SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp68228_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr13
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_histone-lysine_N-methyltransferase_SUV420H1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005634 C nucleus
GO:0005694 C chromosome
GO:0005700 C polytene chromosome
GO:0005720 C heterochromatin
GO:0006342 P heterochromatin assembly
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008168 F methyltransferase activity
GO:0016568 P chromatin organization
GO:0016571 P histone methylation
GO:0016740 F transferase activity
GO:0018024 F histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0032259 P methylation
GO:0034770 P histone H4-K20 methylation
GO:0034772 P histone H4-K20 dimethylation
GO:0034773 P histone H4-K20 trimethylation
GO:0040029 P regulation of gene expression, epigenetic
GO:0042799 F histone methyltransferase activity (H4-K20 specific)
Transcript
Level		FPKM:47.85 TPM:83.45
ORF EntryO_BomoEE15725_complete:A_BomoEE_comp68228_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AAAGGTCTAGATACCAGGCCATAATCTTCAAAATAAAAAGCCGATTTTCGGTACTTGTAA
CACTAATAATGTCAAAAACGTCAAAAAACAAATCAACATGAAGTTTTTAAAATTTCGATT
CAGCTGTCAAAAACATAATACACAACCTAACAACTCTTGGTTATTTTTTAATAAAACGGG
GTAGTTTAATTTGAAAATGGCTTCTGTGATGGATGTTGATGAAGAAGAAGTTGAAATGGC
TTCGTCTAGTAGTGGCAAAGGAGATAAAAAAAGATTCGAAGTAAAAAAGTGGAATGCAGT
AGCACTCTGGGCTTGGGATATTGTTGTCGACAACTGTGCTATTTGCCGAAATCACATAAT
GGATCTGTGTATCGAATGCCAAGCAAATCAAGCCTCAGCCACTAGTGAAGAATGCACAGT
TGCTTGGGGTGTTTGTAATCATGCATTCCATTTCCACTGTATTTCCCGTTGGTTGAAGAC
TCGACAAGTTTGTCCACTAGACAATAGAGAATGGGAGTTCCAAAAGTATGGTCATTAAAT
GTCATTTAGAAGAGCTGCATCCTGCACAGGAGTTTGACATCTTCTGAACATAGGGAATTA
ACATGTCAATATCTATTAAGTTTGTAATAATAAAATAACTCTTACAAAATTCTGTATGTG
AATTTTAATTGAAAATTCGTTGAAAATCTGTTGTTCATAATAATCTGGCATAAAAATAGT
AAACTCCTATGATTATAAATAAAAATTTTACTTAATGGAAGCAAGTCACTCCAAGATATT
CTTGCAAGCACGTTATAAATTACAAGGTAAATAAAAATTACATAAATTACTCAATAAAGT
ATAAAAAGAATTTTCAGAGGCATTTTATTGTGATATTTATTTAATTATTATTTTACAGTC
ACTAATTTGTTAACATTGTGGAACTTTTCTGATTTTTATACCCATTCCCAGGGAATATCA
CAAAAGCTAGTAGCCATAACTAGCAAAATATTATTACTATACTGTACCTTAGTAACATAA
AACTAGGCTCATTATGATATACCAAATGAAAGTTTCAATGTTCTAAAATATTGTGAACCA
CATTTAACAGTCTGTTGTAATATTGGTATCCAAACCCCATTTCATTTGTAAATATTTCAC
AAAATACTTCATATGAATAATGAATAGTAAAGAAACAAATATTATTTTTCATATAAGTCA
CTGGCAGATATTTTAAAAAATGCTTAGAATCAAGAGAAGTATTAGTCAAAGTACAAAATG
CTTACTCAATTTTGGAGATAAACAAGAAATTTACAAACAACCAACAATCAATACCACAAA
TTTGCAAGCAAATTTCAAGGTTCAGTTCACATTACACTTTGGCTTCTCTTGATTCATTCT
AGTCCTGGACGCTGGCATGTATTTGGATCATTATTTTGGGATTAGATTCAACTGTTACGA
AACAATTTATTCAATAGTTTGTAACACTAAATAATTGTAATTGATAAATAAAGGAATAAA
CAACAACTTTACTTGAAGTCAGCACTCAACAACAATGCTCATTACAAAATTAATCCATGA
TACCTAGTTCAAATATGTCAGTACTAGTTTTGCTTTCCACAGACAAGTTTTTACATATTA
AGTAATCAACTTTTGTCTTTTATCTTTTGCAATGTGGATAACAATTGATTAATAATTTCT
CAATAAGTACAATATGCTAACTAATTAAGATCCTGTGAGTTATCATAATTAAGTTAATTA
