SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoFB_comp10274_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr8
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_RNA-directed_DNA_polymerase_from_mobile_element_jockey-like_isoform_X1_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level
FPKM:5.79 TPM:6.35
ORF EntryO_BomoFB12720_complete:A_BomoFB_comp10274_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GGTTTATTTCACTAGGTGTTTCAATAAAGGTTATTTTTGTTTAACTTCAATTATCTTATA
GTAGTACATCTCATATTATGCATGTGCAACACGAAACATTTTGAAAACAATAAAATGTTA
AGATCTATCTACTTATTTACTGTATTGTATATATTACGCAAGTGATATATAAAACATACT
GCCTAGGGCACCCCCACCTGTGTACCTTTCTGTGGGACAAGATGGACATGAGCCTGCACA
GTGAACTCATAGAGTTTCATTATTATAATTTAAGCAATGTCTATTTTGTAATGTTATAAG
TCAGGTTGCAGGAGAGGGTAGTTGGACATCTGTCAGATCACACGCGTTTCGATTATTTTT
AGTGTTTTTCCCGTTTTTTCTGTGTTTTTAAGAATTGTGTTGCCCTATTTTTGTTGGTGG
TGGATTAGTTTAAGTTTCATTTAACTGGTAAGTGTATTTTTTATGTCAATGTCGTCCTCG
GTGGGCGAAAATGTCCCGCCGGACAGAGGGAGGTCTTCTTTAGATTCAGAGATGGACGAT
CTTTCTCTAATACTTAATTCTCCTGTAAAAGCTTCACAAAAACGCCCTGCGGAAGACGTA
TTAAGCGTCCCAGAAAAAAGATCAGCTCCACATTTACCGGCAGCTGCCTCTAATCAACAT
ACCTACACCCGGCCAGGTTTTGATAACAATTCAGTTCTTAATTACTCTGAAACTGACTCT
GGCCCTTTTGTTGTCCATGTATCTCGTTCAGATGGTGACTTTGCCCCAGTTTCGAACCAC
ACCCGTACCCTTAAAATTGCTCAAATTATTTACAATGGTAAGATCTCAGGGATAGATGAA
ATTAAAAACATGGGTAGAAATAGGGCTGCTATTATTTTTAAAACATATAACGAAGCGAAT
TCATTTTTAACAAACCCATTACTTTCATCTAACAAATTGTCAGCAATTATTCCACGCTTT
CAAGTTACCAGGATGGGTGTCGTGAGACAAATTCCTGTAGAGTGGTCTCTTGAGGACCTA
GTCTCATGGATTGAGTGTCGGTCTGTTTCAACCACCGTCATTAAAGCCAGAAGAATGAAT
AAGAAAAAGAAAATAGATGGAAAAACAGTATGGGAACCGACGGGTACAGTTGTCCTCTCT
TTTCTTGGGCAAGTTCTTCCTAAACATGTATATTGTTGCAGCGTTTCCCTCCCTGTAAAC
ATATATACTCTTCCCACTATTCAGTGTTTAAAGTGTTGTCGTTTTGGGCACATTCGTGAT
CAATGTCGATCGCAAGCCCGCTGCTCTCGATGCGCAGGCCCCCATGAAGGTAATTCTTGT
AGTGTTTCAGAAAATAACATAACCTGCTTGTTCTGCTCTGGTTGTCATCCCGCCTCTGAC
CCGAAATGCCCCGAACATGCCCGTCAAAGATCAATTAAGTTGGTTATGTCTGAAGAAAAT
ATTAGTTATATTGAGGCAGCTCGCAGATTTCCTTCAGTCCGCACCTCCTATGCCGATGTT
GCCAATTCTTCTCTTCCCCAAAAACCTATCTTCCTGAGCCGATCAGCTCCATCTTCGAAT
ACCCTCCCGTCTTCCTCCCCCTCATCTTCTCGTCATACTCCGTCAACTTCATACAAAAAA
ACTGTTTTTATTGAAAAATCGTCTAAACCAATACTTTCCAAGTCTTATGATCGTCATGCT
