SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp69876_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr10
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_leucine-rich_repeats_and_immunoglobulin-like_domains_protein_3_[Plutella_xylostella]
Ontology
GO:0005615 C extracellular space
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030659 C cytoplasmic vesicle membrane
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0032474 P otolith morphogenesis
Transcript
Level		FPKM:7.77 TPM:13.55
ORF EntryO_BomoEE19783_complete:A_BomoEE_comp69876_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AGCTGCCTGTCCTGGATATCCGGACTGAAATGAGTTAAATTTTTGTACACATTACAAATC
AAGTTGTGAATTTAAAGTAAATTCTTTAAGGCTACCAAAGCGTACTAGAAAACGGTCAAC
GTCAAGTCTTCGTATTGTTAGAGTTCCACCAGTAATATCGTGACAATTTTTCTAGTTAGC
CTAAAATCAAGAACTAGGTAACTGCTGTCACTCGATTACCATCATCAACAGCCGAAAGTC
GTCTATCGCTGGATGTAGGCTTTTCCAAATACGTGCAGACGAGCTCGATTTTCGGCCCTT
CACATAATATCGACCATAATTTCTCATACATAAAGCACACCTCTGCAAGGTTCCTTTATT
TGTCCCACCTTATAATTTCAAAAGTGAACTCTTTCGGTCGAAGTTACGTCAATAACAGAT
TTTATAGCATTATATTGGATGATGTTTAAGTTTGAATAAGTTTAAGTAAAACGTTTTTAT
TGCGTTAATATATTTATTTTATACGGTATAAATAATTACTGTTATATGTACATAGTACCT
AAGTGTAAACAATACAAAACCTTGAAAATTCAAGGCGATTAATTCTTACAATAATCATCA
CTCCATCACATCACAAAGACCACTAATCATAAGCTCAAGCTTTCGTTTCAGTTGTAAGTA
GTAAAGCTATTACAATTTTATGTTCATTCAGGAGCACTGGAAGGAGTTTAAAAATGTTCT
GGATCTATTATACTAATTTTTGATTTGATGGGGAAGCTTAAATTTATTTGCATGAAATGA
CAAAATATTAATTAACAAAAACAAATCAACATCTTTTTTTCCAATTTTAACAATTTTCGT
AACATTAATACATGATAAATATTTATCAGCTTCCAGGAGTATGCATGTTACTTAATAAAT
TTTCAAATAGAATCTTCAAAACATTTAAAAGACAAAAAATGTTACAATGTTACAGAATAC
TTATCCAGAAAATTAACTACAAAACAAACTTATAACAATTAAAAAATAAGTAGCAGTTTG
TAGTACAGGTACATAGTACATAGTGCATAATACACTAATTAGCTGCCAATCATTTATATA
ATAATATGTACAAATAAAAGTATAATACTTTGAGTTTTGCATTTACTGTGCATTTGTCTA
CTTTGAATTAATTTATATATTACTGTTTTTGTTTAATTAACAAAGCTAAGTAAGGTGGTA
TTATTTGTGTAGGATTGATTGTGGTACAGACAGTTATCTGTGTATATGTCAGCTGTATCA
TTAACATATTTTTGATTTACATGTAAATATAATATTTATATGTAAATATTATATTTACAT
ATAAATTTGTAATTAAGTTATAATAATAAGAATGTAGCATATTATTTGATACCAAAAGAG
CTTTCGAGCATGGGTTTACATTTATTTTGAAAACTGTAATTTTTTATTTATATGCTATTT
AATGAAACAATCAAAATACACTAATATTTTTAACCAAAGCACATTAATATTACACATATA
ATATTTACAGTAGTAAACACCAAGCACAGCAAGGATGATTTATGATTTTATATATTTTTG
