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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp65579_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr12
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_endoplasmic_reticulum_lectin_1_isoform_X2_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0001948 F protein binding
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005788 C endoplasmic reticulum lumen
GO:0030433 P ubiquitin-dependent ERAD pathway
GO:0030970 P retrograde protein transport, ER to cytosol
GO:0051082 F unfolded protein binding
GO:1904153 P negative regulation of retrograde protein transport, ER to cytosol
Transcript
Level		FPKM:1.98 TPM:3.46
ORF EntryO_BomoEE11973_complete:A_BomoEE_comp65579_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
CGAGAAACTCAGTGGGCTGTTTCCCTTGTGTTGTTAACTACAGCTGAAAATTGTGCTACA
AGCAGCAACAGTACTTAACAAAACATTACAGAGCAGACAGGTGAGACTCAGTAATACAGA
ACATTTTTTTCTATAGTTTTCTATAGTTATAGTCATTTTATGTACTAATCTAATATATTA
TGTTTATTTGTTGTAATTTACATATTATTAATATGTTTATAATTATTGGAAATGGACAAG
CGTTATTTGGAAATGTCAAGCCCTGATCCTTCTAAGTGGTGAAACTGCATTCTGAATAAG
TGGTAGCCTTGACAATTTTAAAGCTCATTTGAAGGCATGAAGGCTTTAAAAGAAACTTTT
CCAATATTAGTTTTAATAATATTAAATTAATGGATATTAAAATTTTAGGTTAAAAATTTA
GAACTTAGAAAAGTTTAGAAAATAGAACAATTCCTTGTAATTAATTGTATGATGTCAGAT
ATAGAATTGAGACATTGACTTAATTTTTGAGCTAAACATTATGCCATTCTACTTGTAATA
TAATAGAAAAGCTGTAAGTTCTACCTCATTAAGAGATTCCTTGCTGTTAAGCATTTATAC
AAATGACTATCATCAAACTGCTGGAACTCAAAGTTAATATACTATCAGTCTTCATGTTTG
AAATTAATAATGGAACAAATCTTAACTAAAATAAGCCTAAATTCTATTTCAACAAACAAG
CATAATAAGGTATATTACTGCTAGTTATCTTTCACACATAATATAGTAATAATATAGTAC
ATACAGCATTATCCATGAGTCTTATGCTCTGATGATGAAATCTCAAACTGTTCGCTTCCA
TTTTCAATAAGTCCCTTGGCTTCCTTGGAGCGTCTCCGATTGGGAGGCAGTTTATAACAT
TCTCACTAACATCCATAGGTTTGAACTGTGGATGTTCACATAGAAACGGCGACAGAATAA
TGATCTCGTACTCGCAAGTAGAAGTCTCTCTGAAGGAATAAACCTCATGCTTTCCATGTG
TGTAACACACATAATGAACCCTAGTTAGTCGTGGTTTGCCATTTAAATCACAAATTGTAC
CATCATCCATTACTATTTCAACGTTAGGTAGAGCAACTCCCTCTACTTTGGTGGTCTTGG
GGATTTGTTTGGATTCCTGTGCCGCTTTCATTTCAGCCTCCAGCTTAGCCTGCTTTTCAG
AGCTCCAATATCCCAAGAAATATTCTTGGGTGTTGATTTGTTTGCCCTCTCTTTCTTCGT
GATACTGCCGGATATACCTTCCATGGCATACTTCATAGCTCCAATAGCTTTCCAATCTGT
ATGAACACATTTCTTTGTTCATCAAAGGCTTTAGAAGGTGAAGCGGTGATGGACCATCGT
AATCATCAATGCTGGTAGACTCCGTACTACGAAGTTCCGGCAGTTGACATTCGTAACTCT
CTTTATTTGTTGTTGTTACTTTAACTAACTCTTGGTTCTGAGACTTGTTTTTTTCTCCAT
CAACAAAATTTTCGTTTAAATTGGGATTACCAGGCCAATTTATCCCAAACAAAATGCTAT
CATCGAATCCTTTAAAGTCATGTTCAATACCTATGCAGCTATAAACTAAACTTAACATAA
CAATTTTCACTCTCATTTTGCTATTTCTTACTAATCACGCCTACACATATTTATTTAATA
TCTTTTGGTTTTAATTTAATAATTAGTCGAGCGTTGGATTTTTTTATTTAATTTACTCGA
ACAATTTAAATGAATATGTCAAAATAAAACACAATACCGCCAATAAAATTGAAACGTGAC
CCAAACATTGCACACAGAACAACAATAAGGGGTAATTTAATTTAGACGGATTATTTATTT
CGACCAGACTGACTTGGCATGCTGTCATTTGAGATCGGAAGA
(1902 bp)

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