SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp70265_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Scaf632
NCBI non-redundant
(nr)		hypothetical_protein_KGM_01097_[Danaus_plexippus]
Ontology
GO:0000175 F 3'-5'-exoribonuclease activity
GO:0000287 F magnesium ion binding
GO:0004518 F nuclease activity
GO:0004527 F exonuclease activity
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006259 P DNA metabolic process
GO:0008310 F single-stranded DNA 3'-5' exodeoxyribonuclease activity
GO:0008408 F 3'-5' exonuclease activity
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016788 F hydrolase activity, acting on ester bonds
GO:0016888 F endodeoxyribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0090305 P nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis
GO:0090503 P RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic
Transcript
Level		FPKM:0.60 TPM:1.05
ORF EntryO_BomoEE21844_complete:A_BomoEE_comp70265_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
GTCACGTTTGCCTTTCAAGCGTCTATATTTATTTTACACCCTTCCTACTTCCACGAGGCA
CGAGTTTAAACTCACAGACGCGTAGAAATAACTCTCCAACTCGTCAAACGAATTCAAGTT
TCAGTATTCGAAAGCAAAACAAAAGTCAAGCGACAAATAAACTTATAACTACAGACTGAT
TTACGGAACGAGAATTACCTGAATACTACCGTCAAGTGTATACATATTTAATATAAAATG
TACCGTAATATGAGAGAGCGCGTCGTGGTAATTGATTGTAAACTGTACTCTGTGACGAAT
ACAATTAAATATAAAACTTTTTTTTCCTCAGAAATAATCAAAATAGAACAATCAAGTTCT
GAGATTTAAACGTTATTCGATTGAGAAGGTATGCTTTATAGTTTGTCATCGTTTTGAACG
CTGACGTCACTGTACAAAATATACAGTTCTCTGTCTAGGGTGAAATTAAAGTACCCTAAC
TTCCTTAATTTTTAACAGATTTTAACTACACTATAAAAAAGACATTTGTCAAAATGTGGA
TCATCCATGGTTTAAATGTCATGATAATTTCGATTCTCGCCTGTTCACATTCGATAAACT
TCCCTCTCCGTAAACCAGCCCTAAGCTTGATTAAAATAACAAAAAAATAATTGTGATTAA
AAGAAAAAAAGATATTACAAAATACTCGACTATCAACATTATTTCCAATCACAATTCTCT
TTTCGATATTTCAATTACATTTTTAAATTACTAATCCTAAATCTATTTACAATATATTCG
ATTATAGACAATAAACAATTCGAAATAGGAAAATCTCCGCGCGGAGACAAAAAAAAAAAA
TACAACTACAACACCGAACACCGTGCGTTCACAATATGGTAACAACAAACTGTGTTAAAC
AATCTAAATAATTAATTCAAGAATACATTTAACATTCAATATTGCGTATGTGATGTGACC
TAATAAGGTCGATTAAGGTGATAAAAATCGATATGAAAAATATTCAATTAATAGACTGAA
GTACCAACACGAGTCATGGACGGCCATTGACCCCGGATATCAGCTGATTTTTGGATTGTG
CACAGTAAGTAATACACTGCGCAAAAAAATTTTTGAGCATAATTTACTACGCGTTTTTTT
TTCACCCCCTTCATTACTGGAAGGGTTATTCGATTACCTCAGTCTTATGATTAGCTCACG
TGGGTTTGAGGAGCTCATTTTAAAGCTGCACACTTCCAATTTTGAATGTCAAATGAATCA
ATATACCAATGACTTTTTTCCACGTACATTAAGTCACAATTTTATATTATATAAAATCTA
TGCTATAATTAAAAACGATACGCCATTATTTTCACTATTATGCATTTAAAAAAAAAAAAC
ATTTGGGCCTTTACATAGGACAATAAAATGTTTTTAGGGTTTTACTTTAGTAACGAAAAA
AGATTTTTTAAACACTATTGTTAGTTTTAATAAATAATATTCTAGTCGATTCTGAGATCA
AAAGTCTGTTCCTACCATACTGCTCATAAAGACGTGTGCATAATTACACAAAAACGAAGC
TTCGAAAAAATAATAATAATAATAATAAACATAAAATATTATTCATACAAACTGACATAA
TATTATCAATATTAAATATTACCCTATAATTCGCATGAGAAATGCAATCGAAAATGCCAC
TAATCACCGTCAATAAAACACTATAATCGCCTCTAATATCAAACGATTTCCAAACTTCTG
GATAATAACGACCAATAATTCTTATATCCATTTTGGCGTTTCTTAATCGGCATGCGAATT
