SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp68085_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_MPN_domain-containing_protein_CG4751_isoform_X2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005575 C cellular_component
GO:0006508 P proteolysis
GO:0008150 P biological_process
GO:0008233 F peptidase activity
GO:0016787 F hydrolase activity
Transcript
Level		FPKM:12.72 TPM:22.18
ORF EntryO_BomoEE15453_complete:A_BomoEE_comp68085_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TTCGAACATTAACGAACAAACGACAAACAAATAATTAAAAATAAAAAAAATCCGAAAACC
CAAAAAAAGAGGGGCCAAATTACAAAGCCAGGGATTACTATAATATGTTTCTTCAGTGGA
TTACTTGCTCAGTGGGCAATAGGCATAAACATAGATTAAACTGGGCATAAATAATCACAA
TTTTTTAAACATGCAAGCTAAGATGATTTAAAGATATTGACTACATGTTCGCGTAAACAA
AAAAAAATGGATTTTCAAACATCTCACTTGGCTGCAGCTTTGATGTCTGGTACAAATTAT
AGCGGTAATCCGTCTATTGAATCGGAACCTTTGGTTTGTAATCCTAAAGAGGAAGTAAAA
AATGAAAAATCTTGTGGAAGTAAAAAGGAAACAGCGGAGGAAGAAAAAGATGAAGTCGCA
AGTGGAGAAGAATTCTCGGATGAGGAATCTGAAGCTCAAACTGGAAACAAATCAATGCCG
GGACGTGGTGTCACCCTTCAAATGCTTTTGGAAGATAAAATGTTGGAACCAGGCATAGCC
GCTATGACCATTGAGTACTTGGGCCAAAAGTTTGTTGGCGATTTACAACCAGATGGAAAA
ATTAAATCACATGAAACTGAAACGATATTCTGTTCACCATCAGCTTGGGCAATACATTGC
AAACGCATCATAAACCCTGATAAGAGATCAGGATGTGGCTGGGCATCTGTTAAGTATAGA
GGGAAGAAGTTGGACACCATTAAAGCCACATATTTAAGAAAAAAGCAGCTACAAAGAGAA
AATATGCATAGTGATCAAGAGACTGAAATGGAAGTGGAAAGTCCGCCAGAACCGCCACCA
CAACGAATCGTCATGAAGCATAATACTGTACCCAACAGAATGATGCAGCATGATGCTAAT
ATGTTAATAGAAGGAATATCATTTTCATCAGCTGGAAAAGTTCAGCCGTTCTTGATATCT
GTTAGTAGTAATGCCAGTTTGATACTCGACATCCACTGTCATTTGAAAAAAGAAGAAGTT
TATGGATATCTTGCGGGAACATGGGATTTGAATAGTCACACCTTGTCCATAACACATACA
TTCCCTTGTCTTATTAGCAAGAAAGACACAAAACCACGTGTATTGGTGGAGCTCGAAATT
CAAATGGAAATCGAAAAACTCGGTCTGTCCCTTCTTGGATGGTATCATTCTCATCCGACC
AACCCTGCAATGCCAAGTCTCAGAGATTGCGATAATCAATTGGAGTACCAAATAAAACTA
AGGGGCCCAACAGAAATATCTTATATTCCTTGCATTGGCGTGATTTGTTCGCCATATAAT
CCAGAAAGTCCTGTTTTGGAGTCGTCTTTAACGTTTTTTTGGGTAATGCCTCCGCCAGAA
CAAAGACCCACTGAGTACCCGCGGCCCCTATTGCTACAATATAATGTTGCACACGATAGT
CATCTATCTCCACACGCTATGGAACAAATACGAAAAAGCATAAAGTATTATTCAACGTTT
TCAGACGAAACATCTGTAGATTTCAAAGAAAATTTTAAGCCCGATATTACATATTTGGAC
AAACTTAAATGCACTTTGACCGCAAAGTTTCCTCGAGAACAAAGTGACGGCTTACTGTGG
CACTTCATTAGAGATGAATTAGGATGTTCTTCAGAGAATGACGACAAAATGGATTTGGAT
