SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp67953_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr20
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_SOSS_complex_subunit_B_homolog_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006281 P DNA repair
Transcript
Level		FPKM:39.08 TPM:68.15
ORF EntryO_BomoEE14899_complete:A_BomoEE_comp67953_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AAAGAGTGTAGATCTCGGGGGTCCCCGTATCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTTTT
TTTTTAAAATAATATTATGATGGATAGGTTTTTTAATTTTATTTATTTCCTCAATCGGTG
AATAAACTCATGGCTTATCTGGAGTTATGTGGTTAGCAGAAACATCAACAACTCCTCCAT
CCATCTTGAGACATGAGAGTGTTAGCCTCAGTCTTTTTTTTTTTCATGATTGTGGGATTC
CTGTTGGCCCAAAGGCCTTTCCAATCCTTCACAAGGACAGGTGGGCGTGCAAGGGCTCAG
CCAAGAGGAGTGGGATTTGCTAATCCGAGCGCCTCCCAAGGAGACCTAACAGCTCAAAGG
CAACGGCTCCGCTAATTCATCTACTACCGTATCGGAATCACGACTCGCTGAGAAGAATCG
GTGAGAAACTCAACTCAGCGGGCTTAGTTATGGGCTAGGTTTCGTATCGATCTCTGAAGA
GTACAAGTATGGTTACCAGGGTCCCAATGCCTGCTCCTAGTGCTGAAGCTGTAACAGTAA
GCGTTGATTAAGGACCGTTACAACCGGTAGCCGCAGTGGTGAAGATGAGACTAATATTAT
AAGGTTTCCCAGGGGGGCATAAAAAAACCAGGAATGTAACCATTTAAACATTAAACACAT
ACAACAAAAATAAATAAAGGTTCCTTATAAAATTTACTAAGATTTTACATAAAAATACAG
GGGCTTACATTAATCAATTATTGCAGGTAGAAGAATGATGATGATGGTGAGACGTAACGA
ATTGAACTGTTAAATAATTAAACGTATCTTTAAAATATTGTGATTCTAAAGCACAGGGTC
CTGGGATCCAACGAGGATATTCCAGCTCCTTGGCATAAATTGACAAATAAACGGTACCGA
GTTAGATTCCGGGAGGATACTGCACGATCCACCGAGCGTACTCCAACCATAAAAAGTCAC
GATTGACGGGACTGTTGGAGCCCTACAATAAATTATTTACCCACAATAAGTCACGAGAAT
CTATAGTTTAGACAAAGGAATACATAAAGACTTACCGATATCATGAATCGGGTAAGTAGT
AAATTACTTGATGTAGTAATTCAGATATAGCTCTTTAAGTGTAGACCAGACCTTTATTGT
AACCATTTAGCGCGGCTTCAGAATGACCTGTTACAACGCCAGCACGCGTTTATATCCAAT
CGAGGATAAAATAATTTCAAATGCAGGGGTCGCTAAAACGGGTCGCAATAAAAATTTAAA
CAATTTATTACTGTGTTACAAAGCTGCAGACGTCTAATAATTATGTGCTAAGGCGGTTTT
CATTACGCATCGTGTTATCGAAGTAAGACACTTTAGCATCAATTCAGCTTGCAGATTATC
AGAATGACACAGGTGAATAAGCTCACAGCTCACCTGGCGTATAGTGTTTACCGAAGTGCC
GTGGGCGCAGCCACAAGCTGGCGGCTACCCGCGCGGGACGCTCGCCTCAGTCGCCTCCCC
ACCGCTAGTTGTTCAAATTTATAAATTTGACGAATTTCATTTTCATTAGACGACGTTTTT
AAACCACGGAGAAGCCATTCATTTAGATCATTTAGGTCGTATTTAATTAGAAATTGTAGA
ATTTAAGTACAAATTAAATTATACAGAATAAAAATCCCAAACAAATAAGAGTCCATATTT
TTATTACACATTGTTCTTGCAGGATACACATTATGTCTTATCTGATATTTAAAATTGCAG
ACATTGGCATCATCAAGCCATTCAGAATAATAATTATTAGGGACTGAAACCATATGTGTA