CACAACGATATTATTAGCCCTCCTAACTCTTGTTTACCCAATGGTTGTGCTCTTAGCACT
CCCACCCCCTGTGCCCCTGCTACAAATGATAATCTCGCGGAATTAATGTCAATGCTGCTT
CTAAATATTTTATCAAAATTCAATGATATACTACCGAACAACGTCTTGATTCAGATTCAC
GCTTTAATCTCTAGTCTCGTCAACTCTCAACCAAAGCATAATGACGAAGGTCCTACAATG
GAACTGTCGTAGTATCAGAAATAAAAAACAAGAAATAATTTATCTGTCTAATCAATATAA
CCCTGTCCTCTTTGCTGTTGCGGAGTCATGGTTGAGACCGGATACTCTGCTTAGGGTGCC
CGGGTTCTCGTGTCTCCGCGATGACAGAGACGACGGCTGGGCAGGAACTGCTATCTTGGT
CAGAAGAAATATATCTTTTTCTCGCATTACCCTTCCTCCTCATTCCTCAGCAATTAACAT
TGTGGCAGTTCGCTGCTTTAACATCACAGTGGTCTCAGTGTACATCCCTCACCCTAACAG
TAACCTTATTCAAGAATTTTCGACACTCTTAACCTCTCTTCCATGTCCTCTCTTAGTCTT
AGGAGATTTTAATATACGCCATACAATGTGGGGTTCTGAGTTATGTGACTCAAATTCCTC
ATTATTTCTTGATAAACTTGATGAATTAAATTTGTGTCTACTTAATGATGGAACTCCCAC
CCGTAGAGTATCCCCATCCCAAAGTCCAAGTGCCCCAGACCTGTCCTTGTCCTCTCCCTC
TTTAGTTAACTCGATTTCTTGGTCTGTTCTGTCCAACTCCCATGGCAGTGATCATCTTCC
AATATTACTAACTCTAGCCGATTCTTCCATCCCATCTTCAATTCCATATGAACCCCTTTT
GAAATTCAGACTTAACAAGGCCGACTGGCAAAAGTATTCATCTTTAGTTCAAAATAATCT
TGAATCTCTTCCTGATGCAAATGATGAAAATACTCTATTTTTGTACCTAGAATTTTGTTC
CATTTTATCCTCCGCTGCCGAACTAACCATTCCCTTAAAGAATTCAGCTTCAAATAAAAT
TCCCTCACCAGCATGGTGGGATGCTGAATGCTCCCAAATAGTCCAAAAACGCAAGGAGGC
TGAGTCTGAATTTTCTAAAATTCTCTCTTTAGAGAATTTCCTAGAATTTCAGAAAATTTC
GGCCATCTCTAAAAGATTTTTGCGACAAAAGAAATCTCTTGCTTGGCGTAATTTTTGCGA
GTCTCTCTCCCCAAGAACTCCTGCCTCCTTGATTTGGAAAAAAATAAAAGCATTTCGTAA
ATCACAATCTGATAATAATATTAATTCTAATTCCTTGTCTTGGCTTCCTGATTTTATCTC
CAAACTCTGCCCACCCTTTGTGCCTTTTAAACCTTGTCCCTTAATTCCCTCCTCCGCCTC
TAAGGACCCCATGAATTCCAGCTTCTCATTTGCAGAACTATGCTGTGTTCTTGACAACCT
CCGAGATTCAGCCCCAGGTATAGATGGCTTCCCGTACTCTTTTATAAAAAAATTATCTGA
CTCTTCTAAAAAAATCTTTCTAAATCTTTTAAATCATATATTTCTCTCCAGTTCTATTCC
AGCCTCATGGAAAACTCAATTGATAATCCCAATTCTAAAACCAGGCAAGGATCCAGCTCA
ATCTTGTTCATATAGACCTATTGCTCTCTCGAGTGTGCTAGCTAAAATTATGGAACATTT
GATAAAAAATCGTCTAGAATGGATAGTTGAAAACAGGTCTATTCTCCCTAATAGTCAGTT
TGGCTTTAGACGAGGTTACGGAACATTGGACAGCCTGAGCCTCCTCACTTCAGATATTCG
TGTTGCATTCTCTCAAAATCGTCATGTTATAGCAGTTTTTCTAGATATTTCCTCTGCATA
CGACAATGTCGACCTTCATTTACTTAGACAAAAACTTATTAACCTGAATATGCCTCCTAG
AATTGTGAATTTTATCTTCAATTTGTTTTATGACAGATCTATTATAGTTCGCATCTTAGG
TGAAAATTCTTCTCATCGGACCTGGAAAGGTCTGCCTCAGGGTTCTGTTCTCAGTCCTCT
