SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp65075_c1_seq1
Scaffold_idBomo_Chr4
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_polycomb_group_protein_Psc-like_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0001047 F core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005704 C polytene chromosome band
GO:0005725 C intercalary heterochromatin
GO:0006338 P chromatin remodeling
GO:0006342 P heterochromatin assembly
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0007411 P axon guidance
GO:0007419 P ventral cord development
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0031519 C PcG protein complex
GO:0035102 C PRC1 complex
GO:0035186 P syncytial blastoderm mitotic cell cycle
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level		FPKM:11.92 TPM:20.79
ORF EntryO_BomoEE11423_complete:A_BomoEE_comp65075_c1_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AATCGTGGCCTGAACAGACATCTGAAAATATATAGTTGTACACATAAAATAACAACATAG
GAGATTTTAGTTTCATTTTAAACAGATTTTAATTTACCTTTTTGGTAACGGGCTAATGTA
AAAAATAAAACAATCAGAAGACTGTGAAATAATTATATTAAATAATAAAATTTGTATTCC
TGACATTAACATTGGTTATTTTTTGATTAATATTCTCTACCATAAAACATTGTACATTTT
ATATCTAATTTTAAAATTATTCAGATGCTCATTTTATTTAAACCACAATACATTTAACTG
TTAAAAGCTTCCATAATCATTAAAATTATCTTTAATGCAATAATTATTATATTAATTACT
AACATAATATTATGCTTTATTCCCAATTAAATAATAAAAAAATAGTTCTCAGTAAGCACA
ATTGTGCTAGGTATTTGAATTTAGAATCTTATAATTCAGGTAATTATTCTGAAGCATTTT
ACCTTATCACAATAACTTTTATCTCTAAAATTAAATATGAATACTTCAACTGATTTGAAA
TAACCAAAATAAAATAAAACAAAATTTTATAAAAATATGAAATTGTGGTTAGCATATTCC
AGTCCAGCCTAATATGAAATTACACACTCAAATTAAAATCCAAATATGCAAATAACATCT
ACTGCTTATCTTTGTGATATTCATTTTGATTCTGATGTCCCATATTCTTCATAAATTCAT
ACTGCCTTTGAGCTTTGATCCAAGCATTGACTTCCATGTGTTTAGCAATATGCTGCGATA
AATTACTACTCATAGATGATGATGCAGTGGTTTTAAGTGTTGAAGTCAAAGATGGCCATA
CACCACTAACTTTATTTGTATTGAGGTTTTTTACTTGCTTAAGACTTGGTTTTGATGGAC
CTGGTAAAGTTTTAGATAATTCTCCCTTTGGAGTACCAAAGTTAGTAATATGTGTACTAG
TTACTTGATTCAACTGGCTAACATTGTGTTCCATTACAGTAGTACTTGTTTGTTTTTCTT
CAGCAATGACCAATTTAGGAGATGAACTGGGAGAACGTGTCTGAGACCTTGGTGAAGGTT
GTGCATTGCTAGGTGGGTGGGCTGATGGTATTTGATAAGCGGGAGACTGCAATGTCAAAT
TCATATTGCCTAATTGTTTTACTTGGCTGCTTTTTATAGAACTTTCTTGTCTATTATTAC
CAGTCACTGTTGGCACATTTGGGTTTGGTTTATCAAGTTTTACTTGATTTATAGTATTTG
GGGATGATAAACGTACTGAATTAATTCCAGCAGTTAAAGGTCTGCTTGTGATGCCTGGAA
AAATATTGCTATGTGTCAAAGACATTGGGATCCCTTTTGATGGCAAATTCTGCTTCTTTG
CCAAATTTGCTATAGAATGCATAGTTTCCAAAGCTTTATCAAATGTTTGCTGAACAGCTA
ATTGACTTTGAATGTTGTGAGGGGTTGTTAAATCTAAAGCAGTGCCGGTTTTAGTTTCAG
TACTAGAACTATTTGTAGGTTTGTTTACTGGTATGATAGGTTTAGTGACAGCACTAAGGG
ATTTTGGGGTAGCCGGCACCAACTTAGGCACCTGTGCCTTATTTTTTGGTTTCCCTTTTT
TGTCACATTGTAAGCTCTGTAATTGCTGTTCAAAAGTTTGTTGAAATGTGATGGGTGTTG
