SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp69529_c0_seq7
Scaffold_idBomo_Chr1
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_chromatin_complexes_subunit_BAP18-like_isoform_X4_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0016568 P chromatin organization
GO:0016589 C NURF complex
GO:0071339 C MLL1 complex
Transcript
Level		FPKM:0.59 TPM:1.03
ORF EntryO_BomoEE18780_complete:A_BomoEE_comp69529_c0_seq7
Sequence
(Nucleotide)
AGATTATACACTTAATATCTAATCTATGATTTTGGATTTTGGTTATATGTAGTTTGGCAT
TAAGCATTTTTTTGCAATAAATTATCAAAAAATGAATAATTCTGCAGCTAAAGTTGGGGA
AATTTTTAGAGAGGCGGGAACTGCATTCAATAAATTATCAGAGATGACAATGCTTCTTCA
TCCCATGGGAGATTCGCAGCCGGGAGGTAAATGGACTGAAGAAGAAATAGAAATGCTGCG
CAATTGTGTACATAGATTTGCAGTAGACCTGAATAAACTCAGTCAACACATTAAGAATAG
GACAGTAAATCAAATTCGATCAACGTTGAAGAAGAAAGCTTTTGAAGACGCAGGTATACC
TGTGAGACAGGTAAGCGGCACAACAGGAAATATGGGTCAGCCACAATCCCAGGTAGCATC
CCCACTGGCTGCCATCATCCCGCAGTCAGTGATAGGAAACAATGCCGAGGTTCAGAAATT
CACTAATTACACAAAAATGGCACAGTCACTTATCTATCACATATATAAGAAGATAGCTTG
TTCCTGCCAGTATAGTGGATGCTTATTGCAATTTTATGCACTGGTTTTATAGTCAATGGC
ATTGATATCTTTATCTATTCAAAAACAATCATTTTTTGACATATTATTACGTTCATGATC
GTATTAGTACTTAACTCAGTATAACAATTAAAAATAATTAAAATTTACTAATTACGTTAT
TTGCAGTAGAAAAATGATTGTTTAATTTTGCTCTCATTGATTACTCATTGAGTACTTGTA
GCTAATGGAGTTATATATTTAAAACTTATTTAAGGAGTTAAGATGCCTTTGCTAAAATAG
CAGTATATTATTATTTTGATGTAGGCCAAAGGCAATATTATATACTTGTAGACATTCTCC
CACTGCCCTTTTTACTATGAGTTAATGTCTTAAGAAAGTCATCATGACTGGCCTTCATAT
TCCAGAAATTCCAATAAAACCTGTATAAAAACTAAACTACATTAGTGATAATAGTAGTTC
TAAAATATTTTATAATAATTTTGAAGATTTCATATAAAGCATATGAACAGTACAGACCAC
TATATGCACAAAAGTGATCACCAAAAGTCTGATTATAAATCATTTTGCATCTGAATTTTT
GTTTACTTACTTAAACCAGATAAGATATTCTTGTAGTAAATTTATTTTGGCTTAGCTCGG
TGATTTTCTAAGCATGATTACAGAAATGAGAGAATGAGTAAATAAGTTTAAAATAGAATG
AAATATTGCTTAATAGGAGTTTTATTTGTGTTATGTGTTACTTATCAGTTAGTTTTATAT
ATTTTAATATGGCAACGCTTGTTTAGTTAGAGCCTGTCACAAAGTTGTTATCGTTTTAAG
ATCGTTATCTGTATAGAACTTAAATATCAGTACTTAAAGGCAACTTAGTGTTCGGTTAAT
GCGCTAAGATATAAAACTTTGCTTTAGTTTGAAGACAACTTCACCGGGTTTTAAGTGGGC
TACTACATGACAGACACAAGTTGCACTATAATAATGGCCATCTTACTCCTGAAAAACGAA
TGCATAATTGCTATGCATTATGCAAGTGATATATGCAGTATAGTATGAATTCTTTGTGAC
