SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp69921_c0_seq5
Scaffold_idBomo_Chr13
NCBI non-redundant
(nr)		N-cetylglucosamine-6-phosphate_deacetylase_[Spodoptera_litura]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005575 C cellular_component
GO:0005634 C nucleus
GO:0005975 P carbohydrate metabolic process
GO:0006044 P N-acetylglucosamine metabolic process
GO:0006046 P N-acetylglucosamine catabolic process
GO:0008150 P biological_process
GO:0008448 F N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase activity
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016810 F hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:1.00 TPM:1.74
ORF EntryO_BomoEE20023_complete:A_BomoEE_comp69921_c0_seq5
Sequence
(Nucleotide)
GGACTTCAGCAATGCCAGGGGCACAGCCAAGCCGTTGCCTACCATACTAATGTAACTATG
GATAGTTTTACACACTTAATTATTAACAAATTGCAAGTGCTGAGTGATAATACAGTACTT
GTACTGGGAATGTTTACTTTTCAAAATATTAAAACATGGCATATTCATTTTTTTTTATTA
ATATTTCATTAAACGCTACTATGTGTGCGTTTCAACTTAAGGTTACTGTTTGCTTGTATT
GTAAATAATTATATACGCAGCAATAAAAATACATTATTCGTAAAATCCAATTTTTGACAT
TTTATAACATTTTTTCCAATGAGATTAAATTTTAAATAATAATGCCTTATGATTTACCAG
CGTTCGGTAAAAAATTACAAGGATAATTAGAATTAGCCTTCTAACGTTCAGAAATTTCGC
CAGCTTCATAGTTCGTAAGACATTTTAGCCACCGACTATCGACGATAGAACATTTAAAGA
AATTTTACACTGAAAATATTGAAACGAAGCACAATTGGGAATTTTATTCAGAACTTAAAT
GTTATTACGTATATATGATATCATTCGTATAATGTCGAGAAATACGTTTCTCAAAATTAT
CATCGTCCCAATTGTACTGATATTATTTTTAAAATATAATATATTGGTTTTGTTCATGTC
TTAGTTCTGGCATTTATATACACATTCTCCAGCTATCCAGGTGGATTGAACTTTCAATGT
TTTAGGGTGAAGTATTACGAAGTCAGCGTCACTGTCAAAGTTTAAATTCCCTTTCTTGTC
ATCAATTCCTAAAGCCTTAGCCGGATGTAATGAGGCTGCTTCCAATGCATATTCCAAGCT
ACATTCAATCGAGTCTTTAAATTTCACAATACAGGAGTCCAGGGCAGTAGTGCTTCCACA
GAGGGTTTTCGTTCCAGTGACGTAAGCGCAACCGTCTTCTACCGTCACGATTTGCGGTCC
AATGCGATGGTTACCATCCGGTAGTCCCTGCGCTGGCACTGCATCACTTACTAGTACTAA
ACCTTCGGGATTAGTTCTGTTTGCTATTCTGAGCGCTGCTGGATGAGTGTGGATACCATC
AGCTATTATACCATAATATACTTGTTTTTTCATCGTAGAAGCTAGTAACCCTACTAATCC
TGGATCACGATGATGGAATGGTAGCATTGCATTAAAGAGATGAGTTATTAAATTAGCACC
GCACTCGACAGCCTTTTCGCCTTCTGCCAAACTGGCAATGGAATGTCCAAGAGCAACTTT
GATACCAAGATTCGTGAGATCCTTGATTGCTTCAAAACAACCTGGAAGTTCTGGAGCTAG
TGTGATTATTACCACATTATCCAAAGAACCGTATACTTCTCTAATAGTATCTATACCCCT
ATGAGGATTTTTTATATAGGACTCAACATGAGCTCCCTTTTTGGTAGGGCTTATAAATGG
GCCTTCTAAATGTACTCCAAGTACTGTAGCACCATTTTTGTTTCCTTGGGTTTTCTTAAT
TCTTGGTAATATTTGCCTATAAATTTCTTGATCTGATGTAATCATCGTAGGACAAAATGC
TGTTACTCCATGAGCTAACAAATTCTTTGCAACTTTAGCCACGCCTTCTTCAATGTTATC
AGAATCTCTAGAGAAGTCAACACCCCATCCACCTGAAAATTAATGAAGTTGTTTTTGTTT
TAGTAGTAGACCATTTGCAACTACCAACAAATCTAGCCTCTTCTATTAAGCAGTCATTTT
CAATAAGTTTAAATTTGGCCAAATTGTCATTTTGTTTTGTTAGTAAAAGTTGTCCTTGGA
GCTAGTGGTTAAAGATGAAATGTATAGATAGACTTTTGCATAGTGCATTGTAAATCTGGT
AAGATTGATTTTTTTGCATTCATTGTACTGTCATAGCCTTGGTACATCTGGTCAAAAGCC
TACAATTGCATACATAGCATATTTCCAGATAAAAATAATAACATTATTTTTAAGCATAAA
GGATCTCAAAGACCCTACAGCTAATGACTATTAATTAATAAGATGGCAGGGAGTATTTAT
TTGTGTAATGTGCATAGTTTGAATATGTGATCAGGTGTGCTGTAGTATGTTCATATGATA
TGTTGGAATTTGTTGGAGTTGGAATGTCACTAAGCTACGGTGTTATGTGAAGGCTCATGA
AAAAATATGTTTCAATTACCTAATTGTCTCCGAAGAATTCTTGACTTATAGTTTAATATA
TGTAACTATGTAACTAAATTTAATTTCTTAGATAATGTCTAAGAAATTAAAATGTTATTT
GGTATCCGCTTTTGCAAATTGTATAAATAAAGGAATACATAATAGTCTAAGCATCTATAT
AAGCTATACTCAATAAGGTTTTTTTTTTTGTAAAATGTCAGATAATATGAATTGTATGAC
TATACATATATTGCAAAAAATGTAAACTAAAGTAATTTATTTATTTTTGTGGGTCATAGA
TATAATTAAAAGACATCTCATGTTTATTATTTTAATTTTTTTAGCACAGATAAGGTGTTA
TTTATCATCAATTGTACTAACGGCCGTCTGGTGTAGTGGT
(2560 bp)

- SilkBase 1999-2023 -