SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoEE_comp70213_c0_seq5
Scaffold_idBomo_Chr16
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_probable_E3_ubiquitin-protein_ligase_HERC4_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0007283 P spermatogenesis
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0016874 F ligase activity
GO:0030154 P cell differentiation
GO:0042787 P ubiquitin-dependent protein catabolic process
Transcript
Level
FPKM:0.11 TPM:0.20
ORF EntryO_BomoEE21585_complete:A_BomoEE_comp70213_c0_seq5
Sequence
(Nucleotide)
GCCACTCAAGAACTTTCTGGCCCTTTGCTTAGCCGACATAATTTCAGTCTTTGTTTCAAA
AAAATTGTTTTATATTACTTCTTGGCTTTTTCTAACATGAAAAAAAACTAAGTGACACTT
GACGAAATTGACAAATGACTATTTCATTTTGATGACAATTTCCCAGGCTGATGAAGACGA
CGTTGAAAGATTGTTCTCGATTTTTAAAAATGTATTCCTACTGCCTTTTGCAATCTCAAA
AATGAAATTTTAAGTATAGAATTCTGAGGTGAACTATAAATATATAAATTTACCTCCATT
CCTTCAGACTGAATGACAAAGTATAGGTTATAACAAGCTAATTCAAGCTATTGAAAAAAA
TTGCAAAATTACAAGAAAATGTTTTGTTGGGGCAATGCAACTCATCATGAACTGTGCATC
GACGGTTCACAAATAACTGATTTGGTTATCAAGCCCACATTATCAAAATGGAAAGAAAGT
GATCACATACAAGCAGTAGCAGCTGGCGAATTCCATAGCTTATACCTCTCAAACAGTGGT
CATTTATATTCATGTGGAAATAATGATGTGGGTCAGTTAGGACGTCAAACTGAATCTGAC
AATGGAAAGAATCCAGCTTTAGTGGAAACATTTAAAGACTGCACAATATCGACAATAGCA
TGTGGCCTTCAACATTCTTTAGCTATAGATGAATGGGGGCAGCCTTTCAGTTGGGGCTCT
GACAGTATGGGGCAACTTGGCAATAACCTTGGCGCTCATGCTCAGGACAAACCTAAATTT
GTCAAAGGGTTAGCAACCAAAAATGTAATACAAGTAGCTTGTGGAGCCTATCATTCTGTG
GCATTAACAAACAGTGGTGATCTCTACTCATGGGGTGCAAATAGTTATGGACAATGTGGT
TTAGGAACTATATCAAACAAGGAAATGTCACCTCAACACATTTCATCATTAATTGGTGTA
CCTATTGCCTTAATAGCATGTGGCAATAACCATACATTTGTGCTATCAAAATCAGGTGCG
GTTTTTGGATGGGGTAAAAACACTCATGGACAACTTGGTCTTCAAGACGTTGAAAACAAA
TGCTATCCCACTCACCTAAAAACATTGAGAAATGTGAAGGTATGTCACATAGCGTGTGGT
GAAGATTTCACTGTTTTCTTGACATTGGACGGTGGTGTGTTCACATGTGGAACTGGTGAA
TACGGGCAGACTGGACATGGTACGACTAGAGATGAGCTTGTTCCAAGAAAGATTGTCGAG
CTGATGGGCAGTACAGTGACGCAGATAGCGTGCGGACGACGGCACTTGCTGTGTCGCGTC
GGCGAGCGAATCCTGGCTTGCGGTTACGGAGCGCGAGGTCAACTTGGCTGTCCGCACATG
GCGTTCGCGCTGGTCCCGACACCTGTACCGTTCACACCCAACGACGAATCTCCGCCAAAG
