SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoFB_comp10533_c2_seq13
Scaffold_idBomo_Scaf022
NCBI non-redundant
(nr)		methylglutaconyl-CoA_hydratase_[Agrotis_segetum]
Ontology
GO:0003824 F catalytic activity
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005739 C mitochondrion
GO:0006629 P lipid metabolic process
GO:0006631 P fatty acid metabolic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016829 F lyase activity
Transcript
Level		FPKM:1.27 TPM:1.39
ORF EntryO_BomoFB15501_complete:A_BomoFB_comp10533_c2_seq13
Sequence
(Nucleotide)
CAATTTTTATTTCATATAAATAAACAGTTTAGGAAGCATAAACGATAATTAAGTACAAAT
TAAGAAATGGATGGTCTATAAGGAATGTTGCCATTTATAATAATAACATTGCCACACATA
TAGTGAGTATAAAAAGATCCCCGTGCCGACTATAAACAATAGAATACAATATTCATTTAC
TAAACTATACATAAATGCTTGTAATTTTAAAGAGTTCATATTATTATATTTAACGAATCT
CTAGTGTACAGCAAAGACAGCAAGCAGTGGTTTCTGAGAGGCCATTGACCCCAGATGACG
GCTGAGTCGTTCCCGCGAGGTCATTGACCTCGGATGTCAGCTGGTTAACATTTTTTACTT
AGTGCCAGCTGTATCTGGTACTTTCAGTTCTACTTGGCTTGCTTATTGCTGTGACGAACT
CAACACATCCTGTTTTAATTTTTTTATCACTCAAAAGTATCAATTGATCTCAACATACTA
TTTTAAATGGTGACACAATAATAGTAACCCGAAACAGGCTGTCAGATGAATTGTGCAATA
ACACTTTTATTGACAAAGACCAGTGGTTCTCAACCTTCTTTACTCTGCGATGGGCTAACA
TAATCTTTACACTTTCGCGACACCCTTACTTACATGCAACATTTATGATAATTAAAGTGA
AGGTAGGTACTAGGTACATTTATTAACTTATGCATCGTAGATATGTTGAACATAGTTGTA
CAGTTAACATCTAGTAAACATTTGTATATACAGTCAAAACCGTTTACTTTGACATCGTTT
AATACAACATGCCGGTTATAATAACCAAGAACAAAGGTCCCGGCTGAATGCCATATGACC
GCCTTATTAAAAATATTGCTTTCTACGACATTGGTAATAACGACATACCTCATAAAACGA
CCACTAATATTTCGGAGAATTAGATCTGTTAGAACGACCGGCTAAGCTGTATTGTAAACA
ATTTGAATAGGTATCCACATTTGTCTTCAATGGCTATTAAAATCAGGAAAGAAAACAATA
GGATTTAGTTTAGTGTAGGGTCTTTTCTAATTCTTAGAAACAAAACACGTGCATGCGGTA
GTCAAAGCCCGCTTCTTCATATCTCTTCAGTTAGTTTGTTACTTATCTATACACAAGACG
CACCAAAACTTTGTGGAGTTATTCGTGAAACTTTCAAAATGTCGCAAAGAAAAAGAAAAC
AAATTAATATTGAAGAAAAATCGCGTATTATGTAAATATATTTTTCCAATAATTCCCTAT
CGATTTGTTTGTACTTGCACGATACACATTAAACATCACCGGTTGTTACGACTATCGGTT
TTTACGACTGAATATGAGCAGTCCCTTCGATGTCGTTATAACAGATTTTGACTGTAGTTT
CATTTAAAATTAACAAAGTTATATTTATAAACATTTAGTAACAAATTATATATTTTTAAG
TTATAAAAAAATAAAAACAATTTAAAATTGTATCAATAGTCAACATGTAAACAAATTGAA
GAGTTTGAATAAGTATTGATAAATTTCTTTTAAAAAAATGTTAGCTAATGTCCCTCATAA
ACAGGTTTTCTTTTTTCCATAAATGAAATCATGCCTTCCTGTCTGTCTTTAGTTGGAATA
TTTATTTCGTAGCATTTCTGTTCTATCTCATAACCATCCTTGATACTCAGCTGTATGCCT
TCACTGATAGCTTGTTTTGCACAACGGAGGGCTATGGGGGCATTCGGGATGATTTCTCGT
GCAATGCTCAAGGCCTTCTCAAAGGCTGCTTTGTTTGCAGTGTCTTGTGCGACCACATGA
TTCACTATGCCTAATGCTTTAGCTTCCTTTCCACTAACAATTCTTGATGTAAATATCAAC
TCTTTAGCAATTGGTAGCTGAATAGTTCTTGGTAGTCTCTGGGTACCTCCAGCACCGGGA
ATAAGACCTCTACCAGTCTCGACAAGACCTAGTTTAGCAGTATCTGCTGCTATCCTGATG
TCACATGCCAAGGCTAATTCCAACCCTCCACCAACAGCCACTCCTTCCACAGCAGCTATG
GTTGGCATGGGCAAGTCTTCGATTTCAATAAAAGTTTCTCTAAGCCCTCGAACGAATTTG
GCTACCTCTTCATCGGACATTTTTAAGCGTTCTTTTAGGTTAGCTCCAGCGCAGAAAATT
CCCGGAACCATACTATGAAAGATAACAACAGACAGTTTGGTATCTTCTCGAATGATCTGG
TTGACCTCGCGCATCGCATCTATGAGGGTAAATCCGAGTGCGTTCCTGTCTTTAGGGCTG
TTGAGACCGCATAATGCGATACCCTTATCTACCCCAGTAAGTTTCTCAAATACAACAGGA
TTCACATTTTCGTTCAGTTGTTGTATCTTTGTGGCTAGATTTCGGGTATTTACAACTCTA
ACAATGAAGGATCTCAATTTTAATTTACTTAATAACATTTTCGCAATATACTAATGGTAT
TTATAATTACAGTAATCACAGTTAGCAATAACCTGTACTTTAATTAGCAAAATTATCTTA
TCAACTTAAGTTCACTTGTTATCAAATTGAAAAAA
(2555 bp)

- SilkBase 1999-2023 -