SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp68930_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr1
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_DNA-damage_inducible_protein_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0004190 F aspartic-type endopeptidase activity
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006508 P proteolysis
Transcript
Level		FPKM:9.18 TPM:16.02
ORF EntryO_BomoEE17342_complete:A_BomoEE_comp68930_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTGTTCCTTACGATTTTTATTGAATTTATAAAAAAAAATACTCTTTTTTTAT
TTTATATAGTACACATTTTTTTTTATAAAAAAATTAAATTTTCGTCACTTCTTTTTGCCG
CGCCCACCTTGCTTGGACCTCTCGAGGGCTTCTCGGATCTGTCTCTCTTCGTGGTCCTTG
ACCGACTGGTTCACGATGTCGTCCTCGGAGACGCCAGACAGACGGGCGCATTCTGGAAGA
TCAGATTCTGGCAGGAACGGCGTCTCGGTACCGGTCGTGCCGATCCGTAGAACACCACGT
TTGAGGTCGATGTTGCACTGATGCCGTTTAAGCATATCAAGACCGAGCAGCATATCCATG
GGCTGTTCCTCTAGCACAGAGAACGAGGTCGTCAAGAAGTCCTGTTCGATTCTCATCTGC
ACCATGTGAATGCGACCGATGATCCTTTGTACGCCAACACCTTTAGCGATACCGGCCCAT
CTTGTGTCGACCAAACGCATTATGTTGCATCTCTCAGCACATGCTGCTGACATTATTGTT
GTCTGGGCTCCGGAATCTATGAATGCTTTTACTGGGAATCCATTAACATGACAATTAATA
TATAACATTACAACTGTTCCAAAAGTCTCTGGATTATATTCCATTGCAGCCTCCATGTTG
GCTTCTATATTTTTTTGCCTAATTTCTTCAGCAATCATCCTTTGTGCTTCTGTGTCGAAT
GGGTCAGAGTTCATCATCCTTATTCTTTGTTGCTGCCTTTCAGTTCTAGCCAATATTTGT
TCACGTAGTACAGCAGCAAATGTATCTAAACTACCAGTTAGTAGAGCATCGGCAAGTCTT
GGATTATTCTGTTTAAGTAATGCCAGTTGATCTGGGTTAGCAAGAAACATCTCTCTAATT
ATGCGTGGGTCTTCTTCAACAGGCGTGTTTCTCGAAGCCATTGATGTATTTGCTGATGTT
GTAGGTACTTGGATGTTGCTGAAGTCAAGGCTAGCTATGCCACTTGGCAAGGCTTGGCTG
GAATCATTAACGCTGAGATTCTGTGCGGAATTCACCATGTGCAGAAGAATAATTACGTCG
CCGTCGTGGACGCCGTGTTCCTTCAATGATTTTTTGTTATTCAGAAGTGGTTTGCCATTA
AAATGCAATGTGATGTCTTTAGCAGGAAACCCTGATTCTATCTCACAAAACGCCTTAAAA
TTTTCAAGTTCCAGGTCTTCAGAGACGTCCAGCACGAAGATGTCATCATTGAGAGTGGTT
ACTGTTACTTTCATCGTGAATTTTTGGATAAACCCAATAAATAACACAGTGTAGAGGTTC
TATTGCTTTATATTTACTTATTAAATTTCAAAAACATTTTACAAAAACTGTACAAAAACG
GCCGTTATAAGCAGATCTTACTAGAGTATCTAAATGACGATCAAACAAAAACTTTGGGAC
GTTCCCTCGCGTTCCTTGCTGACGAAAAACAATTTTCAATTCACAATGGAAGTTGCAATC
CGTACTAGTGCTGTCATCGTCGTTTGTAGGTTATTGTGAAAAAATAAATCGAGAAGTGTC
AAAAACGAACACATAGACATCACTATTTTAAAAAGTCAATCCAAGAGAGAAAACTCGTAG
TCGCGGGGGAAACCTTTGTTTTATTTTCCTTTTCATGTTCGAGCGAAGCAGTCTCGCACT
CGTGATTTTATTTTGAAAATGCGCGTGTCGTGAAGTAAGGACTTAATTTTTTCGTACGGT
TTCTGTGACAGAGATTAGGTACTTTTCAATTTACAATGTGAAATCGACACATGACGTTGG
AATGCACTATAGTTAGAGTAATCTGAAATTACATCATTTGGTGAAGAACTAAGATGTCAG
