SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoEE_comp70213_c0_seq9
Scaffold_idBomo_Chr16
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_probable_E3_ubiquitin-protein_ligase_HERC4_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0007283 P spermatogenesis
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0016874 F ligase activity
GO:0030154 P cell differentiation
GO:0042787 P ubiquitin-dependent protein catabolic process
Transcript
Level
FPKM:0.13 TPM:0.23
ORF EntryO_BomoEE21599_complete:A_BomoEE_comp70213_c0_seq9
Sequence
(Nucleotide)
GCCACTCAAGAACTTTCTGGCCCTTTGCTTAGCCGACATAATTTCAGTCTTTGTTTCAAA
AAAATTGTTTTATATTACTTCTTGGCTTTTTCTAACATGAAAAAAAACTAAGTGACACTT
GACGAAATTGACAAATGACTATTTCATTTTGATGACAATTTCCCAGGCTGATGAAGACGA
CGTTGAAAGATTGTTCTCGATTTTTAAAAATGTATTCCTACTGCCTTTTGCAATCTCAAA
AATGAAATTTTAAGTATAGAATTCTGAGGTGAACTATAAATATATAAATTTACCTCCATT
CCTTCAGACTGAATGACAAAGTATAGGTTATAACAAGCTAATTCAAGCTATTGAAAAAAA
TTGCAAAATTACAAGAAAATGTTTTGTTGGGGCAATGCAACTCATCATGAACTGTGCATC
GACGGTTCACAAATAACTGATTTGGTTATCAAGCCCACATTATCAAAATGGAAAGAAAGT
GATCACATACAAGCAGTAGCAGCTGGCGAATTCCATAGCTTATACCTCTCAAACAGTGGT
CATTTATATTCATGTGGAAATAATGATGTGGGTCAGTTAGGACGTCAAACTGAATCTGAC
AATGGAAAGAATCCAGCTTTAGTGGAAACATTTAAAGACTGCACAATATCGACAATAGCA
TGTGGCCTTCAACATTCTTTAGCTATAGATGAATGGGGGCAGCCTTTCAGTTGGGGCTCT
GACAGTATGGGGCAACTTGGCAATAACCTTGGCGCTCATGCTCAGGACAAACCTAAATTT
GTCAAAGGGTTAGCAACCAAAAATGTAATACAAGTAGCTTGTGGAGCCTATCATTCTGTG
GCATTAACAAACAGTGGTGATCTCTACTCATGGGGTGCAAATAGTTATGGACAATGTGGT
TTAGGAACTATATCAAACAAGGAAATGTCACCTCAACACATTTCATCATTAATTGGTGTA
CCTATTGCCTTAATAGCATGTGGCAATAACCATACATTTGTGCTATCAAAATCAGGTGCG
GTTTTTGGATGGGGTAAAAACACTCATGGACAACTTGGTCTTCAAGACGTTGAAAACAAA
TGCTATCCCACTCACCTAAAAACATTGAGAAATGTGAAGGTATGTCACATAGCGTGTGGT
GAAGATTTCACTGTTTTCTTGACATTGGACGGTGGTGTGTTCACATGTGGAACTGGTGAA
TACGGGCAGACTGGACATGGTACGACTAGAGATGAGCTTGTTCCAAGAAAGATTGTCGAG
CTGATGGGCAGTACAGTGACGCAGATAGCGTGCGGACGACGGCACTTGCTGTGTCGCGTC
GGCGAGCGAATCCTGGCTTGCGGTTACGGAGCGCGAGGTCAACTTGGCTGTCCGCACATG
GCGTTCGCGCTGGTCCCGACACCTGTACCGTTCACACCCAACGACGAATCTCCGCCAAAG