AAGAAAGCAAAGGTGGAGGGTTCATCGACATTCGGTCGTTCGGGCAACGTGGGCACTTCT
AAACAAAATGGTCCGATTAAAGTGTTCGCGGGAGGTGACCACAGCTTCGTGGTATTGAAA
GGCGACAAGTCCGGGCCGGTCGACTACCGCACTCCGGACCACAGGAAGCAAATACTCACG
CTCACTCTACCGAAGCTAGCCGCGTGTCAAGTCTTCAAAGATAAAGATTTCGTTAATCAG
GATTTAATGGCGTACTTAGAGACGGTGTTCGGTTCGCTGGCGTGTGTGAACGCGTCCTTC
CTGCTGCCGAGCAACGGACACTACTGTTGCAACACCAAAATGCCGGGCGTCGACCTTAGC
AAAGCCGAGGAGGCGTTCTCGTTGATCAGCCGATTCGAAAACACGTCCATCAAGGAACTA
ATATTCAGTCACTTAACGGATAATATAATTAAGAAAATGAAGCCCTCTCCACCGGATGCT
GAAGCTCTAAGAATGTTTCTAATATTACCGCTATATCACGAGATGAGAAATCCCAGACGC
CATACCCAGCTACAGGGTCCCTTTGCTGAAGCCTTCAACAACTTGTCTACTCATCCTCAA
AAAATAGTCAACTTATGGTGGGAGGCGCAGACGACGGAGTACTTTGAGATGCTCGTAGAT
ATATTCAAAAGCGTCGTTGTGTACGAACTTATGCAGCCTGTAGTTAGATCGACTAAGAAA
GTGCAATTCAAACACAGCACCGTACAGATATTGAACACGTTGTCGTCGCTGAACAAGATC
AACTTCACGAACCCGAAGCTACCTAAAATACCGGCTGAATGTTTCTACATAGAGGACTTG
TGTGATCACGTTGACATCGCTTCTGATTATATTAACTGGTTGTCGGACCAAACTTCTACC
CAGACGCACATGTGCAATTACGCTTTCCTGTTCGACGTCCAATGCAAGTCGTTGCTGCTG
AAGATCGATCAGCAGCTACAAATGCAGATCGCCATAAGCAGGGCCACCACGCAAATCTTC
ACGAGGCTCTTCATGGATCCGACCTACGAGTATCAGAGGGATCAGTTCCTCAACCTGACC
GTCTCGAGGAACCATATCGTCAGGGACACCATGCTGCAGATAAGCAACCATGACACTTCA
CAACTGAAGAAACCGCTCAGAGTCGAGTTTATTGGCGAAGAAGCGGAAGATGCCGGTGGC
GTTAAAAAAGAATTCTTCATGCTACTGCTCAAGGAAATATTTGATCCCGTATACGGTATG
TTCAAGCAATCCGAGGAGACGAACATGATTTGGTTTTCAAATAATCCATTCGAAGATGAC
GTCATGTATTATGTGATTGGTGTTCGGACTGTGTTTCGCCGTGAACACTGAAGTGTTTGA
TCAAATACAAGTGAATCCACTGAAAGAGGACGGAGAGAATATACCTGTGACGCGCGAAAA
TAAAGCCGAATACGTTGAGTTGTACGTGGACTTTTTGCTCAATAAATCTGTGGAGAATCA
ATTTAAAGCTTTCAATCAAGGTTTCCAGAAGGTGTGCGGGGGTAGAATAATAAAGCTGTT
TAGATCTCACGAATTGATGTCCGTTGTCATCGGAAACGAGGAGTACGACTGGGAAATGTT
TCAGAACAATTGTGAATACAAGAATGGATACTCTGAAACTGATCAACAAATCAGATGGTT
CTGGGAAACGTTCCACGAGCTGCCGCTTGAAGATAAGAAGAAATTTTTGCTTTTCTTAAC
CGGCAGCGATCGTGTTCCGATACAAGGAATGAGGGACATTAAAATAAGAATTCAACCAGT
GGCAGACGACAGGTTCTTCCCGGTGGCCCACACTTGCTTCAATCTTCTAGATCTCCCGCG
TTACAAGACTAAAGAGAGGCTCAAGTATTATCTTCTGCAGGCCATTCAGCAGACGCAGGG
CTTCTCGCTGGTCTGAGAAATAATATTCGTTTTCTAGTCGTTTTAAATCATTCGTTATCG