CTTCAATATGCCTTTTCACCAGTGCTATCATTTAAATTATCTAGATTATTATCATAATGA
TCTTAATGTTATAAAGCTGGACCACTATAATAAGTAGGTTATTGTTAGACTGTTACAAAT
TACTTTTACATAAACTATTTTTGGGGTAAAAAATTAAAATAGACAGATTGCAGATTTATA
AGCATGCAAATGCATAGGTCTTGTACAATTATGATGAAGGTGTGGGATTATAAATTGCAT
GTATATAGGTATTACAATATTGCACGAAGTCAGCATGCGATCCTCTCAATGGATGGTTCT
GTCCGTTTCTCTCATTGCTTATTAAATACTGTGGTCAATTTTTTTTATTTGACAGTTAAG
GGCGGTGAAAAATTTTGTCCACGTTTTGGGGAATGGTTTTTGTCACTCATAGACACAGAA
AAATGCATTTTAGACGAACAGGGTGCTTCCGAGCTAATGAGTGACCCGAATTTCTAGACA
ATTTCCGAGAGCAGTTCCAATATAAAATTAAATGAAACTAAAAAAAAAACACCAAAAGTC
CTTTCGTAAACTCAGATAACCTAAATGTCCGTAATCCAAACTAATGATATCTGAAGTTCT
TCGGTAGAGAGTCAAATAGCTGATAAGTTTTCAAAGATGGTCAAATTGCGACGCCGTCAC
AAACGAGTCTATGAATGCTTAACTTAATAAGCTTAATAAAATTTAAATCTATAAACCCTA
TTTGAAGGCTGTAGCCACACCAGGATGCTCAAAGATAAATCAGTGGCCGGCAATGCAAGC
CTCCAATAGATAGAAAGTTATTGATATTCAGAATTAAATGCGGGGAAAGAGGATTGTGAT
ATAGGAGCATCGTGTGAATCTTGTTCGTTTGCTATGTTCGTGTTAAGCTTAGATTCAAAT
TGAGGGCCTTATTGCGCGATTTTATACAGGCCTCTAAATACAAATCGGTCGTTGGATCCG
GAGCTTTACACGAATTTAAAACGGTTATAAAACTACTGTAGTATGATTAAATTGTAAACG
CATTTCTTTCAGGTAACGCTTAACATGTTGAACGCATCCGAGAACGAAGTTGACGTTGAA
GAACTGACAAATGACGTCAAACTTGAGTTCGAGAGCGAACCCGGAAACGAGGAGGTAGCC
ATCAGAAATTTGTTCTAGCAATTGATATATTGATAACCCCATTCGTAACGGCTTTGTGTA
AATTGAGGTTAGTCGTTGTATGGAAATCTGCTTAAAATTTGCAAATTGAAATTATTGATT
CGTAATAGATCCTTAAAATCTCACTGTAGATTGTTCGAGTATTTGCAATAGCCATTGATC
TTTCTAGCTTAGTTTTAGAGTAGAATAATTTAAAATTACTAACTAGTTTTCTGATCTTCG
GTAAGCATGTGTGATTGTAAATTGTAGAAGAAAGAAAAACACTGATATATTAAAATAGAA
ATTGCACACGTAGTTAGATGTATTATTGTTTGCTGATTGTACAGATTGAAAAGGCAGTTG
TCGTGGTCTGTTATTTTGACCTGGTTTTGTAATCAATAATTTTGTTTCGCAAATGTATCA
AGTTCTGTAAATCTCTTATATCGTTCGAACCTTAGAAAGTTCGAGACCACTGTTCTAGTA
CAATCAGCTTATAATAATATAGTGGTTAATCATGTATTTTAATATGTAGAAACGAATTTA
TGTAAACAGATCAAAAAAAAACTTGTTGGATTTTTTTTGTACATATTTATCTGTAACATG
TAACTTTTGTTATAAGCGCAAATTTATCTTACACTCCAGCTACAGGCTTTTGCTCATACT
CAATACTGTACTGTGATATTTAGGTAAGGACTCGAGACTGGTGATTCTCACGTTTGTTAT
TGCTCAAATAATTGAATATAATAATAAGATTATCTCTTGATGAGACATTTTATAAAAACG
TATTTACAAAATATATATTTTCAATGTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTCA
(3592 bp)

- SilkBase 1999-2023 -