SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp68538_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr23
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_apaf-1_protein_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0005524 F ATP binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006915 P apoptotic process
GO:0008635 P activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c
GO:0008656 F cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process
GO:0042981 P regulation of apoptotic process
GO:0043293 C apoptosome
GO:0043531 F ADP binding
GO:0097190 P apoptotic signaling pathway
Transcript
Level		FPKM:20.25 TPM:35.32
ORF EntryO_BomoEE16499_complete:A_BomoEE_comp68538_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
ATCTTCAAATTTTTTTTTGTCTTTGATCTTCCTTTTTCTTTCTCTGTTGTCGACTGTTGT
TGCCTTTTGCCTTTAAAGCTTTTTAAAAGTGTATTATCTATGGTTTTTGATACAAAATAC
TAGTCTGTTTCGTCGTTGTGTTTTGCTCAGTTATGCTCTGTGGTGTGCATTGTATTGTCG
GTATACCTCGAACGCTACTTCAATAATATTTAAAAAAACTGATAACTGTTGAGTGAAATT
TATATAAATTTGCTAGAAATAGTGTATCAAATGGGTGCTAATATACTTATAAGAAGAAGC
CATACAAATTTATAACTCAATAGTTATGATTTCTTTGTAGTGATGAGCGAGCCGCGATCG
AAATGGATCTCAAGAACAGGAAGCTGCTGCAGCACAATCAGCAGGCTATCATCAAAGATC
TAGATGTTCAGTACATTCTAGACGAACTTTACACGAAACAAGCTATATCTTCAGAGGTGT
ACGAACATATCGCTAATCTGGTCATAGTTAAAAATCGAGTCGAAGGCGTCAGGTATTTGA
TAGATTGCCTCCTAAGGTATGGCACGAATCAGGCCTACGAAGCATTCGTTGATAGCCTTG
CCAAAGATTACAACTGGCTCTGGGAGAAGTTTGCTACACAATCCAACGGGCCAATGTTTA
ACGACAGCTTCGAGGACAGCCTTAGCAAAGGCGACGTGCCAAGGCTTCCCGAACACCATG
TCAGGAGAAAGGCTGTGGAAACTGAAGTCCTATCCAAGATTAAAGAGTTGACCCGTCACA
AGATACTGGTGCTTCACGGTATGCTTGGCAGCGGAAAGACCTGCGTCGCCATCAACGTAC
TCCGGGACAACCCCGAACTCATAACGAACAATTTCAATGATATTGTCTTTTGGATGAACT
TTGCGAATTGCAAGACCGATGACGACATCATCGCTCAACAGAATACGTTACTACGTAAAA
TATCATCGATGTACATTCAAAATTCTCACATGAACTCTTCGATATCAATGTCGAGTATGG
GCTCGAATATCGACAGCCATTCGCTCTCCTACTACGATCGCACGTGGAACGACTTCAGAG
ACAGACTGAAGAACCTATTCTCGGAGCCCCCGCTGAAGGAAGGTTTGCTCGTAATGGACG