AAGTGGGTCAACTGGTACCACCAGTGACCCATAGTCGGCCAAACATGACATACAAATTCA
ATGGACCCCACATTGAAGATTCATTTTGCACTTCGATCGATACCAACTATGATCCCATTA
TAAGCATAATATGTGCTATGTATATTGCATTTGGGATTGTGTACACGCTATTTGGCTATC
GCTGTTTCAAAGCCAGTATGTTTTTGACTGGTTTCACTTTTGGCTCTGCTGTTGTATATC
TCATATGCCTACAAGAGTACCTGATGCCTCCTTATGGTAATGTCGGAGTTGCGCTTTGCG
CGGGATTACTCTTCGGTCTCATCACCATGCTGATACAGTACGTTGGGCTGTTCATGACTG
GTTTCCACACCGGACTTTTGCTGGCTATAGCTGGACTGGCCGTCTACGATCACTTCTTGG
ACAAAAGACCGACTGCGTATTGGATGTGCGTTGTGGTGCTGCTATGCTCCGGTATATTTT
TCGCAGTTATCAACTTATACTGGAAGAAAGTTCTAACAATCTTCGGAACGAGCGTGTACG
GCGGTGCAATAATAGCTACCTCCCTGGACTACTTCTTTGAAAGAATGATGATGCTAAAAT
GGTTATGGGAGCGTGCGAAGTTGGAACCAGCCGTGGCTCCACCGTGTCGCATGTCTTGGT
TGACGTTGGCAGCCTGGCCTGCTGCAGCCATCGTGGGACTCACAGCGCAATGCGCGCTCA
CGGCCACCGGAATCTACCACGAGCAAAGTATAAGCGCTCAGAAACGACGCCTCAAAGCTC
AGCAGACCCGTCCGATCACACGCGAGCAACGAGCCGAGATGAAGCAACGCAAGTACCGAT
ATCTGTACCAAGTGCGCACCGCTCACGGAGATGTTATATCCCAGTCATACGTTCAAGCGC
TACAGAAGAAAGCTCAATGCGGGAACTGGAGTGGCGAGTGTAGCACGCTGCAGAGCGACT
CGACCCACTTGACCGTGCTCGCTGGCTCCGAACAAGCCCCGCCCACTGACTCCGACGACG
ACTTGAACCAAATCAGAGCAGCGCATTAAGACGATTGCGTTTATTTAAATAAGATATATC
CAAACTATTTCGATCCAAGGCCATTCGAGGTGAGCTGTATATTTTCTGTAAACGCATCCA
GTATTATATTAACCGTAAAATCGACTTCCCGCATATATGTGGTTTATAATTTAGTAAACT
TTATAGTAGGTAATAATAATAATAATTGTAATCGATGTGAATTTAACGATATTCTATTAA
TTGTGCGACGAAGGAGTTCAAGGCCTAAAACACGCGTTTTATTCATAACATTGCCAAAAA
AATTTTTTTGATAGTTTTTAAGTCAATTTTTATGTTAGTGTTTTTTCGATGAATTTATAC
TTGCTTGTTTCGCGACGGTTCCATGATTGTCGGTGAATGATAAACCTAAAGATTGCATTG
TCCGAATTAAATGAGAAACGACTTCAAAGCTTTAGTGAAATTAATCACACAGCAAACAAC
GAAATGAAAAAAAATAAAAATAAAAAGAAAACAAAATAAGTTTGTAAAAAAAAATATGTT
TCAGTTCCGATATAGATTTTATTTTTAATTATTACCACAATCGTTTTGGTATAGTGTATG
AGATATATATTCGCGAAAGTTTTTGCAAACAAACACACGCACAAATTTATATAAAATGAG
ATTTTGATAAAGCAATATATCTAAGAGCACGCTGGCACACATGCATTCCGTAAAACTAAT
ACAGAATACATATAGAGCACTGAATATGCAGAAGTTCCAAACTTATATTTACAATCATAA
CTATCGGAAATCTGTGCGGGGTCCTCTTCTGTATTCATTCCAATTCTATGACTTCATTAC
ATCAGGTAGGCCGCGACTCGAACTTATAATCAATCGTAGAATTTAATTCAGCACAAAATA
AGAATTATTCTTGTCAGCCTCACAAAATAGAAGGCAAAATAAACATTCCGAATATGTCGT
ATGTAAATGTTAAATAATAATAAAAACGACTTTAAGCTAACAATTTTTAGAGTTGATTAT
GCGTTGAAAGGCAGATCTGAGTGTCGTGTGCATTATTAGAAATAATACGCCACAATTTAA
AGACTTGTATACACATTATACCGATCCGTAAATCGAACACTGCCATTTTATTAATAGTCT
CGTTTGAGTACACGTCGTAATAATGTGCGGTCTTGAACTCCTAATTTAAAATAAAGGTTG
TGTTGTTGTTTCGTGTTTTAGATTAAGCCAAACAGTGTGCTTAGTGCGAGTTTT
(4134 bp)

- SilkBase 1999-2023 -