AAAAATTTCCAGCCTGTTTAGCAAGTTTTGTGTCAGCAATAGGTTTTAAATTAGGAACAG
GGCCTTTAGTGGAAGTCTCTGACCCTTTGGTTGTAGGTTTTGTTTGACTTATTTCAGGTT
TACATTGAGAATTTGTTTTAGAATCAGCTTCGTTTTTTGCAATTTTTTTCAAATTAGAAT
CTGATTCAGGTAATTTTAAAATTTCTATATAATTGTGTACTGGAGGGCTGGGCACTTTAT
GGGCAGAAATACTGCTACTACTAGCAGCAGCTAAGTTTTTATTAGTAAAATTTTTTTTAG
GATCTAATGTATCTACAGGACAGCGATTGTCTGATTTTTGATCTGTTAAAGTAATGGAAA
GGGAAGATGGTATATTTATTTTGCACGAGTCAAACAGAGATTTCAATGGGTCGCCTGAAT
TTTGGGCTGGGCTTTGTACACCCATGGATGATTTTACTTGTGATAATATTTTGCTTCTAT
CAATAGTAGGGTCACTATTATTAGCCAATAGATCCATTCTGACTTTATTCATAGCTGGAC
TTTTACTGTGAGCTGATTGCAACATTGGCATGCTCGGTTTGAGATCTGGTATCTTTTTTA
ATGGGGGTTTTGGAGCTTCACTTGTTTTGGAAACTGCATCTAATTTTGGTATTTGTAACT
TTAAAGGAGATAGAGTCTTCTGTTGCTGTTGTTGTTGCGGCATTGCTTGCTCTGCTGTGG
ATTCATTTGGAGGTTTACGTTTGGGAGATAAAATATTTTGTGGTCCTACAACTGTTCTTT
TAACACCTGAATTATCCAAGGTTTGTTTACTAGTACCAACTTGTTGCTTTACTGTCTGTG
GTTGCTTCAAATCTCTGGTAGTTGGAGTAGCACTTGGTGCATTATTTTTTATAGCAGATT
GATTATTTTTGTTACAATCAACAGTTTCGTGTTTTCTTTGATTTTCTTCTGTTTTGGTGC
TAATACTAGAGCTTGATGGTTGAACACTGAAACTAGGCAAACAATTTGATATTTCCACTT
TTAATTTCTTTAATTCAGGTGTAGGAGGTGATGTGTGATTTTTTCTTTTTAAATTATCAG
GTGTTGGGTCTTCAGCTTTCACTTTGCTTGTTATGCTTTTAGTAACCACTTCCTTCGCAA
GAGATAGTTTTTCTGTGTTGAATTTCTGTGGGGATTTTACTGGTATACAGCTACTTTTAG
CAGTGAGCTCAAATGAATTCAGAAACTGAGATTTCTCTACATCTTCATCTAGCTTGTTTG
TTGAGGAATAATCATTCTTATCATTACAACTTTCGTCATTTTGTACATTCATCTTATCAT
TGGTCAAAACTTCAGGAGTATTTCTATTATTATCATCAGGAACGGGACTACTAGGTCCAG
AAGAAGCTTCCGAAGCATGATCATGCAAATTAGGTGCCGGACTGCTAGTGCTTGTATCTT
CTGTTGAAACAGGACTCAATTTTTGATCATGAAAGTGTGATCGTTTTCTGTTTATATCAA
AAATTCTGTTCCTTATTGCTACATAATCGATTATCTGGTAAAAAAATCTCATAGGCTCAT
TCCTTTTCCAATTATAAATATAAGCAATATCCATTAAAGTATAGTAGTCAGGTAAAGGTA
CTTTCTTGTATAAGATATCAATAGCAAACTGTGAACTGTCAACATCAAACTTTTTACTTA
AGAACTTTTTTAGGTGACTTATATTCACAACAGCTGGGCATTGTAAATATCTTCTAGTAG
ATGCTGAGTTTGGTGGAGGCTCATTACTATCTGAAGATTTACTGGATATGCTATCAGTAT
CTGTGACATCAGCATATTCTAACGAAAATGAAATGACATCTTCAGGACTGAAAATTATTC
TTTCTGTGTCTTCACCTCTCTGTTCTGGTGTAGCTGTTGCGGCTTGTCCAGGCCTCGAGG
CATAAAAATGTTGCCGCCTTTCCATTTCTTTTTGGAAGAGCCCAGGCACAAGTTTGTAGA
CTATGTCCTGCAGTGCTTTGTCAAGTTTGATATTGGGTTTTGCCGAATTTATCATCATTT
CACATACAGGACAGTAGCTCTTTGCTTTAAGGTGTTTAATAATACAACTACGACAAAAGG
AATGCAAGCATTCCACTATTGTGGTCGCATCTATGTAGTACCCTCGACATAATGGGCACG
TTATATGTTCGTTAACTTCACCCAATAATGTTCTTTGCGGTACAACGGCAACGTTACTAT
TATCCATTTTAACAACTTTTTTATCGGAAATTATGTTAGACGTAACCATTTTTTACACGG
CGTCACTGTTCCACCGCAGCTGTTAACTCAAAACATAAAAGCTAAAAAGTCACATTTACA
CTTCTAAGCTAAGAATTATTATTCATTGGACAGCCCGTCAATCACAGTCATCTTTAATAA
AAATGAATTTCAAACCAAAATATAATTGGTTTAATATGTTGAATTTCACGATTCTAAACG
CGACTTACGAAATTGACAATTCCCGATTAGTTGAGTTTGTTACGTTGGTAACATCGATGT
TTATTTTTGAAATAAATATCTTTGGGTATTGAATATACGTTTTAATGATATCAAAACATT
TAC
(4263 bp)

- SilkBase 1999-2023 -