SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoFB_comp10550_c2_seq43
Scaffold_idBomo_Scaf048
NCBI non-redundant
(nr)		putative_conserved_plasma_membrane_protein_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0005319 F lipid transporter activity
GO:0005576 C extracellular region
GO:0005635 C nuclear envelope
GO:0005764 C lysosome
GO:0005765 C lysosomal membrane
GO:0005768 C endosome
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005887 C integral component of plasma membrane
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0006629 P lipid metabolic process
GO:0007041 P lysosomal transport
GO:0007165 P signal transduction
GO:0008158 F hedgehog receptor activity
GO:0008202 P steroid metabolic process
GO:0008203 P cholesterol metabolic process
GO:0008206 P bile acid metabolic process
GO:0015485 F cholesterol binding
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030301 P cholesterol transport
GO:0031902 C late endosome membrane
GO:0042632 P cholesterol homeostasis
GO:0048471 C perinuclear region of cytoplasm
Transcript
Level		FPKM:0.00 TPM:0.00
ORF EntryO_BomoFB15792_complete:A_BomoFB_comp10550_c2_seq43
Sequence
(Nucleotide)
TGTAAAAATACGAACGATGTTTTTTTTTCCAAAAATTTTACCTTGTTTTGTGTATGACCC
ATATCTATGACAGCTGTGTTTATTGTGTTATCTGTGACCACGGCAATGCTGCGCTGTCTT
AAAAGTAGGTTTCATACTTCTATTTATCTATCTCTTAGGTTTATGGCGTTTCCTTTTAGA
TTTCGCCAATGTCAAGTGTATTTAATACTCTGCTTTCTATAGCGGGCTTCGTGAACGAGC
AAGGTCACAGATATTCACTAAGAATTAAGTGAGTAGCTAAGAATGACTTTTACCCTCCAT
ATCGTACCGTAAAATGGGGCGATTAGGGACAAATTCCAACTTTATGAGCAATTTTAAGGT
AGTTGTTGATGTATATAATGCTATATCAGGATCAAAATGATTGAGTCTTGGGGGCATCTT
TGTTGTCTAATTTAAAATTATGCAACTAGCATTCCAGTTTAAGCAAAAAATGCAAAAATA
GGTGTAATCCCTATTTACCCGAAAATTGCGGTTAATTGGGACGAAATGAGAAATTTGCTA
GGGTTGGCACTACTTTTATTTTTATATATAGTTTTAATTAATTAATTTATATAGTTGCAC
CAACAAAGTGATCATCAATACAAAACATTGACAAATTGACAAAAGTTCATGGCAGATGTC
ACCTCAATTATAGGTGCAATCGACAGTGCATTAACATCAAAAATAAAAAAAATATACAGT
TCAAACCATTGTTGTCGATGGAGATTACATGTTGATGTTTCATGACAAGTATCATCCATG
CACCAAGATACAACTTAATTCATTAAATACATTTCTAATTTAACGTCGTGGAAGGTTTTC
ACTATACTATGCAAAACTTAGTTCTATTATAAGTACCTATATAGGTTTACAGTAATTTAA
AACATATTTTATTTATTAAGAATAATGTTAACATAACATTGAAACGTTGCTTAAACTAAA
CACAAATATTAGAAGATAAAATATTTATACATCATTTCGTAGAGAATTAATTATCAACAA
