SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp65355_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr17
NCBI non-redundant
(nr)		KDEL_endoplasmic_reticulum_protein_retention_receptor_2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005046 F KDEL sequence binding
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0006621 P protein retention in ER lumen
GO:0006810 P transport
GO:0006890 P retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016192 P vesicle-mediated transport
GO:0019233 P sensory perception of pain
GO:0030140 C trans-Golgi network transport vesicle
GO:0046923 F ER retention sequence binding
Transcript
Level		FPKM:45.71 TPM:79.72
ORF EntryO_BomoEE11730_complete:A_BomoEE_comp65355_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AAAGGCCTCCGGGCCACCAGTAATTCTTCAATCATATAAGAAAATATTCAAATTAATGAA
ACATAGATTACATTTAATTTTATAAGCGAACATTCCTCATTATGTTATTGACATCAAATA
CGTCGTTTGTCATGTCAAATGGCCACGTCATTTTGGCTTGAATGAGAGGCATACGCGGCG
ATCTTATAATTAATTGTATAACGAACAAATAATAGAAACATGAATATATTCCGTTTGCTT
GGTGATCTATCCCACCTGTTAGCTATAATAATATTGTTATTAAAGATTTGGAAATCAAGA
TCATGTGCAGGGATATCAGGAAAGTCTCAGATTCTGTTTTCAGTGGTATACACGACACGT
TATTTGGATCTACTTACAACTCATGTGTCCCCGTATAACACTGTCATGAAGTTGGTGTTC
ATCTTTACCTCCTATGCAACTATTTATTTGATGTATGTCAAGTTTAAGGCCACCTATGAT
CACAACCATGACACATTCAGGATTGAATTTCTACTGATCCCCACCTTTATCTTGGCTTTA
TTGATAAACCATGAGTTTACTGTTTTGGAGGTATTGTGGACTTTTTCCATTTATTTGGAA
TCTGTCGCTATTCTACCTCAACTGTTCCTGGTTTCAAAAACAAGAGAGGCCGAAAGCATT
ACCTCTCATTATCTGTTTGCTTTAGGTTCATATAGAGCTCTGTACCTCTTGAACTGGGTT
TACCGTTATGTTGTGGAGTCTCACTATGAGTTGATAGCGATTATCTCGGGTGTTGTGCAG
ACAATTCTGTACTGTGATTTCTTTTACCTTTACATTACGAAAGTGTTGAAGGGAAAGAAA
CTACAGTTGCCAGCTTAAGTTTTTTGATAATATCTGTTTAAATGTTTTTGGTGTGAACCA
ATAAATTACCTAAGATTTAGTTTGTATAAACTTTGTCTGTTTTGTGCTATTGTGAAATTG
TTTATTAACTAATCACAATGTATGATTGTAATACTGCAACAAAATGAATGCAGTCACAAG
CAATAAATAATTATTATATGGTATTTAGGATTTTTTAATTTGGTACAACAAATGTAAAAA
AGGATAAAATTATTACAAGAAAATTCCTAGGATTTCTTATGTATGTTTGAAGTACTATGG
ACTAATATGTATTTAAAATTATAATTACGTAAGTGGTGGTACTTGAGGTAAGAAAAAATG
CAGTCAGTAAGTATATACACAAGTGTAGTTCATTAACATCAAAAGTATGGCTGTTTGTGG
CATTCCATTTTTAACTTCCTGTCCTGATCATTAAATTCCCTAAAGTGGTATGTACCATAT
TATTTTGCCCTAATAATCGATAATTCAGAACTTGTCTGTTTTGTAAGTGTTTAAAGACAC
TTTAATTTTCGTATTCTGTATTGGAATAAATTTATAGAGTCATAATTGTTTTATTTTTTA
TAATTGAGCCATTTAACGAGAAATTACTAGGTAGTAGTTTTCAGTTTGCCCTTAAAATCT
ATAATAAGTTTAGTAAATTGGACTCTGTAGCTGTGACATTATTGTATGTGACTGCTTTTA
CATTTTACGTAAATTTAAATAAATGAGTACTTTCGTATTAGATTGACGAATAAGTTCAAA
ATATTATGAATACCTTCAATTATGACTGGTTTTGCCAATATTTATTTCTTATAATTACAC
AGGGTCAATTTTTAGTGGTGAATCAAATATTTTTCTTAGTTGATCATACAATTACTTTCA
CTGGTAGTTAAATAATTAAAATTTTGTTATCTAATTTATTTTGAATTATTGGCAACATTT
CATTAGGTTTCGCGTTTATCACGACCACGACTAGAATTTTGCTGGCTGCATTTTGTTTTG
GTGTGAACAAGATTTGGTGTGGTGTACCAAGAGCAGCAAAGTACTATTTTTTGTATGTAA
GTATACAAATGTAATTCCGACGAGTTAAGTGATCCGACTGCGGGACCATGGAACACAACA
GTAACACTGATAGTATTTCTTTTTAATAATTAAATAGCTTATTGATTGTGACCAATGTAA
ATGGTTCGTCTTTGACTTTATTGCGAAATGCAGCTTCGATTCACCATTAAACATTCACCC
TATATAGGACTTAGATATAGGATGAATCCATTATAAACAATTAAAAAAAATCGCGTCTTC
TAAATCAAAGTAACATTAATTTAGACTAACACAATAATATGTATGTATAAGGTAGAGCCG
ACTAGAGCCAAATTTAGTATTATAATATATTTTTTATGTGTATGAATTTCATATTATTTG
TTGGATTTGGTGTGCCTATAAATGATAGGCAAACTACATAATAGGTTAATGTATGGAAGA
TTTCCTATCGGTAATTTCTTCCATACATTGATTTAATACAATATAGTTTAAATAAGGATA
CGTTTTACTGTGTGCGCGTTTATATTTTTCATTTATTACTTTAAAAAAGAACGTAGCCAG
TTTCGGGCGTGTTTAATTTTAATAAAAGTAATTAATAAAAAAAAA
(2505 bp)

- SilkBase 1999-2023 -