AAATGGCAAAAAGATAAATTATATCAGTTATACGAACATATTTAATAACAAAAATTAACT
TTTATAACATTATGCATTTTAAAAACAAGTGTTTTCTTTACATTACTGTTTTTTATTTAT
TTATTTATTAAATGGCATATTCTTGGACTCGAGAGCATTCTTAGTACGCTCCGTGTGACG
TAAAAATACATGGTTTTAAACATTTTTTAATAATAATTATTAAAAAAAAACCATTTAATA
TAATTCCGATATCCACGGTCTCTATAAATCAGTCCATCAAAAGGCATAACATATTTAGAG
AGGCATTAAAACTAAAATACACATTGGCAAGATATTAAAATGTTAGTTAAAAAATAGGGC
GCGTTATATTGACTGACAAAAACGTAGACTATTTTGTGTTCAAAAAAAACCCATCGACAA
TGACAATGCTGCCATGCTTGCAATGCTTTCGGAACGCCGCCTTTAGCTTTGACAGTTGAG
CGTGTACGGCTTAAGTCAACCATTAACCCGTGACATTGACAATGTCGAGACACAGCAAAC
ACGCTATCTAACCTTTGACATTCAAAAGCACATTTCTATCAAGTACATTTCTTTCAGGAA
AACGTAAAACATTTTTAGATATTCGCGATCTGTGGTTTATGATTGAAACTATTTTTATTT
TACGATTTCAGAATTTGAATCTAACGTCAAAACATGATAATCGCTTACAGCGCTAAACCA
CACTTAATCTCACAGTATTAAAGAATATAATCGCAAAATTAAATCAGTCAAGTATAAACA
CGCCCTTAGCCTCGAAATTTCGCCATTAGTAACAATTAGTTTTATCCACAAAATGGTCGA
TTTTTTTTTTGTTTTCGATGATTATTTTGAGTATTTCATTTCGAGATGCGTTTCAAATTT
CGATTTCAAACATTTTCAAGGATGACGTCAAAGTTTATTTTCAAAAACATTCATTTACTT
CAAAAGAAGAAAGAAAAAATAACTTTTGTAAATAGGTACGTAAATAATTTCTTCGCGTTA
TTGTTCTGATATATTCCATACAATCTTATTGCAGTAAGGCACTACATACAACCTGTACGA
TGATCCAATCAAAGCTCGTGAATTCCGATTCTTTAGTATAAAAAGTTCACTCGACGTTAG
AATTGTGTAAAACAGATCCTCGATAAATTCATTCGGTAATCTGATTTCTAATATTTCCGC
TATTGATTATATAATTTTAGCTTACATCTCTTCTTTAACATTGTAAATGACACTGTCCAT
AGTGTCTGCTTTGAACGCACTATACGGACGCGCTAAACTACTGTAAGAGTTCTCCTAAAA
TATATCCTCAGAAGACTAAATAAATATAGCTACTGATTTTATATTTCGGTTATTGCTGTT
TTTAATTATAACCCAAATGGACATGCTGTAGATAATGTGTTACACAATTCTAACACAGCC
AGCTCAGATGCACAATCTAATTAATTATCTAATTAAAAAAAATCCTTTCTGTATATTTTT
TGAATCTTGCAACACCGATACCTGAGCTGGCAACGCCGACGTACCTGACGTTCACTGGCT
CAGCCCGAAGAGCTTGAGGGCGTTGAAGGCGGTGGCCAGCGCCACGTCCGCAGGGCTGGT
GGCCAGGAAGCCAGCCACCAGTTCCACCACGGCGGGCAGGGCGCACGGCTCGTTGCGTTG
GAACGTGCAGTAACGATTCACGAAGTTCATTGATCTCTCAGTCAGAGATTCCTTTACGTG
CAAAGGCAGTTTCGACGCCCTCATATTCGGGTACATGAAGGGGGAATCCGTTTCGACCAG
AAGCTTGTCCAGTGGCAGAATCCTCTCTGACAGCAGCCTCCTGATGCCGCCGTCGGACTT
GTCCTTACAAATGTACCCTGTTATTCCAAGATAATAGCCCTTTTCTATATATCTGATCCC
TTGCTCGACTGTCCCGGTGAAGGAGTGTATCACGACCGGCGGTAGCCTGGCGCCGAACTC
GTCCAGTATCTTGATAAGATCTTCTTGAGCTTCCTTCTCGTGGACGAATAGCGGTTTCCT
TAAGTCACACGCCATTTCGACCTGACGTTTGAAGACTTCTCTCTGGACGTGTGGCTCAGA
GAAGTCCTTGGTGTAGTTGAGGCCGCATTCCCCGACGGCGACGCACTCTGGTGCCGAAGC
GGTCTCCAGAAGCTCCGCCCACATTTCCTCGTCAGCCATCGACTTTGCGTCATGGGGATG
CACGCCTGCAGTCGAGTATATAGTGCTGGGGTACAGTCGGGTTAACCTGAGAGCCTCTTT
ACTGTTCCTAACTGATGTTCCCGTAACCATGATTTTTTGGACTCCTGCATCCTTAGCCCT
CTGCACAACGGAATCGAGATCACGGCCGTACTTCTTGTTGGTCAGATTAGCACCTATATC
GATTACAATAAGATTCTCGTAGCATCCTTTCAGTTCTTCAGAAATATGGGTTTCCTCAGA
CGTCATCCTCGGTTATGTATGAAGCTTATTATGACGGTGTTTACCTATAAATAGATACTT
AAGATGAATTCTCTTGAACTTCTCGGCAACTGTGTATGACTAAAAACGCACTTACAAATT
GTTTCAAACACTCCTGCTAAATAAGCTTCAAAATTTTTAATGATTACTCAAAAAGTTCAC
CCACTTTACTGAGTTGCCACCATGTTTTTGAGATTATTCTTTGAAAATGACATTTGACAA
TTTGCAGTATTTGACAATTAATTTTTTTGCCTCTTTTTTCCAAGCAGAAGACGGC
(4555 bp)

- SilkBase 1999-2023 -