SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp70415_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr25
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_beta-1,3-galactosyltransferase_2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000139 C Golgi membrane
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0006486 P protein glycosylation
GO:0008378 F galactosyltransferase activity
GO:0008499 F UDP-galactose:beta-N-acetylglucosamine beta-1,3-galactosyltransferase activity
GO:0009312 P oligosaccharide biosynthetic process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016757 F glycosyltransferase activity
Transcript
Level		FPKM:1.88 TPM:3.29
ORF EntryO_BomoEE22470_complete:A_BomoEE_comp70415_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AAATTTAGATCTTATCCTAAAGACACCATGTTTTTCAGAGTCTGCTTCTTGAAATTAACA
GCCCATCAATGCCAGATGAGGTGTGCATAATTCTCGGAGCTACACCTATAACTTGTAAGG
AAGTGTATAGATTGATACTGCCAGCTACTTGCCACAGACCACAGTGTCATTCAAGTCTCA
TAGCCAGTGACCAAAAAATACATAGAAATGTATTTAGTAGTGACCTCTGAGAAATTGAAT
GAAATGTTCTTAAACACTTTAGCTCCAACAAACATGTTTGTTTTTCTAAAGAAAAGAACC
TTTAACGATCAAGATGCTTTGCTGGATACAAGTAACTATTCATTTACAAGTGGTCACCGA
ATTCCTGCTAGTTCTAGAATAATTGTAATCAATTTCAGAACAGGAAATACTGAAAATTTT
AGCTGTTGTAATGAGTTTAAAATTTTTAGTGATGTATCCACTACTGATATTGGCATTGAG
GATAGTTTCAATGAAAACTGTGAAGAATTAAATGAAATCGAATCCACTGACACAATAAAA
TGGTATCAATCATCTTATGTGATGAAAGGATTCAAAGACTGTATCGTAAACGGTAGTTCT
ATTACTAACACATGGATGAGTTCTTGATATTAGTAGATTATTTTATTAGTAAAATTATGA
CTAAGTTTTTTTGCTGACTGTATATCTGTTTGCATTTGGTATGTAGCAGTTGAGTTAGTA
CAGATATGTTTTTGATTTAGTTAAATAATCTAGTAGTCAATCCCAGATTTTATTGAATAA
CTATCATTTATATATTTGTTAAATTGTATTGTTTTTATTATTATGTATCATTAATGGTTA
ACAAATTTGCAATAACAGTTGTGCCTTTTAAGATTTGTTTACATCAATTTTCTTTTTAAG
TGAAATGGGAAATGAAAAAACGAATGCAAGCTGTGTATATTTTTAGATGCGTAATGATGA
TAGATATTTATGTATGTATTCAGTGTATTTGAAAAGCTCTGTAGACAAATATTTAAATGG
TAGTAAATATTGTTATAATAATACTTTCGATGATTTAAAGATAAAACTATTAGGGAACCT
TGTATATAGGTACTAAAAGGTGAAATTAAATATTTTTATTCTGGTCAAGATATTAGGTAT
ATTATTGTACTTTATTATCATCAGAAAAAAAGTATTGTATTCTTGTGCGCCTTGATATGT
GTGCAAATTTTCATGATATCTGAAGGCTTTAAGTTAGTTAAAATTAGATTGAATGATTTC
GTTACTTATATTAATTGATGTTTGATACAAGTTGAGCTAGGATTTTTTAAAGACTGACTT
TCAAGACCTCACTAATGGATAGTTGTTTATGTTGTTAATAAACTGTACCTTATGCAGATA
AGACTTCTTGAAAATAAATAAATAAATAAATAAAAACAGTTTGTGTTACGAATGTTGATG
GTATTATCATTTTACTGTTGAATGTGTGGTTCATTCATATATGTCAGGCTATAATTTTGA
TATAAAAGTGTGCAAACTATCCAAACTAAAACAGTTTAAAATACGGATTGGAAGCATTTT
AGATTATTGAGGATATTGAGACATTTTTAGATAGGAACCACCTACAAATGCAAAATCGTA
AAAGTAATTTTAATAAATGAATTGGAAAGAGTTTAGTATTAAGACTATAATTACTTATAG
AATCAATTTCTAAAATAAAAATATGGTAATGAAAATTAGGTGTATGTAATGAAAATATTT