GCTTTGTTAGCGGTCCCTCAGCCAATACCCGTCTCTAAATCTACCACGTCCGTACCCAAT
TTCCCCTCAGTTAGTACTCTACAGCAGATGGTCAGTAGACCTGCTGGTGTCCCTCCGATA
AATGTATCTTCAGGTATTGGTTCAGGATCGCCGCACAAATTTGAAACACCTTCGCTAAAT
ATACCGGTACTATCTACTCCATCTAAATCGGCATCTAAATCTTCGACATCGTCACTCTCT
TCTGCCTATCCTACTGGCTTAGACATGCTGACAAGCATGGCGCTCGGATTAGGAACCAGC
CAAATGCCTATGCCGCTAGGACCTACCGGCCTAGAAAGCTTGGCAGCTGCTAATAGTATG
CTGGCCGGCCTAACTCCGGGAATTCCATCGAGCTTGGCCGCAAGCTTGTCAGGCAGTAAG
CTTCCGGATCCACCATCATATGCGTCGTCACTTCAAAACCTAACTAGCAGCATCGGAAGC
TACGATAAAACTCCGAGCAGCACCGCCACAAGTACTGCGTCTACTCCTATTCCTGCCAAC
ATTGCCTCAAATTTAATGATGAGTTCTGCAGATATAGCGAACGCTTTATTCTCGGCCAGC
AAATACTCAAATGCAGGTATATTAGGAATACCTGACCCAATGTCTAAATCAACATTAGCT
GCGAACAACATGTTCTTGTCGCCATCTTTAATGAAAATGCAAGAATCACTCATGAAGCCG
ATGTCAAGTAGCAGTCCCATATCTTCGAAAATAGGGTTAGACCAGAACATGATGTTGAAA
TCACCGCACGATTTGTTGAAGTCTCCCCATGATCTAATGAAATCTCCTCACGACTTGTTG
AAATCTCCACACGATTTATTGAAATCTCCCCACGATTTGCTCAAGTCTCCCCATGATTTG
TTGAAATCCCCCCATGATTTATTAAAAAGTAATAAAGATTATCTACCACCGGATTTCGGC
AGTATAGGGAAAAGTAAAACGGAAGCTCTCCCGATGGACGTATCCAAACATTCAGAAAGC
GTACTCTCCTCTAAACTTGACTTGCATAAAGAAAGCGCGGACATGCAAGCCACTGACTTC
AGTATGCCGTCGCGCGTGGGAGGTGACTCTTATTTGAATCAGATGTTAGAACTGACGAAG
AAGACCACGATGCCGGATTATATGTCAGATTATAACCAACCCCTGAAGTTATCGAAGTCT
GACGATTTGATGACTTCTATGCCGCCAACTAGCCATCCTTATATCGGGACGTCAAGCATT
ACCGATTCCGGATCGCAGGCGGCGAGCTACAAAATGGACGAGCCCCTTGACTACGGTAAA
GAACAAGATTACAGCATGAACAAATGTAGCAGTGAAAGTGAAATGCAGTAAATTTAATGA
CAACAATTTTATTGGATACGTTTTAATGCTATCAGTATTTAAAATTGAAACTTTTTTTAT
AACATTGTGTGTTTTCCATGAAGTTTTTAGATCGAACAATCGAATTTATTGGATACCTAG
TGGTAAAGATTACCTAATAATATTGATTCTCGAATACGAAGTTTGTATGTAATTATTATT
AATAATGCTCTCGGCAAGTGTGTCAAGTTTATAAGTATTTAGACTGATAAGTAAGTATAA
TTCGTAAATTGTCCGATTATCAGATAATGTATCGGTACTGTGTATTTAATTTGTGAGATT
TACATACCTTAGCTTCTAATAGTTTAATAGCTCTGTCTAATCCTTTTTTGTTATCTAGCA
TATCAAAAAATGGTATTAGCTATCAGTATTGTGTAGAGTTATCTATCTATTTATTTGAAT
ACGAATAAATCAATATTTTACGTTTCTAAATTTCCTTAACGTTTTCCGAAATAAAATAAA
ATATCATGTGAACGTACATCGTTTTTATTTAATCAGTCAGAATTATTGATTGTTGGTGGA
AAATGTTTTTCGACTTCCTTTGATTTGTATTGTTATACTAAATCAGAATGTTTTTAGAGC
TCCGTAGCAAAATAACAGAACGTTAATGATTCTCTCATGTCAACCCACTAAGTTTCTTGC
CGGATTTTCTCACTGGGTCGTGATTCCGATTAAGTATTAATTCGTAAATTGTCCTATTAT
CAGATAATGC
(3790 bp)

- SilkBase 1999-2023 -