SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp70213_c0_seq7
Scaffold_idBomo_Chr9
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_probable_E3_ubiquitin-protein_ligase_HERC4_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0007283 P spermatogenesis
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0016874 F ligase activity
GO:0030154 P cell differentiation
GO:0042787 P ubiquitin-dependent protein catabolic process
Transcript
Level		FPKM:0.00 TPM:0.00
ORF EntryO_BomoEE21590_complete:A_BomoEE_comp70213_c0_seq7
Sequence
(Nucleotide)
ATAAATAAATAAATAAATATTTATATTTTGGATTTTTTTAAATCCGTTCTGCCAAAAGTA
AATTCCGCACGCGATTTTATTACGCTGTTTCATGTTATTGCGATAAATCGAGAGGTAAGT
CTCGGTCACTTTTGGGTTTGTCGCAAAAAATATTTTGTTTTTTGTTTTTCTGGGTCTTTA
TGAATTAAATACCGAGCCGCTTGAAGCCTTTGGTGTGAAACGCTTAGCAATGTGAATATA
GTTCTGCAAAAAAAAAATTGAGAAGAAACACGAATGTTTGATTATAATAAATTTAATCAT
AAAACAAAAGCGGAAGTTAAACAATATTTCCCTTGCTCTAAAAACACAAAATAGAAACGA
TAGCTATCGTCAGTGTTCTAAGAGAGCAAAAGGTACATCTGTATACCACTGGCGCATACG
GAAGTATTGTAATGTAATGTTTTAAAACAGGGTGCATTGAAGCCTTTCTCGGTAACAATT
TCAAATTGTCTAGACCAGGGATTCCCAAACTATTTTGGGGAAGAGACCCATTTTCCAAAA
TAATAAACTGATACCTCAGAACCCCGTAGACAAATTATATAAATAACTTAAAAACTCTTA
CTCTCTAACTTAAACTCTCTTACACATTATTTTTTTCTCATCAATACAAAATCATTACTA
ATAGAATGACTTGGCGCTTGATCAAGTTATCGGTCGATGTCGACCCTTTTGGAAATCGCT
GGTCTATACGATAAAAATGGTTATACCTGACTTAATGACACTAAAAAAGTAAAGCTCTTA
GAATTTGTTTACTAATAGGTTTTGCTTTGCACGAAATGTAATATGGTTCAAAACTATGGG
CCCTAAACAATGTTACAATTCTGCTAGCGTTAAAAAAGTTTCTGATTGTGTGGCATAGAC
AATGTGATTTCGTCTTTGATTTCTACCGCGAAGAAGCGATATGTCCTGGTTTGCTAGGTG
ATAATACAATAGAGACTTCGACTTCATGTGTCAAGCCGCCGGCATTGAAATAGTGATGTT
ATGGATTCCTTAACAATTTAGCATCATGTACGACGTAGGTACTTAATGCAACTATAAAGC
TTGAGAACACATTATAGATTTCTTAACAGATAGGTCGTGGGTTGGTTTGCCTATCTAAAC
GATAGCAAAATTTAACATTATCTAAGGGCCCAAAAGACACACGGAATTTAAATTGGCTTC
TACTACCTATGATATTGCGGGGGACACTAAATATTATGATAATATCGTTGATAAAATGTT
GAGTATATCTTCTGTTCGTCTTAAGTCAGCAGCTTTAGAAAAGGCTTCTTCACATTCCGT
TTAATACCAATGTCAAATAAATCACTATAAATAATGTTTTCATTATAGACCGAACCCATG
GATCAGAATAAGGTGATTAATTTACGATCATAACTTTTATTACGCATTTCCTCTAGTTAT
TAACGTATTGTAGCTTCCATAGTTTTTGTCACACATATTGTTGCTTGGACCAGCGAATTT