TATTGAGATAGCTTGTTGTGACATCAGTATTCAATATTATTTTAAGTTGCCAACTTCATA
GGTTTTCATTTTGTATACTTGTCTTATCACCTATCAACTTTTAGTACTTAATATTAATAA
TATGACAGTAAATAGAAGTTTTAAAAAATGGAATACATTGACAACAAATGTTGATTTCTC
AAATCGAAACCACAGACTTAAAGTCACATTTTCTCATTTAATAAACCTAAATAGTCAATG
TAATATTTTTGTAAGAAATTAGAGTGAAAGAATGTTTATAATTGTTGCCATATTATTCTA
CTTTCCTTTAAATGTCACATGACTTACTGAAAAAAAAATAACTTTTATTCAGTCTACACA
GTAAGGCAAGCTGGTTATTGGTTCTTAATGTAGTCTAATTAATACCCACTAGTGAAAACA
GTTTTTTTTTTGTTGGATTATAACTTTTGCATTTGCTTTTATTATAAAATTTAATCGTTA
CTTATTGTTCCAACATAATCAATATAGGTATCCTTCTATTAAAATAAATCTTTCAGTTTC
AATGGCATTGCAAATATTGGAGTTGGTTTACTTTAGCTTTACTTTTGTTCATGCAGAAGA
CCTAGAAAAAGTGCCATTTACTAGCATGATATTTTAGACTTCTCTCAATCTTTATTTTTT
GTCTACTTTAGCATTAACACTAATAAATTGTACTTTGGCTAGGCCCCCTGAACAACTATA
CAAAGTTTTTGGGATTGTTCATTTGTGAACAGAAATACATCAGGTATTTATGAATTAATA
AAAAAAATAATTATATAATTACTACTAAAAAAAATATTAACACAAACAATGCTCATTCAT
CATTTTTAAATAATATAATAGTTTCTATAGTATGCACTTAAGAATTAAATGACCTTCAGT
CTTATTTATGAAAACCAATACTGGCAAGTTTGTTTTGTACTAAGCAATCAAATTCTCAAA
CATTACGCATGCCTGTTGTCAGTGCATTTTCACTAATTATTGGTTTAAATTATCTAAATA
CAATTTTTATTTTACCATTACTATTATACAAAATATCAATTATCTTGAGTAGATTCAATT
TGCCTTTTAAAATTACACCCAGTTTTTTGTGCGTTTAAAAAGAGTAGTTTTTTTTTTATT
GACCCCATAGTTAATTAGTGAAAGTGCATTGATTGTTCATCACTATCTGCCATGCTGTCT
ATAAATATTTACTTATCTAAACATTACTACTCTGACTAGAAAAACTATAAGTAGCTGGCG
TTACAGACGTGTTAACGCATACTTGAATTGATGGTTTAAAGGAAGATGGAAGAAGTTTAT
GAGCCTCAGGCACAGGAGAATAGCTCCGGTTGGTGGCAGGAGGCTCAAAGTGTACTTGTT
CAATCCTTTCCATAGGAACACCATCAAAGCTCGTTTGTTTAGCAGAATCACCAGTCCCAC
TATCCTTACATGATGAATGTTCTGAAACATTGTCTGAAAACATTTGTGGAGAATCACTGT
CACTGTGCACTATATGTGTTCTTTTCAAACTTTCTGTAGGAATACGCACTGCAGTTGCCA
TACGCCTACGGGTATGATATATAATTACTACCCATATTATTGAAGTTCCAACAGCACAAC
ACACTACAGTTATAATTATGATGCCAGTCATATCTTCCTCATTAACCATAATTGCTACAG
GTGGCAATACTTGTAGCTGAGTCATATGTTTCTTAGTTCCCAGTTCATTTGTGATCTCAC
AATCATATTTACCAGCATCGTCAGATTGTACTCCTGTTATGATCAATAGTTGGTCATCAT
TAACTAAGAAATGTCTTTCGCCAGGGACAACTGGAGTATCATCTTTTAGCCATTTCAAAA
CTGGCTTAGGTGATCCCGAAATCATACATTGTAAAACAACTGAGTCTCCACTGATGACTT
CTTTGTTTTCCATTACCTTAGCAAATGAAGGTTCTTGTAATACTGTCAATGTAGCATTAG
CCACAATAGTGCCGGCAGGATTTTTTGCAGCGCAACTGTAAACACCAATATCTGTTGTCT
TTACATTAACAATAAAAAATAAATGATCATCCGGCATAACATTCATTCTTCTTTCTCTAG
CTGCAGGGAAGTCATTCCCCCCATCTTTTTTCCATGATATCTCTGGAGTAGGGTCTCCAG