AAGTCAACGATCGGAAATGCGTCGAAGCGTTCGATATCGGTTGCAAGATACTGATCACGA
CCAGAGATACGGACGTTGTGGCTAATTATCACCCGCAAATCGTTACGGTGGAGAACAGTT
TCACAGAGAGGGAGTCCCTAGAACTGTTTGCTTCTTGCTTAGACGAACCTGTATCGAAAC
TTCCATCGTATGCGAAAGAGCTCAACGAATTATGCAAAGGAAGCCCCTTCCACGTGGCCC
TGATCGGTGCCCAGCTCGCAGAAGACAGGGAGAGACTGAAACACGATCGAAGTCATTGGA
AATATTACTTGAAGAAATTAAAAAAGAATTTCTTTTCTGTGTGGAAAACGAACAACGATA
ACCCGATGAAAACTATACAAGTGTGTATAAACTCGTTGAACCCCAACACGCTTGCGATGT
TCATGAAACTGGCAGTGCTTCCGGACAGCGTCAAAGTCACCGCTCAAGTCTACAGCAAAC
TGTGGAACGTAGACGTCAACGAAGTCGAAAACATAACGAAGAAACTCAAGAGCAAGTCTC
TGATCATAAAGAACTACGATAGAGATCAAAAAAAGTATTTATACGAAGTGCACGATCTCA
TAATGAACTATCTAAGGTCTTGTACGCACGAAGAGGAAATGAAGAAGCTACACGACGAAC
TGTTGAACAGTTACAGATATGATAGCGAAACTGCACCAACGGAGATAGTCGATGACGGAT
ACATAGCCTTCTACATAGGATTTCACATTTTGAAAACGAAAAATTTGCACCAGAAATGGA
GTTTGTTCAGTAAGCTGTATTTAGATTTGAGGTTTCTAGGGAATAAAGTCAGACTGACCG
GACCGGACGATGTCATGCTGGATCTGCAGAAATACGAAAATTATATTGTGAGAGATGAAA
TCGACAGAAACTTAGTGTACAGTATAAAAGCGTTTCTAAGCACGCACGGCACAGACCTGC
ACCACTACCCCTGCACGAACATTGTGCAAAGTATAATACAACACGAAACGAAAGGAATAT
TGTGTTGTAAGGCTTCGTTAATAGCACGGGATAACTGCGTAAACAACGAATTGTATTTTG
AGTTTATGCACGAACATGATGTAGAAGAAATTAAACATTCAACTATCGACGTTAAGGAAG
TTATCAAATCTGTTTGCTTCTTGAGAAATTATGTAATTGTTGGGACGTCCAATGGCTTGA
TAAAGTTCTTCAACATAGAAACTAATAAGCAGAAGAAGGAACTAAAGGGCACCGGTGCCG
CCATTAAATGGATAGGCGTCGCGTGCACTAAAGACACGACTATTGTAGCCGCTCTGTCGA
CGGACGGATATCTCAAACTTTGGTTCGTCGATGACTTCGATGATGACGACAACGCTAATA
ATCTCGTCGAAGAAGAACCGAACGATGCCTACAACAACTATCCCAGTCCGTTAACATTTG
AACCCAAACTGGGACCGATACTAAACTGTCGTTGGACGACCAGCGAAGACTTGTTAATAA
CTCACACGTCACAAATGATTATACTGTACCGTCCCAAAGGCGCCGAGTATGACGTCATAA
GTGAGTTCGACAGGGAACAGAAGCTGCTATGCTGCGTCCCCTGTAACAACGACAAATACA
TTGCTGTAGCTAGTTTCAACGCCGTATACAGAGTGGACTTGATCGACATTAGAACTAAGC
AGAAAGTTGTTTATTTCGAAGAAACAGGTGCCATATTGGATATGCTTGTTGTTCCTGGTA
CCAATAAAATAATAACGCTGAAACAAAACGAGATAATGGCACACGAGTTCCGGGTAAAGC
CTGCTTCGATAAACAGAGGCGGGACGGTTATCGATAGCGGTGCGGTCAAAGCGGATGTCC
