SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoEE_comp67912_c0_seq4
Scaffold_idBomo_Chr10
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_GTP-binding_protein_1_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0000177 C cytoplasmic exosome (RNase complex)
GO:0003746 F translation elongation factor activity
GO:0003924 F GTPase activity
GO:0005525 F GTP binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0006414 P translational elongation
GO:0016020 C membrane
GO:0044822 F RNA binding
GO:0061014 P positive regulation of mRNA catabolic process
Transcript
Level
FPKM:3.05 TPM:5.33
ORF EntryO_BomoEE14814_complete:A_BomoEE_comp67912_c0_seq4
Sequence
(Nucleotide)
TATCTCCTCCAAGCCTGCCGTAAAGAACTTCGTTCCAAAAATTTCGTGTATGAGCTTTAT
TTCCTTTGCTTGTCGAACACCGATCACACAAACATTCGACTTATTCTCCGCGATTTCGTC
CATAGTCCATTGCTGTCCATAGATAACACAATAACACATCATTATTTTTGTCGTTTTCGG
TTTTGTGATGCGTGGAGAGAGATTTTCACGACAACGCGTCGAAAATACGCGAGTCCCACG
AGTGCAGTCATAGAGTTCTTGAATTACAAAAGAGGCTAGAAATAGCTAAAGCTCAGATCA
GGAGGCTCCCAGGTATAGAATTCAACAAACACGACCAGCTGAAGCAATTTGAACTGCTCC
GCACTCAGCTGAGATTAAAGCGTGAACTCTTACAGAAGTATCGGAATATGTGCTCATTTG
AGACATCATTCAAGTGAAGATGCCTCTACGTGCGCTGCTTAAATACTTAGCCAATAATGA
ACGAATTGTACAGAAGATTGCAGAGTCCTACCCTGTACGAAGAGCAGCTCAGTTAGCTGT
CTCAGTATTTTACAGAGGGAAGGAAAAGCTCTCTGATGTTGATCCACAGAAAGTTAATAA
ATTTATAGAGTTTTTAAAAAGGTTCAGTGCAAATTTGAAGGAAGGAGTACAGGATGCAAA
AAAACAACTGAAAAAATAATAATAGTTCCTTGGATGTTTTTGGCTAACCATGGATTAGTT
GCTGTTGATTGTAATTCACTATCAGTAGTGTCCTTTACATAATATAACTACTAAATTAGA
TAATAAAAAACTGTAACATAGTTAGAGCTATTTTTATTTCACTCACTCTGAACAAATCAA
TAAAAATATAAACTTTACTTAATTCTAAGAAAAAATCACAATATTGCAATGGTATTCATT
GTAAATGTCAAAATATTGAAAATATATTTACTTTTAGAAAGCAGCTAGCTTCACTAATTT
TATTGCGATTATAAGGTTTTCAGAGTTAAGGCAATGATGATTCAAAACTCTGATCTCATT
AACTTTAATTTTTATTTTTAAGTGTTCAAATATTTTAAGTGACCCTAAAAGATTAAGCTT
AGTGCTGTAAAAATATATACTTGAGTTTTAATTAGTGTTATAAGAACCTCGAGGTTATTA
GTGATTTAACTTGCGAAAATATGCCGACCCATTGTGACAGGTGGATTAGCGGTATGGCTT
GAGGCTGTCTAGATTAATCAGTGTCACTACGTCCCCAGAAAACGACAGGAGTTCTACCCT
TGGTAGTAAAACTACTAAATTGTACTATGCAACAATCACTAGAAAAACCTTTAAGTTAGA
TAAAAAGATCAATATAGATTTTAGATTAATTTGAATAGTATGTGCCACTTTCCAGCCAGT
CATTTTAGAGCAATAGTTTTGTATTAAAAGTAAAATATAGTTGTTTTACATTTAATACAG
ATTCTTCTCCGAATATTTGTAAAGTTATTTATCGATTGAATTACATTCTTAAAGGCGATT
GCACAGTATTAGTATATTGAATAATATAATTTCGATGATAATGTATCTAGCAAACTTCTA
GAAGTCCTAATTATAACTGTCCTCTGTGGACAAATATTAATATATTTTTTTTAATATTTA
AAGAAAGAATTCAGATACGTTAAATTTACAGCCACTATTTCACAGAAATTAGTAACTATT
AAAGTTGACAGACTTGATTAAGCTAAGTCTACCAAAAAATGTTTCTTTTTTCAATGTACA
TTTCTTGTACTTTTTGTGCCTATCCTACTTAAATGGTAAAAGGAAAACATTTTCAACCTA
TACCTACCGTATTTATGTAAAAATGAACTATAATTCTGACATTTGACGTTCAAGCATTTT