AAATTACCATTACAAAGAACACTTTTTTTACAATTATTTACATGATACTATTAATACACT
ATAATTCATTTATTACTACGATTTAATTGTAATTTTTGTTCTTTAATGAAAACGGGAAAA
ATAATTGTGCTAATTAAATAATAATGACATTATTTCACTATTGGATTTAATAAATATTGG
AATCATCAAATAAAATCCAAAACCTATCACACAATACTCAAATTTCCAAATTTTACATCA
CAAAATAAATACTAGGTAAAATAATTCTAGTCAGTGATAATTATACTAATTATTGAAAAT
AACGGTGGAAACAACAATAAGGTAGTTGCGGCTGTCAGTCTGCTGATAAAGCTGTAGGCA
AATCGATAGTGCGACTTTCGTTGCCAAAAATTAATCTTAGGCGTTTCATTGGAGGCAGAG
GACGGACAGGACTATGTTTTCGATGTCGTTCCTTGGATCGACGTCGTTTCTTCAAGCGTC
TAGCAGTTTCGGGATCGACACCTTCTAATCGTAAAACTTCATACTCTGGTGCTTCAGCAG
GTGCTCCACAATCCATTACCTCTTCAACAACAGGACTTCGTTTTACACGTAATGTCAACT
TCAATCCACGCCTTGGTGGAGTACAAGGGCAATCACTGCTTTTATTAGAATTATCCACTA
ACCAAGGAGGTCCAGAATCAACTTCTCTTTTTGACTCATCACTTCTATTGCTTATTTCTA
TTTTTTGAACCTTATTGTTTTTACTATTGTTAGGCTCACTTGGATTTACATTTTCCCTAA
AATCAATTCCACTCTTTAAAGACGAATTTTCATTTCTCACCGTACAATCAATTTCATCAG
GTTCTTTTTGAACCTTTGATTTACTTTCTATAATTTCTATTTTATCCTCTGTCGCTGTAG
CTATAGGCAGGTCTGTTTCAGTTAGAGATTCTTTTTTATCACAATTCTTACCACCTAAAT
GGGTATCAGTATACACAAAAGAATTCAAATCTGAACTGTGTTCATTATCATTTACAATAG
GTAGGTCGGGTTTAATGTCAAAATTGGAAATTTCTAAAGTGCTAGGTAAATCAGCCTCTT
CTTTTGGTGTATTCACATTTCTTTCATATTTTATGTCTGAACCTACTTTTGATCCATTTT
TTATCTTAGGGAAACTGGGTTGAATGCACGTATCAAGAAGGCGTTTATGACTTCTTAGCA
CAATTCCTGAATGAGAATCTCTACTGCTTCGGGAACTGGCAGTGCTACAACAACGAGAAG
GAGGTGCTCTGCGTTTTCCTGTGCCATGTACACCATTAATAGTTTTGTTACTATCTGTCC
TTTTTCGTAACCTTTCACCCCTACTAGATGTGGAGGATTCTCTGCTCCCTTTGTCTTCTT
TATCAGTAGTGCCATCTAAAACATCAGCTATGCAACCCTGAGCTATCAATAATTCTGCAT
CATACTTTGTTAAGCCTTTTTGTTTCATTTCTTTCATACTAAGAGGAGATACTATACTAG
AATTTTGCCTACTGGATATTCGAGTCTTATCAGAATTTTTTACATTTGATGATTTTTGAA
CCTGCTTTGCTTTTGTTCTGTTTATTCTGTTATCTGTTTCTCGAAATCTATATCTTGTGG
ATTGTTCATCATTATGTGAACTTTCAACTGAAAATGCCCCTTTTCCCCTTCTTTCACAAG
TTTCACATTCACAGTAACAATTGCTATTTCCAAAAAAATCTTCACCATAGTAACAAGTAA
TTTCTTCACCAGGCTCTATATCTCTCAGCACTCGAACAAATGCCTTTCCACGATCTGTAG
CTTCAAATGTACATGTTGGTCTACAATCATGATTAATATAAGCAGCAGGTCCAAGCCATA
ACTGAGCACAATTTTTTCTACAGCTATACATAACTGAGAAGTCATTTTTTCCAGGATGTA
ATAATTGTTTTTCTTCTTCTTCAGTCATTTCTGCTATGCACCCAACTAAGAAATCTATTC
TTTCATGTTTGAAAAACTTTTTTGTTGATGAAATTTTTGCTCCTACTCTGCCTTCTAATG
AATATCTATAGCATGGTTCTATAACAAATCCCGCTTTCTTGTCAAAAATTCGTAAATAAC
GATAAATATGGTCTCGAAACTTGGTCTGCTGATGTTTATTTTTACTAAAATGTCGAGGTA
TCCATTCACCATTGGCTAGTTTTGAATAAGCTTTATTATAATCCTGTGTATGAATAAACT
CTTTTATAATGTTTTTTAATTCTTCCTTGTTTGTTTTTAAAGGTCTATAGCGGATATTCA
TCTTGTGTGTCGTGATGCCTAGATATGGGTCCACGATTAGAGCCGTTGCTAGATCATCGT
ATTCGGACAGCTCGCGAGGAGTCATACCCATCGGCTGCATCTTGTGGAGCACTTGCCTTC
CAGGGTAAGACGCTGATCCAACAACCATTCTGGATACACAAATCATAGAATTTACGTAAA
ATTCATATTTATTTCCAATAACAACTTCACTAGTCTAGAATCACTCGCAGACGCTAACAG
TTAGGTTATTTACATGAATTAAACATATTTATTTACTATTGACAAATATATCTAGTATCT
TTATAAATAATTTTCTGAAAACAAAACATTTGTAAGCGTTCTAATCTTAATTTTATTCCT
AAGCAAGCTGAAAAACAACCAATAACCATGTTTATGAGTCTCCCCCATTCATACGGGAGT
CATTTAAAGTTTTCAGAGTTTGCCATTGGTAAGTTTTTTTTTATTCTTGAATATTTGTTA
TTATTAGTTGTAAATTCGATCACATTATATATTTAGATATTGTTAAATGAATGTTTTGTA
ATACCTAAAAT
(4571 bp)

- SilkBase 1999-2023 -