GGTTCGCGGCGATGGCCGTCAACAACTCGGGCTCGCTGCTGTTCGCGGCCACGGACGATA
GCCGGGTCGTTTGTGTCGACTTGAAAACTAACTCAAGAGTTTTCGATATCGAGAACAGAA
GGGGCAATGTGGTGTCAATGGCGGTGAGCGAAGTGCTGATGTGGGATGAATTCGAACCGA
GCTCCGACGTACTTCTAACCGGTACTGATAGTACCGAAAATTCTGCCAAAGTTTGGTATT
TAGACGCTTCATACGTGTCGCAGACTGCACAAAGAAAAGGAAAAGTTCGTCTAACAAGTA
AATTCGACGTGAGTTTCCTAAACGCGACAACGCCAACATCTCCGAGCGCCTCGCCTCTGA
ACAGCGGCGTGGAAACAGTTCACAACCCTCTAAAATCACACCAGTCGTTCACGAACAAGG
ACCCAGTAAAGAAACCGATTAAAACTACCATGAGCTTGGACAGGAATACATTGAAACCGC
TCAATCTCAAAGGAATATGCAACAACAATGAAGGGCTCATACACCCATTACTGGCTGTCG
TCGATGATATGAACAATATACAGGTGATGCGTGGTAAGAAAGTCCTAACCGAGATCTTAG
AGAAATCTGATGAGAAGATAACAGCCGTCAAGGTATCGCCGTGCAATCACTACATCATGT
ACGGGCTCAAGTCGGGAAAAGTCAAGAGATACACATTGAGAACCAAGGAGATGACAACTA
TAATGCACGTTAACAGTCCGGTGCAATACCTGAACTACATCAACAACAGGTTGATGCTGG
TCGCGTGGAAGAACCGATGTCTAATGTCGTATAAACTGGGCCACGAGGAGACCTGGAAGA
CTGAAATGCTACAGGCCGGTAACACGCACCTCGGCTCGCAAGAATCGCAGCTAGGAAGCG
ATTGGCAGAGTATGAAAATAAGGAACGGCCACTCCGACTTGTCGACGTCGAGCAGCGAGG
CCAGCGTGAGCTCCCGCGAGAACCGACTGTTCCACGGCGGGGAGATGAAGGAGCTGTACA
AACAGAGCGACCTCGTCGACTGCTTCTGGGTCGCGGACACCGGCCTCATCACGGTCGAGT
CGAACGCGGCCATCAAACTGTGGAACAAAGACTGCAAAGTCTCAACCATATTGAACGCGA
GGCAAATGGATACTTACATCACGTGCGCCGCTTTCCAGAACAACGTTCTCGTTATATGCG
ATAGTGAAAACAAAGGATTTCAGTCGTACGAACTAAAATTCGACAACACAATAGATTTGT
GCCTCATCCAAGAGTACAAACTGAACAATGTGGTGACGTCATGCGATATCACATCCGACG
GCTACATACTAGCGATGGGACTAGACTGTGGTAATGTTGTGCTTTGGAACGTAAAAGGGA
AGCGTCAAATCAGTTTACTCAAACACCACAACTCGAGAGTGCAGGCGTGCTCGTTCTCGC
CGGTACCGGACCGACTGTACCGGAGCTCCGTGCACTCGCCCGGTGTGACGTCACCGGCGG
ACGCCGTCGCCGACGACCAGCCTCCACTGGTCCTGGTCACGATGGCTTCAGAGATAGTCT
GGTGGAACATCACGTACGTCATACGGATACGAGCGAGTAATAAGTCATTGTGGAGGAGCG
GACTCAATGTTATATCGCCAATTGGAACGCCATTAGAGAATCGAGCTGAGAATCACCAGA
CGACAGAAAATTCGGGCAACGTTAATACCAATTTCTTCTTCAGAGATATGTTCGCAGATA
GACATTGTTGGAAGAACATTTGGAAAGGAAAAACATGTAAAGAAGGGTCGAAACGCAAAG
AAATATTGGCGTGTATAAAACTATCGGGTATAAACGCGACGAGGTTGTGCCACGACGAGA