ACATTTTATAAAAAAATGGAATCATGAAATCATTGGTCGGTCAAATCGATAATCAATATC
GCTCTCTTTTATAATTAATCGTGCAGGGTCAACTTCGAACGTCCCTTGTCTCTTTGAATA
AACGGGTGGTTTTAATTGATTTCGTCCACAAGTTAAATTTTATGTAATCTTTGTTTTCAT
GGATCCATTACAATAACGATCAAATCGAAATATTGTCATTATTTCATTTTAAATGGAATC
TTGACACTTATATTTCACCAGTAAATATTCGAATTTGATAAAAAGGAAATGAGGAGTTTA
CTTTGTTTGGGAAAAAAACGATTGCTCACCCTCAATCATTCCTAATAGAAAGGTTTTTGT
TTTATTTTATTTTAATTCTAGATAATTCTAGTGAATGTCAAAAGCGCTCTTGTTATTTGC
ACGTTTTTCGAATCAATGAAAATACTTATTTTTATTTTTAAAACCTATTATGCGTGCGTT
TTTTTCTAAATTAATAAATAAAAAAAATTCACTCAATCGTTAAAAATTCTATTAAAAAAA
CAGCTACAAATATGAATAATGTTTCTTCAATGAATATAATTGATTTCTATAATTATATTA
CGTTCGCGGAAACACACCATTATAAGCCTCTTTCTGTTTTAATTTTATAAAAACGAAGGA
ACGGTCTCCAAATATTCTCAAAATGTTAAGGTGTGTCCACATGCACACGTAATCACAGAG
TAACCACTGTATCGGCATCCGATTCCAATCGATAAGCCAACAGTGGAAGGCTATGCTGTC
CCTAAATAATTGAGAAAAGAAAAATTAAAACAATGCCTAACTGAGGATGTCTTTCACATC
CATAATTTAGTTCCTACCAAAAACAAAAAATCACGTTCACCTATTCATATGCATTATAAT
TGCTTCACTTAGAATTGTTTCGTAACGGCTATTTAAAATTTTTTGAAGCGGCATCTATCG
ACGTTTATAAAGAACAACAATAAACACAAATTCAGAATTAAAGACACTTTAAACCTAGCT
TATTAATATAATAACAATTAAACAGGTTAAAATTCAATGAACTAGAGCTTAATTTAAAAT
ACATGTACTAATCCACCGCATTTAAGAGATAATTAGGTTTTAGACTATTATTTTTAGTCA
CAGCGTGCACGCATCCTAATTTTCCTCATCCACAATTCAAATAGTTCAAACAGTCTCTAT
TACTATAATAATTGTTTCCGCGAACGTACTATAAACAATATTGAACTTTTTTTTATATCT
GTCTATTTTATAATACAATATTGAAATCATCATAATATTATGATTACTTCTCATATTATT
TTATTACGATTACTTCCAAATTAGGTTATTATTGATAATAATAATGACAATGAATGCATC
GTACACGTGCAAAGGTAACCTCTGTGATACAAAGGCACGTCTCTAATTCGGGGCGTAAAG
AACTGCTCTCGAAAACAAAACATTAGCACTCACTTAAAGGATTACTTTGGTCTTCAAATA
TAATTTGTTTGTACACAGTAAGGATTAGTAAACAATTTTAAGTAACGAAAGATCTGCTAA
CGCGCAAGGTCAACGACCTCGTGTTGCGAATTCCGTGTTGTACGCTTTCCATTGCACGCC
CTGGAAATGTTAAATCACAAACACGATGGGTATTTTGCTTCGTTAATATTGACTGAAAAT
GACTAATATTGGTTTTGGTTTCACGAAGTAGCTCATTTATTTCTGTGTCTATAAAGTCGA
ATTTATTTATTTATCTTATAAAAAATACGAGTGGGTAGTTGATGTTAGCGTTTTGCGTTC
CGAGTGCGGTTCCGTGCGCCCCGTATGTTTAAGGGCCTGCTTGTAATGTTGTTACACTGA
TTCGTTATAAACTGTACATAAAATATGGCGGTAATTAGCTTGGCTAGATCGGTGTTGTTT
TTATAGCATTTACGTGTTTACCTCGGCCTAGTTGTAGCTATGGCGCAATTTGTACATTAT