GTGTATACATGTCTATTTCATGATCTACTTTGTATCGCCTACTACATCTACAACACAATT
GAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAATATCAAATACCAAATTTTTTCACAGGAGACT
AAAATTCATTTACATTTTCTGTTCTCCAAAGTTCATGTATTTTAGTTATATTTTTAGTTT
TCTTCTTACACCGGTACCTTCTAAAACTGATAAGATTTTCGTAACAAAATCATTTTACTA
AAAATTAAGAGAAAGTAAGTATAGTGGGATTAAATATAATATTATTTATAGTCTGCAAAC
ATCATGTTTAGTGATGAGATTTTATAACATGACTCTTCTCCAAACTGAATTTTCTTTAAA
AAGTTATTGAACTTTAAGCTTTACTAATGGAGTTTATTTTAATTATTCCCAATCGATAGA
GATATTGAAAGCCCTCAGGAGGCATCCGCAGCATAAGGTTGTCAATCAGATACAAATATT
GAACAGGTATCCCAGGCTATATACAGTATAAATACCCACATACTTCTCAGAGTATGAGTT
GACTTTCAAGTACATTACTCACTAACGCTAAAAACCATTTTATCTATGTACTGATGGAAT
TGGCTCAGAAACCAATACAATGAGTGTCAAACTACAAAACAAGAAATGAAGTGAAACTAC
ATGGGAATGTAAGAAGTGGCTTACACCATTAAATATTCCAGGTTGTAGCTGAGGTACTGC
ACTTTGCATGTTTAGTACTAAACCGTGGAATACTATGTAAGATATACTAGATGCATATAG
TTCGGTTTGTTCAGACTGTTTTGGCACAAATGAGAGTCCACTTTTTCAAAGTGCAAGTGG
TCAAAATAAAAATGTGTTCATTGTTTTGTAACAAATAGGCAGGATAGTGATGAACCTGTG
AAGGCTTACAAAATACTCTTCCACCAAAGGTATTTTTTGTTTTCAGTTTGTCTCTGCATT
ATGTACCACCTCTGCATCGAGCTCACAAGCATGTCTCTATTACACTGTCACTTTTCACTG
TTAAATATTTAGTTTAAACCCCAGTTGTTTCAAGCTTCTCAAGTCCACAACTTGGCCCTA
TTCAGGTAACTGCTATCTCCTATTGTTGCCTCGCTGGTGACCTCGGCCTCTTACGTATGT
CTTGTGAGCATGCTTGCCATGTTCAGTAGCTGAAGGTGTGAAGCGTTCAGACTTGTTGTT
GTGTTGTGTGGTCGGAGCAGACGACTGCTGATTGCGAGCTGGAGCCGAGGGAGGAGCGGG
TGGTGCGGGAGGAGTAGCTTGTGGCTCACTCATGTTTACCTGCTCATTGAATAACATACA
AAACTCTCCAACCTTCTGTATGTCTCCAGACTTGCCAGAGTAGAGGGTGAGTGCCGCCCG
CCACAGTGAGGCGTAGCCCCGCGTGAGACGCACGATGTCCCCGGGCTGCAGCAAGGCACC
CGGCTCGTCCCACACCGACAGATTGACGCAGGCGGTCGCGTCAGCTACCCGCAGCGTGCG
CACTTCCCGAGCCTCCCTCGTCAATGTCGGCGGACCTACATCCAACACTATAAATACTGC
GTTTATGTTTTTCATACCTGCCTTCAGGTCTTTTATTTGAATGTACTCTAAATTACTCAT
TTTAAAAATCCCTTAGCTATTTTAGTTCGCCCTTAGCATTTACATATTTGTATTGGCAGT
ATTTAAAAATTTTTATAAGAATCAGATCATCTAAATAACTGTTACGTTGATTTACAACAG
TGATTGCATTTACATTGTTAATTCTTGAATATTTCATGGATTACAACCAAATCTTTAGAG
GTTTATCATCTTATAAGAATAAACTATGATTTTTTTTCGAGTTTATGACCTGGTATCTAG
ACTTTTAGGCCAGCACTTTGAAGTTTGATTGGACGAGTGTTGCTGAGTGAGTCGTAAAAA
GTATTTTCAGAAACTTTATTAGCAAACACTACATATTCCCAAACTAATGTCTGATTACAA
TTTGATTGAAAACGTACTAACGCAATAATTAGGAACGAACAATCTCTTTCAATTGATTAT
GTTATGGACTTTTAGTTTTCACCCTTTCGATAAATTGTGTCGGATTCTCAGTAATATCGT
GTAATAAAAAAAGCTTACTAAACAGTATTTTGAAACGGATTAATTTTTTGAATACTTTTA
TCCTTAGAACTGAATCATCCAATATTTCCTTTTG
(3994 bp)

- SilkBase 1999-2023 -