ATTTCTCGTGCTTCGTGACCGTGGACAATCCGGGCCACGTCCACATCATGAACGTTATGA
GGGATCTTTGTACGTAGCACAATGTTAAGCGCGTTCGTTTAACTAGCACAACGAAATTCA
TAAAGACTCTTTAGAACATTCGAATTTCGAATTTTGTTATGCTTTCTTACACTTTAACAA
AACCTTTCCCAGAGATTTGTAATTTAAGTCTACTTGTGTGCTCGTGATAGGTCTATGAGA
ATTGTAAAAAGATTTGAATGCTCATTTTATCCTTAACTCCGTTTTCAAGTCTTCAATTAT
TCTACTCAGTAACATAAACTGTTATAGATTGATCATGAAGGAAATATATATACGTACATA
TTATTTCAATAGCTATACATAATTCACACACACTGCCAAATGCATTTACTATTTCTGTAA
AAAAATAACAAAGATATTGAAATATTATTGTAAGTATGTAGCCTTCCTTCAGCCTAAGTA
GGTGTCATTCAAGAAATTAGATTTAAAAAAAAATATTCAGCCAACATTATTACAGTAAAT
AGTTTTGTGTGTGGTAACAGTGTTGCCATTTGTTTTAGAAAATATTATATTTATATTATA
CTTGTTCACAAATTGGGCACAAAGCTTAGATATGTTTCAAAACAATTTATAGTAATAGAC
TAGTACCAAGTAATAGTAAAATAATATGTTATTTCACATACAGAAAAATATTCAAATAAT
TACAAGTAATATTTTTTTGGAAATGGAAAATAGTTAAGCAGAGACTCAGCTATGACTCTC
GCATTGCTGTTGACCATGAGCATCTATAACCAAGAGGAGCCGCAAGCTCTGTCTTTGAAG
ATAATAGTTTTTTTTTTTAAACCGCAATTTAAATTATTTCTAAATCTCTAGCATTTCAGT
GAATACTTTTAATTGACCACCGAACAATAATTTATATGTAATAAGATCAATTAGTATATA
AATACGTAAATAAGTTTAAGATTTTAGTAAAATTTAAGAATATGAAATATATTTTAAAAT
ATGTTATTTTATGGCTGATAAATGAAAATACATGATGAAATTAAAATTGAAAATACAATA
CTTTACAACGATTTTATGATAGTATAAACATTAATGTTTTTCAATCTATGACTTAGGATA
AATGCAACGAAATTTAAATTTTGCTTATGATTTCTAAAATTATGATTTTGAAATATCAAG
ACGAAGTATAGGTACACATTTTTTTTAAATCACGATCATATTCAATGTTGATATCGTTAG
GTATTTTTTGATATGTAAATGTTAATCCCACCAGTGTTTCTATGTATGTATTTCAATGAA
ATAAATGTCATAAAAACGAGAAACGCGGATGTTCGTAAATAAACAAACTTTTAAAATTCG
TAAAAGCTCTCGAATATAAACAAAACAATATTAATTATCATAGCTAAGCCTGTTTTCATG
TAGCAGAAACGTACAGTTACTCTTGTTTAACATCAAACAATTATAGTCTGTGAAATATAG
CTTGATACGTATGACAGTTGACTAGAGTGAGATTTCTATGGTTAGATTTTGTTGGAAAAA
TCGATAGCCTACCAAAAATCGTTTATAACCAAGTGAATATTAAAATGCTTAAGCAAAATA
ATGTTAACTTAACCTAAAAATGGCGCGAGATTGCTGAATAAACTGAAAATTGAAATTAAA
ATCAGGGATGTCGACACTACGTGGTCAAGAATTTGTTTTTGTGTTAAAATGGTCGCCTTA
CGTACTAGCGTACATGATGACTTTGTCTAACGAGAAATTAATCAGCCGCGTATTTTAATG
AGTAGCAGACACAGGAGTGAATCTTAGCTGAAGAAGAATGACACGTGTGCAATTCATACG
