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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp69922_c0_seq10
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_transmembrane_protein_189_isoform_X2_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0031625 F ubiquitin protein ligase binding
GO:0061630 F ubiquitin protein ligase activity
Transcript
Level		FPKM:0.75 TPM:1.31
ORF EntryO_BomoEE20033_complete:A_BomoEE_comp69922_c0_seq10
Sequence
(Nucleotide)
ACAAGAGGTCCTACCACCAGTGTCCTATCTAAGCAAGCTCAGGCTGGCTCAGAGTACGCG
TTGACAACATTAGACTGTTGCTAAAATTAATTCATAATAACAATCTTAAGATTAAAAACA
TGAAACATTATTTGCGAGTTGTAGACATAGGTAACCTAAATGTACCTATGGGGTTCAATG
TCACTTTTATTATTTTGATTTTATTTTCAGAAATTTCAAATACTTTACAGTTTTCGTGGT
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TGAAACAATTCAATTTCAACATATCGGAAGTAGTTCATATAACCAATTATAACTTTTTTA
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AACAGACCTATCGCTGATGCGGACGCGTCTCATAATAACTTTCAATATTTATGTGATTTC
TCACTAAGCCTACACAATTTCAATTTTAATCTAAGTATTTGTCACACAGCCAATTGACAA
AAGTTGATGCATAAAGTAACGTGCTTAAGTGATTCAAGCGTAGCAAAATATACTTTTAAC
TTATACTATTAATTGATTTGGTAGATGTGGACAAGTGTAAGTCGTATAAAATAATAATTT
CGCATAATAAATTTCAATGTTCTAGGAACGTTTTTGTGCCCATTTAAGGTCGTCTGCTCG
TGGTCTACATCCAGTTACAGCTTCTATTATTGTCTCTAAAGTCGACCAAAAGTGAAGTTT
TTCTAATGGCCAGTTAAGCCAGCCAGTGGTTATACAAAAGTAAGTCTCGTGCGGTGCGAC
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CCATGATGGCAACCCAAAATATGTGTGCGACCATTTGTGAATCTGATTCGTCATAGCCAC
GAATATACAGCACAAATACCAATATGCAATCCAATGAAATTGGTCATGTACTTTTCCTTC
TTCGTACGTAACTAGTTGCCATACTATTCGTGCAAGTACAGGTATCGTTATAGCAAAATT
ATCACCATTGGTCTCAATAAAGTCATGACGGGTGATTGATGTAGGATCGATGTGGTGCTC
TCGAAATGGTCGGAGAAAGTTTTTGCCTATTATTGGTAGATCAACTGCTCCCCAAGTGTC
AGCTGCCCAGTGCACAACTCCAGAAGCAAAATCTGCTGTTAAGACCCCTGCAAGAGCTGC
CAGTACCAGTGAAGCATCAGCCCGAACATATCTGATCATTAAAATTCCGGCAGAGGCACA
TAGTGTGCAACATAATACCACACATACCCATTCCTGCAATCGCTTGCCTGTCAAAATAAC
ACATTAATAATTATAATAACTCGTAATAGTGGTGCCTATTAAAGATACTATCTTATTGTG
AATATTGTTTATTTAACATAGTGAGTTCCAACCTCTTATTAATAAATTACACTGTAGATG
CACCATTATCAGCAAGAATTGCAAAATATATGTACATATCTGGATCGAATGAGCTCCCAA
ACCTTTTTTTTTAATGCACAACCACGCATTTGCCCGCTTTATGGCATCTGCTTTACTACT
GTATGACTTAAGTGTATAAGAATCGAGGAAACAATTATGGAAATCAACATTATCAACTAA
AACAAGATGACAATAAAAAGTTTGACATCCGTATATAGTTATCACTACATAGTATAAAA
(2159 bp)

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