SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoFB_comp10539_c1_seq21
Scaffold_idBomo_Scaf022
NCBI non-redundant
(nr)		putative_ubiquitin-conjugating_enzyme_E2_g_[Danaus_plexippus]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0016740 F transferase activity
GO:0018279 P protein N-linked glycosylation via asparagine
GO:0030433 P ubiquitin-dependent ERAD pathway
GO:0070936 P protein K48-linked ubiquitination
Transcript
Level		FPKM:12.38 TPM:13.56
ORF EntryO_BomoFB15591_complete:A_BomoFB_comp10539_c1_seq21
Sequence
(Nucleotide)
GCTAGGTTGTTTGTGATTGTTTCCTTTGCCGGTATATTAGAATATTCCAACGATAAAATC
TGAATTCTGATGACAGAGTCAGACAAATCAGAGGGAAGTCAAAAACAGGGTACAATACTT
TGACTTCGTATTTTTAACCAGATTAAGTTTCCATTGAAATACGTTAACAATTCATCAAAT
AAAAACCCCAGTTTAATCCCAGAAAAAAAAAGAACGATAAGACAAGTATAAATAGTACTT
TGAATAATTTCACTGGGCATTAAAGCGTTCTCTGTCGTCCTCATTAACTGCATTGGATTA
CATTAACTGTTAACTTTATTCTCGCAAACTGAGATCATTCCGTGCAGTATATTGGTTATT
CAGTGTGCTCTCGAACGCCACTGAGTAAATTTTTGGCCCCAACGTACCATTTTGTCATTC
AAAATTACGGACCAAATGATGGCTGGTTCTGCATTGCGGAGGTTGATGGCAGAATATAAG
CAATTAACAGTAAATCCGCCGGAAGGTATTATAGCTGGGCCTATAAATGAAGATAACTTC
TTCGAATGGGAAGCCTTCATAACAGGTCCTGAAGGCACGTGTTTTGAAGGTGGCATTTTT
CCAGCAAAATTAGTCTTCCCACCTGATTATCCATTGAGTCCTCCAAAGATGCAATTTTTG
TGTGAAATGTTTCATCCGAACATATATGCTGATGGTCGGGTATGCATATCAATCTTACAT
GCACCAGGTGATGATCCAATGGGCTACGAAACCAGTGCTGAAAGATGGTCACCTGTACAA
AGTGTCGAAAAAATACTGCTCTCTGTTGTCAGCATGTTAGCAGAACCCAACGACGAAAGT
GGAGCCAATGTCGATGCTGCCAAAATGTGGAGAGAAGACAGAGAACAATTTAATAAAATA
GCCGAAGAAATCGTAAGGAAAACTCTGGACCTGCCCCCTCCTTAATATTTTATTTCTTGA
TTATTTTATATCAATATCTAAATGAGATGCTAAGTAAATGCTGAAATGGATATCACGTTT
AGGTACGGTATTTTATTATTCGCAAATTATATTTATAATGTTATATAATATATTCACTTT
TAACAAACATTTTTATCAACTTTTATCTGCAAAGCTCATGCATAAAATATTAGAATGTTG
CCAACTAGTTTTGGAAGCCTTATTAGACTTTGCTTGTTATATCAATTATATTGACTTAAG
GAGCGTCAATTAACAAACCGATTGACCTCTGGTCATTTTATTTATCATGAAAGAGATATG
AAACTTTTAACAGAAATAATGTTTTGTATTTATAAATGTTGAAGTTACAATTTGTTAAAC
TACAATAATTATATTCATATAAAGGTTTTTAACATTAAACTTTATGAGACCTGCTTAGCC
AATCGAGGAAAGCATCACGGGCTTGGTACTGCAATGTAAAATTTACAGAACAAATTTCCT
ACTTAATTAATTCTAGTTTTGAGTAGCTGTGGTAGAGAGGGTTTTGAGAACCTATGAGTT
