SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp69982_c0_seq5
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		Uncharacterized_protein_OBRU01_01001,_partial_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005575 C cellular_component
GO:0008150 P biological_process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
Transcript
Level		FPKM:2.49 TPM:4.35
ORF EntryO_BomoEE20272_complete:A_BomoEE_comp69982_c0_seq5
Sequence
(Nucleotide)
TTTCTCGTCGGATCTTCTCAGTGGATTGCCATTCCGATCCGGTAGTAGATTCAACAAAGC
ACTGCTCTTACTAGAGCTAGTGTTAGCAAATTCCCTCAGATTGAACTTGTAAGCCTAGCT
GTCCGCGCGTAGCTAGAATAGCCCTTTACACTTACCAGCGAATGGTAGGGAAAAAACGTC
GCATTTTAACGAACACTTTTTGCATACACTGAGTTTGCTACTTACCTCTCTCTACCCTCC
ATAATATCAGTCGATAATTTGTTTTAATTTTCAAGGGGCATTCCGTAGTTTTTTAATTAG
GTTTTTTTTTTTCTAATCGCAATATATTAAAATCCATGTGAAATGCGTTCAGAAACTCGA
AGTTACCATTAGGCCGCGCACCAATGAGAATCGTGAAATAAAAATAAAATAAAAATAGAT
TTATTGTACAAAATTTATAGACGTTTTTAAAAACTTAATTCTTTTCAGTCGATGCGTAAT
TTAAATTTGATTTACAACAACGAAAAGTTGCTTTTTATTGTTTTTTTTTTTTTCTTAAAT
TTTTATAACCATAATGTTGCATTCTTTGTCCCTTTCTATGACTTCGTATTCGAAGTCGCG
TTTCAATCTTAGGCTACTTTTAACTTTGGTTGAAGACTTGGGCGATTTTTTTATTGTCGC
CCTGTCGTTTGTCGGTGAGGTGGGCTTGAACTGCCCTATTCTGGTTTTAACGATCATTTT
TTTCTTTTTAATTTTCTCGTCGACCGCGCCCAGGGTGTCCTCGACGAAGTGCCGGTACGA
ATCATTGAATGACGTCAGCGACGCGGGCGACCCGAACTTCGGGGACCCAATTTTGTTGTC
CTCAAACTTCACGTTCTTCCTCGTATTGCTGTAAGTCTTAACGGGCACTTTTGTTTTCAT
TTCCGTGTCAAGTTTAGATTCGTCCTCGACAATGTCATCGGTGGATGTCTTTTTAGCGAG
CTCCTTACCATTCTGACACTCAATTTTACAGCCAGCCTCATCGTTCAACAGCGAAGCCAT
CTCCAGTGCTTTACCGTACAACAATTTCAATACGTTCTCCTTAACATGCAACGATTTACC
CAAAATAGTGTCCATTAACCTCTTGAATTGCACGCTGAGGTCGTCCGAGTCACAGTCGAC
GCTCAGCACGGTGTAACAATCCGTATCTCTCAACAGTGAGCTTATTGAGTACTTCTTGAA
CTCCTCGGGGAGGGTGTATTCATCGATTATGTGCCCGTAATGAGCTTTATAGTACACGAC
CTGTATGCCTTTGCTGAACTCTTGCTTCGTGAAGCTAGACGGGCACATGCTGGCCGTAGA
GCTGTCGCATTTCATGTGACTGCAGTGATATATTTGCATATTATCAATTTTGCTTAGGGT
CGTGTATTTTATATCGCAGCGTTTCTCCGTGTCCTGTCGCCACGCCGAGAACGCAGCCTC
ATCAGGAAAGAACAGGTTCTCAGCTCCTTCACTGTGAAGTCCTGCTATGTGTAGTTCGTA
CAAATGTAAAGTATTGAACTGCTGATTGCAACCGAGACAAGAGTACTGGCTCTTCAGAAC
GTTAGAGAATGATATACCACATGTATGATCATCGGACTTTATTAATACATTACAGGCGAT
GCAACGTTCTATACGAACTGGCTTGATTATATCTTTCGATGTTGGTAAAACAGGGTTCCC
TTTCTCGTCAATGCAATGATATTTCTGGATGTGTTTCCAAGCCCAGGAGTAAACCTTGAA
TATTTTAGAACAAACCGGGCACTCAAATTCGGATTGTTTCCCGTCTTCACTAGGTATTGG
CGTTTTAGTGTTGTATTTTCTTAATAAATTGTGTGGCTGTGATTTTTTTGTCGAAGCATT
