SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp68762_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Chr5
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_rab11_family-interacting_protein_2_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005768 C endosome
GO:0006810 P transport
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0017137 F small GTPase binding
GO:0030670 C phagocytic vesicle membrane
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0043231 C intracellular membrane-bounded organelle
GO:0045055 P regulated exocytosis
GO:0055037 C recycling endosome
GO:0070164 P negative regulation of adiponectin secretion
Transcript
Level		FPKM:3.86 TPM:6.73
ORF EntryO_BomoEE16994_complete:A_BomoEE_comp68762_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
AGGATGGATGTCGCAGATTTGATCCTGAAAGAAGTTTTATAAAATTATTAACAAATTAAT
TGACTCAAAACAACTTTATGAAAATGTTTCCCAACATAAAGACGAAGAATTTTAACCTCC
ATATTATTATTTTAATTTTTTAATAATGTTTTTATTTAGAATTTAATTTTAAAAAAGCAT
TGATTTCTTTAATTAATGGCGGTTTCTTTGTTAATTTTATTATTTTATCGTTAAATCAAA
GTAACATTCATGTTGTTACCATGTAACACGACAGCAACAAAATATAATAGATATTTAGTA
GTTAGTTAGATAGTTTCTCGTTCTCTTTTGGTAGAATTCAGTAGCTTTTAATCACCACAA
GCAGTAGATTTGTCAAATGAAATCTGGTCACACTGCCGACGGGTCATAACTAATCTGTGC
GACAGGTAGGGTCAATTTGTTGTTGCGTTATTTTATTAGTTTTGCAGTAATTTTATGATT
ATTGAATAGGGAAAGTGTTGATAAACAAAAGTTGATCTCAAGATGTGGGACCCTACTCAC
GTTCAAGTGACCGTACAAAAAGCTCGTGGACTACTAATCAAAGGGAAAAACGGTACAAAT
AACTGTTTTGTTACCATTGCCCTCGGTAAAGAAAAATTCCAAACTTCCGTTAAACATAAA
GCCACACAGAATGTGGAATGGTTAGAAGAATGCGAACTACCAATACCTACTCAAGGAAAC
ACCGCTGAAGTTGTACTTAAAGTTTATGACGAAGATTTTGTTAAAGATCATTTATTGGGT
CAAGTATCGATTCCGTTAAAAGACCTCGATGTATACGAGCGGCCAAGAAACCGCTGGTAC
AAGCTGCAGGGTAAATCAGGCAAAGAAAATGACAAGGACAGAGGTGAAATAGAAGTCAAA
ATAGCCTTCACAGTGAAGGAAGGCAGCCTCACGGATCTCAGCAAGAAAGACAAGCACCGA
TCCTCCTTATCCAGCCTGGCACAAAATGTTGGTGGAAGCCTCATGAGCATTGGCAGTATT
GAAAAACGTAAAAGTTTAAAAAAATTTGCCAAAAATATTAGCTCTAAAATGAATTTAAAC
AATAAAAAAGATAAGAAAAATGACTCATCATCGATAAGTGGCAGTGTTGGAAATCTAAAA
GGTGCTACCTTACCTTCTCCAATCCACTCAACACCTAAAAGATTATCAGGAGAAGCTGAC
CCTGGTGTCATAAGTGAAGATGATGATGAATTCGCTTTTGATGATTTGTCACACAAAAGT
TCAGGCAGTTCACTTAATGTCCAAGCAAGCTATGCACCCAGAAGTTTCAAATATACACCA
TCACCTGTAAATGCATCTTTAGAAAATTTAGGTGGAGGAGAATTTTTAAGAAGATCTACA
AGTAGCACCTTAGCTGTTCCAGAAAAAAGTATTCCACAAAAACCTGTTCGATTGAGCTTG
GACACATTCACTCCACCACAATTACCTACTCCAGTTATGGATTCAAATGATGAATGGTCT
CAAAAGTTGCTTCCGAGAAAATCTATGAGTCAATTGGCTATAGATAGAGAGAAATCTTCA
AGCCTTGAAAGAAACAAGAAATTAGACAGTCCAAGTTCCTTAAAAGAAAAGCCTAGTCCT
AAATTCTTTAAGAAGTTTGTTGGTAGCAGTAAACCAAAAAAATTACTTGAAGAAAGGATT
ATAGTTGGTGAAGAAAATATTGTTGAGGAAGACTATGTAAATCCTCTGTATCATAACATT