AAGAAAGCAAAGGTGGAGGGTTCATCGACATTCGGTCGTTCGGGCAACGTGGGCACTTCT
AAACAAAATTTTTCACCTGAAATCTTCAAGGGTCCGATTAAAGTGTTCGCGGGAGGTGAC
CACAGCTTCGTGGTATTGAAAGGCGACAAGTCCGGGCCGGTCGACTACCGCACTCCGGAC
CACAGGAAGCAAATACTCACGCTCACTCTACCGAAGCTAGCCGCGTGTCAAGTCTTCAAA
GATAAAGATTTCGTTAATCAGGATTTAATGGCGTACTTAGAGACGGTGTTCGGTTCGCTG
GCGTGTGTGAACGCGTCCTTCCTGCTGCCGAGCAACGGACACTACTGTTGCAACACCAAA
ATGCCGGGCGTCGACCTTAGCAAAGCCGAGGAGGCGTTCTCGTTGATCAGCCGATTCGAA
AACACGTCCATCAAGGAACTAATATTCAGTCACTTAACGGATAATATAATTAAGAAAATG
AAGCCCTCTCCACCGGATGCTGAAGCTCTAAGAATGTTTCTAATATTACCGCTATATCAC
GAGATGAGAAATCCCAGACGCCATACCCAGCTACAGGGTCCCTTTGCTGAAGCCTTCAAC
AACTTGTCTACTCATCCTCAAAAAATAGTCAACTTATGGTGGGAGGCGCAGACGACGGAG
TACTTTGAGATGCTCGTAGATATATTCAAAAGCGTCGTTGTGTACGAACTTATGCAGCCT
GTAGTTAGATCGACTAAGAAAGTGCAATTCAAACACAGCACCGTACAGATATTGAACACG
TTGTCGTCGCTGAACAAGATCAACTTCACGAACCCGAAGCTACCTAAAATACCGGCTGAA
TGTTTCTACATAGAGGACTTGTGTGATCACGTTGACATCGCTTCTGATTATATTAACTGG
TTGTCGGACCAAACTTCTACCCAGACGCACATGTGCAATTACGCTTTCCTGTTCGACGTC
CAATGCAAGTCGTTGCTGCTGAAGATCGATCAGCAGCTACAAATGCAGATCGCCATAAGC
AGGGCCACCACGCAAATCTTCACGAGGCTCTTCATGGATCCGACCTACGAGTATCAGAGG
GATCAGTTCCTCAACCTGACCGTCTCGAGGAACCATATCGTCAGGGACACCATGCTGCAG
ATAAGCAACCATGACACTTCACAACTGAAGAAACCGCTCAGAGTCGAGTTTATTGGCGAA
GAAGCGGAAGATGCCGGTGGCGTTAAAAAAGAATTCTTCATGCTACTGCTCAAGGAAATA
TTTGATCCCGTATACGGTATGTTCAAGCAATCCGAGGAGACGAACATGATTTGGTTTTCA
AATAATCCATTCGAAGATGACGTCATGTATTATGTGATTGGTGTTCGGACTGTGTTTCGC
CGTGAACACTGAAGTGTTTGATCAAATACAAGTGAATCCACTGAAAGAGGACGGAGAGAA
TATACCTGTGACGCGCGAAAATAAAGCCGAATACGTTGAGTTGTACGTGGACTTTTTGCT
CAATAAATCTGTGGAGAATCAATTTAAAGCTTTCAATCAAGGTTTCCAGAAGGTGTGCGG
GGGTAGAATAATAAAGCTGTTTAGATCTCACGAATTGATGTCCGTTGTCATCGGAAACGA
GGAGTACGACTGGGAAATGTTTCAGAACAATTGTGAATACAAGAATGGATACTCTGAAAC
TGATCAACAAATCAGATGGTTCTGGGAAACGTTCCACGAGCTGCCGCTTGAAGATAAGAA
GAAATTTTTGCTTTTCTTAACCGGCAGCGATCGTGTTCCGATACAAGGAATGAGGGACAT
TAAAATAAGAATTCAACCAGTGGCAGACGACAGGTTCTTCCCGGTGGCCCACACTTGCTT
CAATCTTCTAGATCTCCCGCGTTACAAGACTAAAGAGAGGCTCAAGTATTATCTTCTGCA
GGCCATTCAGCAGACGCAGGGCTTCTCGCTGGTCTGAGAAATAATATTCGTTTTCTAGTC