GTATATGTATAAATAAAAATAAAATATTTTCGTAATTAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAC
AAAAAAAAAAAAAAAAAAACGATTTGTCTACGATAATTAACATTTGTCACTGTAAGGCTT
CAGCGGCTTGAAGTCTGCATTGCCGCTCAGATAAGCGTCGAGGAAGTTCTGTACCGAGTG
CGTGGTTATCTCATCGCCGTACTTCATGGTGAACATCCGTTGCTTCGGGAAGTCGATGGC
TGTGAGCAGTGGCACCGCGTCATCTAAGCAGATGTGCTCTCTCAGCATGTCCGCGGTGTC
TGTGCCGTCCACGCCGACGTAGAACATGACGTGTTTGAACGGTCGCTTCTTGGATTTCCT
GGGCGGGTAGTCGAAGTCAAGGGTCTCGTCGTCCGAAGAGCTCTGGTGCGGGCAGAATCC
AGGGTATTGGATGCTGCATTCCTCGTAGTACGACTCCGCGGCCGGCGTTAGTACCGATTC
GGCGAATTCTATTTCGGAATCTTCGTCATCCACAAACAAAACTATGGCCGGGTGTCTGGC
CATCTTTAGGAGAGCTTGTTCAGTCAACACTGAAAGAGGTCTCTGGGACCACGGAAAGTT
CAAGCCAGTGGGATCGGCAGCAAGTTTTTGCCTGCCGTTCGTGGTGAGCACGGTACCATC
ACCGTTTGCTATGACCAGGGCGGGTATACCGGCGACTCCCAGGGCTGTGGGCAAGGCTCC
CCGCGCCTCGGCAGCGCTCCACGGGACAGCCAAAGCGTTGGCCGCGGCAACAGACTGCAC
GGTGCGATTATACGACTGCTCGCTTCTGTCACTGGATACGATTATGAGCTGCGTGTTGGC
GTATTTCGCACGCCGCTTGCGTACTGCTGACAGCGCCGCGCAGAGGCTCGGAGCGAACGT
CCGACATGGGGGACACCAATGAGCAGCAAAATAGAATACTCTCAAGGCATCTCCAGGCAG
ATCCTCATACAGCTTCGTTTCCCCTTCACCTTGAAGCTGAATTCCTCTGAGGACTTCCGT
TAAAGGTGGAGCAGGCCATGGAAACCTTTCGCCCAGCGGATCTTCCAACAGAGCGTCTCT
TACTGGTCTCCCGCGTATGACTAGAGTGGGTACTCCTACTGCTATGCTGTATTTTTGGGT
CAGACGGCGCTTTATGTCCACATCATGATAGGGCACAGCAAACCACGGCTTTCCCATCAG
ACTCTTGTAGAAACCAGCCTCTCTCTCCACCGGACCTTCAGGTGTACCGACATGAGCCCA
CAACACAACTTGAACAACTTGCAGCCGCGGGTGTACTCGTCTATGAATCTCCTCTAAACG
CAGACCAAAATCGTCACTATTATCGCTAATGTTCGCGAAAGAAAAGTAAATACCGCACAC
AGCACCTTCGCCTGCCTCCACACAATCATTCAAAGCTTCTACTGTCGGCACGTTGTCATA
TTGGCCACCCTGTGACACTGATTCGCATTTCACGAGCACTTTACCGAAAAGTTTTTCGCG
CCAATCCATTATTGGATGCGGAATTCAGAAGATCGCCATAATTTACTCGCGAAGCGCGGT
CTCTGTTTGGTTTATTTGTTTATTTTCCAACGCACGACTAGCTTACCGTTCGTTTAGTTT
ATTTTCGTTCAAGTTAACGAAAGCCGAAACATTGTTAACTTTTTTGAAATTTGTCACTAA
CTTTGCCTTCCAAATATTTTTTTATTTTAAGCCAAAATTCAATTGTGGGCATGTTATTTC
TTTTGTAAACAACACTACAGGATGTCGTCAGATGCAGTTTTATTTATAAATCTGAAACGC
GTGGGCGTTTTTACAAGGGACGGAGACGGCCACACTGATTCGTAAACAAAGCGAGACTAG
TGGCTGGAGAGTGGAGGAGGCTGAGGAGGGCCGGGGGAGGCAGCCCTCCG
(7310 bp)

- SilkBase 1999-2023 -