CCCAAAACAGTATTGCAACAGTTTGAAGGAAAGACACGAGAAGATTTAATTGTCATGATT
TACAATTTGCAAAAAGATGCAGAATTGGAGAAAAAGAAAACGAAAGACTTGGAAAACTAT
TTGGATGAACTACTCTTAAGAGTAATGGAAACAACACCCCGCATACTCCAGAATCCCTAT
GTAAGAAACAACAGCATGTATATTCGTAACAAATAACCAAGCAATTCGGTAAAAAAAATA
TAATGAAACCATTCTTTATCTATTGCATGATTGCATATGATTAATGTGGCATGCCTTAGT
CTTTGCAATACCTGTGTAATACTAATAATTATAGTTGGAAACCTGTATTAATTATTTAAC
CAATAAAATGTTACTTGTATTAGATTTAAGAACATAGTAACATTATTCAAAATGCTACTA
ACAACAATAAGAAGCAAGCAAATCATTTGGTCAAAAACAGTTAATGCTTATTAGAAAGTT
GCAATTCAAATTTGTGGCTGCATATTGTTATACTCATCTTTTATGTTAAACTTTCACTCA
TTTCACCAACGTTTAACAATCAAATTTGTATAATAAAGATATGAAGTAGTGCCTTATACA
TATCGCAATTACACTGTGATATTTCTAAATAGAGGTCCAACTCAAATTAAATTTCCCTTA
TATATTTAATCCTAACAGGAATATACTTAGTAAATTATTTTTAATCACTAAGCAGATATT
TTACTTTGTAATATTTTCTTTTCAGAAATTAAGGTGTGAAATACGTAAATAAGTATGATC
TGATAAGAAAATCTGGATTATTATTTGACACATTATCAGATTGTATTTGAGAAATCACCT
ACACTATGTATTATCATAGCAACATATCAAAATGTATCAAATGTTAATAATAAAAGCACT
GCCTGATATTTATCAATAACGGTAGTTGTTCAAAACTTTAATTGAATGAAGTGCCAAAAT
TATAGTTTTATATCAAACTAGTTTTCCAATCCTCATGACTAATTTGTCACCTATCAGGTG
GTTTTTGTTAATTTTTACAAAGTTTATGTCTGTTCTATCTAGAGATTATAATGGTTATGA
TAATATTTCTTAAATATTTTATATTTTAAAAATAACAACAAGCATATCATATTTTTTTGC
TTTGTTTAATGACTCGTTTGTAAACTAAGTACCTATCTAAAGAACTGATTCATAAAACAA
TAATTTATTAATGCAGTTCTAAGTCTTCAGTCACTTCAAGATGTTACAAATTCAATTTTG
AACATAATATTATGTTTTATAAATAATATTAACATCTTGATCTATTATACATAAAATATA
GATTGTTTTGGTTGTTTTTTTGTAATGTATGATAGTATATTCTTACTACAATACATAAAA
TCATTATGTTAATAGTGCATGTTTTTTTTGTCTTTGATTAATTACCATCACATAAACTGA
TTCCTGAATTTATCATAAGATAAAAAGTATGTAATAGATGTTTAATAGTTAGTAAAATGT
AAAAGAAGTGCAAAATTTAGATTAGATTTATAAATGTGCAATATAAACATCTAAAAGGTC
AAGTGAGACATGGTAATAGTCTAGGAGTTGTGCAAAAAATGTTAGGTAATAATCTACTGA
GGTTGTCTGAAATGGAGTGATCTGAAATACTTTAAATGGTGTCATATACAATGTGTCAGC
ATGTTTTTGTTCAAAAAACACAGAACAAAATTATAATATAGGTTGTATGAAAGTTATTAC
ATAGTTTAAAGAATTATTCATTATTTTCTATGTTGTGGCTACATTATCGAAATTCTAAGA
ATATTTAGTTTTATCATGAATAATGCTGTGTTGTTCATGGCCCAAAACTTAGGTTTAAAT
ATCAATCCTATAATTTGATTGTATTTTTATAACCATTAATATATTTCATCACTCAAACCT
TTATATTTAAATGATATTTTTGTAAATTTTTCAAATGAGTATGCGGTCGATTATGACAGA
AACTATTTTGCATCAGTGCCTACAATTGTACAAAAATTTAACTTGGTTCAATAAACGACA
GGCGATAGCGTAAAACATAAATGAACGCCTTTTTTAAATTCTACAAATATGTAATAAATA
CAATGCTGACATTGTATAAACTATCCAGATAGCTTAACGACGACATTTAGATTTCAGCTT
AATGTCACTTTGTGGGTAGAGTATCTTGAGAGGGCCAGGAACTCGTCTGTGAAATAATAA
TTAAAATATAGACAATGCGGTTTTGTTGAATGCTACTTAATATTAACTAGAAAGTTTCAC
TCTCACAATGGAAGCCCTAATCTAACACGAATGTTAACACGAAATTTATCTGTAGCCACA
GCATTAGCAATAATTAGTTACGTTAGAAATTAGTAACCAGAATTGAGGATTATTTATTTG
ATTTTTATTTCCTAATAAACTGCTTACTCTTAATTTTATTTATTCAGTTTAAATGATAAG
AGAAAAGTATGTTTTCAAATTTGTTAGGATTTCTGTATGCTAACCCATAAAGATTTTTCA
ATAAAAAAAAAAA
(4273 bp)

- SilkBase 1999-2023 -