GTTTTAAATCATTCGTTATCGACATTTTATAAAAAAATGGAATCATGAAATCATTGGTCG
GTCAAATCGATAATCAATATCGCTCTCTTTTATAATTAATCGTGCAGGGTCAACTTCGAA
CGTCCCTTGTCTCTTTGAATAAACGGGTGGTTTTAATTGATTTCGTCCACAAGTTAAATT
TTATGTAATCTTTGTTTTCATGGATCCATTACAATAACGATCAAATCGAAATATTGTCAT
TATTTCATTTTAAATGGAATCTTGACACTTATATTTCACCAGTAAATATTCGAATTTGAT
AAAAAGGAAATGAGGAGTTTACTTTGTTTGGGAAAAAAACGATTGCTCACCCTCAATCAT
TCCTAATAGAAAGGTTTTTGTTTTATTTTATTTTAATTCTAGATAATTCTAGTGAATGTC
AAAAGCGCTCTTGTTATTTGCACGTTTTTCGAATCAATGAAAATACTTATTTTTATTTTT
AAAACCTATTATGCGTGCGTTTTTTTCTAAATTAATAAATAAAAAAAATTCACTCAATCG
TTAAAAATTCTATTAAAAAAACAGCTACAAATATGAATAATGTTTCTTCAATGAATATAA
TTGATTTCTATAATTATATTACGTTCGCGGAAACACACCATTATAAGCCTCTTTCTGTTT
TAATTTTATAAAAACGAAGGAACGGTCTCCAAATATTCTCAAAATGTTAAGGTGTGTCCA
CATGCACACGTAATCACAGAGTAACCACTGTATCGGCATCCGATTCCAATCGATAAGCCA
ACAGTGGAAGGCTATGCTGTCCCTAAATAATTGAGAAAAGAAAAATTAAAACAATGCCTA
ACTGAGGATGTCTTTCACATCCATAATTTAGTTCCTACCAAAAACAAAAAATCACGTTCA
CCTATTCATATGCATTATAATTGCTTCACTTAGAATTGTTTCGTAACGGCTATTTAAAAT
TTTTTGAAGCGGCATCTATCGACGTTTATAAAGAACAACAATAAACACAAATTCAGAATT
AAAGACACTTTAAACCTAGCTTATTAATATAATAACAATTAAACAGGTTAAAATTCAATG
AACTAGAGCTTAATTTAAAATACATGTACTAATCCACCGCATTTAAGAGATAATTAGGTT
TTAGACTATTATTTTTAGTCACAGCGTGCACGCATCCTAATTTTCCTCATCCACAATTCA
AATAGTTCAAACAGTCTCTATTACTATAATAATTGTTTCCGCGAACGTACTATAAACAAT
ATTGAACTTTTTTTTATATCTGTCTATTTTATAATACAATATTGAAATCATCATAATATT
ATGATTACTTCTCATATTATTTTATTACGATTACTTCCAAATTAGGTTATTATTGATAAT
AATAATGACAATGAATGCATCGTACACGTGCAAAGGTAACCTCTGTGATACAAAGGCACG
TCTCTAATTCGGGGCGTAAAGAACTGCTCTCGAAAACAAAACATTAGCACTCACTTAAAG
GATTACTTTGGTCTTCAAATATAATTTGTTTGTACACAGTAAGGATTAGTAAACAATTTT
AAGTAACGAAAGATCTGCTAACGCGCAAGGTCAACGACCTCGTGTTGCGAATTCCGTGTT
GTACGCTTTCCATTGCACGCCCTGGAAATGTTAAATCACAAACACGATGGGTATTTTGCT
TCGTTAATATTGACTGAAAATGACTAATATTGGTTTTGGTTTCACGAAGTAGCTCATTTA
TTTCTGTGTCTATAAAGTCGAATTTATTTATTTATCTTATAAAAAATACGAGTGGGTAGT
TGATGTTAGCGTTTTGCGTTCCGAGTGCGGTTCCGTGCGCCCCGTATGTTTAAGGGCCTG
CTTGTAATGTTGTTACACTGATTCGTTATAAACTGTACATAAAATATGGCGGTAATTAGC
TTGGCTAGATCGGTGTTGTTTTTATAGCATTTACGTGTTTACCTCGGCCTAGTTGTAGCT
