SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp67257_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr23
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_vang-like_protein_1_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0005515 F protein binding
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016328 C lateral plasma membrane
GO:0060071 P Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway
Transcript
Level		FPKM:6.84 TPM:11.93
ORF EntryO_BomoEE13744_complete:A_BomoEE_comp67257_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AAGTAATTTTGTAGGTTTTTTTTTAATTTTAGTAAATTCATTGCAATGTAAACATAGTTT
TTGTAGTGTTGGATTTATTAAATACGTTCACTATTCCTCATTTAATAAATAAAATATGTA
AAATGCTTGAATTTTAATATGTACTGAAAAACAAATATTTGTGGACACGGTTCCGTGTTA
AAGTTAAAACCTATTAATTATAAGCTGGAATTTGTCTGTAATGGGTCTTCGAGTTAAGAT
ATATAATGAGTAATGGATGAGGTAGAGAAATACAAACTGCTGTTTGAGACATGGAGACAG
AATCGGTGAGGTCCGAGTTGAGCAGCCGATCCCGGCGCAGCTCCAGACATAGGCACAACA
CGCACCGAAGCACCAGGAGTACAAAATCACAACGGAAAGAAAGCGGTGACAACATAATGG
CACCATTTCAAACAAGTGTCAACATAAACCCTGAAACAGGTAGAGATGGCCAGGAGGTAA
TAGAAGTTCAGATTCTCCCACAAGATGAGAACTGGGGAGAAAATACAACTGCTGTAACTG
GCAACACATCTGAAGGTTCTCAATCTATGGAAGATGTCAGTAATTGGGCTATGGAGTCAG
ATGGTGGATTAGGTTTTGTCTGCTCAAGATACTTTGGGACAACTTTGGCTTTGGGATTGA
CATTTGTGGCCTTCATCAGTCCACTAACAATGGTAGTTTTACCAAAAATAGGTTTCTTTC
CGGGACTGAGTGATAACATCTTGCAACCCAGTCAACAAATGGAGTTGCTAGCCTGCACAG
CGGAATGCAAAGGTGTTCTTTTGTCACTGGCATTTAAACTTGTATTATTAGCTATAGGAG
TATGGGCAGCATTCCTTAGGCCACGGAATGCCATTTTACCAAGAATATTTGTTTTTCGAG
CTGTAACTCTAGTGATGATAGCAGTATGCACATTTTCTTACTGGCTCTTCTACATTGTTC
AGATAACGGAGGCAACTAAAGCAATAGCATTAGGTGAAGATGCAACAGATTACAAAGCTC
TTGTTACATATGTATCGAGTTTTGCAGATACATTGCTTTTCATACATTATGTAGCAGTAA
TCTTGATAGAAATAAGACATTTAGAGCCGAATTATTATATTAAAATCGTCAGAAGTCCTG
ATGGAGAGAGTAGATCATATGCAATAGGCCAATTAAGCATCCAAAGAGCTGCCGTATGGG
TATTACAGAGATATTATACCGAGTTTCCGATATATAACCCATATCTGGAGAAGATACCAA
TATCGAAGAGTCAGAGAAAGGCACAATCCAGTATTAAATTTTATGATGTCGATGGATCTA
ACACAAATGCGGCAGGACAAACAAGATCGACAGCCGGTTCTTGTGCCGGAAGCGGGAGTG
GTCGGCGTCGGGAGTCGGTCTCCGCGCACAACGAGCGCTACCACGAGGAGGCAGAACGAG
AGCGACGAGTCAGGAAGCGACGTGCCAGATTGTTGGCGGCTGCGGATGATGCTTTTGCAC
