SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp68090_c2_seq1
Scaffold_idBomo_Chr21
NCBI non-redundant
(nr)		putative_U3_small_nucleolar_RNA-associated_protein_[Danaus_plexippus]
Ontology
GO:0005634 C nucleus
GO:0005730 C nucleolus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006364 P rRNA processing
GO:0030054 C cell junction
GO:0044822 F RNA binding
Transcript
Level		FPKM:23.34 TPM:40.70
ORF EntryO_BomoEE15456_complete:A_BomoEE_comp68090_c2_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GTCGTCAGGTTTGAGCCCCGTGATCTCACCTACTAGTTAAAGTTACGCTAATATGTTCTC
TAGACCATCAGCCAAGCTAGAAAAAAAAAGTGCCGCGTGTTGCCGTCTACTGGTCTAAAG
GATAAGACACCCGATAAATTCGTATCTAGCGATTCGACTGCGCCGGTGTTCGAATCCCAC
AGGGTGACAGGCGGTAGGTGGACCCATTTTTCTGTCATTCCTGCTTAAGTATATATATAT
AAGATGCGAACCAATCGTGCGGTCATGCATTCCAGGGCACGATAACTGTTGAAACAATGT
TATTGAAAGATCGCTCTCGTCTATTGAAAACTTGCGGTTCTATGATCTATAAGTTACAGT
ATCCAATTCTAATTTTATTTTAAATGTAAAGTATATTTTTATTTGCAGTTGTAATGCTAT
CACGTAGCTGGTGTGGCATCTATGTTACTAAACTTTTTATCAGCATTTTTCAGTACTAAG
ACGTGGCACCACCATACTAAAGCAGTATTCATGGACATTTATAATTTTAACAAAAAGCGT
GCTTGTAATAATATATATTTCTATTTAAAATTTTATACATCAATCACAATATCTTTCTGC
GCTTTTGTAGAGGGTGCTATTGTGTCATTTAGTTCATAAACATCAGTATTGGACACTTGA
GCTCCAGCCATTATTAAGTTTATAGCTCCTTCTAGTTCAGCTATACTTTTACACACTTTT
ATTTCTGATTCTACACGTTTGAATAAACACTTGTAAAGGTAAAGATTTTCAGGAGAAAAC
ATGTTAATTTTGCCTTCAAATATGTCTATGAAAACATTGGTAGCATCAACAATTGTCCTA
GTAAACCTTGTTTCTCCCAATTTGGAGATAAGGAATTTAAGCAGTAGGCCAATAAATTTT
TCTTCTAAGTTTTCAATGGCTACTCTTAAAACTTCTCTTCTAAGCAATTCTTGAATGACA
GCTGTAGTTTTTTCCGGGTATTTCACAGATATGTATGGCCTGAGAACAACTGTTAGTGCT
TTGCTGAATTGCATTTTTCTGATAAGGACATCACAATCTGGAAGTTTCTGTTTTTTATTA
ATTTTCACTTCATTTGCAACCTCCACAGTATCCGCTTTTGTTTGACTGGTGTGATCAGGG
ATGAATTTTAATAGATTTTTTCTTTTTTCAGATTGTCTGACTGGCTCCTCTCGTTTTCTT
ATAGAAATTATACCATCAATCATGCCGACTGTTAAAATGTCATCATGTTCAGATATGGCC
ATACTTAATATTGCATTTGGGAAATCTATATTGTGCACAACTTTGAATGTAGATACGTCA
TATATTTTTACATGTCTGTCTAGAGATGCTGACATTAATCTGCTGTTGTTGCTAGCTAGT
CTCAATGTTGTGACTGTTTTGTGGTGTTGCGAAATATTGGATAAAAGTTTCCCACCATTG
AAAATGTCCCATACTTTTATTTCAGTACCTCCAGCACTAATAAAAATGCCACCTGAAGGT
AAAAATAATGTAGATTCCACAGGGCTTCCGTGGTTTACTGTCATAATAGTTTCATTTGAT
CTGCAGTCATATAATTTTACTGTATGGTCATAGCTTCCTGATAAAATAATGTCTGGAGAA
ATTGGACTGGCAGCTCCTGCTCTAATATAGTCTGTGTGTTCATTAAAATTTGCTATTCTT
