SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp66193_c0_seq3
Scaffold_idBomo_Chr22
NCBI non-redundant
(nr)		chromatin_modifying_protein_1b_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005768 C endosome
GO:0005829 C cytosol
GO:0006810 P transport
GO:0007034 P vacuolar transport
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0031902 C late endosome membrane
Transcript
Level		FPKM:4.69 TPM:8.18
ORF EntryO_BomoEE12669_complete:A_BomoEE_comp66193_c0_seq3
Sequence
(Nucleotide)
CTTGAGAGGCTATGTCAGCGTAACAGGGCGAGATATTGCTCTGTGGTACCAACACCAGTC
TCCTCCCAGGCCGCTCTGTGCTAATGCAATACACGGGGTGGCTGTCTGGTGGCCAACTCA
CGGTATTCCTAAACTCATTACCCCGTTCATAAAACGGGTATGATTGCCTATACGATTTGC
CGAGAACCTAGCTCATTACTATTAATCTCTATATATCTAGAAATTTCAGTTCTGTCCTGC
ACGTTAAGTTCCACATCAATTGAAAATATGTTGTTTGTCAAAAAACTATAAGAATAGGTT
TTTAAAAATTATATCGTGTCTCTTAAATTCCTCCTCGTTTAGATCACGAAATGAAACATT
GATGTTACCAAAGTCAAATAAAATCGAACTTTTCTCTTTTTTCTTGAAAAACAATGCATT
ATTTTTTTGCGGGACGTCCGAAAGCATAGCTAAACAATTTTAGAAAGTTCCTTTATTATA
ATTTATAATATACGATTGAATGCTTAGACCATGACTGTTTTAATAGATGTTCTTATCTAA
ACGTCCCTTCCTATGCGCATAGTGGGACCGATATGCAAGGCTTAAGAAACAATAAAACCT
GTGGTTAAACCAAAAATATTTATGAGAGAATTCACTTTTATCCATACAAATAAAAAAAAA
TACAGAATAAGGAAAAAAGTGAAACATTAAGAGACATTAATGTGAATTATCAATGTAACA
TACTTTTTCTTAATATATACTAATTAATGAGCTTGGAATAAATTCCAATATTCATTGTGT
TCATCGTACAAAATATTCATTTATAGAATTAGTTTATAAAATTAAAAACTTACTATTTAT
AAATTTTATAATACATGGAATAATATAATCTATACAGCAGTAGCATTTTATAAGACACAT
GCAAATTGGACACAATCTCACAAAGATCTAGCTATTGTTTAAAAGATAGATTTGTTCATT
GACAGATTTTAATTAAATATCCGTGAAAAATGATAATTAAAAATACCATATTTCAGAGAA
TATGAGAACATTTGTTTATAATTTGATTACCAACAACCATACCTTTAAGGTTTGAACATT
TACATGTATTACAATAGCTCTGATCCAATTAAACTGATTCACATTTATTCTGCTTGTCTC
AACCTGGCAAGTCTCTGTGTGAGTTCGTCTTGTTCTTGGGAAACAACAGTTGCGGTACCA
ATAGATGTGCTCGGAACACCAGATGGAAGTTCCATATTTAGCTCCAACCCAGCTTCATCT
GCAACCTGTTGAAGTAAATTATCAACGTCTCCTTGGGGAACTGTAGTTGTCGTAGTTTGT
GACATCGCATTCTCCATGTAGGACGACTGGACATCCAAATCCTCAAACTGACTCTCGAAC
TTGTCCATTAGTGTAGAAATTTTCTCTAAGTTCATTGATTTCATTGCTGCATCCATTGCT
TTTACTACACCGGCCATTGAATTTGTAACCTTTCTAGTTGTTAATGCTGTTTGAACTCTG
CTAGAAACAGCATCAACTCTCGCTGACATCCTTAGGTAGTTGAGAGCTTGGTTCTTCTGC
CTAATCGCATTCTCTGCATGTATTCGTGCCCCCTCCATGTTACCTTTCTGTATAGCTTTC
TTAGCTTTCTCTTTTTCTAGTTTTTCTTCTTTTTCACATTTTTTTGAATTGCGTTCTAAC
TCCTTCACAGCAAATTTTAAATTAAATAAATGTTCTGATTGTTTCAATTAAGGATAATCA
TTGTTTTGAGTGCTTAAGATCTGTGTTGAAGATCTTAGATTCTTTAACAAAAAATTCTAC
TATACTAACTACTATGCCTAAGCATTAACAAATAATCTAGCCATAATACGTATATAATAA
ATACATAGTACATAGACAAAACATGTTTACCAGTCACATTTACTAAAAGAAGGAATTCTT
GATGGTAGAAGCCAGGTTAGATTGGCAAAAGTGTCAGTAGACACCAGGATATACCTAAGT
AAGGCAGATATACCTCAGTAAGGCAAGGTCTAAATGTTGGCAAGTGGTGCTTGTCAGCTT
CCATGCAGGTTACAAAAGATGTCTATCAATTGAAAATTAAATATGTATAGATATCAGCAG
TGCTCCTGAAGCTCAAGAGCTAAAGGGAATTCAGCAGCACTAAAAATGCTTAACTATACA
TAAATTTATAAAAGTAGTTGCAATAACCAATTTATTAAAATATTTGCGCAAAGGAAAACT
GCAGTCTTAACTGCATTATTTGATCAAAATTTATTATATAAAATCATTCCGTTCTACTTA
CATCAGCAGGTTCTCTTACGGACACAGTTTTAAATAATGATATCATAAAATTAACTTATT
GTTATGATAAACATTTCTGAAAAGGATACTTTCCATTGCGGAGGATGACATTTCGTTCCC
CAGTTTGAAGGCTTTTATGAACTTTTAACACACAAAAAATAGGTAATAATACCCAACAAA
CTGATATCTAGTAAATTACAGAATTAGAAAAACGTGAAAAAGTGATAATACTGTTATTAA
GGCAGATTATTCATAAATAAATCTCAAATATAATAAGTGTATAAT
(2565 bp)

- SilkBase 1999-2023 -