ATGGCGCAATTTGTACATTATGTATATGTATAAATAAAAATAAAATATTTTCGTAATTAA
AAAAAAAAAAAAAAACTAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGATTTGTCTACGATAATTA
ACATTTGTCACTGTAAGGCTTCAGCGGCTTGAAGTCTGCATTGCCGCTCAGATAAGCGTC
GAGGAAGTTCTGTACCGAGTGCGTGGTTATCTCATCGCCGTACTTCATGGTGAACATCCG
TTGCTTCGGGAAGTCGATGGCTGTGAGCAGTGGCACCGCGTCATCTAAGCAGATGTGCTC
TCTCAGCATGTCCGCGGTGTCTGTGCCGTCCACGCCGACGTAGAACATGACGTGTTTGAA
CGGTCGCTTCTTGGATTTCCTGGGCGGGTAGTCGAAGTCAAGGGTCTCGTCGTCCGAAGA
GCTCTGGTGCGGGCAGAATCCAGGGTATTGGATGCTGCATTCCTCGTAGTACGACTCCGC
GGCCGGCGTTAGTACCGATTCGGCGAATTCTATTTCGGAATCTTCGTCATCCACAAACAA
AACTATGGCCGGGTGTCTGGCCATCTTTAGGAGAGCTTGTTCAGTCAACACTGAAAGAGG
TCTCTGGGACCACGGAAAGTTCAAGCCAGTGGGATCGGCAGCAAGTTTTTGCCTGCCGTT
CGTGGTGAGCACGGTACCATCACCGTTTGCTATGACCAGGGCGGGTATACCGGCGACTCC
CAGGGCTGTGGGCAAGGCTCCCCGCGCCTCGGCAGCGCTCCACGGGACAGCCAAAGCGTT
GGCCGCGGCAACAGACTGCACGGTGCGATTATACGACTGCTCGCTTCTGTCACTGGATAC
GATTATGAGCTGCGTGTTGGCGTATTTCGCACGCCGCTTGCGTACTGCTGACAGCGCCGC
GCAGAGGCTCGGAGCGAACGTCCGACATGGGGGACACCAATGAGCAGCAAAATAGAATAC
TCTCAAGGCATCTCCAGGCAGATCCTCATACAGCTTCGTTTCCCCTTCACCTTGAAGCTG
AATTCCTCTGAGGACTTCCGTTAAAGGTGGAGCAGGCCATGGAAACCTTTCGCCCAGCGG
ATCTTCCAACAGAGCGTCTCTTACTGGTCTCCCGCGTATGACTAGAGTGGGTACTCCTAC
TGCTATGCTGTATTTTTGGGTCAGACGGCGCTTTATGTCCACATCATGATAGGGCACAGC
AAACCACGGCTTTCCCATCAGACTCTTGTAGAAACCAGCCTCTCTCTCCACCGGACCTTC
AGGTGTACCGACATGAGCCCACAACACAACTTGAACAACTTGCAGCCGCGGGTGTACTCG
TCTATGAATCTCCTCTAAACGCAGACCAAAATCGTCACTATTATCGCTAATGTTCGCGAA
AGAAAAGTAAATACCGCACACAGCACCTTCGCCTGCCTCCACACAATCATTCAAAGCTTC
TACTGTCGGCACGTTGTCATATTGGCCACCCTGTGACACTGATTCGCATTTCACGAGCAC
TTTACCGAAAAGTTTTTCGCGCCAATCCATTATTGGATGCGGAATTCAGAAGATCGCCAT
AATTTACTCGCGAAGCGCGGTCTCTGTTTGGTTTATTTGTTTATTTTCCAACGCACGACT
AGCTTACCGTTCGTTTAGTTTATTTTCGTTCAAGTTAACGAAAGCCGAAACATTGTTAAC
TTTTTTGAAATTTGTCACTAACTTTGCCTTCCAAATATTTTTTTATTTTAAGCCAAAATT
CAATTGTGGGCATGTTATTTCTTTTGTAAACAACACTACAGGATGTCGTCAGATGCAGTT
TTATTTATAAATCTGAAACGCGTGGGCGTTTTTACAAGGGACGGAGACGGCCACACTGAT
TCGTAAACAAAGCGAGACTAGTGGCTGGAGAGTGGAGGAGGCTGAGGAGGGCCGGGGGAG
GCAGCCCTCCG
(7331 bp)

- SilkBase 1999-2023 -