AGCTTTTAGCTCATGAAATTGGTTTGTCGAAATTTCTGACTCAACATTGCTTCAGTGAAA
ATGTTTTAAGCACGTTTATAAGTTGATACGTATGTATATATTTTTTGTTTTGTTGCTTAC
AGATAAATTATCTATAATATGTTTTGTTGTGCACTCTTCAAATTATCCCGTATTGTTAAA
TTTATTGTTTTGGAATGAAACTAACCGAGAACTATCCTCCTTTAGCCAAAGAAGAAAGCA
AAGGTGGAGGGTTCATCGACATTCGGTCGTTCGGGCAACGTGGGCACTTCTAAACAAAAT
GTTGAGTCAATTATATTATTATAAACTATAAAAATGAGCCATATGTCATAATACACCTTT
TTCTCTTTATTTTACCCCAACTATATAGTCGCTTTTAGTAGTGTTAACCTATATAGCATT
TATTTGTCTTAGTTTTAACTTAACTTTTGGTCTTGCGTATACGAAAATAATATAAATGTG
TCATATTTACAACGGGGCCAGTGTTTCAAATGTAAAAGTTCCGTGACTTAAGTTTTAGTG
GCCTTGCGCAGTTGAAACTGTTCTTTCGAGTGATGCTCAGTGTAGCAGTTCTAAATAGAG
TTCTTCTGTTGGAATTAGGTCGTGCTTCACGCAGTCTCACTGTAGATTCTATACAGTATC
GTACAAACATGATAACCATTTCATAGCACCCATTCAGTCAAGGCACCCGCTCCTTCCGCT
TGTGTTGTGATAGTTTAAATCGATTATTTGAAACTGAAATTATCACAATTTTTCGCATTT
GCACTATACACTAATAAATATTCTTAGCATGATTCATAGTCTGATGTTTATAATTGTGAG
AGGAAAAAAATCATCACAGGTAGGTCGTAACCTCAGCTTTTATATATTCACAAAAAAATG
GCTATCGATAATTTTGCTGAAGCACGTAACTGTTCCCAAATAGAAACTAATTCTCACCGA
AGTTTGGTGACTTTGGTTTCGCTGCTTAGTTAATTATTATACTACTATCCGAGTTTTGTA
TTATTCACATTAATATACTAAACATTTTAATTAACTAAATAAATAACTAATTTAAAAAAA
ATAACACTATTAAAATCATATTAATATAGTGTGTAAAACACAAAGACCCTCTTTTATCAG
ATGGTTGAGGTGCATCAAAATAAAGTTAACATTTTGTGACTGGCAACATCGAAATAAAAG
TGATCGATTCAACACGTAATTAATTCGCAGTTTTCACCTGAAATCTTCAAGGGTCCGATT
AAAGTGTTCGCGGGAGGTGACCACAGCTTCGTGGTATTGAAAGGCGACAAGTCCGGGCCG
GTCGACTACCGCACTCCGGACCACAGGAAGCAAATACTCACGCTCACTCTACCGAAGCTA
GCCGCGTGTCAAGTCTTCAAAGATAAAGATTTCGTTAATCAGGATTTAATGGCGTACTTA
GAGACGGTGTTCGGTTCGCTGGCGTGTGTGAACGCGTCCTTCCTGCTGCCGAGCAACGGA
CACTACTGTTGCAACACCAAAATGCCGGGCGTCGACCTTAGCAAAGCCGAGGAGGCGTTC
TCGTTGATCAGCCGATTCGAAAACACGTCCATCAAGGAACTAATATTCAGTCACTTAACG
GATAATATAATTAAGAAAATGAAGCCCTCTCCACCGGATGCTGAAGCTCTAAGAATGTTT
CTAATATTACCGCTATATCACGAGATGAGAAATCCCAGACGCCATACCCAGCTACAGGGT
CCCTTTGCTGAAGCCTTCAACAACTTGTCTACTCATCCTCAAAAAATAGTCAACTTATGG
TGGGAGGCGCAGACGACGGAGTACTTTGAGATGCTCGTAGATATATTCAAAAGCGTCGTT
GTGTACGAACTTATGCAGCCTGTAGTTAGATCGACTAAGAAAGTGCAATTCAAACACAGC
ACCGTACAGATATTGAACACGTTGTCGTCGCTGAACAAGATCAACTTCACGAACCCGAAG
CTACCTAAAATACCGGCTGAATGTTTCTACATAGAGGACTTGTGTGATCACGTTGACATC