TAGCTGCACAGTTCAGTGTGACAGTTTCACCAGTTTTAACAGTCACATTTGTTGGTGTTT
TTATAAACCTAGGGAATGTGACAATATTCATTTTTGCTTTTGAAGAATATGTAGTTCCAA
AATTATTTGTTACAACACATTGGTATTTACCAGAATCTCCTTGTGAGATGTTAGGTATAA
TTAGGGTAGATGTTGCACGAGGTTGACCACTCTGTGATAATGTCACATTTGCATATACAG
TGGGATTGCTGACATTCCCATTATTTTTCCTCCACAGGAATGACATATTATTAAATGGAT
TTGCTGTTGCAGAACAAACTAGACTAGCAGAACGCCCTTTAATTGCAAGCTGTGTTTTAG
GATGCTCTACAATTTTTGGTTTTGGCGAATCTCCACAGTTTTCCTCTTTCAGTTTTGTAA
TTGACACACCTCTGACTTCAGAGGGGTATGCACAAGTAGCAGTGATAAATTTTTGCTCAG
CTTTTTCTTTTATCCATTTAACAATCCATAACAAATTACAGTCACAGAGTAGCGATGACG
AGTTCATGTGTAGTTTTTTCAGGTTTGTCATAGAATTAAATGCATGCTGCTGAATAGATG
TTATGTTATTTCCAGCCAAATTTAACTCCAATAGATTGGAAAGACCATCAAATGCCCTGG
AGTTTATAGACTTTATATGATTACTTGCTAAGTTAAAGAAGTGTAAATTTTGTAATTTTG
AGAAAGGCCCAGACATGTCTTCTACAGTCCAAGAAATTTTGTTGTTATTCAAATAAAGTG
CTTTAAGATGAGCCATATAACTGAAGGACTCTTGTGAAATAGATGATATATTATTGTTAC
TAAGATTTAATGTTTCAAGGTTTATTAGGTGTTGAAAGGTACGCCCCTCTATTTCTATCA
AATGATTGTGTGATAAATCAAGAACCTCTAAATTTGCACACAGTTCCCAGCTTCCTAGAT
CAATATTAGATATCAAGTTGTTGGACATAGATAATGTTGTCAAAGATTCAAGGCCATACA
TCCACCCTTTTGATATACCTCTGATTTTATTATGATCCAATTGCAATAGGTTCATTGATT
TAAATCCGAAAAAGGCACCATCCATTATTTTATCTATGTTGTTAAATCTAAGTTTCAAAG
TAGTCAAATTTGATAATCCTTGAAAAAGCAGTGCATTGATAACATGCAATTTATTGTGAT
TCAGTTCTAGAATTCTCAAATTTGTTTGATACTTGAATAAATGATTTGGGAGAGATTTAA
TCTCATTTCTGTTTAATTTCAATACTTCCAAGTTGGATAAATTATCAATAGCTCCTTCAT
GTATCGTCATTATGTGATTACTGTTGAGATTTAATATTTTCAAAGAGCTATTTTCCGGAA
AATGATTCGTGTCTATTGATACAATGTTATTTCTATTGAGGTTTAGTTCTAGTATTTCGT
CCAACTGGAGGTTCGGTATATTGTTCATATTATTCTTGTCGAGTTTTAATACTTTTAAAT
TCGATAGCGTATTCAATTCATTCGTGACATTATTTAGTTTATTATGACTGAGGTCCAATT
GCTCCGCCCACTCAGGAATTTTTGGCACAGACACCAAATTCTTCTTTGAACAATCGACAT
ATAAATGCAGACAGGCGCATTCTAATGGGCAAAAGTAAATTTCCCCCAGAGTCGATGAAC
TAAGGAACAAGCTCATTGTTATAAACAATAACAATCGAGAGTCTCCCATTTTCGTCGATG
CTATCGTTGTTTAACGGTTCCTGCTTACATAATTCAAGCCGTAGGTAAACTAATTAGAGA
ATTCCACGCAAAGATCACTTCACTTATTTGTTGGACATAAAATATTTGCATTTTAGATTC
ATAAACGAAGTTACACTCAAAAAACAACGCATCGATTTTAACGTTACGACATGAAACTTA
GCAGCCATTTTCTTTGCTGCCGCAGTTCTATATTCTTTGTGGTTTTGATCAGGGTTGCTA
GTTTTAAAGGTTTTTAAATTAATTTATTGGAAAGCACTGAAAAATTAGACAATAGAAAAT
GAACACTTTGTAGGTAATTTTATATTGAGATTAAAAGAAACCGAATGTATTAGATTAAGT
TTTTTTTTATTGCTTAGATGTGT
(5843 bp)

- SilkBase 1999-2023 -