SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp68384_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr24
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_zinc_finger_protein_26-like_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003700 F DNA-binding transcription factor activity
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005634 C nucleus
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:12.89 TPM:22.48
ORF EntryO_BomoEE16079_complete:A_BomoEE_comp68384_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTGATAGAAACAAATATTTATTAGTGTTGTTACATTAACGAACACATTCATC
AGTAATCATTAGCAGATTCTAACATTTAAATCTACTCGCATTACTATTGACATTGTAAAT
ATGAACCTTTCAATCGACAGAAATTCACTGCTGGAAATTGCCCCTTTACGCAAATCGACA
TTACTATCATTATATTTACACAACCCATTTAACGTGAGAATTTAAAAAACTTAAAAAAAA
ATTTTGACTTGTATGCATAATTACAGAACGGACTTCTTTCAGTTTTTCACATAATTCAAG
AAGGCCTGTAATCTGTGTATAAAATCTCGCTGTACACTCCGAGCAAATTGGTTTTACAGG
TACATCAGTGATGCGATATAGAAATCCTTCATATACATCTTCTTCTTTCTTTCCTACTTT
TTTCTTTCTTTCTTTCCCTCCATATACATTATTACTTATACGTGGTTGCAAGTCTGAGGT
CTGCTAGAGTCTAAACACCCTTTAGTACACTTTGTTCTGACCACTTTTAAAAATCGCGTC
ATAATTAAGACTAGAATTAGACGCTAACGCCAGTGCAGTAGGTTTAAAATTTATCTTTCC
ACCGCCATGCCAAGGTCTTATTAGTAGAGTTGTAACTACATGAATGTAACAAAACTTAAG
GACTACATTACATATTTAAATAGACTGAATTCGTTATTGAAAATATGCAAAATTCAGAGA
ATGTTTCAGAGAAGACCACGGGCTAGCGGTGTTGGTGACCCATCTGCCCCAAGTTGAGGA
AACTATTGAGTGTTCGAGCCCATATCTTAAGACGGGTCGCAGTATTCCAGTGTCTGCGCT
CTAGTGACTATATATCAACACAAGACTCAATAGCGTTATTAGTCAACTTATGACATCCCA
GATAAAACCATTAAAATTAGAAACATAGTTTCAAGTTTCATTATCATCAAGTTTGGGCAG
TCTCCCGTCTTCGAACAGGTGATGGTACATTTTAGGCACAACTTCTTTATAATCGAAAGG
TCGGTCTTTCCCTTTCCAATGAACATGTTTGAAGTGATGCCTCATTTCTCTCACAAAATG
GAACATACTGTCGCAAGATGGACATGAGACGGTCTTCTCGGCATGTTTCTTTTGTATGTG
AGTACTGAGTATGCTTGATGATCGAAATTTTTCGCCACAATGCTCACAAGTGTAAGGACA
TTCGCCTGTATGTATCCTAAGATGCATTTTAAGGCATACACGATTAGCCATTTTCTTGTG
ACATATGTTACAAATGCAAGACTTCTCCTCGTGAGTCAACTGGTGTTCCCTCAATCTGGC
TCGTCCACAGAACTCTTTGCTGCATTGTTGGCATTTAAAGGGCTTGATTTTGTAATGGTA
GCGGTTCATATGCGCTTCGAGATCGAGTTTTTTTCGTACCAAGTGGCCGCAGACCGGACA
AGCTCGCATCGGTATGGCTTTAATATTTGAATAGCCAGTGGTCTCTACATTTTTTTTATG
TCTCGTCATGTGTTTCTCGAGCAAAGACTCTTTCAGTCGTTTGTTGCACACCGGACATGT
GACAATCTGGTGTGTTTTTATGTGATTGTTCAAAGCGGTTTCTGAAAGGAGCGCTTTCCC