GGTATCATAATCATATTTATAATGAAAAATGAAGCAATAATTTGTACATGGTTTGAAGAT
TTTTGGGTATGTATTTTATTATAATGTGATGGATTCTGACATTTGTGTTGTGTAGTAGTA
CAAGATGGTAATTTAACTAAAAAAAAAATAAAGTTCAAATATAGACATGGTTTTAATAGG
CTATTTAGATTTTATTATTGCAATGTTGAGTAATATAATGAATCTTGTTAAAACATAAGA
GTTATTTACAAATGTTTTAAAAGTTAAAGAATATGCCAATAATAAAGGGTTGTTAACAGA
TCGTTTCCGAAGCCGAAACGAGAATAAATAGCTAATCTAAAGTGAAAGTGTACTGTGAAC
TACCTAAGTAGAGCAATAAAAAACAAAGAGCTATGAATGTTATGGAAAAACTAACATAAT
ACTAAATACTTCTTGTTTAAAAAAATATGAATTAATGTCCCAGTAATGTACCTAAATGTA
AACAAGCAAATTATGATTATGTTCCTCACTCAACATTGTAGGTCCCATGAGTCACTTGAT
TTTATTATAACAGACCAAATGTAAATGAGTAAATAAATTCCTAAAATGGAATTAATATTT
CAGGAGCGATTTCAAACAACCTGTATAATAATATTATGTCTATTTATATATATACTGAGA
TAAAGTGTGACATAATTGAATTAAAAAAAATGACAAAATAAAAAAGCAATAGATCTTCAC
AAATATATATTTTTATACTATTTAAATGTAATAATATACACTGATATACATTTGTTATAA
AGTTGCAGTTTTTATTGAGATATCCAGTAATTTGTGCCTCAAATGATTGCCTAGCGAAAT
TTGTTGCTACAGCAATTTCCATATAATACCATCAAGATACAGTTATTACATCAAGATAGT
TATAAACAAATTTTTCATATTTAAAAAAAAGTTGTAAACTATTTACTAAATTAACCAAAT
TTATGAAAATTATAGTTAACTTCCTTTTTGATAAATACGAAAGCATTAGATTTCATCTTT
GTACTTATTATTAGTCCACAAAATAGTTGGTTTGAATTCAATTGAGATGTTTTTGCAAAC
ACCTAAATTACTCACAGCACTTGATATTTAATTTGGTTTTAAATATTTTATTATTATATT
AAATTAAATTATATAAACTATACTTAATTTTTTATTTAATGACATTTTTATTACAATACA
AAGAGCCATTTAGATAGATTTTATCACATGTTTCATAGTGAGAATTGACATAGTAAGTAC
TTTTGTGAAAAAATCGCAGTACTATCATATGAACTTGGCACACAAGCAAGAATCAAAATG
TCCCCTATGGGTGTGTCATCCGAGATTTAAAAGTATCTTGTTCTTTCAAATTCATATGAA
TATCAAACGAGTAGTTTTGGGTGCGAGTTTGGTCATTCAAATTTGCTAATTTTATACAGA
TACATTCATTAAACAATATTGTGGCGATCATTGTCCGCGTATTAGGAGGAGAATTGCTTA
AATCTACATTAAAAAACTTTTTGTAAACAAGAAACTCTCCATCTAACTGGCCTTTAACTT
AAAAGTGAGTCACAGATTTTTTCAATTTGAAGGAACGGTATTCTGTGGTGGTTTTCCAAT
TACAGCACAAGAGCGCACTATGCGGCATAATGCTCAACGTTGAATGTTGCAACTACAGCA
CAATCGAGCACTCTCAAAAGTACTGCTCTCGCGTGATACTCGCAATCGATACCGACTCAG
TGACAGAAAATTGACAAGTGTTTTTTCTTTAAGTTGGCATTGATCGAAATTTTGTTTATA
TTATCGTTAGTAATATTATTTAATGTTGAAAAAAATTGTAAGGCTTTCGTTTCGTCGTAG
TTTCTTAGAAATAATCAATGTTAATTAAAACTGTGCTAACTTAGCGCACTCTGCTGATGC
ATTTGAAAACTAATTCACGTTCCAATTAAGCTTCAGCATAATTCGGCATTGTGCGTCACT
GAGTCGCATTATGCTCTGTAATTAACCATTACTTAATGGTAG
(3522 bp)

- SilkBase 1999-2023 -