GCTTCTGATTATATTAACTGGTTGTCGGACCAAACTTCTACCCAGACGCACATGTGCAAT
TACGCTTTCCTGTTCGACGTCCAATGCAAGTCGTTGCTGCTGAAGATCGATCAGCAGCTA
CAAATGCAGATCGCCATAAGCAGGGCCACCACGCAAATCTTCACGAGGCTCTTCATGGAT
CCGACCTACGAGTATCAGAGGGATCAGTTCCTCAACCTGACCGTCTCGAGGAACCATATC
GTCAGGGACACCATGCTGCAGATAAGCAACCATGACACTTCACAACTGAAGAAACCGCTC
AGAGTCGAGTTTATTGGCGAAGAAGCGGAAGATGCCGGTGGCGTTAAAAAAGAATTCTTC
ATGCTACTGCTCAAGGAAATATTTGATCCCGTATACGGTATGTTCAAGCAATCCGAGGAG
ACGAACATGATTTGGTTTTCAAATAATCCATTCGAAGATGACGTCATGTATTATGTGATT
GGTGTTCGGACTGTGTTTCGCCGTGAACACTGAAGTGTTTGATCAAATACAAGTGAATCC
ACTGAAAGAGGACGGAGAGAATATACCTGTGACGCGCGAAAATAAAGCCGAATACGTTGA
GTTGTACGTGGACTTTTTGCTCAATAAATCTGTGGAGAATCAATTTAAAGCTTTCAATCA
AGGTTTCCAGAAGGTGTGCGGGGGTAGAATAATAAAGCTGTTTAGATCTCACGAATTGAT
GTCCGTTGTCATCGGAAACGAGGAGTACGACTGGGAAATGTTTCAGAACAATTGTGAATA
CAAGAATGGATACTCTGAAACTGATCAACAAATCAGATGGTTCTGGGAAACGTTCCACGA
GCTGCCGCTTGAAGATAAGAAGAAATTTTTGCTTTTCTTAACCGGCAGCGATCGTGTTCC
GATACAAGGAATGAGGGACATTAAAATAAGAATTCAACCAGTGGCAGACGACAGGTTCTT
CCCGGTGGCCCACACTTGCTTCAATCTTCTAGATCTCCCGCGTTACAAGACTAAAGAGAG
GCTCAAGTATTATCTTCTGCAGGCCATTCAGCAGACGCAGGGCTTCTCGCTGGTCTGAGA
AATAATATTCGTTTTCTAGTCGTTTTAAATCATTCGTTATCGACATTTTATAAAAAAATG
GAATCATGAAATCATTGGTCGGTCAAATCGATAATCAATATCGCTCTCTTTTATAATTAA
TCGTGCAGGGTCAACTTCGAACGTCCCTTGTCTCTTTGAATAAACGGGTGGTTTTAATTG
ATTTCGTCCACAAGTTAAATTTTATGTAATCTTTGTTTTCATGGATCCATTACAATAACG
ATCAAATCGAAATATTGTCATTATTTCATTTTAAATGGAATCTTGACACTTATATTTCAC
CAGTAAATATTCGAATTTGATAAAAAGGAAATGAGGAGTTTACTTTGTTTGGGAAAAAAA
CGATTGCTCACCCTCAATCATTCCTAATAGAAAGGTTTTTGTTTTATTTTATTTTAATTC
TAGATAATTCTAGTGAATGTCAAAAGCGCTCTTGTTATTTGCACGTTTTTCGAATCAATG
AAAATACTTATTTTTATTTTTAAAACCTATTATGCGTGCGTTTTTTTCTAAATTAATAAA
TAAAAAAAATTCACTCAATCGTTAAAAATTCTATTAAAAAAACAGCTACAAATATGAATA
ATGTTTCTTCAATGAATATAATTGATTTCTATAATTATATTACGTTCGCGGAAACACACC
ATTATAAGCCTCTTTCTGTTTTAATTTTATAAAAACGAAGGAACGGTCTCCAAATATTCT
CAAAATGTTAAGGTGTGTCCACATGCACACGTAATCACAGAGTAACCACTGTATCGGCAT
CCGATTCCAATCGATAAGCCAACAGTGGAAGGCTATGCTGTCCCTAAATAATTGAGAAAA
GAAAAATTAAAACAATGCCTAACTGAGGATGTCTTTCACATCCATAATTTAGTTCCTACC
AAAAAC
(5526 bp)

- SilkBase 1999-2023 -