CGGCAAACGTGAAACTTTCAAAATTTTTCTGTCTCATTCTCTCACACGCTACTTCAGATG
TAATGTTTGCCTCTTTTTTCTCATCGCTGTTTGTCGCATCTAGTATCAAATCTAGTTGGT
GCTAAAGAAGTGTTCACTTAAAAATCTTCGGTTTTTTATAACAATCGGAACATTCAGATT
GTACCTAGCAAAGGTTTTCTCACTTAAAATTCAAAAAGGTGGTGCTATGCATGTTTCATA
TTTTAGTGATTGGCTCAAATTGCTGCTTAGAACTAGGACGTCCCTTTGTCACAAAAAACA
TGTAACTATACAGTAAATATCGTCAAATTAACAATCTTTGACGATAACGATATCTGTCCT
TTTCATAGTCTAATCAGACTATGACGGACGACGAATCCGTCGCCCTGCCGTCGTCGACAT
ATTTATGGTCAAAGATTAAAAACGTAAATTGCCTTGGACAAAGAAATTCCAACAATTGCT
CAACACAATAAAAGGAGTTATGTTTTTCGTTTTTCGTCTAATCTACACTACTGACTTAAT
CTCCATACGAAAGCTTTTGAATTATCACAAGTGCGATAAAATAATTTCTTCCGCGTTGAA
TATGTTGCTAAAAAGTTAATTATGCCCATTTATAAACTGTGTTTCCCATTTTTTTCTTAT
TTTAAGAAAATATTGAACATTATTATATAAGCAAATAATTAGTTAATACATAAATTAGTA
ATGTGGGTGAGGTAGTATTAAAAGAAATCCTAGTAAAAACTTTTGGGTGCCATTCTTTGG
TTCATAAATATTAAATAAAATGTAAATATGTTTAAATATCGAAATGTGATGGAAACCATG
TTATGTCATGGACGATCTCTTAATGAATAATTTTATCGTAGAGTTTATAGTGTTTTTGAT
GGTGCTATAACATAAGTACAGAATAGATCAATGCATTCTTATAAATACGTGAAAGTTGAA
CAAAATAGTTTTTACGTAAAAAATTGTAACATTTTGGTACGAACGCTTTTATATCTATAA
AATACCTAACGCCATTTTATTTTGCGTGCACGTGAAATGGAACGCGTCACAGCAAAAAAA
AACTAGGTATATACTGACCTATGTAATTTGAAATATTTGGATATCTTATAGCCCTGGTAG
CTATGAGTCTCACTTAGAAACCTTAAACTACAAATAAAAATCAATTTTCTCACATTCAAA
AAAAATATATATCGCTATCTATATGTTTAATACTTATTTGTTTTATAAATTTTGTTAGAG
AATCAAAATTGTATGATAACCATTGTTCGAATATCGATTAATCGAACGATATATCTCTAA
ACTAGCAAATACATTAGAGATATTTCATTCACACACAATTTATACGAGCTTCGACTTTGG
TTTAATATGAAATATGAGTCCCTTAAAGATATTATGATCCCGAAATAAAACGTACTCTTT
GTATGCGTTCCAATTTCGTAGTTTTTTTTCAAGGATGGTTATAATTTGGGCTCTACAATA
ATATAAACATCAAGCATATCGTAAACTGTCAATTTCTTTTCAGTTCCAGTCCCATGATAA
TATATGGTTAGATTATATTCATCATGCTCAATTTAGCATTTTGTTTTGTTTCTAAAAATA
AAAGAATAATAACTGCATAAGTGTTTCGTGATGTTGCTTTGGACTGATTTTTTAAACTTG
TTGAATTATGTAATAAAAATAAAAATAGTTAAAATGCACTTGATTATTATTGATATGATT
CGATACGATTGTTTTAATTCGTTTTTATATGTAATAACTATGTTCTATTGTTAGATATTT
TACAAATAAATACAATATTTTATTAAGGTTTTGATCGTAAATAAATATACATTTTTTGTA
AAAAAAAAAA
(8590 bp)

- SilkBase 1999-2023 -