ACGTCCGAAGAGTCAGATTGTCTGCTGCCAATGGGGGAGCGCTGGGTCCCCGCGAGGCTG
CACAGGCCGTATTCCCTTCCCTAGCTCGGGCACTGCAAAAGTATCTCCGGGCCACCAGGC
AACAGCCCAGACACACTGCTGACTCAGTCTTAGCCCATCTAGCTCGCTGCTTATCCCAGG
ATGCGTCACCTCGTGCTTTCCTCGAGCCATTCCTAGTGGAAGGCCCGGTTCTGGCTGCCG
ACCACGAGACTCGTCCTTTGCAGCGCTGGTCGCTCATCTCCGACGAGCTGTTAGCGCGAC
CTATTGCCCACAACATCGACTTCCAACTCCGTCAAGGTGACGTTTCATTAATATGTTCTA
TAAAACAGCTACCTAAATTCAGCTTGTCTGAGGAAGTCGTTGACCCGAAGAGCAACAGGT
TCGTGCTCAGGCTCAATTCGGAGACGTCAGTTTGACAGGAGGAGTACGACGCTAGAGACG
GGCTGAGGCTGGTATGACGCTCGATGTCTTGGCCTTTCAGGCACATGACATGCTCTGAGT
GATTGTCAATGTCATTTTGACATTAGTTAAATGCAGCTGAAATTATACCTACATTTATTT
CATTACGTCAAATTAGGAGAGTAGAGATAACGAGAATTGTGTTTTATGATGGACACATTA
AAAAGTGTCCAATCGTAAGCAACAAATTAGCATTTCAAAACCCACCAAAGGCGCCACCGG
TGTTGCGAGTGGTGTGTGATTTGAATGTTGCTGTCATAAACGGAGTGAAGCGCGTTAAGC
TGAAAATATTTTGGTATAATAAATTTTGACGTTACTTAGAAATCACACCAAACGCTACGG
TGGCGCCACCCTAGTTGGTCGTTATTCGACGAACACTTTTTAATACACAGAGACTGTGTT
ATTTACTTCTGCTTTCCACACGTTAAATACATAAAAGTATCTAGTATTCATAATTCTGTA
TTAGTTACAAAAGTATTTCATTAAAAAGACTGTCCAGACATTCCTTCTTTAGTAGCGATT
TTATGAGCTCTCTACAAGTTTTTCTATACAACTTGACAAGTTAAGTGCCTGATGTTGCTT
CGACTTAGGTTAGACGAGTGGCAGCTATTAGAATAATTTAGGTATTAGTAGTTAATTTGT
TGAAAGCCCACTAGTAAGATTTAAACAGTAGTAGAATTAAACATATACCTTTATGAAGGT
ATATTCTTATATGAAGCAAATGGTTAATTTAGTAAAGTTGATTCTGTACAAAATGTTACC
ACCTCCCACTTCAGCAAAACGATTTCAAATCTAAAGTCCGAAATTCATTAGGTCTCCTAA
AATTGAAAATTTCAAATTGTCATCGATTTTGATGTTTAATAGGTTAATGATTTATTTTGT
ACATTAATTTTTTTATTTGAAATCATGCTTTAAATTATCATATTTAAACCATACACTTAT
AATTGTAATTTTTTTGCAAAAGATGGACCCAAACTTATTTTTTGGGTGTTGGAAATTGTT
TTATCATTTGAAAGATACGATATGCCGATAATACCGGCAGCTCTGATTTACTAAGTTTTT
TTTTAAACCCCAGTGTTCACTTTTTTAGTGATGGCAACTTTGAATTATGCCTTTTATTTT
TGCATAAATGAACAGATCGTTTTTCGCTTTAATTAAATTGAAGTGTATTTAGGTAAATTA
TTTAACTATATTTTATGTGCAATTTTTATTATTATTTATTTTTGTGAATCTCAGCAGAGT
AATTTGTGAAGTTATGAGATTATTTTGGTTTTTGTTTGGTTGAAAATTGTGCAAAGAAAA
AAAAATGGTTTCCTATTTCAATCATTTCAAATTATTTCGCTCTCAAATAAACATGATTGA
AATTAATTAGTTTCATATTTTATTGAATATTTTATGGATGAAATATTTTGAGCCTAGTTT
GTACCGTAGTCCGCACTACAGCTGACTGAAATGGGAACTTGTTCATTAAGTTTGCTTTGC
TTAACTTGTTAATTAATAAAACATTTTCAAAGTTACAAACACATTCACGTATTAATTTGT