CAAATTTTAAATCATGTCTTCCTAAATCGTTCATTTTCTTTTTTATGTTTTGTAATATAT
AATTATTTATATGCAATAATGTAAATCGTTAAATAAATCAGTTGTCAATATAATAATATT
ACGTTATTAATTATCCATTGATATAAAATAATGAATTTTCCATTTGTATTGATTTTTCTA
CTTATATGATTAGATAGATTAAATGGTATTAGTAAGATAAGCAATACATATTTTACATTC
CTAATAATTGGCCAATCCGAATCATATTGATAAGACAGAGTATGTGTTATAATTTATATA
ACTCCACTTGAGGTTGACCATTACTAAATATAGTTCTTTCACTGTTCACAATGCATACTT
TCTTTAACGGCGTGCTTTCATCACGTTTCGTGCACTTTTTCGATTTATCACAGTTTCTTA
TTGCGTCATTAAATTCTACAATCAAATTCTCTCTCCCACCGTTCGGTCCAACTACCGAAT
CGCAATTAATTTGTTTATTTATCATATCTCTTAAACAACACTCGAGTAACTCATAATATT
CCAACCAATAATCTCTTGGCAATTGTCGTAATTTAATATGTAAAGCTTCAGTGAGCATAC
CGGTAATTAAAATGTCGTCAATCCAGAATTTAGGATGGTATATAGCTTCCTCGGTTATTT
TGCGGGCCGTTTTTGGCGTTGTTATGTAATACCACCCCGATAAATAAGCAGGGTAGTTTT
TTCTAGAGTATTCTTCCCGAGTAACATACCATTTGTTTTCTTTATTCCTTCTCGGCTTCG
TATTATTGAGAATGTAACCCAGAAGGAAAATGTCATTTGCATCTAAAGTTTCTAGTAATC
GATAAGTCCTTTCTAAATTAAAAACGGTATCGTCGTCGACTTTTAAAATGTACGATGCAT
TGCTGCACGCTGTGGAGGCCCACTGCAAGCCCATCAGATGCTTGAACGTTAAATTTCTAT
AATTTTCCACGAAAGATCCTTGCAGGATATCTCCGAATATATTGCTTTCGTCTATTATTG
CCTCTTGCGTGATGATTTTGTCTTTTTCAGGAATTTTAGCTAATAAGAATACTCTTTTAG
CGTTCATGGCTTCCAGAAGTTTTTGAGGCATGGCTCTTCTGTGAGCACTTCGTAGTTCAA
TATGGCCCACATACGATGTAACTATAATTACCAGAAAGGGATTTCCTGTACACAATTTGT
CACTTGGTTGAATAATTGTATGTTTAAAACTTTCTTGTTCAGAAAGTATTTTTATAGTGT
TATTTACTTCATGGTTTGAACTCCAATATATCCAACTAATCAAAGTTACGGCTAAAATGG
AAGCTAAAACATATTTTCTTTTCACCATGTTACTGTATGCGGCATTTTGTTCTGTTTAAT
ACGAATGTTTACAACTGTTACTAGCAAGCAACAAGTTCGGTGACAATCAATGGGACACAT
GATTCATTCAATTTCATTCGCACTATAATTCTGCAATGATAATAAAGAAGCTACTAAATT
GGTAGAATCTTGTTGAGTAATCTTATCACGATGGCCAATCACTGAAATTATTTGCAAAAA
TCATGATTACAAATTAATGGATATTTTGATGTTAAATTTCCATTTGTCAGGAATAAACAA
AATAGTAATCGGAAACAAAGTCTAATCTAATATTTCCTACACATCGATATTAAAGCGGAT
ATACGTTTAAAAATAGATATTAAATACCCAGATACAGTAAGCGAAACTGTTAGTAATTAA
TGACACGATCCTAAATAACAGTCAAACGATTAGATTAGGTAGTGCCGTAAAAAAATATAT
ATATACTGGAACATGGGCGGGAACAATGGAACAACTAAGGACAATGACGCGGGAGCATTT
GCTTTAAATTCCTTTCTCACAAAGTATAAAAACTTCATAAACATATAATAAGTGTTTGTG
CAAGGTTTTATGAAAGAACATTATTTACTGTGATTTAGCAGTATCTCGAATCCAAAGATA
TGAAAAGCATAATATAAAACTCGCAAAAAAACAACAACTCAAATGGATCAACTGCGTGAT
ATACACGACTGATTTTACGGGCGTTTCAATATTAGGGGTGTCTAACTCCTAAAATTGAAT
TCAAATTAATTGTTAAAAAATCCACAACATTTTTGTATAAAACCATTTTAGGTTTTTTTT
GGGATGAAAGGATCGTGTTTAGGCCAGACTTCGTCGTTTAGCCAGGGCAGATCTGTTATT
GTATCAAGTTTAGATATTTAACTTCTTATGTTTCTGAGAATATCGCAATATTTTAGATTG
TCGGCAGACATAGGCTTCTTACCCATCATACGCCGTTAGCAATAGAATTTTCAAGTTTCT
TTACTTACTACTATTGGCCCAACCGTTCCCAAGGAAAGGTGCAGAATGGTAGTAAAAAAG
TACCAAATCACAACTACAAATAGACTCACGTGCCGATTCCATAAAATAGGATAGCTCTTA
CTGGTTGGTAGAATGTTCTGTGAGCTCTCACAGGTAGGCATATCCGCCCTGCCTATTTCT
GCGGTGA
(4267 bp)

- SilkBase 1999-2023 -