SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp67600_c0_seq2
Scaffold_idBomo_Chr23
NCBI non-redundant
(nr)		cell_death_activator_CIDE-B_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003015 P heart process
GO:0003924 F GTPase activity
GO:0004871 F obsolete signal transducer activity
GO:0005834 C heterotrimeric G-protein complex
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0007015 P actin filament organization
GO:0007155 P cell adhesion
GO:0007165 P signal transduction
GO:0007186 P G protein-coupled receptor signaling pathway
GO:0007391 P dorsal closure
GO:0007637 P proboscis extension reflex
GO:0008360 P regulation of cell shape
GO:0016020 C membrane
GO:0022008 P neurogenesis
GO:0035050 P embryonic heart tube development
GO:0045176 P apical protein localization
GO:0055059 P asymmetric neuroblast division
GO:0061343 P cell adhesion involved in heart morphogenesis
Transcript
Level		FPKM:30.16 TPM:52.60
ORF EntryO_BomoEE14217_complete:A_BomoEE_comp67600_c0_seq2
Sequence
(Nucleotide)
AGGCATCAAATTATTGAAATACTATCTTGATATAAATATAGTTTTTTAAAGTTCGTTTCT
TGAGCTTACTCAAGAGAGCTTTAGCTCGAGAGCGCTTAAATATAAATTAAGCATAGTCAA
AGCTTTTAATCTACTTGAGAAACAGTGAAGCTAGATGTAGAGTGAATATAGTCGGGCCTT
AGTCGAGAACTTAGTCTGTAACATAACATTTTACATAATTATAAGATGCATTACATATAT
AGTGTTATTCGGTCGGGAAACCTCGACATTACTCGGCAGTCAAGTAGCATCTCGCGAAAG
TTCCGAGTCTGGCCGACGAACGAAAGCGCCAGACTTACATTTGCGAAGCTGTGGGAGACA
GTCGTTAGTTGTATGCGATTTTGATTTTCGAGTACCTAATCGTTTTTCGTCTGTGATTAA
AGAAGTGGCAAATTCAACTCTAGATTTTTTTGTATGCTGGCAATTACCGAAAGGCTTTAG
ACAAGAAAAATACAATAGTTCAACCCTTGTCAAACAGTGTTTCTTGGGAATCGGGATTTC
ATCATCTGTTTTTACTTTGTAATCGAAATAAGTAAACAATCTTCTTTTACGTTCAGTATA
TTAACAAAAAAACATGGAAAACGACATTAACAAACCATATAAAATTTGCGATGTTAATCG
CGAAAAGAAGAAAGGAATTGTCGCGATGTCGCTTGAAGACTTACTCATAAAAGTGCCGGA
AAAGCTGGGAATGCCTTCTGAAAATTTAACTGTTGTATTGGAATCAGATGGTACAGAAGT
TGATGATGAAGAATACTTCTCTACGTTAGACCCAGACACGTCCCTCATGATTTTGCACGG
AAATGAAAAGTGGGTCCCGAACATGCCTAAGTGTCAGGTATCGTTAGATCAGACCGATGA
TATAGCTTTGGGTGATAAAGAACAAGTGGCGAGTCTTGTTGGTCGACTGCAGCATAACCT
ATGTCACATCTCGTTGCTTGGAGGCCAAGACCTAGAATTGTTATCTGATATGGATCCTGA
CAGCTTGGCTGACATTGTTACTGATCGAGATAATAGAATAATTTTGGAACATATTAAAGA
AGCATCTGGAAGAATTCTTCTGGAAAAACGTCAAGCCCAAGATGCTATGGAATTGCTAAA
ATTATACCATCAGAGTGTCTCCAATGGTCCAGAAGACGTGTCTTCCCCAAAGCAGGAGAG
GGTTTAAATCAACCCAGTTGAACATCTGGTCTGCACACAGGCAAGACGGAACTTATTAAT
CTAAAGTTTGATAAAGGTATTTGTACACAGTATAATATTATTCCAGCATTAAAGCTATTG
GGATATTAATGTACAATTATTATTAATATCAAACAATGTTTATATTACGATACATAAATA
AAAATTGTAGTATTAAAACGCTAATCTTATGAATATGAGCTAATAATATTAATATGTGGA
