SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp70645_c1_seq7
Scaffold_idBomo_Chr5
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_nicotinic_acetylcholine_receptor_alpha6_subunit_isoform_X3_[Tribolium_castaneum]
Ontology
GO:0005230 F extracellular ligand-gated ion channel activity
GO:0006810 P transport
GO:0006811 P ion transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0034220 P ion transmembrane transport
Transcript
Level		FPKM:0.38 TPM:0.66
ORF EntryO_BomoEE23464_complete:A_BomoEE_comp70645_c1_seq7
Sequence
(Nucleotide)
GCATTTTTTTTTTTACATTAAGTGTTTACATTTTGAAAATTCGTATGGCAGTTCCGTGAG
ATACAAGCATGAATGTCCTTTTAGTAGCGCACTGTGCCCGTGTGTCCACCCACCTGGAGG
GCCGCATGTTTCCTGCATGATTCCCTATAGATATTTTAGTGCATTTGTTCTGGGCTCATC
CTGTTTCCCCTGACAGCTGGACCTCATCTTGAAGGACGAAGCCGGTGGCGACCTATCAGA
TTTCATCACGAATGGAGAATGGTACTTAATAGGAATGCCGGGCAAAAAGAACACAATTAC
ATACGCTTGCTGCCCAGAGCCGTACGTGGACGTCACCTTCACCATCATGATCAGGAGGAG
AACGCTGTACTACTTCTTCAATCTCATCGTGCCGTGCGTTCTGATATCCTCAATGGCGCT
ACTAGGCTTCACGCTACCACCAGATTCTGGGGAGAAATTGACACTCGGTACATATTTCAA
CTGTATTATGTTCATGGTGGCCTCGTCTGTGGTGCTCACCGTTGTGGTGTTGAACTACCA
TCATCGAACGGCTGACATCCATGAGATGCCACAATGGATAAAGACTGTGTTCCTCCAATG
GCTGCCCTGGATTCTGCGTATGTCCAGGCCGGGTAAGAAGATCACGAGGAAGACCATCAT
GATGTCCAACAGGATGCGAGAGTTGGAGCTAAAAGAGCGTTCGTCTAAGTCGCTGTTAGC
CAACGTGCTGGATATAGACGACGACTTTAGACATGCCCCGCCCCCGCCCAACAGTACTGC
TTCTACAGGCAACTTGGGGCCTGGTTGCTCAATATTTAGAACGGACTTTCGGCGTTCGTT
CGTCCGCCCTTCGACGATGGAGGACGTGGGCGGAGGGCTCAGTAGCCACCACAGGGAGCT
GCATCTCATCCTGCGCGAACTCCAGTTCATCACAGCCAGGATGAAGAAGGCCGATGAGGA
GGCCGAGCTGATCAGCGACTGGAAATTCGCTGCAATGGTAGTGGACAGGTTTTGCTTGTT
CGTGTTCACGTTGTTCACGATAATAGCGACGGTGGCCGTGCTGTTGTCGGCGCCGCATAT
CATCGTGCAGTGAGACGGTACCGTGCTCATGTGCATGCTCACTTATAGTATGAGAGAACT
AATTTTAATCGAAATTAAGGTACTGTAATTTATATTAATTAATTTAATTTTAAACGCGTT
GAAACGGACACGTGTCGCTAACATTGTCAGTAACTATGCGATTTGGGTACTGTTCCTCTG
TGTAATCTAAACTATTTATTAAATTTCAAAAGGTTTCCTCTTCATGGGAGGAGGTTTCTT
TAGACACTATAGTACCGATTACTAAGATTAATAAGTTTCAGTCATTGGAATAATTTAACC
AAAATGGTTAGTCACTACAAGAGTGTGTTCGTCTATTTTTCTTTCAATATTGTCAGCAGA
TGAATGAGTTCAATAAACTGTAAAGAAACTTCGGAAGTTGGTCGGTAACGATAACTTAGC
TAAGTGAGGGTACACTTGTCAGCACTCAACCGGGGTCGTTGGTATGCCGAAGCGAACCAG
TAAAATAGTTTAGATTATGCCGTTCCGGTAATAGTTTGTTTAACGCAAGTTTTAACTTCC
AGATAGCGTCTGTGTATATAGAACCTAAGTCGCAAGACGGTAAATGACATGGAAATACAT
TATATGTAACTAAAAAGAAATAATTAGTTAAGCCATATAAATGTTATTGTAAAACAATTG
TGATGTTAATCTGATTAAATATTGAAATATGTAATTTATTAATTAATTAAAAAAAAAATG
ATAATATAAAAAGTTTTAAGATTCGATGGTGAAGTATTTGAAGCTGGTTTCGTCGTTGCG
TCGAAGGCTTCTGAGATAAAAGCTGAAAAATCATTGAATTTACAGTCCACGAATTCACAA
CTTGCCCAAAAGCGATATAGGAATATAAAATCAAATTAAGGTTTGACAGTGTCAAAATTT
AGGCCCGGATACAAATATTTTTTAGACATTGCGTGTGTTCAAGTTTTAAGCATATAAGCA
AACGTTTTTGTTCCCACACGAGCCAAAATTTTAGCAAAATGTACCTAACTTTCCTGTAAT
TTTTTCCATTACGTGTGTGGTACAATGGTAGGTAAGAGCTGTCTATAATATTGAGAGACG
TGTTGATAAAGAGATCACTTTTCATTTAGCGTAAGTGACATGTAACTAATAAAGGATCAT
CGGATTAGGAGCAAGATCAAGAATATAATATCTTAGGAACATCGGGAGTGTGCAGACTGG
TTTTGGCACGCGATAAGGGTTTTTAATTCATTTTATTCATTTATAATTTTATGAATTCGT
TCAAGGATTTGATACAAGGTAAAATTGGGTAGGTGAACCGTTTCTTCTATAGAATTGAGA
CTACTGCATGTCCTTGAGGTTACTACCTATTTTTGGGATTCCTAATGAGCTAGTTCGTGG
AGTGACGTAACTAAAAACTTTGACTTTTCCACATGTAACAAATATACCAGCCCTTCTGAC
GTAATAATGTTGCCAGCCTTCAAATTGTCTGATTTGTTGATAAACGCGTTTTATTTTAAT
CTTTGGAATTGTGGGGAATTGATAAATAAACAATTTAATGGAACCAAACTTTTAAAAATA
TTTAGTGAGGTTGTGTCGAGATATTGACTTAAAATAATACATAAGAATAATAATACATAT
ATTTAATAATTAGTGTAAAATAATGAGAATGAGAGATAACCGAAAAGTTTTTATCTAGTT
TAATAATAATAAAAAAACGAAT
(2782 bp)

- SilkBase 1999-2023 -