TATTGAACAAAAAACTTTATTGGCATTTTCATCAAGCGCCCTTCATACCAAAATTGAAAA
AGTTTAAAATGAGAGAAAAAACCCCAAAAATTATAATTTTCTTCTAGATTAGTAACACTG
TCGTCTTGACTGCAGCGTGTATTAATTAGCCGCAGCGACGGTCGGTTGTGTGGGTTCGGG
CGGCTTGTCGTGTCTCTTCCGACCACGACGCCCCCCTCCCGCCCCTCCGCCTTGGACGCG
CTTGTCCGCTTGGATCTCGAACGGAGAGTCCATTGCAGTCACGTCGCTCTCTTGCACGTG
CTGCGAATCACTCTCATCGGCTGCGTGGTTGTTGTGCTGCGGGTTCCGGCGGTCGTGCCG
GGCGGGCTTCAGCGACATCGGCTCCGGACGTAGCACGTTGCCCACGGCTTTTGTACGACC
CTCACGGAACACCATTCTCTGTCCCCTCTTGAGATACTCCGGATGTTTGATGAAGCGGAA
CTTGACTAAAGCTTTGTCCCCGGTCCGAAGGCAGTCCCTGGACATCGACAATATGGATGC
TGTCTGTCTGATACTGCCGCAGTGCACCATGGCTTGGTAACGCGAGGAGATGGTGGTCGG
GTGGTGCAGCACGAGGATCTCCCCCTCGAACTGCCAGCACGCCTGAGGGTTCAGCGACGG
AGAGACCATCACCATGCCCTTGCGGATTTGAGAACGCTTCACCTTCTTAAGCGCGAAGCT
GGCCGTCTGTCCGCCGCGCACCTCGTGCACCGGCATGCGCTTGCGGTGGATGGACTTGAC
GGCGACGGGGTGGAAGCGGCCCAGCGCGTCCGGGCCCAGCGCCAGCGTGTCGCCCGCGCG
CACCACGCCCGCCAGCGCCGTGCCCGACACCACCGTACCCACGCCCGGCACGGAGTATGT
GTCGTCTATCTGGAATTCGGCTGGCTTGTCTTCGTGCGAGGGCATCCTCGTCTTCAATAG
GTTCAGGAACATCGTCAATAGCTCGAGGTTCTCCCCACTCACGTTCGAAACTTGGAATAT
TGGGCACAGCCTTTGCGAAACGAAGTTGGTGGCGCTGACAATGACATCGTCCTTCGACTT
CACCATCACCGGAACCTTCCTGCACCCCGATGACTTGAGGATCCTGATGAGCAGCTTGAG
ATTGTCTTGCAGAACGTTAGGCGGGCACATGTCAATCTTGGTGACGACAACGAATACTGG
CACTGACAAGGCAAGAGCGAGCCCGAGGTGTTCCTTGGTCATTCCTACTATACCCGCGTT
GGCTCCGATCATGAGCATCCCAAAGTCGGGAGCGTGTCCCGTCATCCCAAAGACCGTAGT
TTTGAGGTACCTCTCGTGTCCAGCTAGGTCTATAAACGTTATCACTTTGGAAGACTTCTC
GCAGATCTTCACCCAGTCAAGAGTGCCGTGATCTGGCTTATTCACAACATTACCCATATT
ATCAAAGCCCAATATGTCGTTCCCCACGGAGCTGGTCCTCCCGCTCTCCATCTCGTGTTT
GTGGCGGAACAGCCTCTGTCGTGCATACCCTCGACCGTTGTCCAGTTCTCCGTGCGTGAG
GACCCCGAGCAGCGTGGACTTGCCAGCGTCCACGTTACCCACCACAGCCACTCTAATCTC
CATAAAGTCATTATTGTCAAGCTCCGTCCTAAGGAGGTATTGGCCGGTGAGCCCACTTCC
ACACTCCCACCTCCTCAGCTCAACACATGACACTCTCTCACTTGCCACCAATGAATGAAG
CGTTGCTAGGGACGCATTGTATTCATCCTCTGTTAAGCCCCGACCATCTTCTCCATGTCC
AATATCATAAATGATCTCGCCATTTCCAGCTTCAAGCCTTTCCAATAGCTGTTTACGGAG
TAACTCATACTCATCAGCATTTGGACTCACCATCACCATCTTCCCTCTAATACTGGAATA
ATCTGTTTCGCTTTCTACGAAGGCTTCATCCTCAGTTAAGGAAATCGCCTTAATCGGAGA
TTCTGGTACGCTGTCCATTTTTACTTTCCAAATTACTTAAACTCAGTCAGAACCCTTGAA
CTTCACTGCTATTCACTGCATTATGTCATACGTCGGCATAAGGGGAAACAAAGAACGACC
TTCCGTAATGTAAGCTATCTTCTATTTTACTAATAATCCGAATGACAATGTTGTTGGCTA
TAGAATTTTTGACAAGGCTTAATAAACGAAAGGTAATTTATCTTTCGGTTACAAACACAA
TTTTGTAGTTTCTCAGTGTCAACACTCACATTGATATGATTTTATAATTTTTTCTGACTA
AACTAATGTTGTTTAAGGTTTTAATTCATCATTTCAATGAAAAAAATTATATTCTGGCAT
TTTTTCCTTTCAGTACTTGTAAGTATTTTGGGAATTAGCAAAATCAAAACCAATTTAACA
GATGGGATAAATGCCAACTTTTTGACAACTCACTCGATTTTAATAATTTTTAAATTCTTT
GCGGCCATAGCTTTTTAATTTTTG
(4344 bp)

- SilkBase 1999-2023 -