TAATGGTTTGATATGATAGTGATGATAATCTTAAGTAGGCAGGCATGTGTACATAGATAT
GCATGAGACTTAAATGATTTCTTGCTCTCTGTCTTTACTTTCTCATTCACTACTATAAAA
TTCAATTCGGTAGTGACCTTTGCATACTTTTAACCAAATGGGTATGATTTGGTATTTTAA
CCATAAGTTGTATAGTTTTTAAAGAGATCCATATTTGGATAAACATTTGGTAATATAGTT
TGTTTTGAAAAGAGATTATAGTGTTAAGAATTTAAGGCCTTCTGCATCATTATGTCACAA
TGTTTTATTTTGTAAACTTTTGAGAGACGATTTGCCACAAGGTTGATAATCAACATCAAT
TTAAAAGACTGATAGTTGGTAATTTTTTTTTTATATAGTTTTACCCTTAGATTAAGATGC
ATTATTTTATTCCAAATTTGCTCAAAATTTACAATTATTGAATAAATTCCTCTGCAATTC
TGTTCTATCCACTGCTATACCATTTTGTAATCTTAGTGGTTACTTATTATTCAGATTCCC
AAGTTTCACTTTGCCCTTCATATAAAATATCAATAGGAAAAACAATATACGATTTTGTTA
AAATTAAGTAATTCTGTTTTATTAAAAAAATGTAAGAGTCAAACAGTTTCATTATAAACA
TGCACCATACATATTTCTGAACAAAACAAAAAAAAAAAAATCATTGAAAAATATTAGGTA
TTCATATTATGATTAATCATGTTTTCTGTACAAATTTATGAGAATTGAGGAGCTAGAGCA
GGGTTGTTTACCAGAAATTAATAAGTGAATTCTGCTAGTATATGTTCTTATTCCTCTATT
CTGATTTCAAAACTAAACAACAATGATACTATGTAGTTGTAAATTGTAAAAGGAGTGTGC
ACTAAAAATGTGAAAAAAAAACACTAAAACCTATGTCAACAATACTAAATTGTTTGCAAA
GTATTGATTAACATACCTACCCAATAAAAATATCCTGCATAGTGGTTTATAGTAAATATG
GTTCAAATTTATTATAAATGTGTAAAGTGTATAATCTGAATACAATTTGAAACACCAAAT
AGATTAAGTTTTTTTTATAAAATGTGGACTGTGGCAAATTTATTCCTACGAAAAACTGGA
ATGTGCAGCAAATAGTTTAATTTAGATTATTGCTTTATTTTATTTTAATTAACTTTTACG
ATAGCAATATTTTAAAATATTTTGCTGCTACCCTGTATACATTTGTGAAGTACTAGTGGA
AGTGTAGTCTAAAATGTGCCATGACTGTGTCCATTTGTACTTTATAGCAATCTTGTATTG
TGGTATAAGGGTGGGCCAACCTGACAGTGTAATAATAATAGAGTAGGTGGAAATATTCTG
TTGTGATGTCTATGGGCTAATCATTGTGTTAGAATGTTTAACACAAAACAAGTTGTATTG
AAATGGAATTGTAAATTTAATTTGTGGAATTGATAACAGAATATTGTTTTTTTATTTGAT
GCACAAATAAACACTGAATTGCATAATTTCTTTATTTATTTTTTAATACATCAAAATTTA
ATACAAACATCAAAACACAATCCATGAACATTTTAATTAACAATAAAATGCGAAATCGGA
TATATTAATCATGGAAACAGAAATAATCTAAACGTTAATAATAAATTAGTAACTAGAGAA
GTTTCCATTACAGGTGACTCCAAATATATTAGAGGTAAAGATCATTTAAAGGACAGTACA
TGAACTTTTTTCACGGAATGGATTTACTTTCTGACTCGAAAACCCAACCAAAAGGCAATC
TTCTTGCTCGTGTTCATTGATATACTTGATGATATCTGAAACTGCTACAGATACCGGGAT
TCTCTTTATTGCTGCTTCTCTGCGGAGCTGCTCAGTTACAGCCCGCTGCTGCTGTAACGT
TGATACCATCATATCCATTACGGCTGTGTCCGAGAGGCCTATGTTGAAAACAAAAGCAAA
ACTAAAGGACTGAAACTGGGCGTCGCCTTGCACTCGTCGTGAGTCACCCGAGGATTTTAT
TTTTTCTGGATAATAAATTAAGATTTACTGAAAATTGTCAAAGTCAATTAATGGCAGCAG
ATCGCCCATAGATTATATATACACTTAATGGATTGCCCATAGATAATGCACCTAGAAAGG
CTCAGGGTCAGACTGTTTTTACATTTAATTCCGGCCATTGGTAACTGGCTTTTTTGATCC
GTTTTAGTTTGTGGGGCGCTGAGGTATACTGGAAGGACTGAAAAAAGAAAACTCGCGGAT
ACATCATTCATATTCTTTAAACAACAAAAAATTTACTTGACAAGTATTAATAGCAAAGAG
ACAAAAAAAATCTGACACCCAACAGTATAAAATT
(3814 bp)

- SilkBase 1999-2023 -