SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoFB_comp10103_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Scaf007
NCBI non-redundant
(nr)		Sr_protein_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0008380 P RNA splicing
GO:0016607 C nuclear speck
Transcript
Level		FPKM:6.76 TPM:7.41
ORF EntryO_BomoFB11771_complete:A_BomoFB_comp10103_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTTGTAACAATTCTTGCACGCGCTCAACTGATGTGACGCCGTCGTGCTATA
CTAAAGTGAATTTAACAACATTGTATTATTCAATTTGTTTGATTTGAGCTGAATATCTAT
ACTACTCAAAATGAGTTACGGAAGACCTCCGCCACGAATCGATGGCATGGTCTCGTTAAA
AGTAGATAATCTTACCTACCGAACGACGCCTGAAGACTTACGCCGCGTTTTCGAAAGGTG
CGGAGAAGTTGGTGATATCTACATTCCCAGAGATCGGTACACAAGGGAAAGTAGAGGATT
CGCCTTCGTGAGGTTTTTCGAGCGTCGTGACGCTGAAGAAGCCCTGGACACGATGGACGG
ACGAATGTTGGACGGCAGGGAACTTCGCGTTCAGATGGCGCGATATGGTCGCCCCTCATC
GCCATACAGGAGTCGTTACGATCGCAGGCGCAGGTCCAGGTCTCGTTCCCGCCGTCGTAG
TTACTCGCGCAGTCGTAGCCGCAGCCGTTCGCGCAGTCGCTCTCGCTCTGACTCAAAGAG
TTCCAGGGGACGTTCCCGCTCACACAGTCGTTCTCGCTCACGATCCAGACACTGAAATGT
CCTTATGGTGTGAGAGTGTACCTGTTGAGAGCTGAAGTGCTATACTAGACGATTGAGCAG
CCTTTAGCCAAGGTACTAATCACAACTATTATATAAGCCACCCTCAGACCTAACTATGGT
GAACATAGTGACAACACATTCAATGTAACAAATTATCTATAAGTTTCTATAGGTTAACTT
ACTACATTTAAGATTGTATTCATTTCTTTTTATTTTCATTGTGTGTGACTGTTTCATCTT
TATAAAAAAAACGAAATTATGGCGTGTGCTACCTCTCTTGGGCTTGTAATATTAATTGGA
TTTAAATTTTTATCTTAGTATGTGTAGCTTTATATTTTTTGTCTTCTGACTTACTTGAGG
TTGTAAAATTTAATGAATTTTAAATAATTGGTACAATATTAGATGTGATGTGGGAGCGGT
TAGATATTATTTCAGGTTCATAAAACAATCTGGAAGACTAAACCACTACAAGGATTATTT
GGGCTAACTTGGGCATTAATTTGTGAACTCCAATTTTGGTAATGATAAAATTTCATAAAA
CAATGTCCCTAATACTTAAAAATGCTAATAATTGAGTACTGGGTTGTTGAAGATGTATCT
GAGTGTAAAAATAATTTGCATATAACTATTAAAACTAATGTAATATGACCCAACCTAATA
CTCAGGATTGTATTATGTAGAATTCTTACGTATGTAAATTTAATTACTTCAAGATTAACT
GATGAATTGGTATGCTCAGGGCGTGAGGTGAGCGCGTGGAGCGTTGCTGTGTGCGGGGAG
GGGGTTGTGTGCGCTGTTTGCTGACAGACGCGGAATTGCCGTAATTGCAGTATCAAAGTT
ATGAGTAAATCTTTGTATTTATTGCCCAACCGACACATGCATTTTGTACAAAATTAATGA
CACGTTGCTATATATAGCATTACAAAAAAAATAAAAAAAATATAAAATGTAAGTATATAA
AAGATCTTTATTCCTATGATAAACAAACTTTATATCAACAATATTGATGCAAAAGAGTTG
ATATAGTAAGTAAAATGTGTGCACAGATTTCTAGTAGTAATCAGAATAATAATGCATCAG
AAACAAACCCAGAGGCTGTATGTTGTTGGAGCACAGACTGCACTAACATTTGCATTTGTT
TAACAGGCCGGTGCTGCTCGCTGGCCTGTATGCTGTTGCAGTCTTCTATGCTGTTTCGAG
CTCGTCTAGGTTCTTATCGGTAACCCCCTGCCCTCCTTTGTGTGCATTGCCTTTAAACTT
GTAGTTTGAGCATGACTTGCTGTAAAAGGTTTGTAGCAAGCGTCTTTTGCTTTCAATGTA
TTTAGAAGAGAAGATCGTCACACATGGATCAGCTACAGGATTTTGTCGTAGGTTTTTTTG
TCAAATAAAATAATAACTATG
(2001 bp)

- SilkBase 1999-2023 -