TTCGGATGTTTTGTTCATTTTATGGGCCACTTTTATTACCTTTTTATGGGGTATAAGCTT
CCTTTTGGCTATAACTTCGGTTTTAGGTCGGTATGCAATCCTTTTCTTCAGCGGATGGGC
AACGGCTTGGTGCGAACGTAACGCTTGCACATTTTTGAATCCTAGAGCACAAGTATCACA
TTTACACGTCAACCGTTGACTTCTCAACTTTCCTGGTATCTTTGAACCCATTTTATGTTC
AGCATTCGTTTCAATTAGGTCATAAAAGTGTATTTTTTTCACTGTTCAAGCGACGCGAAC
AATCTTGAAAACGTTCCATAGATTCAGGTCAACAATGGAACGGATTTGTGACGTTAACGC
TTACGGACAGGTGAAAGAGAAAACAAAGTCACAGTTTAGGAAGTTGAACAAGGATAGAAG
ATCATGCACTCTACACAGTACAGGAGCAATTTAATTATTCTCAGCATCAATTCTATGGTG
ATGATGCATCATTTTTTTTCACTAGGACTATAAATGGTCTAACGAGTACACTGCCCAACT
GGTGCTAAGCGGGCCGAAAGTTGACAACATGTAGCCGTATTTCACAAACAAAACAAGCAT
TTGACAAAAAAAAACAATTGTATTTTTTGGGTTCTTGTGCTTAATCTGCGCCGACCATAG
ACAAATACCTACACAGGCAAGCTTAGTGTCGTCAGATGGAGTTTTGCGCATTAAATTTGT
ATTTTTCGAACTTATTTCCACTGTGAGCTTGAGAAATCCTTCCTTATCTGCTAATGCTTT
TCGCGCTGACATAAATCAACAATTATCTGGTTCTGGTTCATTTAGTATGCGTTTTTAATA
TAATTAATTTATATTTATTTGTTCACGTCAATGAAAAATGATAATAGAGCAATTAAAATT
TCATGTATTAAACAATTTAATTAATCTCATTCTTATATAAAAAGATTAATTTGACAACAA
GCCCTGATAACGTTTGGGGCGATGTTAATAGACATTTTGAAGAGTATAAGTGGATATCCC
AATTTTCACTAAATTTAGAAATAGTTTATCCAATGGAAGTATCAATGGTACCTTGCTGGC
CAAACAACATGTTTTAAATGAAGCAGGTAAATGTGCTAATTTTATTGCATTTGTATAAAA
AGCATATGTAATTATGTAAAGTAAAAAATATTTTTGATGTGTACTATTGTTTTTATTCAA
AACTACGAAATGTACTACTTTTTTAAAGGTGGTATACTATTATCTTATTTTTACATCTGA
CAGCCCTGACAACAACTAAACCGATATCAAAATAACAAAAGGTATAAATAATTAAACAAC
CTTAGAACTGTCTTCATTTAACACATAAAATTTGTTAGAAAAAAACAACAGAGGTGTCCA
TTGTACGTAGTGCGTACCTATATTTAACTACGAAAACAAACAAAAATGTTCAGATTATAT
CTAAAGCCGAATTGCATTTCGATGGGTAAATATCAAATAGCCATTGGTAAGTATCAAGCT
TAACAATTAAATTTTAGTTACTAATCACCACTTATTGATGTTTCACTTATGTTTTTCAAC
AGGTAGTTCTTACATTAAACAGAATGTACACGTGTCTCCGCTATTGAAATCACAGAGTGT
AGCTTTGAAATTACCCACGAATGTTGTTGATATTAACGCATCCGAAGTAGGGAGATTTTC
TCCGAACAGAGAAAGAGATATTTCCGGTCCTGTTATTAATTCTCACTATAAAAAACAACA
TGACATGTCTAAAATTGATATAACAATACAAGTTGACCCATATGTTAACAAATATGATTG
TCGAGGGGCTGTTAGCCTATCTTCGTCCATGCAGAGCAACGTTCCAAGTCCTTTCACAGG
AAACCATACTCATCTCAACATGCCAGGCTCACAATGGGGACAAGGCCACAAATACTTATC
AGATCATCTTCACAGTGCACATTATTTGAGTCTAAGAAATGAATACAGAGAAAAAATTAT
AAATAAAATGGAGTTGATTTAGTGGCTATTCTAAAATATTTAAATATAGAAGAGGGAACT
GTCTTGAAGGCTGCTGGTTCAAATGCTGGGACTTTTGTTATAGCCTATACAGTCCACAAA
ATTTTCGCTCCATTCCGGATAGCCATAACTTTGACTGCAACACCTTTCATCGTTCGACAC
TTAAGAAATATTGGAATTTTAAAACGTGGTATAAATGCTGGTGGTGGGAAATAAATTATA
TTCATAAATAATTTTATACGCATTTTATTCTTAAAATTTTTCTTATCAAAGAATTAAAAT
CTCTTTTAACACTATAAGTCCGACTGGCGGGCTTTTGT
(4178 bp)

- SilkBase 1999-2023 -