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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp68227_c0_seq4
Scaffold_idBomo_Chr3
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_nucleoporin-like_protein_2_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005681 C spliceosomal complex
GO:0005682 C U5 snRNP
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0008380 P RNA splicing
GO:0044822 F RNA binding
GO:0071011 C precatalytic spliceosome
GO:0071013 C catalytic step 2 spliceosome
Transcript
Level		FPKM:4.85 TPM:8.46
ORF EntryO_BomoEE15722_complete:A_BomoEE_comp68227_c0_seq4
Sequence
(Nucleotide)
GACTTAAAGGTCTTAGTTACCAGGGCATAAAATACCTTAATTTTTTTTATAAAAATAGAA
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CTGTTTTCACTCAGAACAATCCAACACCTTCAATTTTCTCACAAAACAACCCACAAAACA
TGTTTGATAATGGAGCTACAAATAATATGTTTGCACAAAACAGTACACAGTTAGGAATAA
CGGATGCCGGAGCAAAATCAATATTTGCTCAGGCCAATCAGAATGTATTTGCACAAAATC
AAACCAATGTGTTCAGTAATACCAATCAAAACTTACAAAATCCTTCCAACATCTTTGCTA
GTGCAAATCAGAATTTGTTTAAACAGAACGACACTCAAGGTTCACCATTTCAATTGAATA
TCTCGCAGCAAAATATGGATACTAATACCTTCCAAAAGTCAAATACACAACAATCAATTT
TTGGACAAAACGTGCCTTCAGTAGAACAGAGTGGTGTTTATAGTAAAATGGAAGAGCTCA
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CACTGGTTATGCTACAGTTGAGACTTAGGCCTCATGTCTCAAACTGGATTATCACATTAA
CATTGCGTTGTCTATGTTCTGATAACAATTTAACACTAGACCACGAGTTTGATTACTAAT
CTAAGGTACAAATAAAAAAGTGTTAATAGGAATGGCCTTACATTGCCCCTTGTTCAGCCC
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TGCATACAATCCAATGTATCTCGTATTTGTATACTATTCACAGATCTCAACACTGCACAA
TAAAAGACAAATTTTGCTTATAAATTAAATGTATTCCTATATTACATTTTACATATTTAT
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TGTCATTGCTACCAAATTTAATTACCAATGTGAAATTGAGTAGATTTTGCATTTAATCGA
ACAATCAACTACAAAAATATATATGCACTGATAATGTAATTTTAGAAAATCTTTTAAATA
CATTAAACCCACTTTTATTTTATATTCTAGTGTAAAGGTAAATTATTTCTAATGTTAAAT
GTTCTATTTGGACTTAAGTGTTTTTTATTACAGTCAGTTTAAGTTTCATTTTAATACATT
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AAGCCCATGTAAATGTTTTATCCTGCTTGAGACATGAGGCGGTTTTCACAATTGTATAGT
AAGACTGATATCCACCCTGCAAACCAAAATAACCTGCCAACAGTAATACGAACACATTGT
CATTGATCTTTTATACACTTTTAGTAAATTAATATTGTTTTGTTTGTCTCCACACCCTGT
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CATCAAACTCAAGACAGGAAATTGTGTAACTAAAAATTTAAAAGTAAAATCAGTCCTCAA
TTTTCAATTTCTCCCAAATAAATCTGTTTATCGCTGGACACTGATAACACTATGGGTTCG
TTTGGATGAAAGTCCACATCATTGACGGATCCTATGTGTCCAGGCAATTTGTAAAGAACT
CTTCTGGATGTTGTGTCCCAAACGTATAGGAAACGATCTGAAGAACCTGCTGACACCTAA
AAATCAAATACGTATTTTGTAGGCAATTTGTAAATAATATCACCACCATTACATACAATA
AAAAACTGTTATGTTATATTTATTTATTATTTGTTAAATCTGATTATTTATTATTTGTTA
AATTTTGGGTTCTTTTAATAAAATAGGCACAAAGATTTTTTTTTTGCAGGAGTGTATAAT
AGCCGGCAAACTTCT
(2775 bp)

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