGAATTATTTGTTTTATCACTAGTTTTAATTGACCCTGTATTAAAGTTT
GAGCCAAAAAAATTCACAACAGGAACTTTGTAACACAAATCAGTAAGAGAAATGGATTGA
TTTTCATACTTAATATTTAGGGCACTTATTCTCTCAGTAATGTCGTTTATTTCTATGAGT
ACATCTGGGTGTAATATATCATTTGCGGTGAAAATAATGTTTTGAAGTCTGAGGCCTGTG
CCGAATGTTTTGATATACCAGTTTGTATCGTGATAAAAATCTGAATCTGGCGGGACCCAT
AAGTTCATTGGATTCTTTTCTATGTGGAACCGTATTAAGCCGATACAGCTCACAGTAACA
AATAATAATGTCCCAAAAATGACTTGCCATGGATGCTTTGCCACAAAGATGCCAAGCGAA
AAAAAAATGCTTTCAACAAAATGCACCGAAACAGATGACACCCCTTCCCATATCTGTTGT
GGAGTCTTGACATTTTTCTTTTTTGACATTTTGGAACAATTCACTGCACTTGTTGAGTAT
GATTTAATTTCGCGCCATATTTATTTTGTATGATTTCGTAAATAGTTTTTGTAATGTAAG
CATAAATATACTTCTAAAGAGTCGCAACACATTACATATCTAAATAATGTTATGTAAAAA
AATAAATAAATAATCACTTGTCACAATCACACACTCAGAATGCATTACTGTTTTATTTGA
GAGCTAATTGTTTACTGCGGCACGGACATGCGGAGAGCGCGCGCCGCTTCTTGCTACTGA
TGTTATCTCTGCCGAGTACTATATGAACGCAGCTAAGCACTGCCGGCCGTACTCCGAG
(5278 bp)

- SilkBase 1999-2023 -