TCTTCTGTAGATATGTCCCATAATCCCACAGATTTATCATCAGAATAACTGATTATTTTT
AGCTGATCTTTCGTGAAGAATGTTCTATGGACAGGGCCTGTATGACCAGTAAAAACTCTA
AGTACATTTTTTGATTGTACATCAAAGAGCTTAACAGCTGCCTCTTCACTACCAGCCACC
AATAATCTTCCATCAGCTCTGAAACACCCTCCGTAAGCAGCTTCAACAAACTTTGAAATA
TTCTTTGCTACCACTTTTGTGACCGGATCATAAACCTGAACTCTTACTGAGCATGTTGCT
GCAAAATAGTAAGGTTCGACCGGGCTGAAGTCTAAATAGTCAATAGCACCGAATTCTTTT
ACGAGAACAGGTAGACCAAGTTTTTTCCAGTAAATGATATCGTGAGTAAGAACTGATGCA
GGTTTTTTAAATATAGCTTTGTTTGTTTTTTTAAAGGGGAACGAGACTTGTGCCATTGTT
ATAATGTATATGAGTACAAAATTAAATAAATGTAATCATCTAAATATCACATATCCTCCA
TAAAAACATTAGCAAAATATGTAAACACAAATCCAACGTTAAACAGTGCCATGCGGCATT
CCGATCATCCGATGATGGTCGATTTTTGACAGTAGCATTCTGTTTTGTGGACATTTGACA
GAATTGACACTTATAGATCAGAAAAAACTGTCATGTATCTCCAATACAAATTAATCTACG
GCATAGAATTGAAAAAAAAAATGTTACGTCAGAAAAGTGTGAATATAAATTGTGTATTTT
TAAGATTTGTATTTAAGTTTTGTTGTATTTACTAAATAGTGATTTTATTTAAAAGAACAA
TAATCGTAATACACCATGTTCAAGTTACTAAACCGTCCTGGTCGACGCAGCGCTGTTATG
AAGTTATTTTGTGAGAAAGTTGAGGTTAGAACACCGAGAATTTTTTATGTTTATTCTTCA
GCTGGTTCTGTGAGATTCGCATCAACACTTGGCAGTGATGCAGGGAAAACTCTACCTCTA
GCGGACAGCATACCAGAACCACCTCCAGTTCCAGATCCTACAACGATATCAGATGCTGTT
AGTGCAGTCCAATCTTTTGCTGCGAATGGTGAACCTACGTTTGCCAGCATAGGCCTAGGA
GGTTGGGGACCAGTTGGATTGGTGCAGAACTGTTTCGAATATCTGCACGTCACTTTAGAT
GTTCCATGGTGGGGTGCAATTGTCTTGGGCACAATAGTTGTCAGAGTTGTTATGTTCCCA
CTTGTGATTTTATCACAGAGGAACAGTGCACAAATGAACAATAATCTACCAGAAATACAG
TTATTGCAGATGAAAATGACACAAGCCAGGCAGACTGGAAATCAAATTGAAGCTGCACGA
TATGCTCAGGAAATGATGCTTTTCATGAAAGAAAAAGGATTGAACCCTCTTAAAAATTTA
ATTGTTCCATTAGCTCAGACACCTCTGTTTATATCCTTTTTTATGGGATTAAGAGGAATG
GCTAATTGTCCTGTAGAAAGTATGACACATGGAGGCTTATGGTGGTTTGTAGACTTAACA
GTCCCAGATCAATATTTCTTACTCCCAGTTATCACAAGTGCAACTATGTGGGCAACAATA
GAACTAGGAGTAGATGGTGGACGTCTCGATGCACAGAATATGCAAGTTATGAGATATGTT
TTGAGGGCAATTCCTTTAGTAATGATACCCTTCACTATTAACTTTCCTGGTGCCATTTTA
GTCTATTGGTGTTCCAGTAACTTCATATCCTTAATGCAAGTTGGTTTCTTAAAAATTCCA
GCAGTCAGAGAATACTTTAAGATCCCAAAGTTAATAAAACATTCTGCTGATGCTTTACCA
ATAAAAAAGAAAGGTTTTGTTGAAGGAGCAAAAGATTCATGGACAAATATGAAGCTTTCA
AAAGAATTAGCTGAAAGACAAAGGATTGATGAAATGATTTTCACAAAAGCAGGCAAGGGA
CCCTTACAGAAAACATATAAATATGATCCCACAAAACTGACAAACATACAAGCAAAATCA
AAGTAATATTAATTTAGAGCTAAAATACTAGTTATGTTTATATAAGACAAAATTAAATAA
AAATTACAAAACAAGAAAAAAAAA
(3804 bp)

- SilkBase 1999-2023 -