TAATTTAACGAGATTTGAATTTTCAATAATTTATAAACAATACACCGTGCATTGTGATAA
CCATTCTGCGTCATGACCTTGCATGCCATCCAAAAGATTTGTTATCGACTTCGACCTATT
ATTGGGAGTGCATTGATAGTAAGTATATAGGTTTACTAGATAATACGCAAGTAAATACTA
ATCATACGAAAAATAAATATATTCTTTACATCAACATTCAAAAGACTACTATGTACTCTT
ATAATGTTACGCTATTGTCATTGCTGTCATTTAAAATATATTGTACTTTTTGCCTACGCA
TTTGACTAAACAAATGTACAAAGAAAATACCTGTCACATTATGTAGGGATCTTTGCGATT
TATGAGAAACTGTTTATTGTTAGTAAATACTATTAATTAAAACGGTGTTTATATTGTATT
TACATTATACAGTACATAATACACTTATAATGACTTAGTGTGCCGATTATCGAATTATCT
GCAGCGATAAATGTAGATATAAATACATCAACTTTATAAATACCTGTAAGACTACATATC
GTCTTTACATTTTTATTCAGATTACAAACTCCTAGCTACGCTAAGTCTAATTTGGTATAT
ACAAATAATTATAATTATTAAACTTCGATGAGTTTCAGGCTGATCTATTCGCGCCTATTA
TGCATACCGACTTCGGTATAAATGATGTTAAATATCCGCTCCACCGAAACAGATCGAATT
TTGTTACGAAAAAATTATCAGTCTCCGCATCGTAGCGACTTAAAATATTTTTATGACGTT
TTCGACAATAGCTTTATCAAAATCAGTTTAGTTAGTAACTAATTTAAGCGTGATACACGA
AGGGAAAAGTAATAATACATCAGTGAGTTGGTACAACCAATAATAATTTGTATTCATAAT
TTTTTAGTACATAATATTATGTTTAATGTTATGTATTTTTTATAATTTCACGAGTTATAG
CGTAATTAAAAGAAAGATTTACGTTTCAAATTGCATATTTATAGTAAAATATTCCCATAA
TCAGTCAACCGTGACCGCTGAAAATGTATAGTAGGACTAAAAATAAGGAAGGAAATAAGG
TAATAAATCGATATTAAATAGGTACCTTCTGTTAAAAAAATATCCTTTTCTTTTGTTACT
ATTACTAAAAAAAATTAATTTGTATGCAAACCATCGTCGGTTTGTTTTTCGTTTAATTCA
TATTGATGAGATTGACAGTCGACGGTGTGATCTTTTATTTTGTACGATCCAGGGCCTATT
AGAGACAAGACCACTGGTAAAAATATTAAGCCGTTAAAAAGTCCGAATAATATAACCAGA
AGGAAGATTTTGAAAAATGATTGGAACGTGTAAGCCTTTGACATACTAAGTAAAGACAGA
GAGAGGAGAGTGGAACCACCACCTAAAAGCACTGCTGTGCCAATGGACGTTACTGTTTTG
TAAGCTCTTTCGTGTCGCGATCCGTCCTGGATGGTTAAAAATGTATGGCCTACATGCGCT
GCGTAATCTACGCACAGACCAATGGCTAATTCAAGACCAATACAACAAACTATATCTACT
GTCATTCCCCATCTCTGCATCCATCCTAAAACGTTCAAAATTGTTAACGAGACACAAATA
AAAATCCAGAAACACATCTGAAGATTTGTTATTAATATAATCGTACAAACCATAACACAA
ATCAAAGCTAGTTCAATGTTTCTCTCAACTTCGTTTGCAATTACCTCGTCAGTTACCCAA
TTTCCGAATACTCTTGACCACACACTGCGGTAAACGTCACCTGCTATGCTGGCTGTTTTT
ACAATGTTCTTAACCTCATGCATAGCGGGAATATATTCTTCAGGACCATGGAATTTTGTA
AATTTGAATGGAATTGAAGTGGCTAAAATTCTTGGGGCGGCTACTCCGCATGATAATGGT
TCAGAAAATTTAAAGTTGGCCTGAAACTTCCCTCCCACAGGGCTAAATAGAAACCGTGAT
AAATACTGATAAAATTCAAAATCAGTTACTGAGGATGTATTTTTTAGATCGGTATTGTAA
TTTATCAAAACATATTTATGCAGATATTCAATCGATGTCATAGCCTCGCTCACATACGAT
TTATTACCAATGCTTTCCATCATTTTACACAGGTTTGGAAACTCTTTTCTGTAATTGAGT