GCTTTATAATATTTACACTGCTATTTTAGATACTACTGTGAACCGTTTTTGCCGTATCCT
CCAATATGCTGACGATATTGCCCTCTATACCATATCTAATTCTTTCTCACAAGCTTGTAA
TTGTCTAAATTCTGCTTTGTTTAACCTGAATTCTTGGTTGAATGATCACTGCTTATCCCT
GTCCATCCCTAAATGTTCTGCGGTTGCTTTCTCCCGTAAGAGAGTTATCCCTGAAATAAA
TATTGAAATTTGTAACCAATCTATTCCAGTCTTGAGTAAAGTTAAGTTTTTGGGCATTCT
CTTGGATTCTAAACTCTCCGGTGTTCACCATTTAAACTATATCTGCAATAAAGTTGAGAA
GAGCATCAATGTTCTACGCGCACTCTCCGGTGTTAAGTGGGGTTCACATCCTTACAGCCA
GAAGCTTCTTTATAATGCTTTAATTAGAAGTCACTTTGACTATGGTTGCTTTGTTTTGGA
GCCTTGTAATAAAATGGCACTTACAAAACTAAATCGTATTCAATCAAAATGCCTCAGAAT
CATATCTGGCGCCATGAAATCTTCCCCTATAAATGCCCTACAAGTTGAATGTTTTGAACC
TCCTTTAGCCTTGCGTAGACAGTTTCTAGCTGATAGATTTTTCTACAAAGTAATTTCTCT
CTCAAACCACCCCCTTTTAGCTCTACTTTCCCAACTTGCTCAACTGACCGAAACCTCTAG
ATACTGGCGTCATAAATCTGTACCTCCTCTTGTCAACTCGTATAAGAAACTGCAAAATTT
AGCTTCTCCAATTTTTCAATATGATAAATTCCCCCTCTTTCTTTTCTCTTTTGACTGTCT
TTTATTTCGTCCCACTACCTTCTTGAATATTGGGATCCATAAAGACTCCCCAGGAGCAAA
TTTACAATTTCAGAACATAGTACAACTACAATGGCCTAATCATTATCACCTATTCACTGA
TGCATCTAAACTATCCCAAAATGGTCTTGTAGGTGCTGCGGTATGGATCCCCAAGTTTAA
AATCTCCCTAAAATACAAACTCCCTCAGACTTCCTCTGTGTACTCTGGTGAAGCTGTTGC
TCTTTTAGAAGCAGCTCTTTTTATTAAAACCCGCGGTCTAAGTAAATCGGTAATTTTTTC
GGACTCCTTAAGTTGTCTTCAAGACATAACTAAATTTCCATCGCATTCAAAAGTCAATTT
TGAAATTATATTAAAAATTAAAGAAACTCTGTTTCAATGTCACTGCTCCGGACTTGATGT
CACTCTCGTCTGGATCCCAAGTCATAGCGGAATTTGTGGGAATGAGCTTGCTGACTCCTG
TGCCAAGGAGGCTGTTGTTATGGGCTGTAACAAGTATAACAAAATTTTTCCTCGAGATTT
ACATTCTCTGGCAAAATCTGATATGCTTCAATCTTGGAATGAAAGCTGGCAGATTTCTCG
TCAGTCAGTAGGTAAGCATTATGGTAACTTGCAACCGACCCTGCCCTCTAAGCCTTGGTT
TTCCTCCCACTGCCATCTTCCTAAAAAAATTGTCTCAGCTATAATCCGTCTTAGACTTGG
CCATGTTTGCTCCCCTGTTTTTCTTGCCAAAATTAGAGTCCGTGACCATTCTCTTTGTGA
GTGTGGATTAGATGAGGGTACCCTGGATCACATTTTCTTCGACTGCCCCAATATCGTATC
CCCTCTTTATGATATCCTTCCCAATGACATTCCCCGACCTATTAATATTAATTGTTTATT
AACTTTAGTCTATTCTAAACATGTAAATATTCTGTGTAAATTTTTATCTGCTAATAATAT
TTATCTCTAAAGTAGTACATATATTTGTTTGTGCTGTTCTTAAAACCACAGATTCGCGTA
TGGAAAAACCGACCAAATTTACTTGTATTTAGATTTAGTAATTTTTTCCCTCTCTAAGCA
CCTGTCATTTTTGTAAATACTTTGACATTGGCAAAATCAATGCCAAAGGCGTTGGAGCCA
AATTATCTAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGTCAGGTTGCAGATATTAACTATTATTTCAATT
ATATAATTA
(5829 bp)

- SilkBase 1999-2023 -