SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp66962_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr17
NCBI non-redundant
(nr)		hypothetical_protein_RP20_CCG009861_[Aedes_albopictus]
Ontology
GO:0002164 P larval development
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005515 F protein binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0007476 P imaginal disc-derived wing morphogenesis
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0008407 P chaeta morphogenesis
GO:0030182 P neuron differentiation
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0048749 P compound eye development
GO:0050767 P regulation of neurogenesis
Transcript
Level		FPKM:5.79 TPM:10.09
ORF EntryO_BomoEE13406_5prime_partial:A_BomoEE_comp66962_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
ATCGAGAACGTTTAAAAAACTCGCACCAAGCACAAAGTTCTATGCGTATAAAAAGCTCAA
GAAATTAATTTTTTTATTTGGATATTATTAAATGTAAAGGATATACGAAGTTTTCGTAGC
AGATATCAACGGATACCCCGATAGGGTTGTCACGTAAATTTTAATAAAAAATCAAAATAT
CGTTATAGTTTCTGAATTCTAAATGCGAACACCAAACAATCGGTCAATTATAGTGTTAGT
TACCCTACCGTTATTTTGTAAGTGGGCTCTAACATTACGTAAACTAGACTGCTCATCGTC
AAAATATTAACAAATGTAGCTAACGCATCATTACATCGATTACCCAAAAACAGGGTTTTA
TTATAATCTGAAACTAGATAGACGTACACAAAATATCAAAAGGCAAAACGGGCGCGTATT
GCTTCAGTTACGATATTGCGACATATGCCACTACATACTTACTTACTTAAATAACATATG
TTTAATATTACGATATTATCTATACCCAACTTTATGAATGCGGAACGAAAACGACTCATT
AAAAAAATAAAACAAATTCAGTTGAAAACACCACCTCCGCGATTAAAACATTGACAAGAC
ATGAAAGAAATTGACAAAAGAATAAGTTTAATAGCCGTCGAGAACAATTGAAATACATAC
TTATTATATACATACAAAAAAATATCCATAAAATATACAAAAAAAAAACATACTTTTAAT
TTATTTGCATTCAATTTGTAACCGTTTATTATTGCAAAAACACATCCTATTTATGGTAGA
TAATAAATATTATTCAGTTTTTTTGTCGTTATTAGTCGCTTTCGTTCTGAATTCCCAAAG
TCGATTAAAATTTGAAAAAATACTACTTAAATCTAAATTCTTTTTAAACGCTAATACAAA
TTTTGTTTTGTCACTATCATTAAATATTCAAAGTTACAAAAAAATAATAATAATAAAATA
CTTGTAACACTTCACTTCAATATAATTATCTGAAATACATAGATAGATGAATATAAATAG
CCTTAACAAAAATACAGCGTCTAATCAGATTACGTTCGTATAAAATAAAAAGATTTCAAT
ACAAAAATTTTGTGTTGTGAATTTTCTTATAAAAAACATTAGAAATTTTTTTAAGACAAA
AATTACCGACTCCAACAAATCCTTTTGCCTCAAACGCTACAGATTACATTTGCGAGTACA
CTTGTCGACTATATACTACCACATCGCCTTCACCATGCCTGGGGTTTTGTTACCATGACA
ACACAATAACGAAAATTCAATGATCCACAGAGTATCACGACTACTTAAAAAAAGCAACGT
TCCTTTTGACTTTTGAAAAAAAATGGAATACCTTCTCATCTATGGAGACAGTGAAATTCC
TTGGTATCTTAAAACAGTATTGTGAGATGAGATGAAATCTCTGTAAAGGATCACAGTATT
TTTATGTCTCGTATAATGGCTAAGGACAAAAAGCCGAGTAATGGACAAAAAAAAAAAGAA
TTTCAAAGCGCTATAAATTACTAACATCCACATATAACGATCTCCTACGGCTCATTGAAA
CGGAAAACCCATCATTTCTATCTAAAATGTACGAAAGGCAAAAAAAAAAATTTTTTTAAA
TGTCTAAAGAAAAATGAATCTTATCTCAACCGCAGAAATCAGATTTTTCAATTTGATAAC