TTTCCGAGAAACACCATTGCGTCGTTCCCGTTTTCGGGGTAATAGTGATCATGAGTATCA
AGATATTGTTTGTAATAGGTGTCGTCAGGAATAAACCATTTAGGGTCAAACCTTTGTTCC
AACTTGAAAACAGCTTGTATACTAAATCCTGTTATTACTATAGTGAACAAAATTACAATA
ATTTTTCCCGGAATCGTAAAAATAATATTCCTATATACGAATTCAAAAATATTTCTCAGA
CAAGTCTTTTTCGTGGATATCTGTATTTGGTTCTTATGCTGATAGCAGAAAATAAGACCA
TTGCAATTATTTTCAATTCTTATTACATCCAAAGTAAAGACTGCTACATAAAACGTTACG
GAAAAACAAAATATAAAAAAGACGCCCGTCGCTGCGTATAGGCAAAAAGATTTTAGTGAT
GGAAGAATTGTTATGGCTCCAATCAATAGAGCAACTATATCTGTAAATGAAGTTATCACG
ATTGATACGCCTGCATGTTTTAGCATCAAACCAATTTTTACCGGGAGACTTTTCTTTGCT
TCACTTTCCGATAGATTTTTCCAGCAGGCTTTCATTACAAACATATCGTCTATACCGAGA
CCCATTAGAAGGAATGGTAATGAAGAATGAACCGGACCAAATGGGATACCAACAATAGAA
CACCAACTAACGGCAGATACGTATGCTAATCCTACACACAATAAACCTACGCTTCCGAGA
GTCAATCTAATTTCCAACCAATTAAAACGGGATAGACCAAATTGTACGTAAACGAACATT
AGTAGAATCCCCAAAAAGAGTTTGTCTAAATCGTGAAACATGCTTTCGCCACTAACGTCA
GCGAAACTTCTACCTGCTTCGTAAAATATTTTGACTGATTTAGTATTAAGAGAGATGCTG
GTTAAAGCTTCCAAAAATTGTTTTTCCCAAGACGCCAGTGGAACAGTTACCCAATCTTCT
GTACCTACCAAGTTACCTACGTCATCTAAATTGACTTCTGACATATTTACTTTTGTATAA
AATGTGAGTAATACAGACTTGGCAGAAATAATTTTACCTTTGTCATCGTATTCTAAACCT
CCTAATATTTTGGTATAATCAAATGGATGGCCGCTTACAGGGTTGACCTTAATCGAATTA
ACTTTTTCTATAATATCATGTTTATTCAAACTACTTATTATATTTAGATCATTCTTCCAT
ATGTCTAACAAATTATATTGGAGACAGGTTAGTTCAAATTCTTCTAAGAAACTGCAATAG
AATTCACTATCAACCCATAAAGTCGGGTCTTCAAAAACACTGTCACTGTAATCACTATTA
GCTGAATTATTTGTTTTATCACTAGTTTTAATTGACCCTGTATTAAAGTTTGAGCCAAAA
AAATTCACAACAGGAACTTTGTAACACAAATCAGTAAGAGAAATGGATTGATTTTCATAC
TTAATATTTAGGGCACTTATTCTCTCAGTAATGTCGTTTATTTCTATGAGTACATCTGGG
TGTAATATATCATTTGCGGTGAAAATAATGTTTTGAAGTCTGAGGCCTGTGCCGAATGTT
TTGATATACCAGTTTGTATCGTGATAAAAATCTGAATCTGGCGGGACCCATAAGTTCATT
GGATTCTTTTCTATGTGGAACCGTATTAAGCCGATACAGCTCACAGTAACAAATAATAAT
GTCCCAAAAATGACTTGCCATGGATGCTTTGCCACAAAGATGCCAAGCGAAAAAAAAATG
CTTTCAACAAAATGCACCGAAACAGATGACACCCCTTCCCATATCTGTTGTGGAGTCTTG
ACATTTTTCTTTTTTGACATTTTGGAACAATTCACTGCACTTGTTGAGTATGATTTAATT
TCGCGCCATATTTATTTTGTATGATTTCGTAAATAGTTTTTGTAATGTAAGCATAAATAT
ACTTCTAAAGAGTCGCAACACATTACATATCTAAATAATGTTATGTAAAAAAATAAATAA
ATAATCACTTGTCACAATCACACACTCAGAATGCATTACTGTTTTATTTGAGAGCTAATT
GTTTACTGCGGCACGGACATGCGGAGAGCGCGCGCCGCTTCTTGCTACTGATGTTATCTC
TGCCGAGTACTATATGAACGCAGCTAAGCACTGCCGGCCGTACTCCGAG
(5329 bp)

- SilkBase 1999-2023 -