AATCACAGGCTGTAGTGTGTAATTCGAACATCTGAAATAAGAAATTGAATGTGCAGAGAT
CAAATCGTAAATGTGTTTTAACGATGGATTATGTTCATATAAAGTATACCTGATTTCCAT
GTATTTAACAAATAAGGGAATTGTAATGAAATAAAAAAAAGACTACATTGCATTTATGAT
AAATAATTGTCCGTTAAGTGTCATATAATTTTAGATTTATTAAATATCTTAGAGTAGACA
ACTTTAGGTAATATCAAGTATTTTATTTTAATTAGTATGTATGTTTTCTATTGAATACAT
ATCTAAGTTAGCTAAACTTTACAGCAATAGTCGGAATGAAGCGACTTTTTATGCTGCGAT
CTGGATCGAAGGCTCATTTAGGGGACTTTATTGCCTGAAATTTATCATACTCAAGTAATG
AATTTTTAAGTGGGTAACACTGAATTATTTTTGTTGCCAGAAATTTAGGTTGCTAAGGGA
AGGTTTAAGGATTGTATCGGTTCTGTGCTTCTGCATCGTTATGCATCGTCGTCCATGACA
TGTGTCAACCATGACACCTGTCAAGACTGCATTTTATCTGTAGCTTTTAATACGTTAGAT
TACTTACGATAAAAAGTATAGACGCGGCGTCAATTCGATGAAAAATATTTTGCCTGTGGA
AAATAAAGTTTATTCCATCTTTATCATAAAATAGCCATCGAATTGAATATCTCATAACAT
CTCTCAAACTTGTTCGCGAGAATGACACTAACGATGTTATTAGGGATTAAAATTATAAAA
TTTTTGATGTGTTTAGGAAAAACAGTTTTATGAAGAGATATGTATTATGTACGTCGCAAT
TATGACCAAAGACTGCTTGAGTTATTATTATATTATGATATTATTAACATATCTTAAGGT
TCCGGCATTTTATAAGATAGGTATTTGATAGTTTATATTCAGCTTTAGTAATTAGCTAGG
TAAGTTTTCACATTGATAGAGAAAATGAGATTATGTGAAAATGTTCAAATTTTTTTGTTA
TGTAAGATTACTGAGTAGATAGAATTTTTGAATGTTTTAAAAGGTTTAATTTCGCATTTA
TTATTATTTAATTAGACTTCGTTTGAGAAGTATGCGATAGTGGATTTAGATATTAAAACA
TAGTTGTTTTCAACAAACCGTAGATTTTTAATTTGGGTCATATTGCATTTATTTTGATCT
TAATGGATTTGAATTAGATAAGAAAAGAATTATTTTTCGATTAGAAGAATACAACAAAAG
TTTTTTTTGACTTAAACCTCACCAGTATGTTAAATAATACGTCATTACGTACTGATTTGA
TTTTAATTTTGAAAAACATTATTAGATCAATGGACTTAACTATCAATGGATATAAGTAGA
AAATTATTAGTTTATAAATGTGTGACTAGTAAAAAAATGATAAAATCTTTGTATAGTTTT
TTTTATTGAAAACTGATAATTGTGGAAATACCCTTAGTACGGTAAATTTGAAGCCAGGGC
CGTAATTTAGTCTTCGAATTGGTCGAGTAATTAAAGGTTTTATTCACGTTTGTATATGAG
AGTACACGTATATATCTAATGGTAACAGTCACGAAAGATTTTAGCCCATTGCTCTGTAGT
TAATTAAGTTATGAGCTAAAGTACCTTAGAAACTTTAATGAGAAAGTTCATAGATAATTT
TGAATATTTTTCATAGAGTGCGTCCCTGGCTATCGAGCTACGTTGTTCGGTGTTTTTTAT
CAACGCTTGTGCCTGCTTCTAGTTTTAAGGGAAATTCTACAAATATTTTATAAACAATTA
ACATGAATTTTAATTGTTTGGAAAATAAAATTCAAAAATAAATATTGCAGTATATTAATT
AATACTCGAAATGACATTAATGTACCAATGAATGTAATGTATAAAACAATTATATGTTTT
CGCTTTAATGTTGAGTCACTTAATCTGCGTACTTAGTGCGAGTTTTGAACGTTCTCGATA
GCGTAA
(5526 bp)

- SilkBase 1999-2023 -