TACTCTTCCAGCGTTTGAACTCTTATCAAGATTCTACATTCACATGAAAACGTTAATATA
AAAATGCATTTAATCGAATACAGTCTAGTTACTCTTTTCATTTAAAACAGTATACAAACT
TTCAATAGCCAAGTCATAAAGATTATCAACGTTCATAAGATATAATCTGTGGAAATGCGA
CAAACACCTACTGAAACATTTTTAGTATAACTGCGAGAAATTACCAACGATGGCAAAACT
GTATAAGGCGATAATTTAACAATAAAAAAAAATTAAAAAACATTGTGGGAAGTCAACCTT
GACTATTGTTTAAATACCATTCAATAATTATTGGAAGCTCCAAGCGTGTACGAACCATAG
ACAAAAACTATTTATTTCAAACAGATTAAATATGCGTTATCTTTCTATGATTATTATTAT
TATTAAAATGTTACTTTATATTCGTTTCGTTTATTGGTCCTTTTAGTGAATGAATTTTCA
GGATTATGGCGCAAAAAATAAATACACTAATTTAGTGTACTGTCCTACTTTAGTAAAGTC
CAGTAAGCCCTCTATCACCTACATACATATACATAGTAAATTGCATATAATCCTTTCTTA
ATTTTGATTGACTTGCATGAGCTATTCTTCACTCCGAGAAAAAAAAAAAAACTATGTTTT
TATAACTACACGAGGCTTTGTGCGAACTAAACCCAAATCGCTACAGAAAACTACAATCTA
AACATATACTCAGCGAGAAGGGGCGTAGTATATAAATAATATATATATGTGTAAGACTAT
AAACTGCATTATTTTAAACTCTATGTTAAATATGCCAACATCATTATGTGATTATAAAAT
TATTAAAAATGTGCAACACTATATTTCTGCATTACAACAATCGTACAGACATTGATCAAT
ATCAATGTATAATTAATATAATATACAAAATATACATTTTTTTCAATTCAAAATTATTTA
AGCTAGAACTACACGAGACACACGTGTGACTATATGACGTTAAGACAAGCCAAATGCTCA
CCGGAGTCTATATTTGAGAACAAGCTGTTTAGAGTAAGCGATCAAACAATAGTTTAGTTT
GGTTTATATATTAATTTTCAGTTTAATTTTAGTCACAAACGTTCTTAGATACTGAACCCT
TTACTGTGCACAATCCAACACACTACTGCCCTTTTTTAAAATAAAAAAATGCAATATAGT
GTGTTCGTATGAACATGTAAACGCAGCCATATGACGGGATGTGGGTAGGTGATTTTTGTA
CACTGAACGTGTGCCTCGCCCTAACATAGTACTAGTTTAAAAAGTACACTAAAGGTACAC
AGCAATGTCAATGAATACACGATTGTTGTAAATACTAATTGAATTATAATTATATTTTGT
ATTTTCAGTTCAAAGTCACGATTACAAGTTCCTAAAATATGTAATGCGCGGGTTATACGC
ACGACATTTTTCTTATTATTGCTTTTCCATTCCTTAACCCTAGTCTATTTATGCATATCT
TTTTTTAATGACAAAATTCCTTGGATTTTGATTAGAAAAGGAATTTGACTTTCAACTTCA
TTAAATTCCAAATATGAAATAAGACCGTGGTTACAGATTTCCAAGGTTTCTTACTTTAAT
ATAAATTATTTTGTATTTTTAACAATGTTGCCAATACATCTTTCATGGTTTTTGGTCGTT
CAATAGACCTCTCTCATACATATGCAGAAAATAGCTCCAAAACTAGTTCGTGATTCACAA
GACAGATTACCACAAAATATAAGTTTCTACTGAAATAGCTTTTGTTCTTTTTATTCTTCA
GAATAAGTTTGTTGTTAACTTACATCTACTATTTTCATCAAATTTAAAAGTGTCCAAGTG
GCATATTTATTATTATTTTGTCATTTTAATATTGGTCAATAGCGGCAGATCTTAAATTCT
TATTGTATTGTTAAGTATATATTTTCGTATCAGTATTAATAAATGCAAACGCAATGCAGG
AGCATAAGCTCCTGTCCCTTCCAAATGAATAATGCAAGCTCTTTAAGCAGCGAGAAAACC
TTGACGCAACGCATTTCTGTTAAGTGTTTTGTTCGATACTCTAACAGAAGACGAATGTCA
ATGACCTCGCGATCGATAGTTTTCCACGAGATATTGTTCTCTATGATTTACCTTTGACAA
TGGTGAATATTAACGTACGGTTCAAGTGGCACTCGAAGAGCAGTATTTCAAACAGCAACC
GGAACGAGGCGGCGCCGACGCTATTGGTGTCTCTGCACCGGGGTCTGGCAGTAGGGGCAG
TGGTCCGTGGTGCCCGCGCACTTGTCGCACAGCACGTAGTGGTTGCACGGCGCCAGCGTG
ACGCTGCGGGGCTGCTCCTCGCAGCCCATGCACTTGGTGGCCGTCTCCAGGTACAACGCC
TTCTCGATCTCCTCGAGGTCCGCCCGCGCGCGCGACTGCAGCGCCTTGAGCGCCGGCAGC
GACAGCGCCCGCGGGTCCCGG
(4161 bp)

- SilkBase 1999-2023 -