GCACATTTCACAAATATGTTTCTTCATGTTCCACTCAGAGCTACACTTAATCACGTGCTT
GAGGTAAAAGGCACTAATGATTTTTCTTCGGCATTTCTCACATTGAATCCTTTCGTAATG
TCGGTGTTGATGCAATTGCAGCTTCTTTAAGCTGTAGAATTTCTTCGAACAGCTCTTGCA
AGGAAAGAGCGTGCCAGCTTTGTGAATCGTGTCTTGATGTTGTTGCAACATTTTAATACT
TTTAAATTTGATTTCACACAGTGTACACTCAATATGTTTACTCCTCTTCTTATACTGGAC
CGTGCTACTGTGTATCATTGCCTCATGTTGTTGCAATTCAATTTCTTCCATGAATCTCTT
ATTGCACAATGTACATTTATATCCTCCATTGTTGTGCTTTAAAAATACATGTTTGTCGTA
ATCCACCACATTATCAAATGACGCTACACATTGGTCACATTTAATTTTTCTAATTATTGT
TTTACACTGATTTCTGTGTTTTTGTAGGAAGAATGGCCTATTGTATTCTTTATCACAATA
TTCACAAGTATTCTCAATGTGATATTGGTCTATGTGAATCCTGAGGCTTGCTTTTGTATA
GAACTGCATGTTACATTCGCTGCATGTGAACGGATGGTGGTCTAAATGCTCCCTATTAGC
GTGCGTTACCAAATATTCCTTTCTCGATGTAGTGTAATCACAGTTCAAGCATTTCGCTTT
GCTTGCATGACTTAAAATCTGGTTTCTATAACTAATGAGATATTCATGATGGATACAAGG
CATTATTGTGCATTCCGGACAATTAAACTTGCATTTATGTAAACTCTTATTTGAGGTAGT
AAATTCTAAATAACAGTACTGACACTGCGGATTCTCAGTTGTATTGTTCACACTGTGACT
GACCCGGATGTGGGTTTGTAAGGCTTCGTGGGTGTAATATACATTGTCACAATGCAGACA
ACACGACAACATTGTGCCATGCTCCTTTTTTAGATGCAACATCAACTCATTGTCTTTTGT
AATTTTAAGGCAATACCTACAGCGAGCCACTTCATGAGTTTTATAATGTAAATCTAAGGA
CTGTAAGGTCAAATAAACTTTTGAACAAACCGTACACTTAAAAAGTTTACTGCTATGTTT
TACTTTTTCGTGTTCCTTCAAGGACTTGTATGTCGTGAAAATGGCTGTGCATTTTGAGCA
TTTATAGATTACATATTGAGGCACTGAAGGAGCTATATTCAGTTTAATAGGATTTATAAC
TATTTCACCACCTTTCGCGGTTATGTGCTTGTTCGTATTAATTCTATTCAAAACGTCATC
ATCTTCGACTATCACAACTGTAGATTTAGAGCTACTAATATTAGTCTGTGGTAGTTTTTT
GAGTACAGGATTCTGTGTTGGCACTATTTCGGACACAGTTGTTAATTCTTTGATGTCTTC
AAGAGTATCATCGTCTTCTTCCAAAACTATCACGATGTTAGATTTGTTACATTCTAAAGT
ACTTAATACTTGTTCATTAATATCTGTCACTTTTGAATGTAAATCATTAACACATGTGTT
TATTACTTTGGATAATTTCTTTGTGTTGCTAATAAAAATGTAGGATTGTAGTGTCTTCTC
TGTGCATTTATCACATATATAGGAACAAGACATTATATTTGCAACATCATCTCTAAATAT
AAAATTAATAATATCCAATAATGACTTGGACTCTTTCTGTCGACTTATAACCAGCTCCAA
GTTGATGGCATTCAGATTTTCAGTTTCTAAGCACATCCCACAGAATTTTGTGCAGTTCCA
GAGGCATTTCAACTTTTCGTGCAGCCAAAGAATGCTGTTTGTGCTGTCTTCAAGGTTGGT
TTCATGCATAATGCTTTCTTTTTCGCGTTCCAGGGGCTAAGTTTTTTATCGACACACGTT
GATGAGGTTTTGTATTTTTTTTAAAGGATTTTTGGCCTGGCCAACCAGGCCTTTAGGTCA
GGTCTTATGTTTTCTTCATAACAGAATATATGACTTAAAAAAATGATATGCAGCGAAATG
AGATGAAATTGATAAATTTGATACTATATCCAATTGGAATGAATTTAAATGAAACGAGAT
GAGATGA
(3727 bp)

- SilkBase 1999-2023 -